MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 62102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48001	NC_014152	TTGA	2	8	2440852	2440859	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48002	NC_014152	TTTTA	2	10	2440869	2440878	20 %	80 %	0 %	0 %	296133858
48003	NC_014152	GCC	3	9	2440905	2440913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133858
48004	NC_014152	TGC	2	6	2440950	2440955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133858
48005	NC_014152	TTC	2	6	2440988	2440993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133858
48006	NC_014152	T	6	6	2441051	2441056	0 %	100 %	0 %	0 %	296133858
48007	NC_014152	GGC	2	6	2441075	2441080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133858
48008	NC_014152	CTGG	2	8	2441093	2441100	0 %	25 %	50 %	25 %	296133858
48009	NC_014152	A	6	6	2441118	2441123	100 %	0 %	0 %	0 %	296133858
48010	NC_014152	GAA	2	6	2441136	2441141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296133858
48011	NC_014152	AAT	2	6	2441150	2441155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133858
48012	NC_014152	ACC	2	6	2441189	2441194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133858
48013	NC_014152	ACC	2	6	2441223	2441228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133858
48014	NC_014152	CAGC	2	8	2441263	2441270	25 %	0 %	25 %	50 %	296133858
48015	NC_014152	CTT	2	6	2441296	2441301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133858
48016	NC_014152	CATC	2	8	2441335	2441342	25 %	25 %	0 %	50 %	296133858
48017	NC_014152	AAT	2	6	2441368	2441373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133858
48018	NC_014152	TTCTTT	2	12	2441459	2441470	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	296133858
48019	NC_014152	CCA	2	6	2441473	2441478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133858
48020	NC_014152	TAG	2	6	2441512	2441517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133858
48021	NC_014152	AAG	2	6	2441537	2441542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296133858
48022	NC_014152	TCA	2	6	2441607	2441612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133858
48023	NC_014152	TAA	2	6	2441653	2441658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133858
48024	NC_014152	AGG	2	6	2441903	2441908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296133858
48025	NC_014152	TCT	2	6	2442039	2442044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133858
48026	NC_014152	TTCAA	2	10	2442045	2442054	40 %	40 %	0 %	20 %	296133858
48027	NC_014152	CTT	2	6	2442067	2442072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133858
48028	NC_014152	ATA	2	6	2442091	2442096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133858
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48031	NC_014152	CTG	2	6	2442336	2442341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133858
48032	NC_014152	TCC	2	6	2442348	2442353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133858
48033	NC_014152	CCG	2	6	2442362	2442367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133858
48034	NC_014152	CACCCT	2	12	2442416	2442427	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	296133858
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48036	NC_014152	CAT	2	6	2442662	2442667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133859
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48040	NC_014152	GTCC	2	8	2442865	2442872	0 %	25 %	25 %	50 %	296133859
48041	NC_014152	GGC	2	6	2443019	2443024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133859
48042	NC_014152	AAAGG	2	10	2443086	2443095	60 %	0 %	40 %	0 %	296133859
48043	NC_014152	TCT	2	6	2443116	2443121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133859
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48049	NC_014152	GCA	2	6	2443380	2443385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133859
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48051	NC_014152	CGC	2	6	2443450	2443455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133859
48052	NC_014152	CGA	2	6	2443519	2443524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133859
48053	NC_014152	CTT	2	6	2443576	2443581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133859
48054	NC_014152	TCC	2	6	2443604	2443609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133859
48055	NC_014152	TCC	2	6	2443649	2443654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48056	NC_014152	CTT	2	6	2443668	2443673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48057	NC_014152	T	6	6	2443680	2443685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48058	NC_014152	AAT	2	6	2443836	2443841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133860
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48062	NC_014152	ACG	2	6	2444087	2444092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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48065	NC_014152	TAC	2	6	2444129	2444134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48090	NC_014152	TCT	2	6	2445665	2445670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48103	NC_014152	CCA	2	6	2446306	2446311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133862
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48105	NC_014152	TCA	2	6	2446448	2446453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48106	NC_014152	ATA	3	9	2446465	2446473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48108	NC_014152	TTG	2	6	2446530	2446535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133863
48109	NC_014152	ATA	2	6	2446562	2446567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133863
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48118	NC_014152	A	6	6	2447368	2447373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48240	NC_014152	CTTA	2	8	2452489	2452496	25 %	50 %	0 %	25 %	296133872
48241	NC_014152	TCC	2	6	2452559	2452564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133872
