MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 62102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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49003	NC_014152	AT	3	6	2489656	2489661	50 %	50 %	0 %	0 %	296133907
49004	NC_014152	TAA	2	6	2489666	2489671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133907
49005	NC_014152	TTAG	2	8	2489698	2489705	25 %	50 %	25 %	0 %	296133907
49006	NC_014152	C	7	7	2489759	2489765	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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49013	NC_014152	AAACC	2	10	2490529	2490538	60 %	0 %	0 %	40 %	296133908
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49019	NC_014152	T	7	7	2490888	2490894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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49236	NC_014152	TAA	2	6	2501793	2501798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49237	NC_014152	GCA	2	6	2501895	2501900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133919
49238	NC_014152	CCT	2	6	2502018	2502023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133919
49239	NC_014152	CAT	2	6	2502028	2502033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133919
49240	NC_014152	CTG	2	6	2502051	2502056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133919
49241	NC_014152	CTT	2	6	2502077	2502082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133919
49242	NC_014152	TA	3	6	2502106	2502111	50 %	50 %	0 %	0 %	296133919
49243	NC_014152	TCT	2	6	2502206	2502211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133919
49244	NC_014152	TTC	2	6	2502226	2502231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133919
49245	NC_014152	TTC	2	6	2502305	2502310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133919
49246	NC_014152	AGA	2	6	2502369	2502374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296133919
49247	NC_014152	CAA	3	9	2502394	2502402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133919
49248	NC_014152	TAA	2	6	2502558	2502563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133920
49249	NC_014152	GCTTCC	2	12	2502621	2502632	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	296133920
49250	NC_014152	GC	3	6	2502642	2502647	0 %	0 %	50 %	50 %	296133920
49251	NC_014152	CAACGT	2	12	2502781	2502792	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	296133920
49252	NC_014152	ATA	2	6	2502808	2502813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133920
49253	NC_014152	TCAGG	2	10	2502865	2502874	20 %	20 %	40 %	20 %	296133920
49254	NC_014152	GTA	2	6	2502915	2502920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133920
49255	NC_014152	AAT	2	6	2502944	2502949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133920
49256	NC_014152	TTC	2	6	2502953	2502958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133920
49257	NC_014152	CAA	2	6	2502970	2502975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133920
49258	NC_014152	GCC	2	6	2503131	2503136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133920
49259	NC_014152	ACC	2	6	2503205	2503210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133920
49260	NC_014152	CGG	2	6	2503295	2503300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133920
49261	NC_014152	CCG	2	6	2503304	2503309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133920
49262	NC_014152	GCC	2	6	2503353	2503358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133920
49263	NC_014152	ATG	2	6	2503398	2503403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133920
49264	NC_014152	AGC	2	6	2503448	2503453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133920
49265	NC_014152	CCT	2	6	2503480	2503485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49266	NC_014152	AATTA	2	10	2503489	2503498	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49267	NC_014152	CAC	2	6	2503540	2503545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133921
49268	NC_014152	CCT	2	6	2503553	2503558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133921
49269	NC_014152	TCC	2	6	2503600	2503605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133921
49270	NC_014152	CGG	2	6	2503778	2503783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133921
49271	NC_014152	TTAA	2	8	2503793	2503800	50 %	50 %	0 %	0 %	296133921
49272	NC_014152	ATA	2	6	2503847	2503852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133921
49273	NC_014152	AGCC	2	8	2503994	2504001	25 %	0 %	25 %	50 %	296133921
49274	NC_014152	CAT	2	6	2504014	2504019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133921
49275	NC_014152	A	6	6	2504029	2504034	100 %	0 %	0 %	0 %	296133921
49276	NC_014152	CAA	2	6	2504119	2504124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133921
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49288	NC_014152	CAG	2	6	2504794	2504799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133921
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49290	NC_014152	TCT	2	6	2504833	2504838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133921
49291	NC_014152	CCT	2	6	2504873	2504878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49292	NC_014152	GCC	3	9	2504893	2504901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133922
49293	NC_014152	GAA	2	6	2504906	2504911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296133922
49294	NC_014152	CCG	2	6	2504915	2504920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133922
49295	NC_014152	GCC	2	6	2504923	2504928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133922
49296	NC_014152	CCG	2	6	2504930	2504935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133922
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49299	NC_014152	CCG	2	6	2504972	2504977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133922
49300	NC_014152	GCC	3	9	2504989	2504997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133922
49301	NC_014152	CAGG	2	8	2505230	2505237	25 %	0 %	50 %	25 %	296133922
49302	NC_014152	CTCC	2	8	2505285	2505292	0 %	25 %	0 %	75 %	296133922
49303	NC_014152	GTTT	2	8	2505327	2505334	0 %	75 %	25 %	0 %	296133922
49304	NC_014152	TTG	2	6	2505350	2505355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133922
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49306	NC_014152	AAT	2	6	2505410	2505415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133922
49307	NC_014152	TTC	2	6	2505427	2505432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133922
49308	NC_014152	TTTTC	2	10	2505486	2505495	0 %	80 %	0 %	20 %	296133922
49309	NC_014152	AT	4	8	2505565	2505572	50 %	50 %	0 %	0 %	296133922
