MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 24968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014160	GTA	2	6	234573	234578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_014160	CT	3	6	234595	234600	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4503	NC_014160	TTA	2	6	234621	234626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_014160	CTGT	2	8	234654	234661	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4505	NC_014160	TCT	2	6	234677	234682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242005
4506	NC_014160	GTT	2	6	234684	234689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242005
4507	NC_014160	TAT	2	6	234730	234735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242005
4508	NC_014160	AGCGAG	2	12	234751	234762	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	296242005
4509	NC_014160	CCA	2	6	234801	234806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242005
4510	NC_014160	CCG	2	6	234828	234833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242005
4511	NC_014160	GAGC	2	8	234858	234865	25 %	0 %	50 %	25 %	296242005
4512	NC_014160	AGG	2	6	234920	234925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242005
4513	NC_014160	AC	3	6	234927	234932	50 %	0 %	0 %	50 %	296242005
4514	NC_014160	ATAA	2	8	234935	234942	75 %	25 %	0 %	0 %	296242005
4515	NC_014160	GGAA	2	8	235143	235150	50 %	0 %	50 %	0 %	296242006
4516	NC_014160	CAGC	2	8	235173	235180	25 %	0 %	25 %	50 %	296242006
4517	NC_014160	ACC	2	6	235207	235212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242006
4518	NC_014160	GGT	2	6	235236	235241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242006
4519	NC_014160	TAC	2	6	235250	235255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242006
4520	NC_014160	AG	3	6	235264	235269	50 %	0 %	50 %	0 %	296242006
4521	NC_014160	CGC	2	6	235274	235279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242006
4522	NC_014160	TTG	2	6	235324	235329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242006
4523	NC_014160	AG	3	6	235514	235519	50 %	0 %	50 %	0 %	296242006
4524	NC_014160	GGA	2	6	235568	235573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242006
4525	NC_014160	AGT	2	6	235645	235650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242006
4526	NC_014160	CCT	2	6	235657	235662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242006
4527	NC_014160	GTA	2	6	235733	235738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242006
4528	NC_014160	ACT	2	6	235743	235748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242006
4529	NC_014160	ATGA	2	8	235769	235776	50 %	25 %	25 %	0 %	296242006
4530	NC_014160	AC	3	6	235777	235782	50 %	0 %	0 %	50 %	296242006
4531	NC_014160	TTG	2	6	235825	235830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242006
4532	NC_014160	ACT	2	6	235839	235844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242006
4533	NC_014160	CGTG	2	8	235855	235862	0 %	25 %	50 %	25 %	296242006
4534	NC_014160	CGG	2	6	235967	235972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242006
4535	NC_014160	GCGA	2	8	235974	235981	25 %	0 %	50 %	25 %	296242006
4536	NC_014160	TGT	2	6	236036	236041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242006
4537	NC_014160	GAA	2	6	236117	236122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242006
4538	NC_014160	GGA	2	6	236131	236136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242006
4539	NC_014160	ACC	2	6	236163	236168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242006
4540	NC_014160	AGTACT	2	12	236172	236183	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4541	NC_014160	ATA	2	6	236266	236271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242007
4542	NC_014160	AGTA	2	8	236288	236295	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_014160	ACTA	2	8	236359	236366	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4544	NC_014160	TAGAC	2	10	236367	236376	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4545	NC_014160	CA	3	6	236380	236385	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4546	NC_014160	AAC	2	6	236420	236425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_014160	C	6	6	236453	236458	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4548	NC_014160	AG	3	6	236484	236489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_014160	CT	3	6	236545	236550	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4550	NC_014160	GCA	2	6	236552	236557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_014160	AG	3	6	236687	236692	50 %	0 %	50 %	0 %	296242008
4552	NC_014160	CTC	2	6	236705	236710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242008
4553	NC_014160	CGT	2	6	236788	236793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242008
4554	NC_014160	AGG	2	6	236823	236828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242008
4555	NC_014160	GAG	2	6	236833	236838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242008
4556	NC_014160	AGAACT	2	12	236860	236871	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296242008
4557	NC_014160	GAGGT	2	10	236898	236907	20 %	20 %	60 %	0 %	296242008
4558	NC_014160	ACG	2	6	236916	236921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242008
4559	NC_014160	GCTC	2	8	236922	236929	0 %	25 %	25 %	50 %	296242008
4560	NC_014160	GGA	2	6	236968	236973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242008
4561	NC_014160	AGG	2	6	236987	236992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242008
4562	NC_014160	GA	3	6	237010	237015	50 %	0 %	50 %	0 %	296242008
4563	NC_014160	AGC	2	6	237035	237040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242008
