MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 24968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_014160	A	6	6	682706	682711	100 %	0 %	0 %	0 %	296242459
13002	NC_014160	TGG	2	6	682763	682768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242459
13003	NC_014160	ACTCC	2	10	682821	682830	20 %	20 %	0 %	60 %	296242459
13004	NC_014160	TTG	2	6	682852	682857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242459
13005	NC_014160	ATA	2	6	682867	682872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242459
13006	NC_014160	GGC	2	6	683049	683054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242459
13007	NC_014160	TC	4	8	683062	683069	0 %	50 %	0 %	50 %	296242459
13008	NC_014160	CTTCTC	2	12	683076	683087	0 %	50 %	0 %	50 %	296242459
13009	NC_014160	AAT	2	6	683210	683215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242459
13010	NC_014160	CAAC	2	8	683324	683331	50 %	0 %	0 %	50 %	296242459
13011	NC_014160	CTT	2	6	683385	683390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242459
13012	NC_014160	GTA	2	6	683526	683531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242459
13013	NC_014160	CAAG	2	8	683566	683573	50 %	0 %	25 %	25 %	296242459
13014	NC_014160	AG	3	6	683579	683584	50 %	0 %	50 %	0 %	296242459
13015	NC_014160	TCA	2	6	683602	683607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242459
13016	NC_014160	TGA	2	6	683642	683647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242459
13017	NC_014160	ATT	2	6	683661	683666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242459
13018	NC_014160	ACTA	2	8	683675	683682	50 %	25 %	0 %	25 %	296242459
13019	NC_014160	CTT	2	6	683806	683811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242460
13020	NC_014160	ATC	2	6	683852	683857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242460
13021	NC_014160	GT	3	6	683945	683950	0 %	50 %	50 %	0 %	296242460
13022	NC_014160	CCT	2	6	683969	683974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242460
13023	NC_014160	CGGA	2	8	684000	684007	25 %	0 %	50 %	25 %	296242460
13024	NC_014160	TAT	2	6	684022	684027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242460
13025	NC_014160	GAT	2	6	684037	684042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242460
13026	NC_014160	CACTC	2	10	684060	684069	20 %	20 %	0 %	60 %	296242460
13027	NC_014160	CTA	2	6	684077	684082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242460
13028	NC_014160	TAGA	2	8	684108	684115	50 %	25 %	25 %	0 %	296242460
13029	NC_014160	GTG	2	6	684127	684132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242460
13030	NC_014160	TAAC	2	8	684143	684150	50 %	25 %	0 %	25 %	296242460
13031	NC_014160	GGA	2	6	684198	684203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242460
13032	NC_014160	TG	3	6	684283	684288	0 %	50 %	50 %	0 %	296242460
13033	NC_014160	CTCG	2	8	684316	684323	0 %	25 %	25 %	50 %	296242460
13034	NC_014160	AT	4	8	684341	684348	50 %	50 %	0 %	0 %	296242460
13035	NC_014160	AT	3	6	684388	684393	50 %	50 %	0 %	0 %	296242460
13036	NC_014160	AAG	3	9	684459	684467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242460
13037	NC_014160	TAA	3	9	684592	684600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_014160	GGA	2	6	684632	684637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242461
13039	NC_014160	AG	3	6	684644	684649	50 %	0 %	50 %	0 %	296242461
13040	NC_014160	GGA	2	6	684669	684674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242461
13041	NC_014160	ACGC	2	8	684734	684741	25 %	0 %	25 %	50 %	296242461
13042	NC_014160	CCG	2	6	684815	684820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242461
13043	NC_014160	A	6	6	684829	684834	100 %	0 %	0 %	0 %	296242461
13044	NC_014160	CA	3	6	684835	684840	50 %	0 %	0 %	50 %	296242461
13045	NC_014160	CACT	2	8	684842	684849	25 %	25 %	0 %	50 %	296242461
13046	NC_014160	AGG	2	6	684980	684985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242461
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13048	NC_014160	AGG	2	6	685103	685108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242461
13049	NC_014160	ATT	2	6	685117	685122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242461
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13051	NC_014160	GAA	2	6	685155	685160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242461
13052	NC_014160	AAC	2	6	685347	685352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242462
13053	NC_014160	CCG	2	6	685453	685458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242462
13054	NC_014160	ATT	2	6	685504	685509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242462
13055	NC_014160	TCC	2	6	685510	685515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242462
13056	NC_014160	TTCTCC	2	12	685639	685650	0 %	50 %	0 %	50 %	296242462
13057	NC_014160	AT	3	6	685753	685758	50 %	50 %	0 %	0 %	296242462
13058	NC_014160	T	6	6	685781	685786	0 %	100 %	0 %	0 %	296242462
