MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tsukamurella paurometabola DSM 20162 chromosome

Total Repeats: 114837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_014158	GGGC	2	8	609151	609158	0 %	0 %	75 %	25 %	296138316
16002	NC_014158	CGA	2	6	609166	609171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138316
16003	NC_014158	GGC	2	6	609301	609306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138316
16004	NC_014158	CAC	2	6	609365	609370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296138316
16005	NC_014158	GCGG	2	8	609374	609381	0 %	0 %	75 %	25 %	296138316
16006	NC_014158	CGA	2	6	609424	609429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138316
16007	NC_014158	CGG	2	6	609447	609452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138316
16008	NC_014158	GAC	2	6	609500	609505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138316
16009	NC_014158	CAG	2	6	609643	609648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138317
16010	NC_014158	GTA	2	6	609663	609668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296138317
16011	NC_014158	CGA	2	6	609735	609740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138317
16012	NC_014158	TGCGCC	2	12	609764	609775	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	296138317
16013	NC_014158	GAT	2	6	609811	609816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296138317
16014	NC_014158	GCCC	2	8	609820	609827	0 %	0 %	25 %	75 %	296138317
16015	NC_014158	AGG	2	6	609896	609901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296138317
16016	NC_014158	TCG	2	6	609932	609937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138317
16017	NC_014158	CAC	2	6	609973	609978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296138317
16018	NC_014158	GCA	2	6	610173	610178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138317
16019	NC_014158	CCCG	2	8	610190	610197	0 %	0 %	25 %	75 %	296138317
16020	NC_014158	CCA	2	6	610213	610218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296138317
16021	NC_014158	GCCGA	2	10	610298	610307	20 %	0 %	40 %	40 %	296138317
16022	NC_014158	CAC	2	6	610357	610362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296138317
16023	NC_014158	GCC	2	6	610372	610377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138317
16024	NC_014158	CGG	2	6	610389	610394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138317
16025	NC_014158	GCT	2	6	610395	610400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138317
16026	NC_014158	TG	3	6	610421	610426	0 %	50 %	50 %	0 %	296138317
16027	NC_014158	AGT	2	6	610467	610472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296138317
16028	NC_014158	CCA	3	9	610482	610490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296138317
16029	NC_014158	CTC	2	6	610507	610512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296138317
16030	NC_014158	GAGGC	2	10	610517	610526	20 %	0 %	60 %	20 %	296138317
16031	NC_014158	CCGG	2	8	610560	610567	0 %	0 %	50 %	50 %	296138317
16032	NC_014158	CGA	2	6	610572	610577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138317
16033	NC_014158	CGG	2	6	610677	610682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138317
16034	NC_014158	CGA	2	6	610708	610713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138317
16035	NC_014158	CCG	2	6	610763	610768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138317
16036	NC_014158	CAA	2	6	610890	610895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16037	NC_014158	CTC	2	6	610897	610902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16038	NC_014158	TCGG	2	8	610924	610931	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16039	NC_014158	CGG	2	6	610935	610940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16040	NC_014158	GGAGT	2	10	610946	610955	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
16041	NC_014158	TTCG	2	8	611011	611018	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16042	NC_014158	TGC	2	6	611043	611048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16043	NC_014158	TGA	2	6	611081	611086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296138318
16044	NC_014158	CCG	2	6	611145	611150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138318
16045	NC_014158	CTC	2	6	611158	611163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296138318
16046	NC_014158	GTG	2	6	611179	611184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296138318
16047	NC_014158	TCGA	2	8	611209	611216	25 %	25 %	25 %	25 %	296138318
16048	NC_014158	GGC	2	6	611229	611234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138318
16049	NC_014158	GGT	2	6	611250	611255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296138318
16050	NC_014158	CGA	2	6	611268	611273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138318
16051	NC_014158	GCG	2	6	611278	611283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138318
16052	NC_014158	TTG	2	6	611284	611289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296138318
16053	NC_014158	CGT	2	6	611294	611299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138318
16054	NC_014158	GAG	2	6	611308	611313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296138318
16055	NC_014158	GGGC	2	8	611314	611321	0 %	0 %	75 %	25 %	296138318
16056	NC_014158	GGT	2	6	611364	611369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296138318
16057	NC_014158	TCG	2	6	611381	611386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138318
16058	NC_014158	ACACCG	2	12	611546	611557	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	296138318
16059	NC_014158	GAT	2	6	611592	611597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296138318
16060	NC_014158	CCGG	2	8	611637	611644	0 %	0 %	50 %	50 %	296138318
16061	NC_014158	CGACA	2	10	611730	611739	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
16062	NC_014158	CGG	2	6	611789	611794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138319
16063	NC_014158	TCG	2	6	611890	611895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138319
16064	NC_014158	TGC	2	6	611921	611926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138319
16065	NC_014158	GAT	2	6	611943	611948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296138319
16066	NC_014158	CGA	2	6	611951	611956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138319
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16068	NC_014158	GAT	2	6	611997	612002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296138319
16069	NC_014158	CCG	2	6	612037	612042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138319
16070	NC_014158	CGG	2	6	612107	612112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138319
16071	NC_014158	CCG	2	6	612127	612132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138319
16072	NC_014158	GCCGAT	2	12	612141	612152	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296138319
