MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 24968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_014160	GAC	2	6	524339	524344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242288
10002	NC_014160	GGT	2	6	524432	524437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242288
10003	NC_014160	GAG	2	6	524442	524447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242288
10004	NC_014160	GGCAT	2	10	524692	524701	20 %	20 %	40 %	20 %	296242288
10005	NC_014160	GAT	2	6	524724	524729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242288
10006	NC_014160	GAAG	2	8	524730	524737	50 %	0 %	50 %	0 %	296242288
10007	NC_014160	TGTT	2	8	524770	524777	0 %	75 %	25 %	0 %	296242288
10008	NC_014160	ATT	2	6	524796	524801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242288
10009	NC_014160	AG	4	8	524811	524818	50 %	0 %	50 %	0 %	296242288
10010	NC_014160	AGT	2	6	524835	524840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242288
10011	NC_014160	CTG	2	6	524864	524869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242288
10012	NC_014160	CAG	2	6	524904	524909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242288
10013	NC_014160	CAA	2	6	524946	524951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242288
10014	NC_014160	A	6	6	524959	524964	100 %	0 %	0 %	0 %	296242288
10015	NC_014160	ACTCC	2	10	525057	525066	20 %	20 %	0 %	60 %	296242288
10016	NC_014160	GTG	2	6	525099	525104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242288
10017	NC_014160	CGG	2	6	525131	525136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242288
10018	NC_014160	CGAG	2	8	525145	525152	25 %	0 %	50 %	25 %	296242288
10019	NC_014160	GATG	2	8	525230	525237	25 %	25 %	50 %	0 %	296242288
10020	NC_014160	GAA	2	6	525284	525289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242288
10021	NC_014160	GAC	2	6	525300	525305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242288
10022	NC_014160	ATA	2	6	525306	525311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242288
10023	NC_014160	TTC	2	6	525354	525359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242288
10024	NC_014160	CTC	2	6	525363	525368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242288
10025	NC_014160	GA	3	6	525509	525514	50 %	0 %	50 %	0 %	296242288
10026	NC_014160	TAC	2	6	525542	525547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242288
10027	NC_014160	GGA	2	6	525551	525556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242288
10028	NC_014160	GAA	2	6	525582	525587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242288
10029	NC_014160	ACAT	2	8	525636	525643	50 %	25 %	0 %	25 %	296242288
10030	NC_014160	TTG	2	6	525814	525819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242288
10031	NC_014160	TAA	2	6	525847	525852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242288
10032	NC_014160	GA	3	6	525881	525886	50 %	0 %	50 %	0 %	296242288
10033	NC_014160	GGC	2	6	525893	525898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242288
10034	NC_014160	CTA	2	6	525911	525916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242288
10035	NC_014160	TAGA	2	8	525922	525929	50 %	25 %	25 %	0 %	296242288
10036	NC_014160	TCA	2	6	525961	525966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242288
10037	NC_014160	GAA	2	6	526008	526013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242288
10038	NC_014160	AGG	2	6	526072	526077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242288
10039	NC_014160	AGC	3	9	526106	526114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242288
10040	NC_014160	GTT	2	6	526203	526208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242288
10041	NC_014160	AAACC	2	10	526255	526264	60 %	0 %	0 %	40 %	296242288
10042	NC_014160	AGG	2	6	526279	526284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242288
10043	NC_014160	GAA	2	6	526548	526553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242288
10044	NC_014160	TGA	2	6	526600	526605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242288
10045	NC_014160	GTC	2	6	526644	526649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242288
10046	NC_014160	ACA	2	6	526807	526812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242288
10047	NC_014160	CGA	2	6	526837	526842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242289
10048	NC_014160	GCA	2	6	526913	526918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242289
10049	NC_014160	GCTA	2	8	526970	526977	25 %	25 %	25 %	25 %	296242289
10050	NC_014160	CCG	2	6	527004	527009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242289
10051	NC_014160	GA	3	6	527033	527038	50 %	0 %	50 %	0 %	296242289
10052	NC_014160	CCT	2	6	527084	527089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242289
10053	NC_014160	AAT	2	6	527137	527142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242289
10054	NC_014160	TCA	2	6	527156	527161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242289
10055	NC_014160	TCA	2	6	527238	527243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242290
