MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thiomonas intermedia K12 chromosome

Total Repeats: 82209

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014153	TGAA	2	8	20287	20294	50 %	25 %	25 %	0 %	296134519
502	NC_014153	CGG	3	9	20335	20343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134519
503	NC_014153	GGC	2	6	20351	20356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134519
504	NC_014153	GCT	2	6	20396	20401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134519
505	NC_014153	CTG	2	6	20406	20411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134519
506	NC_014153	GC	3	6	20458	20463	0 %	0 %	50 %	50 %	296134519
507	NC_014153	TGC	2	6	20467	20472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134519
508	NC_014153	CCA	2	6	20549	20554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134519
509	NC_014153	GGT	2	6	20588	20593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134519
510	NC_014153	GC	3	6	20642	20647	0 %	0 %	50 %	50 %	296134519
511	NC_014153	CAT	2	6	20652	20657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134519
512	NC_014153	GCC	2	6	20791	20796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134520
513	NC_014153	GCG	2	6	20804	20809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134520
514	NC_014153	GTG	2	6	20910	20915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134520
515	NC_014153	CAC	2	6	20943	20948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134520
516	NC_014153	GCA	3	9	20950	20958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134520
517	NC_014153	TGG	2	6	20994	20999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134520
518	NC_014153	CAG	2	6	21056	21061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134520
519	NC_014153	CAGC	2	8	21071	21078	25 %	0 %	25 %	50 %	296134520
520	NC_014153	GC	3	6	21118	21123	0 %	0 %	50 %	50 %	296134520
521	NC_014153	GGC	2	6	21156	21161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134520
522	NC_014153	CAGCGC	2	12	21173	21184	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	296134520
523	NC_014153	GCC	2	6	21195	21200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134520
524	NC_014153	CGT	2	6	21208	21213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134520
525	NC_014153	GCTGA	2	10	21245	21254	20 %	20 %	40 %	20 %	296134520
526	NC_014153	GCTG	2	8	21256	21263	0 %	25 %	50 %	25 %	296134520
527	NC_014153	CAC	3	9	21285	21293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134520
528	NC_014153	CGGT	2	8	21375	21382	0 %	25 %	50 %	25 %	296134520
529	NC_014153	GAGGTT	2	12	21404	21415	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	296134520
530	NC_014153	TGA	2	6	21508	21513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134520
531	NC_014153	CG	3	6	21539	21544	0 %	0 %	50 %	50 %	296134520
532	NC_014153	ACC	2	6	21603	21608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134520
533	NC_014153	GCA	2	6	21616	21621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134520
534	NC_014153	CCA	2	6	21667	21672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134520
535	NC_014153	TGG	2	6	21748	21753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134520
536	NC_014153	G	8	8	21791	21798	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
537	NC_014153	GGTCGG	2	12	21824	21835	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	296134521
538	NC_014153	CTG	2	6	21857	21862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134521
539	NC_014153	GCG	2	6	21880	21885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134521
540	NC_014153	GC	3	6	21904	21909	0 %	0 %	50 %	50 %	296134521
541	NC_014153	GCG	2	6	21931	21936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134521
542	NC_014153	CCA	2	6	21958	21963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134521
543	NC_014153	CAGC	2	8	22022	22029	25 %	0 %	25 %	50 %	296134521
544	NC_014153	CGG	2	6	22036	22041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134521
545	NC_014153	GCC	2	6	22156	22161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134521
546	NC_014153	GCC	2	6	22188	22193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134521
547	NC_014153	CCA	2	6	22243	22248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134521
548	NC_014153	CAG	2	6	22274	22279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134521
549	NC_014153	CCGG	2	8	22308	22315	0 %	0 %	50 %	50 %	296134521
550	NC_014153	GGC	2	6	22367	22372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134521
551	NC_014153	GCAG	2	8	22519	22526	25 %	0 %	50 %	25 %	296134521
552	NC_014153	CAC	2	6	22529	22534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134521
553	NC_014153	CGC	2	6	22636	22641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134521
554	NC_014153	CGA	2	6	22654	22659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134521
555	NC_014153	CAC	4	12	22781	22792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134521
556	NC_014153	CAA	2	6	22826	22831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134521
557	NC_014153	AAAC	2	8	22840	22847	75 %	0 %	0 %	25 %	296134521
558	NC_014153	TCA	2	6	22913	22918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_014153	CG	4	8	22944	22951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
560	NC_014153	CAAT	2	8	22982	22989	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
561	NC_014153	TGG	2	6	23070	23075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
562	NC_014153	GCC	2	6	23177	23182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134522
