MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tsukamurella paurometabola DSM 20162 chromosome

Total Repeats: 114837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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100002	NC_014158	AAG	2	6	3812398	3812403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296141368
100003	NC_014158	GGT	2	6	3812448	3812453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141368
100004	NC_014158	CGC	2	6	3812454	3812459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141368
100005	NC_014158	CAC	2	6	3812466	3812471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141368
100006	NC_014158	GCT	2	6	3812517	3812522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141368
100007	NC_014158	CGGCTT	2	12	3812526	3812537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141368
100008	NC_014158	CGC	2	6	3812592	3812597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141368
100009	NC_014158	CAG	2	6	3812668	3812673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141368
100010	NC_014158	AGA	2	6	3812717	3812722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296141368
100011	NC_014158	GACC	2	8	3812739	3812746	25 %	0 %	25 %	50 %	296141368
100012	NC_014158	CGC	2	6	3812747	3812752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141368
100013	NC_014158	TGG	2	6	3812798	3812803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141368
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100015	NC_014158	CGG	2	6	3812828	3812833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141368
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100020	NC_014158	CGC	2	6	3813018	3813023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141369
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100036	NC_014158	GCG	2	6	3813838	3813843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100037	NC_014158	CG	3	6	3813861	3813866	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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100039	NC_014158	ACT	2	6	3813927	3813932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296141370
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100227	NC_014158	CCT	2	6	3821216	3821221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296141376
100228	NC_014158	CTC	2	6	3821316	3821321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296141376
100229	NC_014158	TGA	2	6	3821327	3821332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141376
100230	NC_014158	CCTT	2	8	3821335	3821342	0 %	50 %	0 %	50 %	296141376
100231	NC_014158	GCCG	2	8	3821391	3821398	0 %	0 %	50 %	50 %	296141376
100232	NC_014158	AGC	2	6	3821412	3821417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141376
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100234	NC_014158	CCT	2	6	3821447	3821452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296141376
100235	NC_014158	CGGTGG	2	12	3821570	3821581	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	296141376
100236	NC_014158	CGT	2	6	3821600	3821605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141376
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100239	NC_014158	TCT	2	6	3821645	3821650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296141376
100240	NC_014158	CGT	2	6	3821693	3821698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141376
100241	NC_014158	CTT	2	6	3821721	3821726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296141376
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100247	NC_014158	TCT	2	6	3821900	3821905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100248	NC_014158	TCGAT	2	10	3821909	3821918	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
100249	NC_014158	GACG	2	8	3821925	3821932	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100250	NC_014158	GCC	2	6	3822080	3822085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100251	NC_014158	GC	4	8	3822089	3822096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100252	NC_014158	TGC	2	6	3822122	3822127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100253	NC_014158	CCG	2	6	3822152	3822157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100254	NC_014158	CGT	2	6	3822198	3822203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141377
100255	NC_014158	GGTC	2	8	3822230	3822237	0 %	25 %	50 %	25 %	296141377
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100257	NC_014158	GTTTTC	2	12	3822286	3822297	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	296141377
100258	NC_014158	GGC	2	6	3822298	3822303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141377
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100261	NC_014158	CACCAA	2	12	3822363	3822374	50 %	0 %	0 %	50 %	296141377
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100263	NC_014158	GGC	2	6	3822499	3822504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141377
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100271	NC_014158	CG	3	6	3822668	3822673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100272	NC_014158	TCG	2	6	3822738	3822743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141378
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100327	NC_014158	CCG	2	6	3825127	3825132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100328	NC_014158	CGGTG	2	10	3825145	3825154	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
100329	NC_014158	CG	3	6	3825180	3825185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100330	NC_014158	GAACC	2	10	3825359	3825368	40 %	0 %	20 %	40 %	296141380
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100333	NC_014158	CGGA	2	8	3825441	3825448	25 %	0 %	50 %	25 %	296141380
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100335	NC_014158	CCG	2	6	3825480	3825485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141380
100336	NC_014158	GCC	2	6	3825526	3825531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141380
100337	NC_014158	ATCCG	2	10	3825553	3825562	20 %	20 %	20 %	40 %	296141380
100338	NC_014158	GCCCGG	2	12	3825579	3825590	0 %	0 %	50 %	50 %	296141380
100339	NC_014158	GCG	2	6	3825618	3825623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141380
100340	NC_014158	CCG	2	6	3825624	3825629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141380
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100342	NC_014158	GGC	2	6	3825689	3825694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141380
