MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 24968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014160	CGC	2	6	53665	53670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_014160	CAC	2	6	53720	53725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_014160	CAG	2	6	53783	53788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_014160	GAG	2	6	53827	53832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_014160	CGAG	2	8	53885	53892	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1006	NC_014160	G	6	6	53940	53945	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_014160	GCC	2	6	53949	53954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_014160	GGA	2	6	53964	53969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_014160	AGG	2	6	53970	53975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_014160	CGC	2	6	54083	54088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_014160	CG	3	6	54142	54147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_014160	CG	3	6	54155	54160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_014160	CA	3	6	54183	54188	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_014160	GGTCG	2	10	54238	54247	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1015	NC_014160	CTCCCT	2	12	54250	54261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_014160	G	6	6	54264	54269	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_014160	CCT	2	6	54315	54320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1018	NC_014160	GCT	2	6	54345	54350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_014160	CTC	2	6	54379	54384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_014160	CTC	2	6	54506	54511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_014160	GCG	2	6	54524	54529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_014160	CGC	2	6	54534	54539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_014160	GGCTC	2	10	54549	54558	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1024	NC_014160	AGC	2	6	54609	54614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_014160	GTG	2	6	54663	54668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_014160	CGGG	2	8	54679	54686	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1027	NC_014160	C	6	6	54689	54694	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1028	NC_014160	TAG	2	6	54709	54714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_014160	GAG	2	6	54718	54723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_014160	AATC	2	8	54728	54735	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_014160	CCAAA	2	10	54774	54783	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
1032	NC_014160	GA	3	6	54803	54808	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_014160	CCGT	2	8	55183	55190	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_014160	CGTAGG	2	12	55248	55259	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1035	NC_014160	GGC	2	6	55287	55292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_014160	CCG	2	6	55478	55483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_014160	CAGCC	2	10	55494	55503	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1038	NC_014160	G	6	6	55643	55648	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_014160	AAC	2	6	55649	55654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_014160	CAG	2	6	55741	55746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_014160	CCG	2	6	55777	55782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_014160	GCCG	2	8	55817	55824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_014160	GGCG	2	8	55868	55875	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1044	NC_014160	CGG	2	6	55935	55940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_014160	CCG	2	6	55972	55977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_014160	GTC	2	6	56004	56009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_014160	G	6	6	56458	56463	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_014160	TAA	2	6	56474	56479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_014160	CT	3	6	56600	56605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_014160	GC	3	6	56640	56645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_014160	C	6	6	56723	56728	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1052	NC_014160	CGTAG	2	10	56791	56800	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1053	NC_014160	GGC	2	6	56839	56844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_014160	ACC	2	6	56853	56858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_014160	G	6	6	56893	56898	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_014160	GGC	2	6	56926	56931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_014160	CCG	2	6	56988	56993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_014160	C	6	6	57080	57085	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1059	NC_014160	GTC	2	6	57133	57138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_014160	GCA	2	6	57206	57211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_014160	GCT	2	6	57227	57232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_014160	CGT	2	6	57268	57273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_014160	G	6	6	57297	57302	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_014160	GCC	2	6	57308	57313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_014160	GCG	2	6	57349	57354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_014160	CGC	2	6	57402	57407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_014160	GGC	2	6	57457	57462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_014160	CGC	2	6	57467	57472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_014160	CGG	2	6	57483	57488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_014160	AGA	2	6	57502	57507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_014160	CGC	2	6	57565	57570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_014160	CGC	2	6	57585	57590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_014160	CTCA	2	8	57596	57603	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_014160	TCC	2	6	57712	57717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_014160	CGT	2	6	57797	57802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_014160	TCA	2	6	57804	57809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_014160	GGC	2	6	57906	57911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_014160	TTA	2	6	57924	57929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_014160	GGT	2	6	57950	57955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_014160	GGT	2	6	57973	57978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_014160	GAT	2	6	58001	58006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241810
1082	NC_014160	TCT	2	6	58045	58050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241810
1083	NC_014160	CTC	2	6	58053	58058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241810
1084	NC_014160	GGC	2	6	58232	58237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296241810
1085	NC_014160	ATT	2	6	58284	58289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241810
1086	NC_014160	CCTCGT	2	12	58301	58312	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	296241810
1087	NC_014160	TGG	2	6	58365	58370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296241810
1088	NC_014160	ACA	2	6	58395	58400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241810
1089	NC_014160	GA	3	6	58499	58504	50 %	0 %	50 %	0 %	296241810
1090	NC_014160	CAG	2	6	58582	58587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241810
1091	NC_014160	GCA	2	6	58609	58614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241810