563	NC_014153	GCG	2	6	23183	23188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134522
564	NC_014153	TAC	2	6	23261	23266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134522
565	NC_014153	CTGG	2	8	23289	23296	0 %	25 %	50 %	25 %	296134522
566	NC_014153	CGG	2	6	23299	23304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134522
567	NC_014153	GGC	2	6	23345	23350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134522
568	NC_014153	GGT	3	9	23371	23379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134522
569	NC_014153	GGT	3	9	23392	23400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134522
570	NC_014153	GCC	2	6	23410	23415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134522
571	NC_014153	TAC	2	6	23441	23446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134522
572	NC_014153	CGG	2	6	23457	23462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134522
573	NC_014153	TAC	2	6	23465	23470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134522
574	NC_014153	TGCC	2	8	23508	23515	0 %	25 %	25 %	50 %	296134522
575	NC_014153	CGC	2	6	23517	23522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134522
576	NC_014153	CAT	2	6	23591	23596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134523
577	NC_014153	TCT	2	6	23636	23641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134523
578	NC_014153	GC	3	6	23656	23661	0 %	0 %	50 %	50 %	296134523
579	NC_014153	G	6	6	23669	23674	0 %	0 %	100 %	0 %	296134523
580	NC_014153	CGC	2	6	23686	23691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134523
581	NC_014153	GCC	2	6	23764	23769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134523
582	NC_014153	GCA	3	9	23777	23785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134523
583	NC_014153	GGC	2	6	23802	23807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134523
584	NC_014153	CGG	2	6	23830	23835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134523
585	NC_014153	CGG	2	6	23876	23881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134523
586	NC_014153	GCGG	2	8	23934	23941	0 %	0 %	75 %	25 %	296134523
587	NC_014153	GC	3	6	23978	23983	0 %	0 %	50 %	50 %	296134523
588	NC_014153	ACA	2	6	23986	23991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134523
589	NC_014153	CAG	2	6	24000	24005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134523
590	NC_014153	GCG	2	6	24042	24047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134523
591	NC_014153	GCC	2	6	24062	24067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134523
592	NC_014153	CAGCCG	2	12	24129	24140	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	296134523
593	NC_014153	GCG	2	6	24241	24246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_014153	CTG	2	6	24276	24281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134524
595	NC_014153	GCC	2	6	24307	24312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134524
596	NC_014153	GC	3	6	24337	24342	0 %	0 %	50 %	50 %	296134524
597	NC_014153	CT	3	6	24357	24362	0 %	50 %	0 %	50 %	296134524
598	NC_014153	TGC	2	6	24387	24392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134524
599	NC_014153	GTG	2	6	24554	24559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134524
600	NC_014153	CGC	2	6	24601	24606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134524
601	NC_014153	TGGAC	2	10	24639	24648	20 %	20 %	40 %	20 %	296134524
602	NC_014153	CGC	2	6	24661	24666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134524
603	NC_014153	GCC	2	6	24689	24694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134524
604	NC_014153	CCA	2	6	24708	24713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134524
605	NC_014153	GC	3	6	24728	24733	0 %	0 %	50 %	50 %	296134524
606	NC_014153	A	6	6	24753	24758	100 %	0 %	0 %	0 %	296134524
607	NC_014153	CGC	2	6	24759	24764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134524
608	NC_014153	TGAGC	2	10	24808	24817	20 %	20 %	40 %	20 %	296134524
609	NC_014153	GC	3	6	24865	24870	0 %	0 %	50 %	50 %	296134524
610	NC_014153	GGC	4	12	24880	24891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134524
611	NC_014153	GGC	2	6	24937	24942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134524
612	NC_014153	GAC	2	6	25073	25078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134524
613	NC_014153	TGG	2	6	25101	25106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134524
614	NC_014153	CTG	2	6	25118	25123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134524
615	NC_014153	CGC	2	6	25147	25152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134524
616	NC_014153	TGG	2	6	25173	25178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134524
617	NC_014153	ACC	2	6	25223	25228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134524
618	NC_014153	GGC	2	6	25249	25254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134524
619	NC_014153	GC	3	6	25319	25324	0 %	0 %	50 %	50 %	296134524
620	NC_014153	CGATGC	2	12	25342	25353	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296134524
621	NC_014153	ACG	2	6	25386	25391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134524
622	NC_014153	CGGC	2	8	25392	25399	0 %	0 %	50 %	50 %	296134524
623	NC_014153	GTG	2	6	25415	25420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134524
624	NC_014153	GCG	2	6	25482	25487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134524
625	NC_014153	CGC	2	6	25501	25506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134524
626	NC_014153	ATCG	2	8	25544	25551	25 %	25 %	25 %	25 %	296134524