16073	NC_014158	GTC	2	6	612186	612191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138319
16074	NC_014158	CGC	2	6	612227	612232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138319
16075	NC_014158	CAGC	2	8	612243	612250	25 %	0 %	25 %	50 %	296138319
16076	NC_014158	GAT	2	6	612267	612272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296138319
16077	NC_014158	ACC	2	6	612280	612285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296138319
16078	NC_014158	GCC	2	6	612294	612299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138319
16079	NC_014158	AAG	2	6	612307	612312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296138319
16080	NC_014158	CGGGC	2	10	612345	612354	0 %	0 %	60 %	40 %	296138319
16081	NC_014158	GAC	2	6	612363	612368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138319
16082	NC_014158	ACC	2	6	612410	612415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296138319
16083	NC_014158	CAA	2	6	612491	612496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16084	NC_014158	GGC	2	6	612523	612528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16085	NC_014158	CAC	2	6	612581	612586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296138320
16086	NC_014158	CAG	2	6	612596	612601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138320
16087	NC_014158	CGC	2	6	612634	612639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138320
16088	NC_014158	GCCG	2	8	612652	612659	0 %	0 %	50 %	50 %	296138320
16089	NC_014158	CG	4	8	612670	612677	0 %	0 %	50 %	50 %	296138320
16090	NC_014158	ACG	2	6	612726	612731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138320
16091	NC_014158	TCG	2	6	612741	612746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138320
16092	NC_014158	GC	3	6	612805	612810	0 %	0 %	50 %	50 %	296138320
16093	NC_014158	GT	3	6	612926	612931	0 %	50 %	50 %	0 %	296138321
16094	NC_014158	GCAG	2	8	613015	613022	25 %	0 %	50 %	25 %	296138321
16095	NC_014158	CGG	2	6	613100	613105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138321
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16099	NC_014158	GTC	2	6	613254	613259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138321
16100	NC_014158	GAG	2	6	613356	613361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296138321
16101	NC_014158	TGC	2	6	613414	613419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138321
16102	NC_014158	GC	3	6	613487	613492	0 %	0 %	50 %	50 %	296138321
16103	NC_014158	CGT	2	6	613532	613537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138321
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16105	NC_014158	CG	3	6	613723	613728	0 %	0 %	50 %	50 %	296138322
16106	NC_014158	CGA	2	6	613819	613824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138322
16107	NC_014158	CTG	2	6	613847	613852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138322
16108	NC_014158	CGC	2	6	613855	613860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138322
16109	NC_014158	GC	3	6	613977	613982	0 %	0 %	50 %	50 %	296138322
16110	NC_014158	GGT	2	6	613984	613989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296138322
16111	NC_014158	TCC	2	6	614016	614021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296138322
16112	NC_014158	CGG	2	6	614028	614033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138322
16113	NC_014158	CGA	2	6	614035	614040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138322
16114	NC_014158	GC	3	6	614123	614128	0 %	0 %	50 %	50 %	296138322
16115	NC_014158	GCT	2	6	614143	614148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138322
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16117	NC_014158	CGA	2	6	614263	614268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138322
16118	NC_014158	CG	3	6	614272	614277	0 %	0 %	50 %	50 %	296138322
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16120	NC_014158	CGGT	2	8	614300	614307	0 %	25 %	50 %	25 %	296138322
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16360	NC_014158	TGG	2	6	624164	624169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296138334
16361	NC_014158	CGA	2	6	624197	624202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138334
16362	NC_014158	CGC	2	6	624209	624214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138334
16363	NC_014158	TTG	2	6	624220	624225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296138334
16364	NC_014158	GGCC	2	8	624266	624273	0 %	0 %	50 %	50 %	296138334
16365	NC_014158	GCACGT	2	12	624287	624298	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296138334
16366	NC_014158	CTT	2	6	624309	624314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296138334
16367	NC_014158	CGA	2	6	624320	624325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138334
16368	NC_014158	CCGCA	2	10	624383	624392	20 %	0 %	20 %	60 %	296138334
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16372	NC_014158	TCC	2	6	624486	624491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16373	NC_014158	CG	3	6	624503	624508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16374	NC_014158	CAC	2	6	624541	624546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16375	NC_014158	GTA	2	6	624552	624557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16377	NC_014158	CGC	2	6	624575	624580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16378	NC_014158	CGG	2	6	624588	624593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16379	NC_014158	CG	3	6	624613	624618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16380	NC_014158	CGT	2	6	624645	624650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16382	NC_014158	AGC	2	6	624761	624766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16478	NC_014158	CGA	2	6	628543	628548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138339
16479	NC_014158	CGG	2	6	628553	628558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138339
16480	NC_014158	GTGCG	2	10	628566	628575	0 %	20 %	60 %	20 %	296138339
16481	NC_014158	GCC	2	6	628646	628651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138339
16482	NC_014158	CG	3	6	628694	628699	0 %	0 %	50 %	50 %	296138339
16483	NC_014158	GCC	2	6	628700	628705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138339
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16486	NC_014158	CGC	2	6	628756	628761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138339
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16488	NC_014158	AGG	2	6	628830	628835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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16491	NC_014158	CGGGT	2	10	628905	628914	0 %	20 %	60 %	20 %	296138340
16492	NC_014158	GCG	2	6	628920	628925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138340
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16499	NC_014158	GGCC	2	8	629049	629056	0 %	0 %	50 %	50 %	296138340
16500	NC_014158	CG	3	6	629116	629121	0 %	0 %	50 %	50 %	296138340

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