MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 24968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014160	CT	3	6	27597	27602	0 %	50 %	0 %	50 %	296241778
502	NC_014160	CGG	2	6	27605	27610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296241778
503	NC_014160	T	6	6	27624	27629	0 %	100 %	0 %	0 %	296241778
504	NC_014160	TTCC	2	8	27688	27695	0 %	50 %	0 %	50 %	296241778
505	NC_014160	CT	3	6	27737	27742	0 %	50 %	0 %	50 %	296241778
506	NC_014160	TGT	2	6	27743	27748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241778
507	NC_014160	TTC	2	6	27877	27882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241778
508	NC_014160	TC	3	6	27889	27894	0 %	50 %	0 %	50 %	296241778
509	NC_014160	TTC	2	6	27904	27909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241778
510	NC_014160	CTA	2	6	27989	27994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241778
511	NC_014160	CTTC	2	8	28013	28020	0 %	50 %	0 %	50 %	296241778
512	NC_014160	GAG	2	6	28170	28175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241778
513	NC_014160	AGT	2	6	28202	28207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241778
514	NC_014160	AAGCC	2	10	28267	28276	40 %	0 %	20 %	40 %	296241778
515	NC_014160	TTG	2	6	28357	28362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241778
516	NC_014160	AAC	2	6	28483	28488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241779
517	NC_014160	ACT	2	6	28498	28503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241779
518	NC_014160	CT	3	6	28584	28589	0 %	50 %	0 %	50 %	296241779
519	NC_014160	TGG	2	6	28666	28671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296241779
520	NC_014160	TCC	2	6	28718	28723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241779
521	NC_014160	TGA	2	6	28818	28823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241779
522	NC_014160	ATC	2	6	28873	28878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241779
523	NC_014160	CTT	2	6	28940	28945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241780
524	NC_014160	TCCT	2	8	28953	28960	0 %	50 %	0 %	50 %	296241780
525	NC_014160	TTGC	2	8	28970	28977	0 %	50 %	25 %	25 %	296241780
526	NC_014160	CTT	2	6	28982	28987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241780
527	NC_014160	CAA	2	6	29006	29011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241780
528	NC_014160	C	6	6	29041	29046	0 %	0 %	0 %	100 %	296241780
529	NC_014160	TCA	2	6	29097	29102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241780
530	NC_014160	TGA	2	6	29116	29121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241780
531	NC_014160	GAA	2	6	29206	29211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241780
532	NC_014160	CCTCC	2	10	29276	29285	0 %	20 %	0 %	80 %	296241780
533	NC_014160	TCAG	2	8	29307	29314	25 %	25 %	25 %	25 %	296241780
534	NC_014160	CAA	2	6	29380	29385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241780
535	NC_014160	CAA	2	6	29434	29439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241780
536	NC_014160	TGC	2	6	29459	29464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241780
537	NC_014160	GA	3	6	29472	29477	50 %	0 %	50 %	0 %	296241780
538	NC_014160	TGCT	2	8	29567	29574	0 %	50 %	25 %	25 %	296241780
539	NC_014160	TCG	2	6	29607	29612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241780
540	NC_014160	CTA	2	6	29622	29627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241780
541	NC_014160	TTC	2	6	29642	29647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241780
542	NC_014160	CTT	2	6	29659	29664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241780
543	NC_014160	ATG	2	6	29666	29671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241780
544	NC_014160	TAC	2	6	29693	29698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241780
545	NC_014160	TCT	2	6	29754	29759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241780
546	NC_014160	CTA	2	6	29848	29853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241780
547	NC_014160	GGT	3	9	29903	29911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296241780
548	NC_014160	ATT	2	6	29940	29945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241780
549	NC_014160	CGC	2	6	29986	29991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296241780
550	NC_014160	AGC	2	6	29994	29999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241780
551	NC_014160	ACTC	2	8	30251	30258	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
552	NC_014160	TAC	2	6	30270	30275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_014160	TAAT	2	8	30277	30284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_014160	AG	3	6	30289	30294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
555	NC_014160	AC	3	6	30303	30308	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
556	NC_014160	TGA	2	6	30340	30345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_014160	G	6	6	30397	30402	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
558	NC_014160	TC	3	6	30438	30443	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
559	NC_014160	ATA	2	6	30504	30509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_014160	AGT	2	6	30550	30555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_014160	AT	3	6	30557	30562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_014160	GA	3	6	30597	30602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
563	NC_014160	AC	3	6	30629	30634	50 %	0 %	0 %	50 %	296241781
564	NC_014160	AGG	2	6	30658	30663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241781
565	NC_014160	GGA	2	6	30756	30761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241781
