MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 62102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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45002	NC_014152	TTC	2	6	2286207	2286212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45003	NC_014152	TTA	2	6	2286214	2286219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45004	NC_014152	T	7	7	2286233	2286239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45005	NC_014152	GAA	2	6	2286290	2286295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45006	NC_014152	GTT	2	6	2286300	2286305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45007	NC_014152	A	6	6	2286398	2286403	100 %	0 %	0 %	0 %	296133707
45008	NC_014152	GTT	2	6	2286479	2286484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133707
45009	NC_014152	TGTT	2	8	2286486	2286493	0 %	75 %	25 %	0 %	296133707
45010	NC_014152	TAC	2	6	2286496	2286501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133707
45011	NC_014152	GCA	2	6	2286607	2286612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133707
45012	NC_014152	TTC	2	6	2286614	2286619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133707
45013	NC_014152	AGG	2	6	2286627	2286632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296133707
45014	NC_014152	A	6	6	2286646	2286651	100 %	0 %	0 %	0 %	296133707
45015	NC_014152	TTGA	2	8	2286680	2286687	25 %	50 %	25 %	0 %	296133707
45016	NC_014152	TCC	2	6	2286738	2286743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133707
45017	NC_014152	A	6	6	2286757	2286762	100 %	0 %	0 %	0 %	296133707
45018	NC_014152	AAG	2	6	2286791	2286796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296133707
45019	NC_014152	TAC	2	6	2286821	2286826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133707
45020	NC_014152	TTA	2	6	2286983	2286988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133707
45021	NC_014152	ATG	2	6	2286998	2287003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133707
45022	NC_014152	AAACG	2	10	2287076	2287085	60 %	0 %	20 %	20 %	296133707
45023	NC_014152	GCCA	2	8	2287163	2287170	25 %	0 %	25 %	50 %	296133707
45024	NC_014152	ACT	2	6	2287178	2287183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133707
45025	NC_014152	TGA	2	6	2287210	2287215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133707
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45028	NC_014152	GTA	2	6	2287371	2287376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133707
45029	NC_014152	A	6	6	2287441	2287446	100 %	0 %	0 %	0 %	296133707
45030	NC_014152	CGG	2	6	2287489	2287494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133707
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45032	NC_014152	TGA	2	6	2287618	2287623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133707
45033	NC_014152	CAAA	2	8	2287634	2287641	75 %	0 %	0 %	25 %	296133707
45034	NC_014152	CCT	2	6	2287642	2287647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133707
45035	NC_014152	TGA	2	6	2287714	2287719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133707
45036	NC_014152	CTA	2	6	2287752	2287757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133707
45037	NC_014152	AACC	2	8	2287795	2287802	50 %	0 %	0 %	50 %	296133707
45038	NC_014152	AT	3	6	2287918	2287923	50 %	50 %	0 %	0 %	296133707
45039	NC_014152	GAA	2	6	2288009	2288014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296133707
45040	NC_014152	TGA	2	6	2288092	2288097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133707
45041	NC_014152	AGTA	2	8	2288215	2288222	50 %	25 %	25 %	0 %	296133707
45042	NC_014152	CTG	3	9	2288285	2288293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133708
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45044	NC_014152	T	7	7	2288334	2288340	0 %	100 %	0 %	0 %	296133708
45045	NC_014152	CGC	2	6	2288352	2288357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133708
45046	NC_014152	TA	4	8	2288463	2288470	50 %	50 %	0 %	0 %	296133708
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45051	NC_014152	CAC	2	6	2288724	2288729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133708
45052	NC_014152	AGT	2	6	2288774	2288779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133708
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45055	NC_014152	TTG	2	6	2288980	2288985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133708
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45059	NC_014152	CGGC	2	8	2289131	2289138	0 %	0 %	50 %	50 %	296133708
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45061	NC_014152	CGA	2	6	2289234	2289239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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45063	NC_014152	AT	5	10	2289330	2289339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45064	NC_014152	AAT	2	6	2289342	2289347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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45072	NC_014152	TA	3	6	2289565	2289570	50 %	50 %	0 %	0 %	296133709
45073	NC_014152	TTG	2	6	2289634	2289639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133709
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45085	NC_014152	AC	3	6	2290420	2290425	50 %	0 %	0 %	50 %	296133711
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45091	NC_014152	TTC	2	6	2290572	2290577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133712
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45093	NC_014152	TTG	2	6	2290654	2290659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133712
