MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 24968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_014160	AT	3	6	629352	629357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12002	NC_014160	GAT	2	6	629360	629365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12003	NC_014160	GGA	2	6	629415	629420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242404
12004	NC_014160	AAT	2	6	629553	629558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242404
12005	NC_014160	TTCA	2	8	629598	629605	25 %	50 %	0 %	25 %	296242404
12006	NC_014160	TTG	2	6	629615	629620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242404
12007	NC_014160	TAA	2	6	629678	629683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242404
12008	NC_014160	CCT	2	6	629729	629734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242404
12009	NC_014160	CGA	2	6	629757	629762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242404
12010	NC_014160	TGG	2	6	629870	629875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242404
12011	NC_014160	A	6	6	629881	629886	100 %	0 %	0 %	0 %	296242404
12012	NC_014160	AGC	2	6	629955	629960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242404
12013	NC_014160	TCC	2	6	629984	629989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242404
12014	NC_014160	TCA	2	6	630034	630039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242404
12015	NC_014160	GAA	2	6	630075	630080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242404
12016	NC_014160	TCT	2	6	630095	630100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242404
12017	NC_014160	CGAG	2	8	630101	630108	25 %	0 %	50 %	25 %	296242404
12018	NC_014160	GGA	2	6	630130	630135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242404
12019	NC_014160	AAGC	2	8	630141	630148	50 %	0 %	25 %	25 %	296242404
12020	NC_014160	TGG	2	6	630160	630165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242404
12021	NC_014160	AGG	2	6	630176	630181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242404
12022	NC_014160	AAC	2	6	630204	630209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242404
12023	NC_014160	TTG	2	6	630322	630327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242404
12024	NC_014160	GAC	2	6	630426	630431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242405
12025	NC_014160	GAG	2	6	630632	630637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242405
12026	NC_014160	ATCA	2	8	630711	630718	50 %	25 %	0 %	25 %	296242405
12027	NC_014160	ATT	2	6	630728	630733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242405
12028	NC_014160	GAA	2	6	631119	631124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242405
12029	NC_014160	GTT	2	6	631257	631262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242405
12030	NC_014160	T	6	6	631275	631280	0 %	100 %	0 %	0 %	296242405
12031	NC_014160	CTA	2	6	631327	631332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242405
12032	NC_014160	TG	3	6	631392	631397	0 %	50 %	50 %	0 %	296242405
12033	NC_014160	CCT	2	6	631401	631406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242405
12034	NC_014160	CCAC	2	8	631411	631418	25 %	0 %	0 %	75 %	296242405
12035	NC_014160	GT	3	6	631497	631502	0 %	50 %	50 %	0 %	296242405
12036	NC_014160	GGGAA	2	10	631524	631533	40 %	0 %	60 %	0 %	296242405
12037	NC_014160	TCAAG	2	10	631561	631570	40 %	20 %	20 %	20 %	296242405
12038	NC_014160	ATA	2	6	631593	631598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242405
12039	NC_014160	GTAT	2	8	631735	631742	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12040	NC_014160	ATT	2	6	631753	631758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12041	NC_014160	TGG	2	6	631792	631797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12042	NC_014160	AAG	2	6	631822	631827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242406
12043	NC_014160	CGG	2	6	631908	631913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242406
12044	NC_014160	C	6	6	631927	631932	0 %	0 %	0 %	100 %	296242406
12045	NC_014160	CGG	2	6	632059	632064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242406
12046	NC_014160	AAT	2	6	632086	632091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242406
12047	NC_014160	TAT	2	6	632121	632126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242406
12048	NC_014160	CTA	2	6	632136	632141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242406
12049	NC_014160	TGA	2	6	632152	632157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242406
12050	NC_014160	ATCCCG	2	12	632259	632270	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	296242406
12051	NC_014160	CTATT	2	10	632307	632316	20 %	60 %	0 %	20 %	296242406
12052	NC_014160	ATA	2	6	632345	632350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242406
12053	NC_014160	GAG	2	6	632354	632359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242406
12054	NC_014160	TG	3	6	632398	632403	0 %	50 %	50 %	0 %	296242406
12055	NC_014160	TA	3	6	632407	632412	50 %	50 %	0 %	0 %	296242406
12056	NC_014160	GAC	2	6	632445	632450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242406
12057	NC_014160	GTG	2	6	632492	632497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242406
12058	NC_014160	TGG	2	6	632527	632532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242406
12059	NC_014160	CGA	2	6	632562	632567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242406
12060	NC_014160	TATT	2	8	632777	632784	25 %	75 %	0 %	0 %	296242406
12061	NC_014160	GGCTGG	2	12	632811	632822	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	296242406
12062	NC_014160	GAG	2	6	632852	632857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242406
12063	NC_014160	GAC	2	6	632942	632947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242406