49310	NC_014152	AGT	2	6	2505626	2505631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133922
49311	NC_014152	AAAC	2	8	2505632	2505639	75 %	0 %	0 %	25 %	296133922
49312	NC_014152	CTGC	2	8	2505723	2505730	0 %	25 %	25 %	50 %	296133923
49313	NC_014152	CAT	2	6	2505766	2505771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133923
49314	NC_014152	TAT	2	6	2505810	2505815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133923
49315	NC_014152	ACC	2	6	2505938	2505943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133923
49316	NC_014152	ATT	2	6	2505973	2505978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133923
49317	NC_014152	TGT	2	6	2506000	2506005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133923
49318	NC_014152	CCA	2	6	2506086	2506091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133923
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49320	NC_014152	T	6	6	2506144	2506149	0 %	100 %	0 %	0 %	296133923
49321	NC_014152	AAT	2	6	2506219	2506224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133923
49322	NC_014152	CCT	2	6	2506264	2506269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49323	NC_014152	A	7	7	2506295	2506301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49324	NC_014152	CTTC	2	8	2506317	2506324	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49325	NC_014152	TAA	2	6	2506325	2506330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49326	NC_014152	CCT	2	6	2506340	2506345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49327	NC_014152	TAAAA	2	10	2506400	2506409	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49328	NC_014152	GGA	2	6	2506469	2506474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49329	NC_014152	TTA	2	6	2506547	2506552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49330	NC_014152	AAT	2	6	2506761	2506766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133924
49331	NC_014152	TCC	2	6	2506785	2506790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133924
49332	NC_014152	ATA	2	6	2506843	2506848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133924
49333	NC_014152	TTA	2	6	2506876	2506881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133924
49334	NC_014152	ATA	2	6	2506898	2506903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133924
49335	NC_014152	A	6	6	2506939	2506944	100 %	0 %	0 %	0 %	296133924
49336	NC_014152	GAT	2	6	2506997	2507002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133924
49337	NC_014152	CTT	2	6	2507009	2507014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133924
49338	NC_014152	GCT	2	6	2507081	2507086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133924
49339	NC_014152	GTT	2	6	2507173	2507178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133924
49340	NC_014152	CCA	2	6	2507307	2507312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133924
49341	NC_014152	TCC	2	6	2507364	2507369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133924
49342	NC_014152	ACA	2	6	2507383	2507388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133924
49343	NC_014152	TTA	2	6	2507449	2507454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133924
49344	NC_014152	CTTTT	2	10	2507456	2507465	0 %	80 %	0 %	20 %	296133924
49345	NC_014152	A	7	7	2507489	2507495	100 %	0 %	0 %	0 %	296133924
49346	NC_014152	T	6	6	2507522	2507527	0 %	100 %	0 %	0 %	296133925
49347	NC_014152	TTA	2	6	2507596	2507601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133925
49348	NC_014152	ATA	2	6	2507658	2507663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133925
49349	NC_014152	CCGA	2	8	2507697	2507704	25 %	0 %	25 %	50 %	296133925
49350	NC_014152	TTTG	2	8	2507709	2507716	0 %	75 %	25 %	0 %	296133925
49351	NC_014152	ATT	2	6	2507776	2507781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133925
49352	NC_014152	CCA	2	6	2507788	2507793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133925
49353	NC_014152	CAAC	2	8	2507825	2507832	50 %	0 %	0 %	50 %	296133925
49354	NC_014152	TCG	2	6	2507872	2507877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133925
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49474	NC_014152	TCA	2	6	2513887	2513892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133931
49475	NC_014152	GCT	2	6	2513895	2513900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133931
49476	NC_014152	A	7	7	2514023	2514029	100 %	0 %	0 %	0 %	296133931
49477	NC_014152	TTC	2	6	2514074	2514079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133931
49478	NC_014152	GTCTTT	2	12	2514092	2514103	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	296133931
49479	NC_014152	CAAA	2	8	2514124	2514131	75 %	0 %	0 %	25 %	296133931
49480	NC_014152	T	7	7	2514210	2514216	0 %	100 %	0 %	0 %	296133932
49481	NC_014152	TA	3	6	2514285	2514290	50 %	50 %	0 %	0 %	296133932
49482	NC_014152	CCA	2	6	2514311	2514316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133932
49483	NC_014152	GACCA	2	10	2514322	2514331	40 %	0 %	20 %	40 %	296133932
49484	NC_014152	T	6	6	2514360	2514365	0 %	100 %	0 %	0 %	296133932
49485	NC_014152	CTGA	2	8	2514403	2514410	25 %	25 %	25 %	25 %	296133932
49486	NC_014152	ACC	2	6	2514449	2514454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133932
49487	NC_014152	ATG	2	6	2514608	2514613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133932
49488	NC_014152	A	8	8	2514789	2514796	100 %	0 %	0 %	0 %	296133932
49489	NC_014152	A	7	7	2514836	2514842	100 %	0 %	0 %	0 %	296133932
49490	NC_014152	ACAA	2	8	2514854	2514861	75 %	0 %	0 %	25 %	296133932
49491	NC_014152	GTA	2	6	2514993	2514998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133932
49492	NC_014152	CGT	2	6	2515005	2515010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133932
49493	NC_014152	TTTCAA	2	12	2515073	2515084	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	296133933
49494	NC_014152	CTT	2	6	2515144	2515149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133933
49495	NC_014152	GGC	2	6	2515243	2515248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133933
49496	NC_014152	AAT	3	9	2515256	2515264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133933
49497	NC_014152	TTGC	2	8	2515283	2515290	0 %	50 %	25 %	25 %	296133933
49498	NC_014152	GCG	2	6	2515314	2515319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133933
49499	NC_014152	GTA	2	6	2515359	2515364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133933
49500	NC_014152	CAT	2	6	2515390	2515395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133933

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