MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 24968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014160	AGT	2	6	314234	314239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242084
6002	NC_014160	TAG	2	6	314423	314428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242084
6003	NC_014160	GAA	2	6	314435	314440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242084
6004	NC_014160	ATA	2	6	314490	314495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242084
6005	NC_014160	AAT	2	6	314649	314654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242084
6006	NC_014160	GAAG	2	8	314681	314688	50 %	0 %	50 %	0 %	296242084
6007	NC_014160	AGTC	2	8	314800	314807	25 %	25 %	25 %	25 %	296242084
6008	NC_014160	ATA	2	6	314868	314873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242084
6009	NC_014160	GAG	2	6	314930	314935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242084
6010	NC_014160	GAAA	2	8	314979	314986	75 %	0 %	25 %	0 %	296242084
6011	NC_014160	T	6	6	315054	315059	0 %	100 %	0 %	0 %	296242084
6012	NC_014160	GATG	2	8	315170	315177	25 %	25 %	50 %	0 %	296242085
6013	NC_014160	TGT	2	6	315221	315226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242085
6014	NC_014160	TAA	2	6	315239	315244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242085
6015	NC_014160	GAA	2	6	315281	315286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242085
6016	NC_014160	CT	3	6	315297	315302	0 %	50 %	0 %	50 %	296242085
6017	NC_014160	AGC	2	6	315389	315394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242085
6018	NC_014160	GAA	2	6	315413	315418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242085
6019	NC_014160	TAT	2	6	315426	315431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242085
6020	NC_014160	ATTT	2	8	315494	315501	25 %	75 %	0 %	0 %	296242085
6021	NC_014160	C	6	6	315539	315544	0 %	0 %	0 %	100 %	296242085
6022	NC_014160	TGA	2	6	315548	315553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242085
6023	NC_014160	TC	3	6	315638	315643	0 %	50 %	0 %	50 %	296242085
6024	NC_014160	TTTCT	2	10	315734	315743	0 %	80 %	0 %	20 %	296242085
6025	NC_014160	GCG	2	6	315760	315765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242085
6026	NC_014160	TGA	2	6	315791	315796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242085
6027	NC_014160	TC	3	6	315860	315865	0 %	50 %	0 %	50 %	296242085
6028	NC_014160	AGA	2	6	315866	315871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242085
6029	NC_014160	CGC	2	6	315928	315933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242085
6030	NC_014160	ATA	3	9	316009	316017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242085
6031	NC_014160	TAC	2	6	316018	316023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242085
6032	NC_014160	AGA	2	6	316026	316031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242085
6033	NC_014160	TTG	2	6	316036	316041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242085
6034	NC_014160	GTT	2	6	316088	316093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242085
6035	NC_014160	AAG	2	6	316120	316125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242085
6036	NC_014160	AT	3	6	316163	316168	50 %	50 %	0 %	0 %	296242085
6037	NC_014160	GCA	2	6	316292	316297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242086
6038	NC_014160	ATTT	2	8	316350	316357	25 %	75 %	0 %	0 %	296242086
6039	NC_014160	GAT	2	6	316366	316371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242086
6040	NC_014160	AT	3	6	316437	316442	50 %	50 %	0 %	0 %	296242086
6041	NC_014160	TGCTCC	2	12	316469	316480	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	296242086
6042	NC_014160	CTC	2	6	316511	316516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242086
6043	NC_014160	AGT	2	6	316572	316577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242086
6044	NC_014160	TGA	2	6	316614	316619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242086
6045	NC_014160	ACT	2	6	316652	316657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242086
6046	NC_014160	CTA	2	6	316764	316769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242086
6047	NC_014160	ATA	2	6	316788	316793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242086
6048	NC_014160	TAC	2	6	316800	316805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242086
6049	NC_014160	TTA	2	6	316821	316826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_014160	TGA	2	6	316843	316848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_014160	TCG	2	6	316907	316912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242087
6052	NC_014160	CTT	2	6	316915	316920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242087
6053	NC_014160	AG	3	6	316921	316926	50 %	0 %	50 %	0 %	296242087
6054	NC_014160	GAG	2	6	316939	316944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242087
6055	NC_014160	GTAG	2	8	316945	316952	25 %	25 %	50 %	0 %	296242087
6056	NC_014160	AAG	2	6	317010	317015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242087
6057	NC_014160	AAC	2	6	317210	317215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242087
6058	NC_014160	TAA	2	6	317227	317232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242087
6059	NC_014160	ACC	2	6	317247	317252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242087
6060	NC_014160	AGG	2	6	317324	317329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242087
6061	NC_014160	AC	3	6	317344	317349	50 %	0 %	0 %	50 %	296242087
6062	NC_014160	TA	3	6	317350	317355	50 %	50 %	0 %	0 %	296242087
6063	NC_014160	CAT	2	6	317400	317405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242087
6064	NC_014160	GGA	2	6	317418	317423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242087
6065	NC_014160	AAT	2	6	317467	317472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242087
6066	NC_014160	GA	4	8	317511	317518	50 %	0 %	50 %	0 %	296242087
6067	NC_014160	TAT	2	6	317539	317544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242087
