MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 24968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_014160	ATA	2	6	577093	577098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242346
11003	NC_014160	CTT	2	6	577176	577181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242346
11004	NC_014160	GA	3	6	577254	577259	50 %	0 %	50 %	0 %	296242346
11005	NC_014160	A	6	6	577265	577270	100 %	0 %	0 %	0 %	296242346
11006	NC_014160	CAGGC	2	10	577300	577309	20 %	0 %	40 %	40 %	296242346
11007	NC_014160	GA	3	6	577320	577325	50 %	0 %	50 %	0 %	296242346
11008	NC_014160	TGA	2	6	577339	577344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_014160	TAG	2	6	577411	577416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_014160	GGC	2	6	577461	577466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242347
11011	NC_014160	CTG	2	6	577478	577483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242347
11012	NC_014160	GAA	2	6	577512	577517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242347
11013	NC_014160	TTA	2	6	577526	577531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242347
11014	NC_014160	GAA	2	6	577534	577539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242347
11015	NC_014160	AGG	2	6	577589	577594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242347
11016	NC_014160	GGA	2	6	577611	577616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242347
11017	NC_014160	GTT	2	6	577624	577629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242347
11018	NC_014160	GTT	2	6	577666	577671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242347
11019	NC_014160	CTA	2	6	577696	577701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242347
11020	NC_014160	AAG	2	6	577704	577709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242347
11021	NC_014160	AATC	2	8	577725	577732	50 %	25 %	0 %	25 %	296242347
11022	NC_014160	TGA	2	6	577742	577747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242347
11023	NC_014160	TAT	2	6	577824	577829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242347
11024	NC_014160	CAG	2	6	577919	577924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242347
11025	NC_014160	GAAAT	2	10	577955	577964	60 %	20 %	20 %	0 %	296242347
11026	NC_014160	GAA	2	6	577977	577982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242347
11027	NC_014160	ATT	2	6	577999	578004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242347
11028	NC_014160	ATGAGA	2	12	578063	578074	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	296242347
11029	NC_014160	TGG	2	6	578114	578119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242347
11030	NC_014160	TCT	2	6	578195	578200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242347
11031	NC_014160	AAG	2	6	578245	578250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242347
11032	NC_014160	CTT	2	6	578397	578402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242347
11033	NC_014160	CTG	2	6	578546	578551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242348
11034	NC_014160	CCT	2	6	578552	578557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242348
11035	NC_014160	CAAC	2	8	578636	578643	50 %	0 %	0 %	50 %	296242348
11036	NC_014160	GAA	2	6	578729	578734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242348
11037	NC_014160	TCG	2	6	578835	578840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242348
11038	NC_014160	AAG	2	6	578844	578849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242348
11039	NC_014160	ATC	2	6	578951	578956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242348
11040	NC_014160	ACT	2	6	579033	579038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242348
11041	NC_014160	CTG	2	6	579075	579080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242348
11042	NC_014160	TGGG	2	8	579288	579295	0 %	25 %	75 %	0 %	296242348
11043	NC_014160	ATA	2	6	579339	579344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242349
11044	NC_014160	AGG	2	6	579421	579426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242349
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11046	NC_014160	CAGC	2	8	579586	579593	25 %	0 %	25 %	50 %	296242349
11047	NC_014160	TAC	2	6	579601	579606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242349
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11049	NC_014160	GGA	2	6	579764	579769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242349
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11052	NC_014160	GGA	2	6	579925	579930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242349
11053	NC_014160	CTTA	2	8	580021	580028	25 %	50 %	0 %	25 %	296242349
11054	NC_014160	AGT	2	6	580091	580096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11055	NC_014160	ATC	2	6	580113	580118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11056	NC_014160	G	6	6	580144	580149	0 %	0 %	100 %	0 %	296242350
11057	NC_014160	ACC	2	6	580188	580193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242350
11058	NC_014160	ACA	2	6	580252	580257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242350
11059	NC_014160	GTT	2	6	580293	580298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242350
11060	NC_014160	AAG	2	6	580398	580403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242350
11061	NC_014160	CAG	2	6	580409	580414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242350
11062	NC_014160	GAGAAA	2	12	580419	580430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242350
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11064	NC_014160	GA	3	6	580464	580469	50 %	0 %	50 %	0 %	296242350
11065	NC_014160	CCA	2	6	580485	580490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242350
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11069	NC_014160	GAA	2	6	580755	580760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242350
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11072	NC_014160	TTA	2	6	581007	581012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242350
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11079	NC_014160	AGGG	2	8	581284	581291	25 %	0 %	75 %	0 %	296242351
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11085	NC_014160	AAACT	2	10	581653	581662	60 %	20 %	0 %	20 %	296242351
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11093	NC_014160	TGG	2	6	582127	582132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242352
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11099	NC_014160	AT	3	6	582451	582456	50 %	50 %	0 %	0 %	296242352
11100	NC_014160	A	6	6	582468	582473	100 %	0 %	0 %	0 %	296242352
11101	NC_014160	TG	3	6	582561	582566	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_014160	GTT	2	6	582621	582626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242353
11103	NC_014160	ATT	2	6	582637	582642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242353