12064	NC_014160	TAA	2	6	632996	633001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242406
12065	NC_014160	T	6	6	633034	633039	0 %	100 %	0 %	0 %	296242407
12066	NC_014160	TAA	2	6	633054	633059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242407
12067	NC_014160	GGGT	2	8	633083	633090	0 %	25 %	75 %	0 %	296242407
12068	NC_014160	CAG	2	6	633108	633113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242407
12069	NC_014160	ACT	2	6	633151	633156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242407
12070	NC_014160	GGA	2	6	633172	633177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242407
12071	NC_014160	GA	3	6	633185	633190	50 %	0 %	50 %	0 %	296242407
12072	NC_014160	AGG	3	9	633282	633290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242407
12073	NC_014160	GAG	2	6	633314	633319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242407
12074	NC_014160	AG	3	6	633376	633381	50 %	0 %	50 %	0 %	296242407
12075	NC_014160	GAA	2	6	633441	633446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242407
12076	NC_014160	CTAA	2	8	633527	633534	50 %	25 %	0 %	25 %	296242407
12077	NC_014160	A	6	6	633558	633563	100 %	0 %	0 %	0 %	296242407
12078	NC_014160	CCA	2	6	633782	633787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242408
12079	NC_014160	AGG	2	6	633887	633892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242408
12080	NC_014160	ATT	2	6	633895	633900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242408
12081	NC_014160	TTC	2	6	633922	633927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242408
12082	NC_014160	TC	4	8	633967	633974	0 %	50 %	0 %	50 %	296242408
12083	NC_014160	GTT	2	6	634011	634016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242408
12084	NC_014160	CGA	2	6	634020	634025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242408
12085	NC_014160	CAG	2	6	634038	634043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242408
12086	NC_014160	CTCG	2	8	634047	634054	0 %	25 %	25 %	50 %	296242408
12087	NC_014160	CTA	2	6	634090	634095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242408
12088	NC_014160	GCT	2	6	634132	634137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242408
12089	NC_014160	AGT	2	6	634247	634252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242408
12090	NC_014160	TCA	2	6	634262	634267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242408
12091	NC_014160	TCA	2	6	634318	634323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242408
12092	NC_014160	ATA	2	6	634324	634329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242408
12093	NC_014160	GAG	2	6	634402	634407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242408
12094	NC_014160	AT	3	6	634496	634501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12095	NC_014160	GTG	2	6	634527	634532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12096	NC_014160	CCTT	2	8	634565	634572	0 %	50 %	0 %	50 %	296242409
12097	NC_014160	ACT	2	6	634601	634606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242409
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12100	NC_014160	TGA	2	6	634697	634702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242409
12101	NC_014160	AGT	2	6	634711	634716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242409
12102	NC_014160	CTA	2	6	634767	634772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242409
12103	NC_014160	CAT	2	6	634821	634826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242409
12104	NC_014160	AG	3	6	634839	634844	50 %	0 %	50 %	0 %	296242409
12105	NC_014160	AGA	2	6	634917	634922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242409
12106	NC_014160	CAG	2	6	634930	634935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242409
12107	NC_014160	GA	3	6	634936	634941	50 %	0 %	50 %	0 %	296242409
12108	NC_014160	ACT	2	6	634988	634993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242409
12109	NC_014160	ACCA	2	8	635060	635067	50 %	0 %	0 %	50 %	296242409
12110	NC_014160	GGC	2	6	635125	635130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242409
12111	NC_014160	TC	3	6	635142	635147	0 %	50 %	0 %	50 %	296242409
12112	NC_014160	GAA	2	6	635328	635333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242409
12113	NC_014160	TACG	2	8	635340	635347	25 %	25 %	25 %	25 %	296242409
12114	NC_014160	CTAT	2	8	635365	635372	25 %	50 %	0 %	25 %	296242409
12115	NC_014160	AGG	2	6	635439	635444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242409
12116	NC_014160	CTT	2	6	635476	635481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242409
12117	NC_014160	GA	3	6	635513	635518	50 %	0 %	50 %	0 %	296242409
12118	NC_014160	AAC	2	6	635562	635567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242409
12119	NC_014160	TAG	2	6	635611	635616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242409
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12121	NC_014160	GTTT	2	8	635691	635698	0 %	75 %	25 %	0 %	296242410
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12242	NC_014160	TGA	2	6	642033	642038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242418
12243	NC_014160	AGA	2	6	642150	642155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242418
12244	NC_014160	ACT	2	6	642156	642161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242418
12245	NC_014160	AGGC	2	8	642163	642170	25 %	0 %	50 %	25 %	296242418
12246	NC_014160	AG	4	8	642230	642237	50 %	0 %	50 %	0 %	296242418
12247	NC_014160	CGA	2	6	642291	642296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242418
12248	NC_014160	ACA	2	6	642366	642371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242418
12249	NC_014160	TAC	2	6	642505	642510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242418
12250	NC_014160	CCT	2	6	642543	642548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242418
