MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tsukamurella paurometabola DSM 20162 chromosome

Total Repeats: 114837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014158	AGG	2	6	207312	207317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137943
5502	NC_014158	CCG	2	6	207336	207341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137943
5503	NC_014158	GTGC	2	8	207387	207394	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5504	NC_014158	CCG	2	6	207410	207415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137944
5505	NC_014158	GC	3	6	207433	207438	0 %	0 %	50 %	50 %	296137944
5506	NC_014158	AGC	2	6	207452	207457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137944
5507	NC_014158	GAG	2	6	207535	207540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137944
5508	NC_014158	CACCG	2	10	207565	207574	20 %	0 %	20 %	60 %	296137944
5509	NC_014158	GCG	2	6	207575	207580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137944
5510	NC_014158	ACC	2	6	207582	207587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137944
5511	NC_014158	CGGT	2	8	207590	207597	0 %	25 %	50 %	25 %	296137944
5512	NC_014158	GCG	2	6	207677	207682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137944
5513	NC_014158	CGG	2	6	207720	207725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137944
5514	NC_014158	CG	3	6	207736	207741	0 %	0 %	50 %	50 %	296137944
5515	NC_014158	GC	3	6	207742	207747	0 %	0 %	50 %	50 %	296137944
5516	NC_014158	CAC	2	6	207781	207786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137944
5517	NC_014158	CCG	2	6	207816	207821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137944
5518	NC_014158	CCA	2	6	207897	207902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137944
5519	NC_014158	CCCGCG	2	12	207913	207924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137944
5520	NC_014158	GGA	2	6	207936	207941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137944
5521	NC_014158	GC	3	6	207954	207959	0 %	0 %	50 %	50 %	296137944
5522	NC_014158	GAGGCC	3	18	207979	207996	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296137944
5523	NC_014158	GAG	2	6	208000	208005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137944
5524	NC_014158	GAC	2	6	208109	208114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137945
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5526	NC_014158	GCG	2	6	208149	208154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137945
5527	NC_014158	CG	3	6	208157	208162	0 %	0 %	50 %	50 %	296137945
5528	NC_014158	CGG	2	6	208180	208185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137945
5529	NC_014158	AGC	2	6	208210	208215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137945
5530	NC_014158	CGGC	2	8	208325	208332	0 %	0 %	50 %	50 %	296137945
5531	NC_014158	GCCGG	2	10	208344	208353	0 %	0 %	60 %	40 %	296137945
5532	NC_014158	GGTTC	2	10	208399	208408	0 %	40 %	40 %	20 %	296137945
5533	NC_014158	CGG	2	6	208417	208422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137945
5534	NC_014158	GAC	2	6	208464	208469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137945
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5536	NC_014158	CAC	2	6	208520	208525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137945
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5538	NC_014158	CG	3	6	208604	208609	0 %	0 %	50 %	50 %	296137945
5539	NC_014158	TGG	2	6	208629	208634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137945
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5541	NC_014158	GAC	2	6	208677	208682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137945
5542	NC_014158	TGC	2	6	208696	208701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137945
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5544	NC_014158	CCCG	2	8	208742	208749	0 %	0 %	25 %	75 %	296137945
5545	NC_014158	CGCAT	2	10	208750	208759	20 %	20 %	20 %	40 %	296137945
5546	NC_014158	CTGGG	2	10	208800	208809	0 %	20 %	60 %	20 %	296137945
5547	NC_014158	GTG	2	6	208849	208854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137945
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5551	NC_014158	CTG	2	6	208990	208995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_014158	CCCG	2	8	208997	209004	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5553	NC_014158	GCG	2	6	209045	209050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137946
5554	NC_014158	TCG	2	6	209097	209102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137946
5555	NC_014158	CTG	2	6	209109	209114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137946
5556	NC_014158	CGG	2	6	209137	209142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137946
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5558	NC_014158	GTG	2	6	209256	209261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137946
5559	NC_014158	GCCCG	2	10	209292	209301	0 %	0 %	40 %	60 %	296137946
5560	NC_014158	GC	3	6	209328	209333	0 %	0 %	50 %	50 %	296137946
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5594	NC_014158	GGCG	2	8	210410	210417	0 %	0 %	75 %	25 %	296137946
5595	NC_014158	CG	3	6	210453	210458	0 %	0 %	50 %	50 %	296137946
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5607	NC_014158	GC	3	6	210941	210946	0 %	0 %	50 %	50 %	296137947
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5609	NC_014158	CGGGC	2	10	210961	210970	0 %	0 %	60 %	40 %	296137947
5610	NC_014158	CG	3	6	210975	210980	0 %	0 %	50 %	50 %	296137947
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5621	NC_014158	GATC	2	8	211464	211471	25 %	25 %	25 %	25 %	296137948
5622	NC_014158	CGT	2	6	211485	211490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137948
5623	NC_014158	CACT	2	8	211514	211521	25 %	25 %	0 %	50 %	296137948
5624	NC_014158	ACG	2	6	211547	211552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137948
5625	NC_014158	GTG	2	6	211559	211564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137948
5626	NC_014158	GCG	2	6	211619	211624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137948
5627	NC_014158	CA	3	6	211659	211664	50 %	0 %	0 %	50 %	296137948
5628	NC_014158	AGGCC	2	10	211704	211713	20 %	0 %	40 %	40 %	296137948
5629	NC_014158	CGT	2	6	211794	211799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137948
5630	NC_014158	GCT	2	6	211811	211816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137948
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5632	NC_014158	CCA	2	6	211860	211865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137948
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5635	NC_014158	CGG	2	6	212001	212006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137948
5636	NC_014158	CCGA	2	8	212018	212025	25 %	0 %	25 %	50 %	296137948
5637	NC_014158	GGA	2	6	212106	212111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137948
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5642	NC_014158	CCG	2	6	212221	212226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137949
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5646	NC_014158	GC	3	6	212323	212328	0 %	0 %	50 %	50 %	296137949
5647	NC_014158	TCGG	2	8	212332	212339	0 %	25 %	50 %	25 %	296137949
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5654	NC_014158	GGTC	2	8	212587	212594	0 %	25 %	50 %	25 %	296137949