100343	NC_014158	TCG	2	6	3825717	3825722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141380
100344	NC_014158	GCG	3	9	3825738	3825746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141380
100345	NC_014158	CGA	2	6	3825754	3825759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141380
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100350	NC_014158	CGC	2	6	3825931	3825936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141380
100351	NC_014158	GCT	2	6	3825964	3825969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141380
100352	NC_014158	CCGC	2	8	3826023	3826030	0 %	0 %	25 %	75 %	296141380
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100354	NC_014158	CGC	2	6	3826072	3826077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141380
100355	NC_014158	CGCCAC	2	12	3826171	3826182	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	296141380
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100372	NC_014158	CGA	2	6	3826620	3826625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141381
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100400	NC_014158	CGG	2	6	3827584	3827589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141381
100401	NC_014158	CGTGC	2	10	3827590	3827599	0 %	20 %	40 %	40 %	296141381
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100404	NC_014158	AGG	2	6	3827822	3827827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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100407	NC_014158	ATC	3	9	3827905	3827913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296141382
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100412	NC_014158	CGG	2	6	3828000	3828005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141382
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100423	NC_014158	GCC	2	6	3828506	3828511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141383
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100454	NC_014158	TCG	2	6	3829458	3829463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141384
100455	NC_014158	GGC	2	6	3829528	3829533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141384
100456	NC_014158	TCGCGG	2	12	3829545	3829556	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	296141384
100457	NC_014158	GCT	2	6	3829594	3829599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141384
100458	NC_014158	GTG	2	6	3829604	3829609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141384
100459	NC_014158	CTG	2	6	3829619	3829624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141384
100460	NC_014158	CGGCC	2	10	3829662	3829671	0 %	0 %	40 %	60 %	296141384
100461	NC_014158	GCG	2	6	3829699	3829704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141384
100462	NC_014158	GCC	2	6	3829751	3829756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141384
100463	NC_014158	CCG	2	6	3829776	3829781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141384
100464	NC_014158	CG	3	6	3829780	3829785	0 %	0 %	50 %	50 %	296141384
100465	NC_014158	GAC	2	6	3829818	3829823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141384
100466	NC_014158	GCTGC	2	10	3829824	3829833	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
100467	NC_014158	CTC	2	6	3829976	3829981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296141385
100468	NC_014158	CCG	3	9	3829995	3830003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141385
100469	NC_014158	GCACC	2	10	3830025	3830034	20 %	0 %	20 %	60 %	296141385
100470	NC_014158	CGA	2	6	3830050	3830055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141385
100471	NC_014158	GGT	2	6	3830095	3830100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141385
100472	NC_014158	CGCC	2	8	3830106	3830113	0 %	0 %	25 %	75 %	296141385
100473	NC_014158	TGC	3	9	3830136	3830144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141385
100474	NC_014158	GCT	2	6	3830197	3830202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141385
100475	NC_014158	TGA	2	6	3830211	3830216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141385
100476	NC_014158	GCA	2	6	3830284	3830289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141385
100477	NC_014158	ACGA	2	8	3830318	3830325	50 %	0 %	25 %	25 %	296141385
100478	NC_014158	GCT	2	6	3830326	3830331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141385
100479	NC_014158	CGG	2	6	3830421	3830426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141385
100480	NC_014158	GCG	2	6	3830427	3830432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141385
100481	NC_014158	GGTCAC	2	12	3830434	3830445	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296141385
100482	NC_014158	CGAGGC	2	12	3830464	3830475	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296141385
100483	NC_014158	TGG	2	6	3830508	3830513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141385
100484	NC_014158	CGA	2	6	3830563	3830568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141385
100485	NC_014158	GCT	2	6	3830575	3830580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141385
100486	NC_014158	GC	3	6	3830592	3830597	0 %	0 %	50 %	50 %	296141385
100487	NC_014158	GCG	2	6	3830634	3830639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141385
100488	NC_014158	CGT	2	6	3830662	3830667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141385
100489	NC_014158	CGCGC	2	10	3830668	3830677	0 %	0 %	40 %	60 %	296141385
100490	NC_014158	CG	3	6	3830755	3830760	0 %	0 %	50 %	50 %	296141385
100491	NC_014158	GC	3	6	3830764	3830769	0 %	0 %	50 %	50 %	296141385
100492	NC_014158	GCG	2	6	3830789	3830794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141385
100493	NC_014158	CTG	2	6	3830819	3830824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141385
100494	NC_014158	CCA	2	6	3830847	3830852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141385
100495	NC_014158	CGA	2	6	3830860	3830865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141385
100496	NC_014158	CCA	2	6	3830907	3830912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141385
100497	NC_014158	CGGAC	2	10	3830961	3830970	20 %	0 %	40 %	40 %	296141385
100498	NC_014158	AGC	2	6	3830997	3831002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141385
100499	NC_014158	GCGA	2	8	3831003	3831010	25 %	0 %	50 %	25 %	296141385
100500	NC_014158	CGAC	2	8	3831039	3831046	25 %	0 %	25 %	50 %	296141385

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