627	NC_014153	GTCG	2	8	25630	25637	0 %	25 %	50 %	25 %	296134524
628	NC_014153	GC	3	6	25657	25662	0 %	0 %	50 %	50 %	296134524
629	NC_014153	TGGG	2	8	25664	25671	0 %	25 %	75 %	0 %	296134524
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631	NC_014153	CGA	2	6	25798	25803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134524
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633	NC_014153	CGC	2	6	25848	25853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134524
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661	NC_014153	GGC	2	6	26982	26987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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742	NC_014153	TCT	2	6	30541	30546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134527
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750	NC_014153	T	6	6	30885	30890	0 %	100 %	0 %	0 %	296134528
751	NC_014153	GGT	2	6	30927	30932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134528
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757	NC_014153	GGC	2	6	31220	31225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134528
758	NC_014153	GCA	2	6	31247	31252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134528
759	NC_014153	GC	3	6	31254	31259	0 %	0 %	50 %	50 %	296134528
760	NC_014153	GGC	2	6	31288	31293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134528
761	NC_014153	ATC	2	6	31318	31323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134528
762	NC_014153	GC	3	6	31348	31353	0 %	0 %	50 %	50 %	296134528
763	NC_014153	GGC	2	6	31378	31383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134528
764	NC_014153	GTG	2	6	31414	31419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134528
765	NC_014153	GC	3	6	31438	31443	0 %	0 %	50 %	50 %	296134528
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768	NC_014153	ATG	2	6	31537	31542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134528
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770	NC_014153	CGCC	2	8	31683	31690	0 %	0 %	25 %	75 %	296134529
771	NC_014153	TCG	2	6	31745	31750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134529
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779	NC_014153	GGC	2	6	32018	32023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134529
780	NC_014153	GCG	2	6	32064	32069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134529
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782	NC_014153	CCTGCC	2	12	32110	32121	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	296134529
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787	NC_014153	CGG	2	6	32241	32246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134529
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794	NC_014153	CTG	3	9	32533	32541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134530
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820	NC_014153	TCG	2	6	33413	33418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134530
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832	NC_014153	TCGGC	2	10	33746	33755	0 %	20 %	40 %	40 %	296134530
833	NC_014153	ACA	2	6	33794	33799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134530
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840	NC_014153	CG	3	6	33992	33997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
841	NC_014153	TGC	2	6	34055	34060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134531
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844	NC_014153	GAGCTG	2	12	34195	34206	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	296134531
845	NC_014153	GAC	2	6	34273	34278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134531
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847	NC_014153	GGCC	2	8	34332	34339	0 %	0 %	50 %	50 %	296134531
848	NC_014153	GCA	2	6	34352	34357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134531
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851	NC_014153	CACG	2	8	34532	34539	25 %	0 %	25 %	50 %	296134532
852	NC_014153	GGT	3	9	34562	34570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134532
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857	NC_014153	TCGAT	2	10	34829	34838	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
858	NC_014153	AAT	2	6	34856	34861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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870	NC_014153	TGC	2	6	35523	35528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134533
871	NC_014153	GCG	2	6	35535	35540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134533
872	NC_014153	ACCA	2	8	35648	35655	50 %	0 %	0 %	50 %	296134533
873	NC_014153	GCT	2	6	35747	35752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
874	NC_014153	ATCC	2	8	35768	35775	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
875	NC_014153	CGT	2	6	35805	35810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134534
876	NC_014153	GCT	3	9	35846	35854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134534
877	NC_014153	GCA	2	6	35960	35965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134534
878	NC_014153	CAA	2	6	35972	35977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134534
879	NC_014153	ATC	2	6	36052	36057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134534
880	NC_014153	ACT	3	9	36085	36093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134534
881	NC_014153	GT	3	6	36151	36156	0 %	50 %	50 %	0 %	296134534
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