MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tsukamurella paurometabola DSM 20162 chromosome

Total Repeats: 114837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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108002	NC_014158	CAC	2	6	4113782	4113787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141654
108003	NC_014158	CGG	2	6	4113847	4113852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141654
108004	NC_014158	GGA	2	6	4113941	4113946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296141654
108005	NC_014158	GCC	2	6	4113980	4113985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141654
108006	NC_014158	CGG	2	6	4114003	4114008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141654
108007	NC_014158	TGG	2	6	4114033	4114038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141654
108008	NC_014158	TCGG	2	8	4114041	4114048	0 %	25 %	50 %	25 %	296141654
108009	NC_014158	CGC	2	6	4114114	4114119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141654
108010	NC_014158	CGG	2	6	4114174	4114179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141654
108011	NC_014158	TGA	2	6	4114183	4114188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141654
108012	NC_014158	TCG	2	6	4114230	4114235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141654
108013	NC_014158	CCG	2	6	4114236	4114241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141654
108014	NC_014158	CGG	2	6	4114250	4114255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141654
108015	NC_014158	CAC	3	9	4114256	4114264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141654
108016	NC_014158	GA	3	6	4114324	4114329	50 %	0 %	50 %	0 %	296141654
108017	NC_014158	TGACGC	2	12	4114411	4114422	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296141654
108018	NC_014158	GGC	2	6	4114429	4114434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141654
108019	NC_014158	GT	3	6	4114468	4114473	0 %	50 %	50 %	0 %	296141654
108020	NC_014158	CG	3	6	4114534	4114539	0 %	0 %	50 %	50 %	296141654
108021	NC_014158	CGGC	2	8	4114546	4114553	0 %	0 %	50 %	50 %	296141654
108022	NC_014158	GCC	3	9	4114572	4114580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141654
108023	NC_014158	GCTCG	2	10	4114591	4114600	0 %	20 %	40 %	40 %	296141654
108024	NC_014158	GATC	2	8	4114618	4114625	25 %	25 %	25 %	25 %	296141654
108025	NC_014158	CGC	2	6	4114634	4114639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141654
108026	NC_014158	AGCG	2	8	4114680	4114687	25 %	0 %	50 %	25 %	296141654
108027	NC_014158	GGCG	2	8	4114741	4114748	0 %	0 %	75 %	25 %	296141654
108028	NC_014158	TGC	2	6	4114786	4114791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141654
108029	NC_014158	CGG	2	6	4114831	4114836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141654
108030	NC_014158	CGG	2	6	4114839	4114844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141654
108031	NC_014158	CGG	2	6	4114873	4114878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141654
108032	NC_014158	GC	3	6	4114923	4114928	0 %	0 %	50 %	50 %	296141654
108033	NC_014158	GGCC	2	8	4114969	4114976	0 %	0 %	50 %	50 %	296141654
108034	NC_014158	GCG	3	9	4114977	4114985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141654
108035	NC_014158	GTG	2	6	4115015	4115020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141654
108036	NC_014158	GGC	2	6	4115021	4115026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141654
108037	NC_014158	TCC	2	6	4115115	4115120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296141654
108038	NC_014158	CAT	2	6	4115186	4115191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296141654
108039	NC_014158	GCC	2	6	4115259	4115264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141654
108040	NC_014158	TGG	2	6	4115274	4115279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141654
108041	NC_014158	GCA	2	6	4115395	4115400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141654
108042	NC_014158	CGG	2	6	4115401	4115406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141654
108043	NC_014158	GCGG	2	8	4115411	4115418	0 %	0 %	75 %	25 %	296141654
108044	NC_014158	CCGA	2	8	4115497	4115504	25 %	0 %	25 %	50 %	296141654
108045	NC_014158	CGG	2	6	4115604	4115609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141654
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108048	NC_014158	CGG	2	6	4115701	4115706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141654
108049	NC_014158	CGA	2	6	4115707	4115712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141654
108050	NC_014158	CGGCTT	2	12	4115729	4115740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141654
108051	NC_014158	GCGAC	2	10	4115787	4115796	20 %	0 %	40 %	40 %	296141654
108052	NC_014158	GTG	2	6	4115834	4115839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141654
108053	NC_014158	CGG	2	6	4115953	4115958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141654
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108055	NC_014158	TGC	2	6	4116025	4116030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141654
108056	NC_014158	GTC	2	6	4116059	4116064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141654
108057	NC_014158	GGC	2	6	4116104	4116109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141654
108058	NC_014158	GGC	2	6	4116116	4116121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141654
108059	NC_014158	TCT	2	6	4116127	4116132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296141654
108060	NC_014158	CTG	2	6	4116197	4116202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141654
108061	NC_014158	CCA	2	6	4116253	4116258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141654
108062	NC_014158	GTCGC	2	10	4116271	4116280	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
108063	NC_014158	GCG	2	6	4116322	4116327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108064	NC_014158	CG	3	6	4116362	4116367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108065	NC_014158	ATTG	2	8	4116473	4116480	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108066	NC_014158	CGC	2	6	4116494	4116499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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108068	NC_014158	CGC	2	6	4116575	4116580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108069	NC_014158	CAC	2	6	4116606	4116611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108070	NC_014158	CCG	2	6	4116612	4116617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108071	NC_014158	CTC	3	9	4116655	4116663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108072	NC_014158	CGG	2	6	4116672	4116677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108073	NC_014158	TCC	2	6	4116740	4116745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108074	NC_014158	CTC	2	6	4116761	4116766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108075	NC_014158	CCGG	2	8	4116859	4116866	0 %	0 %	50 %	50 %	296141655