48242	NC_014152	TGG	2	6	2452593	2452598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296133872
48243	NC_014152	GCT	2	6	2452607	2452612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133872
48244	NC_014152	C	7	7	2452743	2452749	0 %	0 %	0 %	100 %	296133872
48245	NC_014152	CT	4	8	2452763	2452770	0 %	50 %	0 %	50 %	296133872
48246	NC_014152	CA	3	6	2452774	2452779	50 %	0 %	0 %	50 %	296133872
48247	NC_014152	ACC	2	6	2452802	2452807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133872
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48249	NC_014152	ACC	2	6	2452907	2452912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133872
48250	NC_014152	AATT	2	8	2452983	2452990	50 %	50 %	0 %	0 %	296133872
48251	NC_014152	GGC	2	6	2453017	2453022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133872
48252	NC_014152	CCG	2	6	2453099	2453104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133872
48253	NC_014152	AGGGA	2	10	2453125	2453134	40 %	0 %	60 %	0 %	296133872
48254	NC_014152	TAA	2	6	2453258	2453263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133872
48255	NC_014152	T	6	6	2453335	2453340	0 %	100 %	0 %	0 %	296133872
48256	NC_014152	T	8	8	2453342	2453349	0 %	100 %	0 %	0 %	296133872
48257	NC_014152	CTC	2	6	2453380	2453385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48258	NC_014152	TTC	2	6	2453437	2453442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133873
48259	NC_014152	T	6	6	2453493	2453498	0 %	100 %	0 %	0 %	296133873
48260	NC_014152	AAT	2	6	2453562	2453567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133873
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48264	NC_014152	CTG	2	6	2453804	2453809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133873
48265	NC_014152	CTG	2	6	2453826	2453831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133873
48266	NC_014152	ATGA	2	8	2453845	2453852	50 %	25 %	25 %	0 %	296133873
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48272	NC_014152	AAT	2	6	2454127	2454132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133873
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48276	NC_014152	TATC	2	8	2454243	2454250	25 %	50 %	0 %	25 %	296133873
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48281	NC_014152	T	6	6	2454335	2454340	0 %	100 %	0 %	0 %	296133874
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48289	NC_014152	TAAT	2	8	2454659	2454666	50 %	50 %	0 %	0 %	296133875
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48293	NC_014152	TTTC	2	8	2454830	2454837	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48294	NC_014152	CCT	2	6	2454841	2454846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48295	NC_014152	AGGG	2	8	2454857	2454864	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
48296	NC_014152	GCAG	2	8	2454914	2454921	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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48298	NC_014152	A	6	6	2454997	2455002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48299	NC_014152	TGA	2	6	2455019	2455024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48300	NC_014152	CCG	2	6	2455227	2455232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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48303	NC_014152	GCC	2	6	2455329	2455334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48304	NC_014152	CCCA	2	8	2455369	2455376	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
48305	NC_014152	GACT	2	8	2455388	2455395	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48306	NC_014152	TCCT	2	8	2455453	2455460	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48307	NC_014152	T	6	6	2455460	2455465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48308	NC_014152	ATA	2	6	2455482	2455487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48310	NC_014152	TGG	2	6	2455589	2455594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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48312	NC_014152	TTG	2	6	2455793	2455798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48313	NC_014152	CCT	2	6	2455803	2455808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48314	NC_014152	ATA	2	6	2455816	2455821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48317	NC_014152	ATT	2	6	2455878	2455883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48352	NC_014152	ATTT	2	8	2457328	2457335	25 %	75 %	0 %	0 %	296133877
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48482	NC_014152	AGG	2	6	2463533	2463538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48483	NC_014152	AT	3	6	2463557	2463562	50 %	50 %	0 %	0 %	296133886
48484	NC_014152	TAA	2	6	2463624	2463629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133886
48485	NC_014152	CGG	2	6	2463637	2463642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133886
48486	NC_014152	CCA	2	6	2463699	2463704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133886
48487	NC_014152	TGG	2	6	2463762	2463767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296133886
48488	NC_014152	CCA	2	6	2463768	2463773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133886
48489	NC_014152	GCT	2	6	2463784	2463789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133886
48490	NC_014152	CTA	2	6	2463835	2463840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133886
48491	NC_014152	TA	3	6	2463866	2463871	50 %	50 %	0 %	0 %	296133886
48492	NC_014152	CGGC	2	8	2463876	2463883	0 %	0 %	50 %	50 %	296133886
48493	NC_014152	TA	3	6	2463902	2463907	50 %	50 %	0 %	0 %	296133886
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48498	NC_014152	AATA	2	8	2464136	2464143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48499	NC_014152	AG	3	6	2464148	2464153	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48500	NC_014152	TCC	2	6	2464163	2464168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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