13059	NC_014160	CAA	2	6	685790	685795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242462
13060	NC_014160	TAT	2	6	685866	685871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242462
13061	NC_014160	CTC	2	6	685877	685882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242462
13062	NC_014160	CGC	2	6	685919	685924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242462
13063	NC_014160	ACT	2	6	685936	685941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242462
13064	NC_014160	TGC	2	6	686006	686011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242462
13065	NC_014160	ACA	2	6	686032	686037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242462
13066	NC_014160	CGA	2	6	686183	686188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242462
13067	NC_014160	AGT	2	6	686207	686212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242462
13068	NC_014160	ACT	2	6	686227	686232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242462
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13070	NC_014160	CTAT	2	8	686302	686309	25 %	50 %	0 %	25 %	296242462
13071	NC_014160	CG	3	6	686341	686346	0 %	0 %	50 %	50 %	296242462
13072	NC_014160	TCT	2	6	686369	686374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242462
13073	NC_014160	AAG	2	6	686389	686394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242462
13074	NC_014160	AT	3	6	686464	686469	50 %	50 %	0 %	0 %	296242462
13075	NC_014160	GGT	2	6	686511	686516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13076	NC_014160	ATA	2	6	686658	686663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242463
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13082	NC_014160	CT	3	6	687071	687076	0 %	50 %	0 %	50 %	296242464
13083	NC_014160	CTT	2	6	687124	687129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242464
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13087	NC_014160	TGGC	2	8	687483	687490	0 %	25 %	50 %	25 %	296242464
13088	NC_014160	TGC	2	6	687491	687496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242464
13089	NC_014160	CT	3	6	687505	687510	0 %	50 %	0 %	50 %	296242464
13090	NC_014160	CTT	2	6	687542	687547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242464
13091	NC_014160	TC	3	6	687566	687571	0 %	50 %	0 %	50 %	296242464
13092	NC_014160	CT	3	6	687578	687583	0 %	50 %	0 %	50 %	296242464
13093	NC_014160	GTC	2	6	687638	687643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242464
13094	NC_014160	CATAC	2	10	687875	687884	40 %	20 %	0 %	40 %	296242464
13095	NC_014160	CTC	2	6	687986	687991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242464
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13097	NC_014160	TCG	2	6	688044	688049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242464
13098	NC_014160	AT	3	6	688115	688120	50 %	50 %	0 %	0 %	296242464
13099	NC_014160	CTA	2	6	688195	688200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242464
13100	NC_014160	AT	3	6	688276	688281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13101	NC_014160	ATC	2	6	688284	688289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13102	NC_014160	CT	3	6	688407	688412	0 %	50 %	0 %	50 %	296242465
13103	NC_014160	ACC	2	6	688445	688450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242465
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13105	NC_014160	TGA	2	6	688495	688500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242465
13106	NC_014160	ACA	2	6	688507	688512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242465
13107	NC_014160	CAA	2	6	688626	688631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242465
13108	NC_014160	CAAG	2	8	688647	688654	50 %	0 %	25 %	25 %	296242465
13109	NC_014160	ACC	2	6	688718	688723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242465
13110	NC_014160	CAC	2	6	688725	688730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242465
13111	NC_014160	AGCA	2	8	688777	688784	50 %	0 %	25 %	25 %	296242465
13112	NC_014160	ACC	2	6	688862	688867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242465
13113	NC_014160	GCC	2	6	688985	688990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242466
13114	NC_014160	TA	3	6	689008	689013	50 %	50 %	0 %	0 %	296242466
13115	NC_014160	CGA	2	6	689035	689040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242466
13116	NC_014160	GA	3	6	689109	689114	50 %	0 %	50 %	0 %	296242466
13117	NC_014160	CCT	2	6	689124	689129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242466
13118	NC_014160	ACC	2	6	689133	689138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242466
13119	NC_014160	TAT	2	6	689147	689152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242466
13120	NC_014160	AGG	2	6	689171	689176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242466
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13122	NC_014160	ACAT	2	8	689208	689215	50 %	25 %	0 %	25 %	296242466
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