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108084	NC_014158	CGACTT	2	12	4117155	4117166	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	296141655
108085	NC_014158	ATC	2	6	4117177	4117182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296141655
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108087	NC_014158	TGA	2	6	4117236	4117241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141655
108088	NC_014158	GAA	2	6	4117278	4117283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296141655
108089	NC_014158	CGC	2	6	4117324	4117329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141655
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108098	NC_014158	CTGT	2	8	4117725	4117732	0 %	50 %	25 %	25 %	296141655
108099	NC_014158	CGA	2	6	4117830	4117835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141655
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108101	NC_014158	CGG	2	6	4117893	4117898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141655
108102	NC_014158	CAA	2	6	4117944	4117949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296141655
108103	NC_014158	CGA	2	6	4117977	4117982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141655
108104	NC_014158	CGA	2	6	4117998	4118003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141655
108105	NC_014158	CAT	2	6	4118112	4118117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296141655
108106	NC_014158	CGC	2	6	4118146	4118151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141655
108107	NC_014158	TCAG	2	8	4118165	4118172	25 %	25 %	25 %	25 %	296141655
108108	NC_014158	AGA	2	6	4118180	4118185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296141655
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108110	NC_014158	CGATC	2	10	4118253	4118262	20 %	20 %	20 %	40 %	296141655
108111	NC_014158	TCG	2	6	4118399	4118404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141655
108112	NC_014158	GAC	2	6	4118473	4118478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141655
108113	NC_014158	CGTG	2	8	4118508	4118515	0 %	25 %	50 %	25 %	296141655
108114	NC_014158	CGA	2	6	4118520	4118525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141655
108115	NC_014158	CAC	2	6	4118565	4118570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141655
108116	NC_014158	CT	3	6	4118574	4118579	0 %	50 %	0 %	50 %	296141655
108117	NC_014158	GC	3	6	4118580	4118585	0 %	0 %	50 %	50 %	296141655
108118	NC_014158	CG	3	6	4118605	4118610	0 %	0 %	50 %	50 %	296141655
108119	NC_014158	CGAG	2	8	4118623	4118630	25 %	0 %	50 %	25 %	296141655
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108122	NC_014158	GCC	2	6	4118843	4118848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141656
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108127	NC_014158	CGA	2	6	4119051	4119056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141656
108128	NC_014158	ACA	2	6	4119099	4119104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296141656
108129	NC_014158	ACG	2	6	4119137	4119142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141656
108130	NC_014158	AGC	2	6	4119152	4119157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141656
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108135	NC_014158	CAC	2	6	4119385	4119390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141656
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108138	NC_014158	TGA	2	6	4119450	4119455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141656
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108142	NC_014158	CGC	2	6	4119525	4119530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141656
108143	NC_014158	GAGAAG	2	12	4119560	4119571	50 %	0 %	50 %	0 %	296141656
108144	NC_014158	CAG	2	6	4119595	4119600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141656
108145	NC_014158	CCG	2	6	4119602	4119607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141656
108146	NC_014158	CGG	2	6	4119619	4119624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141656
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108151	NC_014158	GC	3	6	4119822	4119827	0 %	0 %	50 %	50 %	296141657
108152	NC_014158	AG	3	6	4119872	4119877	50 %	0 %	50 %	0 %	296141657
108153	NC_014158	GCG	2	6	4119934	4119939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141657
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108177	NC_014158	GCT	2	6	4120907	4120912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141657
108178	NC_014158	CGG	2	6	4120928	4120933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141657
108179	NC_014158	CGA	2	6	4120957	4120962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141657
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108193	NC_014158	TCG	2	6	4121573	4121578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141658
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108195	NC_014158	AT	3	6	4121670	4121675	50 %	50 %	0 %	0 %	296141658
108196	NC_014158	GCG	2	6	4121740	4121745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141658
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108198	NC_014158	ACG	2	6	4122007	4122012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141658
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108202	NC_014158	CGG	2	6	4122193	4122198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141658
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108210	NC_014158	CGA	2	6	4122622	4122627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141660
108211	NC_014158	ACC	2	6	4122636	4122641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141660
108212	NC_014158	TGC	2	6	4122685	4122690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141660
108213	NC_014158	GCG	2	6	4122851	4122856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141660
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108216	NC_014158	CA	3	6	4122903	4122908	50 %	0 %	0 %	50 %	296141660