4564	NC_014160	ACTATT	2	12	237064	237075	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	296242008
4565	NC_014160	ACT	2	6	237099	237104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242008
4566	NC_014160	GA	3	6	237124	237129	50 %	0 %	50 %	0 %	296242008
4567	NC_014160	CTA	2	6	237138	237143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242008
4568	NC_014160	CTA	2	6	237164	237169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242008
4569	NC_014160	GCT	2	6	237172	237177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242008
4570	NC_014160	GAG	2	6	237178	237183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242008
4571	NC_014160	CT	3	6	237190	237195	0 %	50 %	0 %	50 %	296242008
4572	NC_014160	ACT	2	6	237301	237306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242008
4573	NC_014160	GTG	2	6	237326	237331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242008
4574	NC_014160	C	8	8	237345	237352	0 %	0 %	0 %	100 %	296242008
4575	NC_014160	CT	3	6	237362	237367	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4576	NC_014160	GAG	2	6	237385	237390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_014160	GGC	2	6	237501	237506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_014160	GA	3	6	237537	237542	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_014160	GA	3	6	237674	237679	50 %	0 %	50 %	0 %	296242009
4580	NC_014160	GAG	2	6	237693	237698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242009
4581	NC_014160	AG	3	6	237705	237710	50 %	0 %	50 %	0 %	296242009
4582	NC_014160	CGG	2	6	237851	237856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242009
4583	NC_014160	C	6	6	237867	237872	0 %	0 %	0 %	100 %	296242009
4584	NC_014160	CGC	2	6	237879	237884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242009
4585	NC_014160	GAGCA	2	10	237912	237921	40 %	0 %	40 %	20 %	296242009
4586	NC_014160	AGT	2	6	237928	237933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_014160	CTA	2	6	237939	237944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_014160	CT	3	6	237973	237978	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4589	NC_014160	GTA	2	6	238004	238009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_014160	CCT	2	6	238033	238038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4591	NC_014160	AGT	3	9	238117	238125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_014160	AG	3	6	238139	238144	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_014160	GTA	2	6	238181	238186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_014160	TCA	2	6	238242	238247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_014160	GCG	2	6	238259	238264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_014160	AGA	2	6	238274	238279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_014160	CTG	2	6	238280	238285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4598	NC_014160	GAG	2	6	238310	238315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_014160	GAG	2	6	238379	238384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_014160	GGA	2	6	238420	238425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_014160	AAG	2	6	238445	238450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_014160	GGA	2	6	238456	238461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_014160	AGT	2	6	238472	238477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_014160	GAG	2	6	238483	238488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_014160	TTC	2	6	238520	238525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_014160	TAG	3	9	238587	238595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_014160	C	6	6	238685	238690	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4608	NC_014160	GGA	2	6	238705	238710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_014160	TC	3	6	238757	238762	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4610	NC_014160	AG	3	6	238775	238780	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_014160	GGA	2	6	238782	238787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_014160	TAG	2	6	238803	238808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_014160	GTG	2	6	238843	238848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_014160	AGA	2	6	238886	238891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_014160	GT	3	6	238898	238903	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_014160	TTA	2	6	238904	238909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_014160	GAG	2	6	238933	238938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_014160	AG	3	6	239042	239047	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_014160	GGA	2	6	239078	239083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_014160	TC	3	6	239099	239104	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4621	NC_014160	TAG	2	6	239127	239132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_014160	CTC	2	6	239160	239165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242010
4623	NC_014160	AC	4	8	239176	239183	50 %	0 %	0 %	50 %	296242010
4624	NC_014160	GA	4	8	239210	239217	50 %	0 %	50 %	0 %	296242010
4625	NC_014160	GTA	2	6	239250	239255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242010
4626	NC_014160	CCA	2	6	239305	239310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242010
4627	NC_014160	GCG	2	6	239323	239328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242010
4628	NC_014160	ATT	2	6	239334	239339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242010
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