1092	NC_014160	TCA	2	6	58707	58712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241810
1093	NC_014160	GGA	2	6	58757	58762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241810
1094	NC_014160	CTC	2	6	58791	58796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241810
1095	NC_014160	TAG	2	6	58817	58822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241810
1096	NC_014160	CTA	2	6	58887	58892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241811
1097	NC_014160	GAA	2	6	58894	58899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241811
1098	NC_014160	AAT	2	6	59029	59034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241811
1099	NC_014160	CCG	2	6	59222	59227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296241811
1100	NC_014160	TTA	2	6	59289	59294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241811
1101	NC_014160	TCC	2	6	59316	59321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241811
1102	NC_014160	GAA	2	6	59328	59333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241811
1103	NC_014160	GGA	2	6	59420	59425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241811
1104	NC_014160	GCG	2	6	59489	59494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296241811
1105	NC_014160	GAA	2	6	59521	59526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241811
1106	NC_014160	TAT	2	6	59595	59600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241811
1107	NC_014160	TCAA	2	8	59682	59689	50 %	25 %	0 %	25 %	296241811
1108	NC_014160	CTT	2	6	59724	59729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241812
1109	NC_014160	AT	3	6	59886	59891	50 %	50 %	0 %	0 %	296241812
1110	NC_014160	CTC	2	6	59976	59981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241812
1111	NC_014160	TTC	2	6	60061	60066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241812
1112	NC_014160	GAGT	2	8	60094	60101	25 %	25 %	50 %	0 %	296241812
1113	NC_014160	TAG	2	6	60111	60116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241812
1114	NC_014160	TCC	2	6	60181	60186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241812
1115	NC_014160	CAA	2	6	60351	60356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241812
1116	NC_014160	TGA	2	6	60519	60524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241812
1117	NC_014160	CAA	2	6	60557	60562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241812
1118	NC_014160	C	6	6	60571	60576	0 %	0 %	0 %	100 %	296241812
1119	NC_014160	CTTG	2	8	60646	60653	0 %	50 %	25 %	25 %	296241812
1120	NC_014160	TCC	2	6	60676	60681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241812
1121	NC_014160	ATTTA	2	10	60695	60704	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_014160	TAAA	2	8	60717	60724	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_014160	AGA	2	6	60753	60758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241813
1124	NC_014160	AGT	2	6	60777	60782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241813
1125	NC_014160	TAG	2	6	60824	60829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241813
1126	NC_014160	CAT	2	6	60873	60878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241813
1127	NC_014160	GAT	2	6	60898	60903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241813
1128	NC_014160	AT	3	6	61065	61070	50 %	50 %	0 %	0 %	296241813
1129	NC_014160	GGCG	2	8	61077	61084	0 %	0 %	75 %	25 %	296241813
1130	NC_014160	CAA	2	6	61101	61106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241813
1131	NC_014160	CCT	2	6	61168	61173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241813
1132	NC_014160	GAA	2	6	61203	61208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241813
1133	NC_014160	GAA	2	6	61281	61286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241813
1134	NC_014160	GGA	2	6	61295	61300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241813
1135	NC_014160	GTT	2	6	61336	61341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241813
1136	NC_014160	TCG	2	6	61378	61383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241814
1137	NC_014160	GTC	2	6	61441	61446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241814
1138	NC_014160	ATA	2	6	61603	61608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241814
1139	NC_014160	CCT	2	6	61676	61681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241814
1140	NC_014160	ACC	2	6	61690	61695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296241814
1141	NC_014160	AAG	2	6	61815	61820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241814
1142	NC_014160	CAAC	2	8	61830	61837	50 %	0 %	0 %	50 %	296241814
1143	NC_014160	ACCTA	2	10	61841	61850	40 %	20 %	0 %	40 %	296241815
1144	NC_014160	CTC	2	6	61889	61894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241815
1145	NC_014160	GTA	2	6	61935	61940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241815
1146	NC_014160	ATC	2	6	61980	61985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241815
1147	NC_014160	GAC	2	6	62046	62051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241815
1148	NC_014160	TC	3	6	62080	62085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1149	NC_014160	TAAG	2	8	62090	62097	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1150	NC_014160	TAA	2	6	62114	62119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1151	NC_014160	AT	4	8	62159	62166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1152	NC_014160	GGT	2	6	62167	62172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1153	NC_014160	AGG	2	6	62286	62291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241816
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1156	NC_014160	TCA	2	6	62438	62443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241816
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1158	NC_014160	GAG	2	6	62504	62509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241816
1159	NC_014160	ATC	2	6	62512	62517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241816
1160	NC_014160	TAT	2	6	62518	62523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241816
1161	NC_014160	GAG	2	6	62549	62554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241816
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1164	NC_014160	AAG	2	6	62655	62660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241816
1165	NC_014160	GGA	2	6	62711	62716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241816
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1168	NC_014160	TCA	2	6	62949	62954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241816
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1173	NC_014160	CAG	2	6	63176	63181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241817
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1177	NC_014160	TGAG	2	8	63442	63449	25 %	25 %	50 %	0 %	296241817
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1243	NC_014160	GAAA	2	8	67114	67121	75 %	0 %	25 %	0 %	296241820
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1247	NC_014160	GAAT	2	8	67339	67346	50 %	25 %	25 %	0 %	296241821
1248	NC_014160	CTCA	2	8	67380	67387	25 %	25 %	0 %	50 %	296241821
1249	NC_014160	GAA	2	6	67410	67415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241821
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1255	NC_014160	AG	3	6	67698	67703	50 %	0 %	50 %	0 %	296241821
1256	NC_014160	GGA	2	6	67745	67750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241821
1257	NC_014160	ACC	2	6	67835	67840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296241821
1258	NC_014160	GA	3	6	68025	68030	50 %	0 %	50 %	0 %	296241821
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