MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 24968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_014160	CGC	2	6	448731	448736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242220
8502	NC_014160	CCT	2	6	448788	448793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242220
8503	NC_014160	GTT	2	6	448818	448823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242220
8504	NC_014160	TAA	2	6	448834	448839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242220
8505	NC_014160	AAT	2	6	448874	448879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242220
8506	NC_014160	CATTA	2	10	448963	448972	40 %	40 %	0 %	20 %	296242220
8507	NC_014160	TCA	2	6	449000	449005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242220
8508	NC_014160	TTC	2	6	449012	449017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242220
8509	NC_014160	AAT	2	6	449026	449031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242220
8510	NC_014160	CCA	2	6	449107	449112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242221
8511	NC_014160	CTA	2	6	449189	449194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242221
8512	NC_014160	CTA	2	6	449197	449202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242221
8513	NC_014160	GGT	2	6	449214	449219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242221
8514	NC_014160	AT	3	6	449272	449277	50 %	50 %	0 %	0 %	296242221
8515	NC_014160	TCT	2	6	449365	449370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242221
8516	NC_014160	TTC	2	6	449376	449381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242221
8517	NC_014160	AGC	2	6	449457	449462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242221
8518	NC_014160	TAC	2	6	449468	449473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242221
8519	NC_014160	AAG	2	6	449485	449490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242221
8520	NC_014160	TG	3	6	449493	449498	0 %	50 %	50 %	0 %	296242221
8521	NC_014160	TCA	2	6	449566	449571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242221
8522	NC_014160	TCT	2	6	449611	449616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242221
8523	NC_014160	CCTG	2	8	449683	449690	0 %	25 %	25 %	50 %	296242221
8524	NC_014160	TGC	2	6	449691	449696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242221
8525	NC_014160	CAG	2	6	449735	449740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242221
8526	NC_014160	AAG	2	6	449751	449756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242221
8527	NC_014160	AACC	2	8	449771	449778	50 %	0 %	0 %	50 %	296242221
8528	NC_014160	G	6	6	449799	449804	0 %	0 %	100 %	0 %	296242221
8529	NC_014160	TCA	2	6	449875	449880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242221
8530	NC_014160	CCT	2	6	449893	449898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242221
8531	NC_014160	GCA	2	6	449902	449907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242221
8532	NC_014160	ATT	2	6	449955	449960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242221
8533	NC_014160	AT	3	6	449970	449975	50 %	50 %	0 %	0 %	296242221
8534	NC_014160	TTA	2	6	450014	450019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242221
8535	NC_014160	TTCT	2	8	450217	450224	0 %	75 %	0 %	25 %	296242221
8536	NC_014160	CTG	2	6	450229	450234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242221
8537	NC_014160	TCGC	2	8	450242	450249	0 %	25 %	25 %	50 %	296242221
8538	NC_014160	ATT	2	6	450294	450299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242221
8539	NC_014160	TGA	2	6	450303	450308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242221
8540	NC_014160	GA	3	6	450315	450320	50 %	0 %	50 %	0 %	296242221
8541	NC_014160	CGC	2	6	450347	450352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242221
8542	NC_014160	CTA	2	6	450358	450363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242221
8543	NC_014160	AGG	2	6	450481	450486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242221
8544	NC_014160	TAT	2	6	450522	450527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8545	NC_014160	ATA	2	6	450532	450537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8546	NC_014160	TA	3	6	450536	450541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8547	NC_014160	TTA	2	6	450598	450603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8548	NC_014160	AGGCT	2	10	450640	450649	20 %	20 %	40 %	20 %	296242222
8549	NC_014160	ATT	2	6	450666	450671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242222
8550	NC_014160	GAC	2	6	450674	450679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242222
8551	NC_014160	CTA	2	6	450715	450720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242222
8552	NC_014160	TAT	2	6	450746	450751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242222
8553	NC_014160	ATA	2	6	450897	450902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242222
8554	NC_014160	TAT	2	6	450938	450943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242222
8555	NC_014160	ACC	2	6	450956	450961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242222
8556	NC_014160	ACCC	2	8	450971	450978	25 %	0 %	0 %	75 %	296242222
8557	NC_014160	CCA	2	6	451072	451077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242222
8558	NC_014160	AGA	2	6	451087	451092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242222
8559	NC_014160	ATT	2	6	451122	451127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242222
