MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 24968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_014160	AGG	3	9	842349	842357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242626
16002	NC_014160	AAG	2	6	842361	842366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242626
16003	NC_014160	GTC	2	6	842373	842378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242626
16004	NC_014160	GGTT	2	8	842396	842403	0 %	50 %	50 %	0 %	296242626
16005	NC_014160	GTG	2	6	842407	842412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242626
16006	NC_014160	T	6	6	842426	842431	0 %	100 %	0 %	0 %	296242626
16007	NC_014160	GAA	2	6	842462	842467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242626
16008	NC_014160	ATT	2	6	842489	842494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242626
16009	NC_014160	CGC	2	6	842527	842532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242626
16010	NC_014160	GTGG	2	8	842584	842591	0 %	25 %	75 %	0 %	296242626
16011	NC_014160	AGG	2	6	842639	842644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242626
16012	NC_014160	GAG	2	6	842658	842663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242626
16013	NC_014160	CGG	2	6	842710	842715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242626
16014	NC_014160	TAA	2	6	842716	842721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242626
16015	NC_014160	ATCTTT	2	12	842772	842783	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	296242627
16016	NC_014160	TCC	2	6	842803	842808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242627
16017	NC_014160	GGTA	2	8	842829	842836	25 %	25 %	50 %	0 %	296242627
16018	NC_014160	GTC	2	6	842865	842870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242627
16019	NC_014160	TTC	2	6	842880	842885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242627
16020	NC_014160	ACC	2	6	842946	842951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242627
16021	NC_014160	TTA	2	6	843180	843185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242628
16022	NC_014160	GTG	2	6	843212	843217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242628
16023	NC_014160	TTC	2	6	843224	843229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242628
16024	NC_014160	TCC	2	6	843254	843259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242628
16025	NC_014160	TGCC	2	8	843301	843308	0 %	25 %	25 %	50 %	296242628
16026	NC_014160	CCT	2	6	843328	843333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242628
16027	NC_014160	CCT	2	6	843427	843432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242628
16028	NC_014160	TCG	2	6	843522	843527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242628
16029	NC_014160	GAG	2	6	843623	843628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242628
16030	NC_014160	GTT	2	6	843638	843643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242628
16031	NC_014160	TTG	2	6	843758	843763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242628
16032	NC_014160	GTT	2	6	843827	843832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242628
16033	NC_014160	AAG	2	6	843850	843855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242628
16034	NC_014160	GAC	2	6	843866	843871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242628
16035	NC_014160	TTG	2	6	843897	843902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242628
16036	NC_014160	C	6	6	843942	843947	0 %	0 %	0 %	100 %	296242628
16037	NC_014160	GAT	2	6	844019	844024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242628
16038	NC_014160	GAC	2	6	844115	844120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242628
16039	NC_014160	CCTTG	2	10	844158	844167	0 %	40 %	20 %	40 %	296242629
16040	NC_014160	CAA	2	6	844172	844177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242629
16041	NC_014160	CT	3	6	844193	844198	0 %	50 %	0 %	50 %	296242629
16042	NC_014160	CAA	2	6	844242	844247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242629
16043	NC_014160	ACG	2	6	844286	844291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242629
16044	NC_014160	AG	3	6	844303	844308	50 %	0 %	50 %	0 %	296242629
16045	NC_014160	CAA	2	6	844332	844337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242629
16046	NC_014160	CAG	2	6	844396	844401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242629
16047	NC_014160	TC	3	6	844516	844521	0 %	50 %	0 %	50 %	296242629
16048	NC_014160	TGGTA	2	10	844609	844618	20 %	40 %	40 %	0 %	296242629
16049	NC_014160	ATT	2	6	844660	844665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242629
16050	NC_014160	GCG	2	6	844732	844737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242629