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45095	NC_014152	ATC	2	6	2290701	2290706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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45098	NC_014152	ATACT	3	15	2290755	2290769	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45099	NC_014152	AT	3	6	2290781	2290786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45100	NC_014152	CAAC	2	8	2290839	2290846	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45101	NC_014152	T	6	6	2290847	2290852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45102	NC_014152	ATG	2	6	2290859	2290864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45103	NC_014152	ACCC	2	8	2290871	2290878	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
45104	NC_014152	CAA	3	9	2290882	2290890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45105	NC_014152	GCC	2	6	2290897	2290902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45106	NC_014152	TCA	2	6	2291159	2291164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133713
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45108	NC_014152	AGT	2	6	2291221	2291226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133713
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45113	NC_014152	TA	3	6	2291498	2291503	50 %	50 %	0 %	0 %	296133713
45114	NC_014152	TAT	2	6	2291506	2291511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133713
45115	NC_014152	ATG	2	6	2291534	2291539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133713
45116	NC_014152	ATA	2	6	2291552	2291557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133713
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45118	NC_014152	T	6	6	2291622	2291627	0 %	100 %	0 %	0 %	296133713
45119	NC_014152	TCC	2	6	2291855	2291860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133713
45120	NC_014152	CAA	2	6	2291866	2291871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133713
45121	NC_014152	TA	3	6	2291905	2291910	50 %	50 %	0 %	0 %	296133713
45122	NC_014152	AAC	3	9	2291926	2291934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133713
45123	NC_014152	CAG	2	6	2292001	2292006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133713
45124	NC_014152	ACA	2	6	2292038	2292043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133713
45125	NC_014152	CCT	2	6	2292072	2292077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133713
45126	NC_014152	CATA	2	8	2292078	2292085	50 %	25 %	0 %	25 %	296133713
45127	NC_014152	AAC	2	6	2292115	2292120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133713
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45129	NC_014152	ACA	2	6	2292147	2292152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133713
45130	NC_014152	CGT	2	6	2292187	2292192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133713
45131	NC_014152	AT	3	6	2292268	2292273	50 %	50 %	0 %	0 %	296133713
45132	NC_014152	TA	3	6	2292310	2292315	50 %	50 %	0 %	0 %	296133713
45133	NC_014152	ACCG	2	8	2292336	2292343	25 %	0 %	25 %	50 %	296133713
45134	NC_014152	TA	3	6	2292436	2292441	50 %	50 %	0 %	0 %	296133714
45135	NC_014152	TA	3	6	2292497	2292502	50 %	50 %	0 %	0 %	296133714
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45140	NC_014152	AGGTC	2	10	2292727	2292736	20 %	20 %	40 %	20 %	296133714
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45142	NC_014152	CT	4	8	2292780	2292787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45143	NC_014152	T	6	6	2292811	2292816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45144	NC_014152	TTG	2	6	2292949	2292954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45145	NC_014152	GCC	2	6	2292998	2293003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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45149	NC_014152	CAAC	2	8	2293221	2293228	50 %	0 %	0 %	50 %	296133715
45150	NC_014152	CAA	2	6	2293252	2293257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133715
45151	NC_014152	AACC	2	8	2293283	2293290	50 %	0 %	0 %	50 %	296133715
45152	NC_014152	AT	3	6	2293372	2293377	50 %	50 %	0 %	0 %	296133715
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45162	NC_014152	GAAA	2	8	2294038	2294045	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45163	NC_014152	TTTC	2	8	2294068	2294075	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45164	NC_014152	CCA	2	6	2294118	2294123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133716
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45178	NC_014152	TTCAA	2	10	2294677	2294686	40 %	40 %	0 %	20 %	296133716
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45182	NC_014152	TGA	2	6	2294783	2294788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133716
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45232	NC_014152	CTGC	2	8	2297269	2297276	0 %	25 %	25 %	50 %	296133718
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45237	NC_014152	CGT	2	6	2297488	2297493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133718
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45239	NC_014152	CAG	2	6	2297519	2297524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133718
45240	NC_014152	TTA	2	6	2297526	2297531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133718
45241	NC_014152	TTG	3	9	2297532	2297540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133718
45242	NC_014152	CTT	2	6	2297620	2297625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133718
45243	NC_014152	GGCC	2	8	2297708	2297715	0 %	0 %	50 %	50 %	296133718
45244	NC_014152	CCG	2	6	2297764	2297769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133718
45245	NC_014152	ATC	2	6	2297786	2297791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133718
45246	NC_014152	GGC	2	6	2297793	2297798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133718
45247	NC_014152	TCG	2	6	2297883	2297888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133718
45248	NC_014152	GCCC	2	8	2297923	2297930	0 %	0 %	25 %	75 %	296133718
