MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 24968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014160	TTC	2	6	257519	257524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_014160	CCAA	2	8	257540	257547	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5003	NC_014160	AGTGG	2	10	257636	257645	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_014160	ACT	2	6	257652	257657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_014160	AAT	2	6	257672	257677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_014160	AG	3	6	257708	257713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_014160	GAG	2	6	257777	257782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_014160	GTG	2	6	257837	257842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_014160	GGA	2	6	257893	257898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_014160	TAA	2	6	257919	257924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_014160	TGG	2	6	257933	257938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_014160	ACT	2	6	257961	257966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_014160	GAA	2	6	258032	258037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_014160	TGA	2	6	258043	258048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_014160	TAC	2	6	258095	258100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_014160	CGA	2	6	258121	258126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_014160	AT	3	6	258167	258172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_014160	T	6	6	258297	258302	0 %	100 %	0 %	0 %	296242030
5019	NC_014160	TTA	2	6	258327	258332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242030
5020	NC_014160	ATC	2	6	258350	258355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242030
5021	NC_014160	CGG	2	6	258372	258377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242030
5022	NC_014160	GAG	2	6	258399	258404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242030
5023	NC_014160	TCG	2	6	258483	258488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242030
5024	NC_014160	CTT	2	6	258581	258586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242030
5025	NC_014160	ATTG	2	8	258658	258665	25 %	50 %	25 %	0 %	296242030
5026	NC_014160	AAT	2	6	258691	258696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242030
5027	NC_014160	CTA	2	6	258737	258742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242030
5028	NC_014160	GAA	2	6	258771	258776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242030
5029	NC_014160	GGCT	2	8	258786	258793	0 %	25 %	50 %	25 %	296242030
5030	NC_014160	CTTG	2	8	258829	258836	0 %	50 %	25 %	25 %	296242030
5031	NC_014160	CAC	2	6	259056	259061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242030
5032	NC_014160	GA	3	6	259135	259140	50 %	0 %	50 %	0 %	296242030
5033	NC_014160	CTT	2	6	259154	259159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242030
5034	NC_014160	TCT	2	6	259221	259226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242030
5035	NC_014160	TAA	2	6	259233	259238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242030
5036	NC_014160	CAA	2	6	259306	259311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242031
5037	NC_014160	A	6	6	259347	259352	100 %	0 %	0 %	0 %	296242031
5038	NC_014160	TCATC	2	10	259431	259440	20 %	40 %	0 %	40 %	296242031
5039	NC_014160	ATC	2	6	259445	259450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242031
5040	NC_014160	TTA	2	6	259472	259477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242031
5041	NC_014160	GGA	2	6	259513	259518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242031
5042	NC_014160	GA	3	6	259582	259587	50 %	0 %	50 %	0 %	296242031
5043	NC_014160	T	6	6	259590	259595	0 %	100 %	0 %	0 %	296242031
5044	NC_014160	GTCAG	2	10	259613	259622	20 %	20 %	40 %	20 %	296242031
5045	NC_014160	GTT	2	6	259669	259674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242031
5046	NC_014160	TTA	2	6	259693	259698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242031
5047	NC_014160	ATT	2	6	259738	259743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242031
5048	NC_014160	TGG	2	6	259835	259840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242031
5049	NC_014160	AT	3	6	259865	259870	50 %	50 %	0 %	0 %	296242031
5050	NC_014160	AAG	2	6	259873	259878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242031
5051	NC_014160	TTC	2	6	259899	259904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242031
5052	NC_014160	AAT	2	6	259936	259941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242031
5053	NC_014160	CCA	2	6	259970	259975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242031
5054	NC_014160	TAA	2	6	260079	260084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242031
5055	NC_014160	AGG	2	6	260088	260093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242031
5056	NC_014160	GA	3	6	260191	260196	50 %	0 %	50 %	0 %	296242031
5057	NC_014160	GAG	2	6	260215	260220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242031
5058	NC_014160	GGT	2	6	260286	260291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242032
5059	NC_014160	TAAAG	2	10	260316	260325	60 %	20 %	20 %	0 %	296242032
5060	NC_014160	ACG	2	6	260374	260379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242032
5061	NC_014160	ACC	2	6	260403	260408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242032
5062	NC_014160	GAA	2	6	260554	260559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242032
5063	NC_014160	CTA	2	6	260565	260570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242032
5064	NC_014160	ATGG	2	8	260588	260595	25 %	25 %	50 %	0 %	296242032
5065	NC_014160	GAA	2	6	260601	260606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242032
5066	NC_014160	GGT	2	6	260607	260612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242032
5067	NC_014160	AGG	2	6	260615	260620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242032
5068	NC_014160	TGG	2	6	260639	260644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242032