10056	NC_014160	ACT	3	9	527282	527290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242290
10057	NC_014160	CT	3	6	527318	527323	0 %	50 %	0 %	50 %	296242290
10058	NC_014160	TC	3	6	527365	527370	0 %	50 %	0 %	50 %	296242290
10059	NC_014160	GT	3	6	527577	527582	0 %	50 %	50 %	0 %	296242290
10060	NC_014160	TTA	2	6	527604	527609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242290
10061	NC_014160	TTC	2	6	527690	527695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242290
10062	NC_014160	AGT	2	6	527906	527911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_014160	TAA	2	6	527923	527928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_014160	TAG	2	6	527954	527959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242291
10065	NC_014160	CTT	2	6	527971	527976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242291
10066	NC_014160	CAG	2	6	528015	528020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242291
10067	NC_014160	CAC	2	6	528138	528143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242291
10068	NC_014160	ATT	2	6	528194	528199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242291
10069	NC_014160	TCG	2	6	528231	528236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242291
10070	NC_014160	CGG	2	6	528307	528312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242291
10071	NC_014160	GTCTT	2	10	528340	528349	0 %	60 %	20 %	20 %	296242291
10072	NC_014160	ATTT	2	8	528411	528418	25 %	75 %	0 %	0 %	296242291
10073	NC_014160	TCA	2	6	528630	528635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242291
10074	NC_014160	TCC	2	6	528650	528655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242291
10075	NC_014160	ACCTT	2	10	528666	528675	20 %	40 %	0 %	40 %	296242291
10076	NC_014160	TGC	2	6	528775	528780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242291
10077	NC_014160	GCT	2	6	528815	528820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242291
10078	NC_014160	T	6	6	528820	528825	0 %	100 %	0 %	0 %	296242291
10079	NC_014160	GAA	2	6	528832	528837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242291
10080	NC_014160	TCTCG	2	10	528895	528904	0 %	40 %	20 %	40 %	296242291
10081	NC_014160	CTAGT	2	10	528942	528951	20 %	40 %	20 %	20 %	296242291
10082	NC_014160	AG	3	6	528960	528965	50 %	0 %	50 %	0 %	296242291
10083	NC_014160	GA	3	6	528982	528987	50 %	0 %	50 %	0 %	296242291
10084	NC_014160	CAC	2	6	528988	528993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242291
10085	NC_014160	AT	3	6	529099	529104	50 %	50 %	0 %	0 %	296242291
10086	NC_014160	GTT	2	6	529126	529131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242291
10087	NC_014160	AAT	2	6	529208	529213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_014160	A	6	6	529232	529237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_014160	TCA	2	6	529289	529294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242292
10090	NC_014160	CA	3	6	529303	529308	50 %	0 %	0 %	50 %	296242292
10091	NC_014160	CCCCGG	2	12	529422	529433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242292
10092	NC_014160	TCC	2	6	529472	529477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242292
10093	NC_014160	GCT	2	6	529562	529567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242292
10094	NC_014160	CTT	2	6	529864	529869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242292
10095	NC_014160	CAA	2	6	529942	529947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242292
10096	NC_014160	GTC	2	6	529948	529953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242292
10097	NC_014160	TAT	2	6	529957	529962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242292
10098	NC_014160	GCC	2	6	530050	530055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242292
10099	NC_014160	CTA	2	6	530130	530135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242292
10100	NC_014160	AC	3	6	530178	530183	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10101	NC_014160	CATG	2	8	530273	530280	25 %	25 %	25 %	25 %	296242293
10102	NC_014160	ACT	2	6	530299	530304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242293
10103	NC_014160	TCA	2	6	530321	530326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242293
10104	NC_014160	AAG	2	6	530344	530349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242293
10105	NC_014160	TTCT	2	8	530359	530366	0 %	75 %	0 %	25 %	296242293
10106	NC_014160	AGC	2	6	530403	530408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242293
10107	NC_014160	GTA	2	6	530445	530450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242293
10108	NC_014160	GCT	2	6	530482	530487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242293
10109	NC_014160	CAT	2	6	530513	530518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242293
10110	NC_014160	TC	3	6	530577	530582	0 %	50 %	0 %	50 %	296242293
10111	NC_014160	CTT	2	6	530588	530593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242293
10112	NC_014160	GGC	2	6	530652	530657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242293
10113	NC_014160	AAT	2	6	530700	530705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242293