12251	NC_014160	ACC	2	6	642597	642602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242418
12252	NC_014160	CTACA	2	10	642727	642736	40 %	20 %	0 %	40 %	296242418
12253	NC_014160	AGGA	2	8	642796	642803	50 %	0 %	50 %	0 %	296242418
12254	NC_014160	GGA	2	6	642909	642914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242418
12255	NC_014160	GAA	2	6	642931	642936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242418
12256	NC_014160	GCG	2	6	643003	643008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242418
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12261	NC_014160	AAG	2	6	643306	643311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242418
12262	NC_014160	TTC	2	6	643334	643339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12263	NC_014160	ATT	2	6	643501	643506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242419
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12266	NC_014160	AAGAT	2	10	643607	643616	60 %	20 %	20 %	0 %	296242419
12267	NC_014160	A	7	7	643635	643641	100 %	0 %	0 %	0 %	296242419
12268	NC_014160	GCC	2	6	643824	643829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12269	NC_014160	CAC	2	6	643830	643835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12270	NC_014160	ATT	2	6	643965	643970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242420
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12272	NC_014160	T	6	6	644001	644006	0 %	100 %	0 %	0 %	296242420
12273	NC_014160	TTA	2	6	644066	644071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242420
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12299	NC_014160	CTC	2	6	645088	645093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12300	NC_014160	T	6	6	645143	645148	0 %	100 %	0 %	0 %	296242422
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12315	NC_014160	CCATG	2	10	645739	645748	20 %	20 %	20 %	40 %	296242422
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12317	NC_014160	TA	3	6	645791	645796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12330	NC_014160	GGGAAC	2	12	646445	646456	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	296242423
12331	NC_014160	GAC	2	6	646518	646523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242423
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12338	NC_014160	GAA	2	6	647319	647324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242424
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12343	NC_014160	GCAG	2	8	647898	647905	25 %	0 %	50 %	25 %	296242424
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12347	NC_014160	AAG	2	6	648030	648035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242424
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12351	NC_014160	AGT	2	6	648185	648190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242424
12352	NC_014160	A	7	7	648201	648207	100 %	0 %	0 %	0 %	296242424
12353	NC_014160	GAT	2	6	648237	648242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242424
12354	NC_014160	TAG	2	6	648257	648262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242424
12355	NC_014160	GATA	2	8	648353	648360	50 %	25 %	25 %	0 %	296242424
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12357	NC_014160	AGT	2	6	648390	648395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242424
12358	NC_014160	CAT	2	6	648441	648446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242424
12359	NC_014160	ATA	2	6	648471	648476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242424
12360	NC_014160	GAC	2	6	648489	648494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242424
12361	NC_014160	GAAAA	2	10	648531	648540	80 %	0 %	20 %	0 %	296242424
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12363	NC_014160	AG	3	6	648608	648613	50 %	0 %	50 %	0 %	296242424
12364	NC_014160	GAA	2	6	648627	648632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242424
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12368	NC_014160	TGA	2	6	648767	648772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242424
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12384	NC_014160	TGCT	2	8	649950	649957	0 %	50 %	25 %	25 %	296242425
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12391	NC_014160	TTC	2	6	650562	650567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242425
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12470	NC_014160	TA	3	6	654008	654013	50 %	50 %	0 %	0 %	296242431
12471	NC_014160	AGCCT	2	10	654042	654051	20 %	20 %	20 %	40 %	296242431
12472	NC_014160	AT	3	6	654060	654065	50 %	50 %	0 %	0 %	296242431
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12482	NC_014160	GAA	2	6	654677	654682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242431
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12485	NC_014160	ATA	2	6	654726	654731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242431
12486	NC_014160	CCAT	2	8	654816	654823	25 %	25 %	0 %	50 %	296242431
12487	NC_014160	GAA	2	6	654843	654848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242431
12488	NC_014160	AGA	2	6	654967	654972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242431
12489	NC_014160	GCT	2	6	654978	654983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242431
12490	NC_014160	GAG	2	6	655185	655190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242431
12491	NC_014160	GATAT	2	10	655249	655258	40 %	40 %	20 %	0 %	296242431
12492	NC_014160	GAA	2	6	655332	655337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242431
12493	NC_014160	A	6	6	655359	655364	100 %	0 %	0 %	0 %	296242431
12494	NC_014160	TGA	2	6	655418	655423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242431
12495	NC_014160	AAT	2	6	655490	655495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242431
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