45249	NC_014152	GGCA	2	8	2298037	2298044	25 %	0 %	50 %	25 %	296133718
45250	NC_014152	TTCC	2	8	2298064	2298071	0 %	50 %	0 %	50 %	296133718
45251	NC_014152	TCTGCG	2	12	2298157	2298168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133718
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45253	NC_014152	TGC	2	6	2298248	2298253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133718
45254	NC_014152	GTA	2	6	2298257	2298262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133718
45255	NC_014152	GGCA	2	8	2298337	2298344	25 %	0 %	50 %	25 %	296133718
45256	NC_014152	CAT	2	6	2298352	2298357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133718
45257	NC_014152	TGT	2	6	2298364	2298369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133718
45258	NC_014152	CAG	2	6	2298398	2298403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133718
45259	NC_014152	CAAT	2	8	2298444	2298451	50 %	25 %	0 %	25 %	296133718
45260	NC_014152	TTG	2	6	2298458	2298463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133718
45261	NC_014152	ATG	2	6	2298479	2298484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133718
45262	NC_014152	GCG	2	6	2298618	2298623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133718
45263	NC_014152	CA	3	6	2298643	2298648	50 %	0 %	0 %	50 %	296133718
45264	NC_014152	AGT	2	6	2298686	2298691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133718
45265	NC_014152	CAG	2	6	2298814	2298819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133718
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45269	NC_014152	ATTT	2	8	2299292	2299299	25 %	75 %	0 %	0 %	296133718
45270	NC_014152	CGG	2	6	2299310	2299315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133718
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45302	NC_014152	AT	3	6	2301660	2301665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45303	NC_014152	TAT	2	6	2301708	2301713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45304	NC_014152	TAA	2	6	2301717	2301722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45305	NC_014152	CCG	2	6	2301778	2301783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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45307	NC_014152	TTA	2	6	2301913	2301918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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45309	NC_014152	TCATT	2	10	2301998	2302007	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45310	NC_014152	CTT	2	6	2302011	2302016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45311	NC_014152	AGG	2	6	2302075	2302080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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45313	NC_014152	CAA	2	6	2302134	2302139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45314	NC_014152	AAT	2	6	2302156	2302161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45315	NC_014152	TCTT	2	8	2302226	2302233	0 %	75 %	0 %	25 %	296133720
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45328	NC_014152	TA	3	6	2303253	2303258	50 %	50 %	0 %	0 %	296133720
45329	NC_014152	TAA	2	6	2303280	2303285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133720
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45350	NC_014152	ATGA	2	8	2304622	2304629	50 %	25 %	25 %	0 %	296133720
45351	NC_014152	TTC	2	6	2304720	2304725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133720
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45354	NC_014152	TGT	2	6	2304912	2304917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133720
45355	NC_014152	GGCCAG	2	12	2305000	2305011	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296133720
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45357	NC_014152	GCA	2	6	2305154	2305159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133720
45358	NC_014152	CGG	2	6	2305206	2305211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133720
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45362	NC_014152	GGA	2	6	2305407	2305412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296133720
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45370	NC_014152	A	6	6	2305985	2305990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45371	NC_014152	A	7	7	2306043	2306049	100 %	0 %	0 %	0 %	296133721
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45394	NC_014152	CAAA	2	8	2307146	2307153	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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45451	NC_014152	CT	3	6	2310373	2310378	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45452	NC_014152	ATT	2	6	2310409	2310414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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45465	NC_014152	CGTA	2	8	2310860	2310867	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45466	NC_014152	CTTC	2	8	2310925	2310932	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45467	NC_014152	AGCA	2	8	2311020	2311027	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45468	NC_014152	A	6	6	2311161	2311166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45469	NC_014152	ACC	2	6	2311181	2311186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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45471	NC_014152	T	6	6	2311276	2311281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45472	NC_014152	AAT	2	6	2311332	2311337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133726
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45476	NC_014152	TCA	2	6	2311420	2311425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133726
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45478	NC_014152	GCTT	2	8	2311511	2311518	0 %	50 %	25 %	25 %	296133726
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