10114	NC_014160	CCAG	2	8	530780	530787	25 %	0 %	25 %	50 %	296242293
10115	NC_014160	CTG	2	6	530813	530818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242293
10116	NC_014160	TTC	2	6	530854	530859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242293
10117	NC_014160	C	6	6	530864	530869	0 %	0 %	0 %	100 %	296242293
10118	NC_014160	GGA	2	6	530954	530959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242293
10119	NC_014160	TAC	2	6	531002	531007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242293
10120	NC_014160	ATT	2	6	531094	531099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242294
10121	NC_014160	CTG	2	6	531116	531121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242294
10122	NC_014160	CAA	2	6	531248	531253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242294
10123	NC_014160	T	6	6	531278	531283	0 %	100 %	0 %	0 %	296242294
10124	NC_014160	ATT	2	6	531316	531321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242294
10125	NC_014160	TCAT	2	8	531358	531365	25 %	50 %	0 %	25 %	296242294
10126	NC_014160	ATT	2	6	531367	531372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242294
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10133	NC_014160	TC	3	6	531644	531649	0 %	50 %	0 %	50 %	296242295
10134	NC_014160	CCT	2	6	531650	531655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242295
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10243	NC_014160	CCT	2	6	537418	537423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242300
10244	NC_014160	GA	3	6	537466	537471	50 %	0 %	50 %	0 %	296242300
10245	NC_014160	CCT	2	6	537520	537525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242300
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10248	NC_014160	TC	3	6	537760	537765	0 %	50 %	0 %	50 %	296242300
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10311	NC_014160	GAA	2	6	540511	540516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10312	NC_014160	T	6	6	540604	540609	0 %	100 %	0 %	0 %	296242303
10313	NC_014160	GAA	2	6	540628	540633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242303
10314	NC_014160	CCTA	2	8	540712	540719	25 %	25 %	0 %	50 %	296242303
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10330	NC_014160	CAT	2	6	541311	541316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242303
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10335	NC_014160	TCTT	2	8	541413	541420	0 %	75 %	0 %	25 %	296242303
10336	NC_014160	TCT	2	6	541455	541460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242303
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10339	NC_014160	GAT	2	6	541594	541599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242303
10340	NC_014160	AT	3	6	541619	541624	50 %	50 %	0 %	0 %	296242303
10341	NC_014160	TG	3	6	541670	541675	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10342	NC_014160	TAGCTA	2	12	541682	541693	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10343	NC_014160	TCT	2	6	541694	541699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242304
10344	NC_014160	TTAT	2	8	541709	541716	25 %	75 %	0 %	0 %	296242304
10345	NC_014160	CTA	2	6	541719	541724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242304
10346	NC_014160	TA	3	6	541727	541732	50 %	50 %	0 %	0 %	296242304
10347	NC_014160	TGT	2	6	541738	541743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242304
10348	NC_014160	AAG	2	6	541753	541758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242304
10349	NC_014160	CT	3	6	541772	541777	0 %	50 %	0 %	50 %	296242304
10350	NC_014160	TA	3	6	541783	541788	50 %	50 %	0 %	0 %	296242304
10351	NC_014160	TTGT	2	8	541792	541799	0 %	75 %	25 %	0 %	296242304
10352	NC_014160	TAT	2	6	541830	541835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242304
10353	NC_014160	TC	3	6	541848	541853	0 %	50 %	0 %	50 %	296242304
10354	NC_014160	ATT	2	6	541898	541903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242304
10355	NC_014160	GTT	2	6	541912	541917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242304
10356	NC_014160	AT	3	6	541991	541996	50 %	50 %	0 %	0 %	296242304
10357	NC_014160	TAC	2	6	542032	542037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242304
10358	NC_014160	TCT	2	6	542067	542072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242304
10359	NC_014160	TTGCTA	2	12	542220	542231	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	296242304
10360	NC_014160	CTA	2	6	542262	542267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242304
10361	NC_014160	TA	3	6	542266	542271	50 %	50 %	0 %	0 %	296242304
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10363	NC_014160	AATG	2	8	542347	542354	50 %	25 %	25 %	0 %	296242304
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10488	NC_014160	TCA	2	6	548665	548670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242314
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10490	NC_014160	TATC	2	8	548776	548783	25 %	50 %	0 %	25 %	296242314
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