16051	NC_014160	CTT	2	6	844818	844823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242629
16052	NC_014160	TTC	2	6	844843	844848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242629
16053	NC_014160	TGG	2	6	844940	844945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242629
16054	NC_014160	G	6	6	844944	844949	0 %	0 %	100 %	0 %	296242629
16055	NC_014160	CTT	2	6	845001	845006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242630
16056	NC_014160	TGG	2	6	845081	845086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242630
16057	NC_014160	CGG	2	6	845089	845094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242630
16058	NC_014160	GGCTGG	2	12	845210	845221	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	296242630
16059	NC_014160	AT	3	6	845222	845227	50 %	50 %	0 %	0 %	296242630
16060	NC_014160	A	6	6	845279	845284	100 %	0 %	0 %	0 %	296242630
16061	NC_014160	GAT	2	6	845295	845300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242630
16062	NC_014160	AAT	2	6	845312	845317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242630
16063	NC_014160	TAA	2	6	845321	845326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242630
16064	NC_014160	CTC	2	6	845382	845387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242630
16065	NC_014160	TAC	2	6	845406	845411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242630
16066	NC_014160	CTT	2	6	845518	845523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242630
16067	NC_014160	ATA	2	6	845550	845555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242630
16068	NC_014160	CAG	2	6	845603	845608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242630
16069	NC_014160	GAG	2	6	845651	845656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242630
16070	NC_014160	ATT	2	6	845658	845663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242630
16071	NC_014160	CAT	2	6	845672	845677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242630
16072	NC_014160	TAT	2	6	845736	845741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242630
16073	NC_014160	TCAT	2	8	845805	845812	25 %	50 %	0 %	25 %	296242630
16074	NC_014160	G	6	6	845816	845821	0 %	0 %	100 %	0 %	296242630
16075	NC_014160	TAA	2	6	846014	846019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242630
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16077	NC_014160	TTC	2	6	846033	846038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242630
16078	NC_014160	GAAGG	2	10	846097	846106	40 %	0 %	60 %	0 %	296242631
16079	NC_014160	ATCT	2	8	846116	846123	25 %	50 %	0 %	25 %	296242631
16080	NC_014160	CTC	2	6	846140	846145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242631
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16083	NC_014160	CAG	2	6	846246	846251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242631
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16086	NC_014160	G	6	6	846450	846455	0 %	0 %	100 %	0 %	296242632
16087	NC_014160	CTT	2	6	846495	846500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242632
16088	NC_014160	TCGC	2	8	846544	846551	0 %	25 %	25 %	50 %	296242632
16089	NC_014160	GGACTT	2	12	846552	846563	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	296242632
16090	NC_014160	G	6	6	846565	846570	0 %	0 %	100 %	0 %	296242632
16091	NC_014160	ACA	2	6	846629	846634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242632
16092	NC_014160	CTA	2	6	846676	846681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242632
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16094	NC_014160	CCT	2	6	846848	846853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242632
16095	NC_014160	CGGG	2	8	846881	846888	0 %	0 %	75 %	25 %	296242632
16096	NC_014160	CAA	2	6	846957	846962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242632
16097	NC_014160	GGC	2	6	846982	846987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242632
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16099	NC_014160	GA	3	6	847175	847180	50 %	0 %	50 %	0 %	296242632
16100	NC_014160	CTC	2	6	847203	847208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242632
16101	NC_014160	GCT	2	6	847236	847241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242632
16102	NC_014160	TTTA	2	8	847266	847273	25 %	75 %	0 %	0 %	296242632
16103	NC_014160	CAG	2	6	847292	847297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242632
16104	NC_014160	CT	3	6	847348	847353	0 %	50 %	0 %	50 %	296242632
16105	NC_014160	TCC	2	6	847424	847429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242632
16106	NC_014160	T	6	6	847441	847446	0 %	100 %	0 %	0 %	296242632
16107	NC_014160	AGA	2	6	847500	847505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242632