5655	NC_014158	TGG	2	6	212644	212649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137950
5656	NC_014158	CGG	2	6	212707	212712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137950
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5658	NC_014158	TCG	2	6	212781	212786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137950
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5660	NC_014158	AGC	2	6	212835	212840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137950
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5662	NC_014158	CG	3	6	212987	212992	0 %	0 %	50 %	50 %	296137950
5663	NC_014158	GCAG	2	8	213089	213096	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5664	NC_014158	TCG	2	6	213129	213134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137951
5665	NC_014158	TCG	2	6	213186	213191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137951
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5667	NC_014158	CACC	2	8	213256	213263	25 %	0 %	0 %	75 %	296137951
5668	NC_014158	TCG	2	6	213303	213308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137951
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5697	NC_014158	GATCG	2	10	214472	214481	20 %	20 %	40 %	20 %	296137951
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5720	NC_014158	TCCCGC	2	12	215472	215483	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
5721	NC_014158	G	6	6	215572	215577	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5722	NC_014158	GCGGG	2	10	215588	215597	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5723	NC_014158	GC	3	6	215646	215651	0 %	0 %	50 %	50 %	296137952
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5732	NC_014158	GTG	2	6	216100	216105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137952
5733	NC_014158	GCT	2	6	216129	216134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137952
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5739	NC_014158	GAC	2	6	216361	216366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137952
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5741	NC_014158	CGC	2	6	216429	216434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137952
5742	NC_014158	GAA	2	6	216441	216446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296137952
5743	NC_014158	GC	3	6	216480	216485	0 %	0 %	50 %	50 %	296137952
5744	NC_014158	GCGCC	2	10	216539	216548	0 %	0 %	40 %	60 %	296137953
5745	NC_014158	CTC	2	6	216564	216569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137953
5746	NC_014158	GGC	2	6	216585	216590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137953
5747	NC_014158	ACC	2	6	216715	216720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137953
5748	NC_014158	TCG	2	6	216742	216747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137953
5749	NC_014158	CG	3	6	216746	216751	0 %	0 %	50 %	50 %	296137953
5750	NC_014158	CGG	2	6	216764	216769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137953
5751	NC_014158	GC	3	6	216781	216786	0 %	0 %	50 %	50 %	296137953
5752	NC_014158	CGC	2	6	216792	216797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137953
5753	NC_014158	CGG	2	6	216824	216829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137953
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5755	NC_014158	CTC	2	6	216981	216986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137953
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5758	NC_014158	GAG	2	6	217094	217099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137954
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5760	NC_014158	GC	3	6	217346	217351	0 %	0 %	50 %	50 %	296137954
5761	NC_014158	GCT	2	6	217381	217386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137954
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5763	NC_014158	CGA	2	6	217432	217437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137954
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5769	NC_014158	GAC	2	6	217739	217744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137954
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5772	NC_014158	CG	3	6	217838	217843	0 %	0 %	50 %	50 %	296137954
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5777	NC_014158	TCA	2	6	218010	218015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5784	NC_014158	CGCT	2	8	218192	218199	0 %	25 %	25 %	50 %	296137955
5785	NC_014158	GTG	2	6	218234	218239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137955
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5822	NC_014158	GCG	3	9	219626	219634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137955
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5826	NC_014158	GCCG	2	8	219783	219790	0 %	0 %	50 %	50 %	296137955
5827	NC_014158	ACC	2	6	219850	219855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5851	NC_014158	CGA	2	6	220635	220640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137956
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5867	NC_014158	CAG	2	6	221221	221226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137957
5868	NC_014158	GGT	2	6	221230	221235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137957
5869	NC_014158	GC	3	6	221295	221300	0 %	0 %	50 %	50 %	296137957
5870	NC_014158	GC	3	6	221322	221327	0 %	0 %	50 %	50 %	296137957
5871	NC_014158	CGG	2	6	221391	221396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137957
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5875	NC_014158	AG	3	6	221551	221556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5886	NC_014158	CTG	2	6	222098	222103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137958
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5894	NC_014158	CGCGC	2	10	222403	222412	0 %	0 %	40 %	60 %	296137958
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5985	NC_014158	TGG	2	6	225611	225616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137961
5986	NC_014158	CGC	2	6	225642	225647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137961
5987	NC_014158	CCTCGT	2	12	225664	225675	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	296137962
5988	NC_014158	GCT	2	6	225685	225690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137962
5989	NC_014158	CGCTG	2	10	225827	225836	0 %	20 %	40 %	40 %	296137962
5990	NC_014158	CG	3	6	225843	225848	0 %	0 %	50 %	50 %	296137962
5991	NC_014158	ACG	2	6	225858	225863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137962
5992	NC_014158	GCA	2	6	225889	225894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137962
5993	NC_014158	ATCG	2	8	225938	225945	25 %	25 %	25 %	25 %	296137962
5994	NC_014158	CGG	2	6	226000	226005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137962
5995	NC_014158	TCG	2	6	226011	226016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137962
5996	NC_014158	GCG	2	6	226017	226022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137962
5997	NC_014158	TCG	2	6	226032	226037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137962
5998	NC_014158	TGA	2	6	226048	226053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137962
5999	NC_014158	CCG	2	6	226065	226070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137962
6000	NC_014158	CAG	2	6	226106	226111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137962

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