108217	NC_014158	GCG	2	6	4122933	4122938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141660
108218	NC_014158	CCA	2	6	4123018	4123023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141660
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108221	NC_014158	TCC	2	6	4123137	4123142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296141660
108222	NC_014158	CGGAC	2	10	4123145	4123154	20 %	0 %	40 %	40 %	296141660
108223	NC_014158	GTT	2	6	4123169	4123174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296141660
108224	NC_014158	CAC	2	6	4123175	4123180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141660
108225	NC_014158	GGC	2	6	4123211	4123216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141660
108226	NC_014158	CGG	2	6	4123276	4123281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141660
108227	NC_014158	CAG	2	6	4123334	4123339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141660
108228	NC_014158	CGA	2	6	4123364	4123369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141660
108229	NC_014158	GTGCG	2	10	4123384	4123393	0 %	20 %	60 %	20 %	296141660
108230	NC_014158	GCG	4	12	4123436	4123447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141661
108231	NC_014158	CCG	2	6	4123478	4123483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141661
108232	NC_014158	CCG	4	12	4123520	4123531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141661
108233	NC_014158	ACC	2	6	4123618	4123623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141661
108234	NC_014158	CAC	2	6	4123711	4123716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141661
108235	NC_014158	CGC	2	6	4123842	4123847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141661
108236	NC_014158	TGC	2	6	4123913	4123918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141661
108237	NC_014158	CCGGG	2	10	4123932	4123941	0 %	0 %	60 %	40 %	296141661
108238	NC_014158	GAT	2	6	4124038	4124043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141661
108239	NC_014158	AGT	2	6	4124067	4124072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141661
108240	NC_014158	TCG	2	6	4124100	4124105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141661
108241	NC_014158	GCG	2	6	4124135	4124140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141661
108242	NC_014158	CGA	2	6	4124170	4124175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141661
108243	NC_014158	GAT	2	6	4124185	4124190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141661
108244	NC_014158	TGC	2	6	4124201	4124206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141661
108245	NC_014158	GCCG	2	8	4124278	4124285	0 %	0 %	50 %	50 %	296141661
108246	NC_014158	TGC	2	6	4124342	4124347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141661
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108256	NC_014158	GCCGC	2	10	4124699	4124708	0 %	0 %	40 %	60 %	296141661
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108259	NC_014158	CGG	2	6	4124850	4124855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141661
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108262	NC_014158	GCC	2	6	4124938	4124943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141661
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108264	NC_014158	TCG	2	6	4125004	4125009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141661
108265	NC_014158	GGCC	2	8	4125051	4125058	0 %	0 %	50 %	50 %	296141661
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108267	NC_014158	TGC	2	6	4125101	4125106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141661
108268	NC_014158	CAT	2	6	4125112	4125117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296141661
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108270	NC_014158	GCAC	2	8	4125171	4125178	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108271	NC_014158	GC	3	6	4125235	4125240	0 %	0 %	50 %	50 %	296141662
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108275	NC_014158	CGA	2	6	4125459	4125464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141662
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108289	NC_014158	GCCC	2	8	4125933	4125940	0 %	0 %	25 %	75 %	296141663
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108331	NC_014158	CGG	2	6	4127526	4127531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141664
108332	NC_014158	GAT	2	6	4127542	4127547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141664
108333	NC_014158	ACCG	2	8	4127552	4127559	25 %	0 %	25 %	50 %	296141664
108334	NC_014158	CGC	2	6	4127572	4127577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141664
108335	NC_014158	GACCG	2	10	4127609	4127618	20 %	0 %	40 %	40 %	296141664
108336	NC_014158	CGG	2	6	4127619	4127624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141664
108337	NC_014158	GCG	2	6	4127721	4127726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141664
108338	NC_014158	CGG	2	6	4127835	4127840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141664
108339	NC_014158	TCG	2	6	4127888	4127893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141664
108340	NC_014158	TTC	2	6	4127942	4127947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296141664
108341	NC_014158	GGT	2	6	4128003	4128008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141664
108342	NC_014158	GC	3	6	4128025	4128030	0 %	0 %	50 %	50 %	296141664
108343	NC_014158	GCT	2	6	4128042	4128047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141664
108344	NC_014158	GGC	3	9	4128091	4128099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141664
108345	NC_014158	GGATC	2	10	4128117	4128126	20 %	20 %	40 %	20 %	296141664
108346	NC_014158	TCG	2	6	4128161	4128166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141664
108347	NC_014158	CGT	2	6	4128231	4128236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141664
108348	NC_014158	AGC	2	6	4128239	4128244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141664
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108351	NC_014158	CCG	2	6	4128386	4128391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141665
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108353	NC_014158	CCGG	2	8	4128422	4128429	0 %	0 %	50 %	50 %	296141665
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108356	NC_014158	CGC	2	6	4128554	4128559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141665
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