8560	NC_014160	ACC	2	6	451183	451188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8561	NC_014160	TCA	2	6	451326	451331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242223
8562	NC_014160	TCCT	2	8	451412	451419	0 %	50 %	0 %	50 %	296242223
8563	NC_014160	AC	3	6	451440	451445	50 %	0 %	0 %	50 %	296242223
8564	NC_014160	CCG	2	6	451477	451482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242223
8565	NC_014160	TTG	2	6	451523	451528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242223
8566	NC_014160	TTC	2	6	451598	451603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242223
8567	NC_014160	CT	3	6	451714	451719	0 %	50 %	0 %	50 %	296242223
8568	NC_014160	TAT	2	6	451751	451756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242223
8569	NC_014160	TAT	2	6	451919	451924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242224
8570	NC_014160	CTT	2	6	451970	451975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242224
8571	NC_014160	CAT	2	6	452003	452008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242224
8572	NC_014160	TAA	2	6	452054	452059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242224
8573	NC_014160	CTC	2	6	452165	452170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242224
8574	NC_014160	ATC	2	6	452202	452207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242224
8575	NC_014160	T	7	7	452246	452252	0 %	100 %	0 %	0 %	296242224
8576	NC_014160	T	6	6	452337	452342	0 %	100 %	0 %	0 %	296242224
8577	NC_014160	AT	3	6	452353	452358	50 %	50 %	0 %	0 %	296242224
8578	NC_014160	CTA	2	6	452435	452440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242224
8579	NC_014160	AAT	2	6	452466	452471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242224
8580	NC_014160	CAA	2	6	452523	452528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242224
8581	NC_014160	TCC	2	6	452617	452622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242224
8582	NC_014160	GGA	2	6	452634	452639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242224
8583	NC_014160	TGT	2	6	452657	452662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242224
8584	NC_014160	TAG	2	6	452663	452668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242224
8585	NC_014160	TTCC	2	8	452739	452746	0 %	50 %	0 %	50 %	296242224
8586	NC_014160	CTC	2	6	452756	452761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242224
8587	NC_014160	TAA	2	6	452802	452807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8588	NC_014160	TGA	2	6	452868	452873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242225
8589	NC_014160	TC	3	6	452912	452917	0 %	50 %	0 %	50 %	296242225
8590	NC_014160	GTT	2	6	452940	452945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242225
8591	NC_014160	ATG	3	9	452977	452985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242225
8592	NC_014160	ATCT	2	8	453002	453009	25 %	50 %	0 %	25 %	296242225
8593	NC_014160	TCT	2	6	453019	453024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242225
8594	NC_014160	TCA	2	6	453031	453036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242225
8595	NC_014160	TTC	2	6	453080	453085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242225
8596	NC_014160	TAA	2	6	453095	453100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242225
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8598	NC_014160	GGT	2	6	453234	453239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242225
8599	NC_014160	GA	3	6	453291	453296	50 %	0 %	50 %	0 %	296242225
8600	NC_014160	GAG	2	6	453307	453312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242225
8601	NC_014160	TAT	2	6	453363	453368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242225
8602	NC_014160	TCT	2	6	453386	453391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242225
8603	NC_014160	GTG	2	6	453430	453435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242225
8604	NC_014160	A	6	6	453458	453463	100 %	0 %	0 %	0 %	296242225
8605	NC_014160	TCC	2	6	453554	453559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242225
8606	NC_014160	CT	3	6	453570	453575	0 %	50 %	0 %	50 %	296242225
8607	NC_014160	GTG	2	6	453583	453588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242225
8608	NC_014160	AG	3	6	453667	453672	50 %	0 %	50 %	0 %	296242225
8609	NC_014160	ATCT	2	8	453712	453719	25 %	50 %	0 %	25 %	296242225
8610	NC_014160	GAT	2	6	453735	453740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242225
8611	NC_014160	GAAA	2	8	453781	453788	75 %	0 %	25 %	0 %	296242225
8612	NC_014160	CTAT	2	8	453817	453824	25 %	50 %	0 %	25 %	296242225
8613	NC_014160	TTG	2	6	453988	453993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242225
8614	NC_014160	AT	3	6	454000	454005	50 %	50 %	0 %	0 %	296242225
8615	NC_014160	T	6	6	454039	454044	0 %	100 %	0 %	0 %	296242225
8616	NC_014160	TTA	2	6	454105	454110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242225
8617	NC_014160	TTC	2	6	454171	454176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242226
8618	NC_014160	CG	3	6	454185	454190	0 %	0 %	50 %	50 %	296242226
8619	NC_014160	TCT	2	6	454302	454307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242226
8620	NC_014160	AT	4	8	454369	454376	50 %	50 %	0 %	0 %	296242226
8621	NC_014160	ACT	2	6	454424	454429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242226
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