MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 24968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_014160	TGC	2	6	790329	790334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242560
15003	NC_014160	GGA	2	6	790335	790340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242560
15004	NC_014160	AGGG	2	8	790442	790449	25 %	0 %	75 %	0 %	296242561
15005	NC_014160	CCTT	2	8	790494	790501	0 %	50 %	0 %	50 %	296242561
15006	NC_014160	AGG	2	6	790504	790509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242561
15007	NC_014160	GAG	2	6	790529	790534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242561
15008	NC_014160	GCA	2	6	790544	790549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242561
15009	NC_014160	C	6	6	790611	790616	0 %	0 %	0 %	100 %	296242561
15010	NC_014160	TAC	2	6	790664	790669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242561
15011	NC_014160	ATG	2	6	790673	790678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242561
15012	NC_014160	GCA	2	6	790691	790696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242561
15013	NC_014160	AAG	2	6	790706	790711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242561
15014	NC_014160	TAG	2	6	790743	790748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242561
15015	NC_014160	GGT	2	6	790813	790818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242561
15016	NC_014160	GGCG	2	8	790834	790841	0 %	0 %	75 %	25 %	296242561
15017	NC_014160	GAT	2	6	790843	790848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242561
15018	NC_014160	AT	3	6	790862	790867	50 %	50 %	0 %	0 %	296242561
15019	NC_014160	GCA	2	6	790888	790893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242561
15020	NC_014160	TCC	2	6	790900	790905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242561
15021	NC_014160	AAG	2	6	790925	790930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242561
15022	NC_014160	TCG	2	6	790950	790955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242561
15023	NC_014160	TTG	2	6	791031	791036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242561
15024	NC_014160	CCT	3	9	791174	791182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242562
15025	NC_014160	CCT	2	6	791231	791236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242562
15026	NC_014160	CT	3	6	791281	791286	0 %	50 %	0 %	50 %	296242562
15027	NC_014160	TAA	2	6	791300	791305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242562
15028	NC_014160	ATT	2	6	791344	791349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15029	NC_014160	AAG	2	6	791398	791403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242563
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15031	NC_014160	CT	3	6	791431	791436	0 %	50 %	0 %	50 %	296242563
15032	NC_014160	TGAAGC	2	12	791480	791491	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296242563
15033	NC_014160	TGG	2	6	791513	791518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242563
15034	NC_014160	GAA	2	6	791567	791572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242563
15035	NC_014160	AGA	2	6	791577	791582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15036	NC_014160	TTC	2	6	791769	791774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242564
15037	NC_014160	CAGC	2	8	791876	791883	25 %	0 %	25 %	50 %	296242564
15038	NC_014160	TGT	2	6	792041	792046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242564
15039	NC_014160	CTT	2	6	792072	792077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242564
15040	NC_014160	AT	3	6	792160	792165	50 %	50 %	0 %	0 %	296242564
15041	NC_014160	TGT	2	6	792194	792199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242564
15042	NC_014160	TC	3	6	792204	792209	0 %	50 %	0 %	50 %	296242564
15043	NC_014160	GCC	2	6	792211	792216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242564
15044	NC_014160	CCAAT	2	10	792230	792239	40 %	20 %	0 %	40 %	296242564
15045	NC_014160	GGC	2	6	792333	792338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242564
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15048	NC_014160	GAG	2	6	792406	792411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242564
15049	NC_014160	TTACC	2	10	792434	792443	20 %	40 %	0 %	40 %	296242564
15050	NC_014160	TGT	2	6	792530	792535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242564
15051	NC_014160	CTGGG	2	10	792556	792565	0 %	20 %	60 %	20 %	296242564
15052	NC_014160	CTT	2	6	792580	792585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242565
15053	NC_014160	GAA	2	6	792595	792600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242565
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15056	NC_014160	CTC	2	6	792838	792843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242565
15057	NC_014160	CCG	2	6	792998	793003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242565
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15084	NC_014160	TA	3	6	794653	794658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15085	NC_014160	GTAAA	2	10	794684	794693	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15086	NC_014160	TCCT	2	8	794736	794743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15087	NC_014160	GTCGC	2	10	794762	794771	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15088	NC_014160	TAA	2	6	794811	794816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15089	NC_014160	A	6	6	794865	794870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15102	NC_014160	CGA	2	6	795756	795761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242568
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15106	NC_014160	TCT	2	6	795946	795951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15107	NC_014160	AAGATT	2	12	795967	795978	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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15109	NC_014160	CCCCT	2	10	796197	796206	0 %	20 %	0 %	80 %	296242569
15110	NC_014160	AGGG	2	8	796249	796256	25 %	0 %	75 %	0 %	296242569
15111	NC_014160	GGA	2	6	796266	796271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242569
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15363	NC_014160	GGCA	2	8	809966	809973	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15364	NC_014160	AGGCC	2	10	810003	810012	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15365	NC_014160	CCA	2	6	810077	810082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242582
15366	NC_014160	TTC	2	6	810175	810180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242582
15367	NC_014160	CTT	2	6	810252	810257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242582
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15371	NC_014160	CTC	2	6	810432	810437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242582
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15379	NC_014160	TAA	2	6	810907	810912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15380	NC_014160	TCCA	2	8	810913	810920	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15381	NC_014160	AG	3	6	810994	810999	50 %	0 %	50 %	0 %	296242583
15382	NC_014160	GGA	2	6	811001	811006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242583
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15387	NC_014160	GAG	2	6	811491	811496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242583
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15391	NC_014160	AAG	2	6	811581	811586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242583
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15420	NC_014160	GGT	2	6	813223	813228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15482	NC_014160	AGG	2	6	816250	816255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242588
15483	NC_014160	ATC	2	6	816287	816292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242588
15484	NC_014160	AGG	3	9	816319	816327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242588
15485	NC_014160	GA	3	6	816328	816333	50 %	0 %	50 %	0 %	296242588
15486	NC_014160	CGT	2	6	816351	816356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242588
15487	NC_014160	TC	3	6	816399	816404	0 %	50 %	0 %	50 %	296242588
15488	NC_014160	CCT	2	6	816410	816415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242588
15489	NC_014160	CGT	2	6	816459	816464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242588
15490	NC_014160	CAG	2	6	816631	816636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242588
15491	NC_014160	GGC	2	6	816666	816671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242588
15492	NC_014160	CTCC	2	8	816710	816717	0 %	25 %	0 %	75 %	296242588
15493	NC_014160	CGA	2	6	816723	816728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242588
15494	NC_014160	TGA	2	6	816743	816748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242588
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15497	NC_014160	GAG	2	6	816951	816956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242589
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15499	NC_014160	AGG	2	6	817008	817013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242589
15500	NC_014160	CTC	2	6	817050	817055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242589

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