6068	NC_014160	TAA	2	6	317562	317567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242087
6069	NC_014160	CTTA	2	8	317679	317686	25 %	50 %	0 %	25 %	296242088
6070	NC_014160	ATT	2	6	317728	317733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242088
6071	NC_014160	GAG	2	6	317738	317743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242088
6072	NC_014160	GAA	2	6	317818	317823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242088
6073	NC_014160	AG	3	6	317988	317993	50 %	0 %	50 %	0 %	296242088
6074	NC_014160	GAG	2	6	318006	318011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242088
6075	NC_014160	AAGTAT	2	12	318016	318027	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	296242088
6076	NC_014160	CTG	2	6	318032	318037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242088
6077	NC_014160	ATGA	2	8	318106	318113	50 %	25 %	25 %	0 %	296242088
6078	NC_014160	TGAA	2	8	318161	318168	50 %	25 %	25 %	0 %	296242088
6079	NC_014160	ACA	2	6	318202	318207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242088
6080	NC_014160	GGT	2	6	318287	318292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242088
6081	NC_014160	AAG	2	6	318349	318354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242088
6082	NC_014160	ATGG	2	8	318373	318380	25 %	25 %	50 %	0 %	296242088
6083	NC_014160	AAC	2	6	318426	318431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242088
6084	NC_014160	GA	3	6	318508	318513	50 %	0 %	50 %	0 %	296242089
6085	NC_014160	TCC	2	6	318587	318592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242089
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6088	NC_014160	AAT	2	6	318692	318697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242089
6089	NC_014160	GTT	2	6	318713	318718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242089
6090	NC_014160	TTC	2	6	318752	318757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242089
6091	NC_014160	CTA	2	6	318780	318785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242089
6092	NC_014160	TTA	2	6	318794	318799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242089
6093	NC_014160	CATG	2	8	318834	318841	25 %	25 %	25 %	25 %	296242089
6094	NC_014160	TCC	2	6	318869	318874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242089
6095	NC_014160	CCAG	2	8	318875	318882	25 %	0 %	25 %	50 %	296242089
6096	NC_014160	AGA	2	6	318947	318952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242089
6097	NC_014160	AGCC	2	8	318988	318995	25 %	0 %	25 %	50 %	296242089
6098	NC_014160	CTC	2	6	319048	319053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242089
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6100	NC_014160	TAT	2	6	319195	319200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242089
6101	NC_014160	CTT	2	6	319218	319223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242089
6102	NC_014160	CAC	2	6	319225	319230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242089
6103	NC_014160	CCG	2	6	319256	319261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242089
6104	NC_014160	CT	3	6	319405	319410	0 %	50 %	0 %	50 %	296242089
6105	NC_014160	CAA	2	6	319437	319442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242089
6106	NC_014160	CAT	2	6	319459	319464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242089
6107	NC_014160	TGGGCC	2	12	319615	319626	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	296242090
6108	NC_014160	AT	3	6	319674	319679	50 %	50 %	0 %	0 %	296242090
6109	NC_014160	GAA	2	6	319741	319746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242090
6110	NC_014160	ATAA	2	8	319814	319821	75 %	25 %	0 %	0 %	296242090
6111	NC_014160	GAC	2	6	319868	319873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242090
6112	NC_014160	AAT	2	6	319951	319956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242090
6113	NC_014160	GA	3	6	319961	319966	50 %	0 %	50 %	0 %	296242090
6114	NC_014160	CCA	2	6	319983	319988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242090
6115	NC_014160	GCA	2	6	320087	320092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242090
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6117	NC_014160	GACT	2	8	320404	320411	25 %	25 %	25 %	25 %	296242090
6118	NC_014160	TCC	2	6	320448	320453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242090
6119	NC_014160	GAT	2	6	320458	320463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242090
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6121	NC_014160	TAG	2	6	320569	320574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242090
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6123	NC_014160	AAC	2	6	320681	320686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242090
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6345	NC_014160	TGCT	2	8	332612	332619	0 %	50 %	25 %	25 %	296242104
6346	NC_014160	GT	3	6	332623	332628	0 %	50 %	50 %	0 %	296242104
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6364	NC_014160	ATTG	2	8	333843	333850	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6365	NC_014160	AAAC	2	8	333863	333870	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6366	NC_014160	CCAG	2	8	333957	333964	25 %	0 %	25 %	50 %	296242107
6367	NC_014160	AGAA	2	8	334048	334055	75 %	0 %	25 %	0 %	296242107
6368	NC_014160	GGGGC	2	10	334119	334128	0 %	0 %	80 %	20 %	296242107
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6494	NC_014160	CACC	2	8	341239	341246	25 %	0 %	0 %	75 %	296242113
6495	NC_014160	TCGA	2	8	341247	341254	25 %	25 %	25 %	25 %	296242113
6496	NC_014160	TCT	2	6	341299	341304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242113
6497	NC_014160	AAT	2	6	341307	341312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242113
6498	NC_014160	AAT	2	6	341318	341323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242113
6499	NC_014160	TCT	2	6	341362	341367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242113
6500	NC_014160	CAATT	2	10	341405	341414	40 %	40 %	0 %	20 %	296242113

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