5069	NC_014160	ATT	2	6	260669	260674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242032
5070	NC_014160	G	6	6	260692	260697	0 %	0 %	100 %	0 %	296242032
5071	NC_014160	GCA	2	6	260700	260705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242032
5072	NC_014160	ATC	2	6	260746	260751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242032
5073	NC_014160	TGA	2	6	260757	260762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242032
5074	NC_014160	GA	3	6	260823	260828	50 %	0 %	50 %	0 %	296242032
5075	NC_014160	TAACC	2	10	260835	260844	40 %	20 %	0 %	40 %	296242032
5076	NC_014160	TTG	2	6	260984	260989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242032
5077	NC_014160	GGA	2	6	261034	261039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242032
5078	NC_014160	GTT	2	6	261071	261076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242032
5079	NC_014160	ACC	2	6	261122	261127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242032
5080	NC_014160	AAG	2	6	261137	261142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242032
5081	NC_014160	TTG	2	6	261155	261160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242032
5082	NC_014160	TAA	2	6	261193	261198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242033
5083	NC_014160	TAC	2	6	261228	261233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242033
5084	NC_014160	GTT	2	6	261279	261284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242033
5085	NC_014160	TTG	2	6	261304	261309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242033
5086	NC_014160	TAA	2	6	261325	261330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242033
5087	NC_014160	AT	3	6	261426	261431	50 %	50 %	0 %	0 %	296242033
5088	NC_014160	TGA	2	6	261532	261537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242033
5089	NC_014160	AG	3	6	261581	261586	50 %	0 %	50 %	0 %	296242033
5090	NC_014160	ACT	2	6	261634	261639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242033
5091	NC_014160	GGA	2	6	261657	261662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242033
5092	NC_014160	ATG	2	6	261663	261668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242033
5093	NC_014160	GTT	2	6	261861	261866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242033
5094	NC_014160	ATT	2	6	261867	261872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242033
5095	NC_014160	TAG	2	6	261886	261891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242033
5096	NC_014160	AGG	2	6	261892	261897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242033
5097	NC_014160	GTT	2	6	261944	261949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242033
5098	NC_014160	GCTG	2	8	262009	262016	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5099	NC_014160	A	6	6	262099	262104	100 %	0 %	0 %	0 %	296242034
5100	NC_014160	GA	3	6	262142	262147	50 %	0 %	50 %	0 %	296242034
5101	NC_014160	CAA	2	6	262163	262168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242034
5102	NC_014160	AG	3	6	262188	262193	50 %	0 %	50 %	0 %	296242034
5103	NC_014160	TAG	2	6	262399	262404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242034
5104	NC_014160	AGA	2	6	262421	262426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242034
5105	NC_014160	GAA	2	6	262470	262475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242034
5106	NC_014160	GAG	2	6	262515	262520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242034
5107	NC_014160	AGA	2	6	262534	262539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242034
5108	NC_014160	TTG	2	6	262555	262560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242034
5109	NC_014160	AAT	2	6	262637	262642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242034
5110	NC_014160	AATA	2	8	262677	262684	75 %	25 %	0 %	0 %	296242034
5111	NC_014160	GAT	2	6	262764	262769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242034
5112	NC_014160	GAG	2	6	262800	262805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242034
5113	NC_014160	CCAG	2	8	262872	262879	25 %	0 %	25 %	50 %	296242034
5114	NC_014160	GA	3	6	262944	262949	50 %	0 %	50 %	0 %	296242034
5115	NC_014160	ACA	2	6	263028	263033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242034
5116	NC_014160	CCA	2	6	263144	263149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242034
5117	NC_014160	ATT	2	6	263160	263165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242034
5118	NC_014160	GAA	2	6	263171	263176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242034
5119	NC_014160	CTT	2	6	263201	263206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242034
5120	NC_014160	AGG	2	6	263236	263241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242034
5121	NC_014160	AT	3	6	263291	263296	50 %	50 %	0 %	0 %	296242034
5122	NC_014160	TGG	2	6	263333	263338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242034
5123	NC_014160	GAT	2	6	263442	263447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242034
5124	NC_014160	GA	3	6	263534	263539	50 %	0 %	50 %	0 %	296242034
5125	NC_014160	ATG	2	6	263586	263591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5127	NC_014160	TTG	2	6	263646	263651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242035
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5493	NC_014160	T	6	6	285125	285130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5494	NC_014160	ATA	2	6	285284	285289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242054
5495	NC_014160	TTC	2	6	285341	285346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242054
5496	NC_014160	CT	3	6	285415	285420	0 %	50 %	0 %	50 %	296242054
5497	NC_014160	AT	3	6	285444	285449	50 %	50 %	0 %	0 %	296242054
5498	NC_014160	TA	3	6	285475	285480	50 %	50 %	0 %	0 %	296242054
5499	NC_014160	CTC	2	6	285494	285499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242054
5500	NC_014160	AGC	2	6	285604	285609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242054

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