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11105	NC_014160	CTT	2	6	582669	582674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242353
11106	NC_014160	G	6	6	582691	582696	0 %	0 %	100 %	0 %	296242353
11107	NC_014160	CAA	2	6	582716	582721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242353
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11113	NC_014160	AT	3	6	583054	583059	50 %	50 %	0 %	0 %	296242354
11114	NC_014160	GAC	2	6	583089	583094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242354
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11116	NC_014160	A	6	6	583168	583173	100 %	0 %	0 %	0 %	296242354
11117	NC_014160	ACT	2	6	583214	583219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242354
11118	NC_014160	A	6	6	583249	583254	100 %	0 %	0 %	0 %	296242354
11119	NC_014160	CT	3	6	583328	583333	0 %	50 %	0 %	50 %	296242355
11120	NC_014160	CAT	2	6	583391	583396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242355
11121	NC_014160	CCT	2	6	583441	583446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242355
11122	NC_014160	GTG	2	6	583466	583471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242355
11123	NC_014160	GTA	2	6	583487	583492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242355
11124	NC_014160	TC	3	6	583521	583526	0 %	50 %	0 %	50 %	296242355
11125	NC_014160	GGA	2	6	583567	583572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242355
11126	NC_014160	CAT	2	6	583597	583602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242355
11127	NC_014160	AATT	2	8	583675	583682	50 %	50 %	0 %	0 %	296242355
11128	NC_014160	TAA	2	6	583693	583698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242355
11129	NC_014160	CCGC	2	8	583791	583798	0 %	0 %	25 %	75 %	296242355
11130	NC_014160	CAA	2	6	583801	583806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242355
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11132	NC_014160	CTA	2	6	583867	583872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242355
11133	NC_014160	GAT	2	6	583994	583999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242355
11134	NC_014160	TGG	2	6	584014	584019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242355
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11136	NC_014160	T	6	6	584093	584098	0 %	100 %	0 %	0 %	296242355
11137	NC_014160	TTC	2	6	584289	584294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242355
11138	NC_014160	ACT	2	6	584301	584306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242355
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11144	NC_014160	GGT	2	6	584517	584522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242356
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11148	NC_014160	CCCT	2	8	584794	584801	0 %	25 %	0 %	75 %	296242357
11149	NC_014160	TA	3	6	584862	584867	50 %	50 %	0 %	0 %	296242357
11150	NC_014160	AC	3	6	584944	584949	50 %	0 %	0 %	50 %	296242357
11151	NC_014160	AT	3	6	584976	584981	50 %	50 %	0 %	0 %	296242357
11152	NC_014160	CAG	2	6	585054	585059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242357
11153	NC_014160	CT	3	6	585082	585087	0 %	50 %	0 %	50 %	296242357
11154	NC_014160	TCA	2	6	585110	585115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242357
11155	NC_014160	TCC	2	6	585118	585123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242357
11156	NC_014160	TCC	2	6	585184	585189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242358
11157	NC_014160	TCAC	2	8	585190	585197	25 %	25 %	0 %	50 %	296242358
11158	NC_014160	TC	4	8	585276	585283	0 %	50 %	0 %	50 %	296242358
11159	NC_014160	AT	3	6	585421	585426	50 %	50 %	0 %	0 %	296242358
11160	NC_014160	CAGG	2	8	585458	585465	25 %	0 %	50 %	25 %	296242358
11161	NC_014160	TCA	2	6	585470	585475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242358
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11182	NC_014160	TAT	2	6	586587	586592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242358
11183	NC_014160	CAA	2	6	586601	586606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242358
11184	NC_014160	TCC	2	6	586615	586620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242358
11185	NC_014160	TA	3	6	586670	586675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11186	NC_014160	TTTA	2	8	586679	586686	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11187	NC_014160	ATTT	2	8	586699	586706	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11188	NC_014160	A	6	6	586820	586825	100 %	0 %	0 %	0 %	296242359
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11195	NC_014160	GAAA	2	8	587116	587123	75 %	0 %	25 %	0 %	296242359
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11210	NC_014160	TAGA	2	8	588106	588113	50 %	25 %	25 %	0 %	296242361
11211	NC_014160	GAA	2	6	588146	588151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242361
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11219	NC_014160	TAG	2	6	588655	588660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242361
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11229	NC_014160	ATC	2	6	588869	588874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242361
11230	NC_014160	TACTCC	2	12	588889	588900	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	296242361
11231	NC_014160	TTG	2	6	588964	588969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242361
11232	NC_014160	CTG	2	6	588990	588995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242361
11233	NC_014160	TGA	2	6	588997	589002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242361
11234	NC_014160	AAT	2	6	589022	589027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242361
11235	NC_014160	GAA	2	6	589068	589073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242361
11236	NC_014160	ATT	2	6	589105	589110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242361
11237	NC_014160	ATA	2	6	589120	589125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242361
11238	NC_014160	AAG	2	6	589241	589246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242361
11239	NC_014160	G	6	6	589262	589267	0 %	0 %	100 %	0 %	296242361
11240	NC_014160	TC	3	6	589271	589276	0 %	50 %	0 %	50 %	296242361
11241	NC_014160	GAC	2	6	589299	589304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242361
11242	NC_014160	GTA	2	6	589308	589313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242361
11243	NC_014160	CTT	2	6	589379	589384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242361
11244	NC_014160	TAC	2	6	589446	589451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242361
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11352	NC_014160	ATT	2	6	594698	594703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242370
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11361	NC_014160	AAC	2	6	595181	595186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242371
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