16108	NC_014160	AG	3	6	847606	847611	50 %	0 %	50 %	0 %	296242632
16109	NC_014160	TAG	2	6	847613	847618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242632
16110	NC_014160	CTT	2	6	847651	847656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242632
16111	NC_014160	AGGG	2	8	847668	847675	25 %	0 %	75 %	0 %	296242632
16112	NC_014160	GGA	2	6	847683	847688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242632
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16115	NC_014160	GAG	2	6	847795	847800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242632
16116	NC_014160	GAG	2	6	847860	847865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242632
16117	NC_014160	TGG	2	6	847942	847947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242633
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16119	NC_014160	CT	3	6	848025	848030	0 %	50 %	0 %	50 %	296242633
16120	NC_014160	GCT	2	6	848039	848044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242633
16121	NC_014160	ATCA	2	8	848155	848162	50 %	25 %	0 %	25 %	296242633
16122	NC_014160	CTC	2	6	848169	848174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242633
16123	NC_014160	GCAGG	2	10	848196	848205	20 %	0 %	60 %	20 %	296242633
16124	NC_014160	G	6	6	848226	848231	0 %	0 %	100 %	0 %	296242633
16125	NC_014160	GA	3	6	848302	848307	50 %	0 %	50 %	0 %	296242633
16126	NC_014160	GTGAG	2	10	848355	848364	20 %	20 %	60 %	0 %	296242633
16127	NC_014160	GAGC	2	8	848376	848383	25 %	0 %	50 %	25 %	296242633
16128	NC_014160	GTT	2	6	848390	848395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242633
16129	NC_014160	GACGAG	2	12	848431	848442	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	296242633
16130	NC_014160	GTGTTG	2	12	848451	848462	0 %	50 %	50 %	0 %	296242633
16131	NC_014160	TGA	2	6	848494	848499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242633
16132	NC_014160	GAA	2	6	848518	848523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242633
16133	NC_014160	GAGG	2	8	848563	848570	25 %	0 %	75 %	0 %	296242633
16134	NC_014160	G	6	6	848630	848635	0 %	0 %	100 %	0 %	296242633
16135	NC_014160	TCA	2	6	848666	848671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242633
16136	NC_014160	TCC	2	6	848687	848692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242633
16137	NC_014160	CAA	2	6	848742	848747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242633
16138	NC_014160	TTG	2	6	848753	848758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242633
16139	NC_014160	AGG	2	6	848765	848770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242633
16140	NC_014160	TC	3	6	848789	848794	0 %	50 %	0 %	50 %	296242633
16141	NC_014160	AGGG	2	8	848819	848826	25 %	0 %	75 %	0 %	296242633
16142	NC_014160	GA	3	6	848840	848845	50 %	0 %	50 %	0 %	296242633
16143	NC_014160	GA	3	6	848897	848902	50 %	0 %	50 %	0 %	296242633
16144	NC_014160	CAC	2	6	848920	848925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242633
16145	NC_014160	TCC	2	6	848948	848953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242633
16146	NC_014160	CGT	2	6	848962	848967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242633
16147	NC_014160	GTG	2	6	849002	849007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242633
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16150	NC_014160	ATT	2	6	849185	849190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242633
16151	NC_014160	GGC	2	6	849199	849204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242633
16152	NC_014160	TAG	2	6	849359	849364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242634
16153	NC_014160	GGTA	2	8	849408	849415	25 %	25 %	50 %	0 %	296242634
16154	NC_014160	AAG	2	6	849454	849459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242634
16155	NC_014160	ACT	2	6	849704	849709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242634
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16157	NC_014160	TAA	2	6	849762	849767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242634
16158	NC_014160	GAA	2	6	849769	849774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242634
16159	NC_014160	CTA	2	6	849861	849866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242634
16160	NC_014160	TAT	2	6	850000	850005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242634
16161	NC_014160	C	6	6	850050	850055	0 %	0 %	0 %	100 %	296242634
16162	NC_014160	GTC	2	6	850120	850125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242634
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16166	NC_014160	TCTT	2	8	850400	850407	0 %	75 %	0 %	25 %	296242634
16167	NC_014160	GCT	2	6	850438	850443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242634