566	NC_014160	AAC	2	6	30841	30846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241781
567	NC_014160	CAC	2	6	30874	30879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296241781
568	NC_014160	GAT	2	6	30897	30902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241781
569	NC_014160	AAG	2	6	31015	31020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241781
570	NC_014160	TTG	2	6	31088	31093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241781
571	NC_014160	AGG	2	6	31106	31111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241781
572	NC_014160	AGA	2	6	31152	31157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_014160	CAA	2	6	31206	31211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241782
574	NC_014160	GAA	2	6	31275	31280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241782
575	NC_014160	TAC	2	6	31306	31311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241782
576	NC_014160	TACC	2	8	31447	31454	25 %	25 %	0 %	50 %	296241782
577	NC_014160	CTA	2	6	31471	31476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241782
578	NC_014160	AGC	2	6	31477	31482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241782
579	NC_014160	TCA	2	6	31543	31548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241782
580	NC_014160	TCAA	2	8	31594	31601	50 %	25 %	0 %	25 %	296241782
581	NC_014160	AC	3	6	31649	31654	50 %	0 %	0 %	50 %	296241782
582	NC_014160	CTG	2	6	31690	31695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241782
583	NC_014160	GGC	2	6	31702	31707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296241782
584	NC_014160	ATT	2	6	31787	31792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241782
585	NC_014160	AGA	2	6	31817	31822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241782
586	NC_014160	GAA	2	6	31845	31850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241782
587	NC_014160	ATT	2	6	31873	31878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241782
588	NC_014160	CGG	2	6	31881	31886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296241782
589	NC_014160	GCGG	2	8	31932	31939	0 %	0 %	75 %	25 %	296241782
590	NC_014160	ACCT	2	8	31975	31982	25 %	25 %	0 %	50 %	296241782
591	NC_014160	GTG	2	6	32035	32040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296241782
592	NC_014160	AGG	2	6	32132	32137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241782
593	NC_014160	AAG	2	6	32169	32174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241783
594	NC_014160	CTT	2	6	32343	32348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241783
595	NC_014160	TCCT	2	8	32355	32362	0 %	50 %	0 %	50 %	296241783
596	NC_014160	TTG	2	6	32473	32478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241783
597	NC_014160	CCCT	2	8	32528	32535	0 %	25 %	0 %	75 %	296241783
598	NC_014160	AGG	2	6	32580	32585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241783
599	NC_014160	TTG	2	6	32637	32642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241783
600	NC_014160	GGA	2	6	32651	32656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241783
601	NC_014160	AT	3	6	32745	32750	50 %	50 %	0 %	0 %	296241783
602	NC_014160	AAG	2	6	32777	32782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241783
603	NC_014160	GTG	2	6	32811	32816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296241784
604	NC_014160	GGA	3	9	32837	32845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241784
605	NC_014160	CAAG	2	8	32876	32883	50 %	0 %	25 %	25 %	296241784
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608	NC_014160	TAA	2	6	32957	32962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241784
609	NC_014160	TGA	2	6	33020	33025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241784
610	NC_014160	GT	3	6	33238	33243	0 %	50 %	50 %	0 %	296241784
611	NC_014160	TCTAC	2	10	33251	33260	20 %	40 %	0 %	40 %	296241784
612	NC_014160	AGG	2	6	33309	33314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241784
613	NC_014160	TTGC	2	8	33348	33355	0 %	50 %	25 %	25 %	296241785
614	NC_014160	TTC	2	6	33373	33378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241785
615	NC_014160	ATT	2	6	33409	33414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241785
616	NC_014160	AGGG	2	8	33466	33473	25 %	0 %	75 %	0 %	296241785
617	NC_014160	AAG	2	6	33514	33519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241785
618	NC_014160	AGCA	2	8	33604	33611	50 %	0 %	25 %	25 %	296241785
619	NC_014160	GTT	2	6	33648	33653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241785
620	NC_014160	CTC	2	6	33681	33686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241785
621	NC_014160	ACC	2	6	33811	33816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296241785
622	NC_014160	TGA	2	6	33818	33823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241785
623	NC_014160	GAG	2	6	33892	33897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241785
624	NC_014160	TTA	2	6	33947	33952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241785
625	NC_014160	GGT	2	6	33986	33991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
626	NC_014160	ATC	2	6	34026	34031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241786
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628	NC_014160	AGG	2	6	34083	34088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241786
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999	NC_014160	TGGG	2	8	53618	53625	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1000	NC_014160	CCCA	2	8	53633	53640	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding

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