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16171	NC_014160	TTCA	2	8	850585	850592	25 %	50 %	0 %	25 %	296242634
16172	NC_014160	AGA	2	6	850704	850709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242634
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16175	NC_014160	ACT	2	6	850778	850783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242634
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16181	NC_014160	TAC	2	6	851017	851022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242634
16182	NC_014160	GAGG	2	8	851041	851048	25 %	0 %	75 %	0 %	296242634
16183	NC_014160	AGG	2	6	851065	851070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242634
16184	NC_014160	GTT	2	6	851282	851287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242634
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16187	NC_014160	GAC	2	6	851402	851407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16188	NC_014160	GTTA	2	8	851457	851464	25 %	50 %	25 %	0 %	296242635
16189	NC_014160	GCAT	2	8	851487	851494	25 %	25 %	25 %	25 %	296242635
16190	NC_014160	CGG	2	6	851543	851548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242635
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16194	NC_014160	TCC	2	6	851753	851758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242635
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16198	NC_014160	TAG	2	6	851957	851962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242635
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16203	NC_014160	CTT	2	6	852161	852166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242636
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16211	NC_014160	TAA	2	6	852470	852475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16212	NC_014160	GCTT	2	8	852543	852550	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16213	NC_014160	GATG	2	8	852756	852763	25 %	25 %	50 %	0 %	296242637
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16218	NC_014160	TAT	2	6	853183	853188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16219	NC_014160	TA	3	6	853336	853341	50 %	50 %	0 %	0 %	296242638
16220	NC_014160	GAG	2	6	853348	853353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242638
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16222	NC_014160	CTGGA	2	10	853417	853426	20 %	20 %	40 %	20 %	296242638
16223	NC_014160	GGA	2	6	853463	853468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242638
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16226	NC_014160	CT	3	6	853708	853713	0 %	50 %	0 %	50 %	296242638
16227	NC_014160	TTAG	2	8	853741	853748	25 %	50 %	25 %	0 %	296242638
16228	NC_014160	CAGG	2	8	853862	853869	25 %	0 %	50 %	25 %	296242638
16229	NC_014160	TAG	2	6	853880	853885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242638
16230	NC_014160	CATA	2	8	853905	853912	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16231	NC_014160	AT	3	6	853983	853988	50 %	50 %	0 %	0 %	296242639
16232	NC_014160	TGGA	2	8	854065	854072	25 %	25 %	50 %	0 %	296242639
16233	NC_014160	AT	3	6	854227	854232	50 %	50 %	0 %	0 %	296242639
16234	NC_014160	GTTA	2	8	854268	854275	25 %	50 %	25 %	0 %	296242639
16235	NC_014160	TA	3	6	854299	854304	50 %	50 %	0 %	0 %	296242639
16236	NC_014160	ACA	2	6	854485	854490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242639
16237	NC_014160	T	7	7	854542	854548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16238	NC_014160	CG	3	6	854562	854567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16239	NC_014160	ATA	2	6	854589	854594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16240	NC_014160	AT	4	8	854622	854629	50 %	50 %	0 %	0 %	296242640
16241	NC_014160	CGACGG	2	12	854894	854905	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296242640
16242	NC_014160	ATG	2	6	854983	854988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242640
16243	NC_014160	CAA	2	6	855063	855068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242640
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16349	NC_014160	ACA	3	9	861033	861041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16351	NC_014160	GTC	2	6	861068	861073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16353	NC_014160	CAT	2	6	861200	861205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16355	NC_014160	AATC	2	8	861272	861279	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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16487	NC_014160	CTA	2	6	868293	868298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242654
16488	NC_014160	CTA	2	6	868310	868315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242654
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