MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 62102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44502	NC_014152	CA	3	6	2262120	2262125	50 %	0 %	0 %	50 %	296133683
44503	NC_014152	CGC	2	6	2262147	2262152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133683
44504	NC_014152	ATCA	2	8	2262154	2262161	50 %	25 %	0 %	25 %	296133683
44505	NC_014152	TAA	2	6	2262189	2262194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133683
44506	NC_014152	CTT	2	6	2262311	2262316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133683
44507	NC_014152	A	6	6	2262471	2262476	100 %	0 %	0 %	0 %	296133683
44508	NC_014152	TA	3	6	2262495	2262500	50 %	50 %	0 %	0 %	296133683
44509	NC_014152	ATC	2	6	2262541	2262546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133683
44510	NC_014152	GCC	2	6	2262574	2262579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133683
44511	NC_014152	GAT	2	6	2262664	2262669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133683
44512	NC_014152	CCG	2	6	2262683	2262688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133683
44513	NC_014152	TC	3	6	2262722	2262727	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44514	NC_014152	CTT	2	6	2262764	2262769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44515	NC_014152	GCA	2	6	2262783	2262788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44516	NC_014152	A	7	7	2262791	2262797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44517	NC_014152	CAGC	2	8	2262807	2262814	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44518	NC_014152	TTA	2	6	2262847	2262852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44519	NC_014152	TAAA	2	8	2262868	2262875	75 %	25 %	0 %	0 %	296133684
44520	NC_014152	A	6	6	2262895	2262900	100 %	0 %	0 %	0 %	296133684
44521	NC_014152	CA	3	6	2262929	2262934	50 %	0 %	0 %	50 %	296133684
44522	NC_014152	CCG	2	6	2262972	2262977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133684
44523	NC_014152	AT	3	6	2263028	2263033	50 %	50 %	0 %	0 %	296133684
44524	NC_014152	A	6	6	2263041	2263046	100 %	0 %	0 %	0 %	296133684
44525	NC_014152	GCCA	2	8	2263056	2263063	25 %	0 %	25 %	50 %	296133684
44526	NC_014152	CCA	2	6	2263110	2263115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133684
44527	NC_014152	TTC	2	6	2263228	2263233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133684
44528	NC_014152	CCG	2	6	2263267	2263272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133684
44529	NC_014152	CTG	2	6	2263286	2263291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133684
44530	NC_014152	CAT	2	6	2263446	2263451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133684
44531	NC_014152	CTA	2	6	2263466	2263471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133684
44532	NC_014152	CCT	2	6	2263514	2263519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44533	NC_014152	CAC	2	6	2263582	2263587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133685
44534	NC_014152	A	6	6	2263614	2263619	100 %	0 %	0 %	0 %	296133685
44535	NC_014152	TTC	2	6	2263693	2263698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133685
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44537	NC_014152	CTT	2	6	2263794	2263799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133685
44538	NC_014152	CCG	3	9	2263866	2263874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133685
44539	NC_014152	TAA	2	6	2263929	2263934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133685
44540	NC_014152	CCA	2	6	2263980	2263985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133685
44541	NC_014152	CTT	2	6	2264041	2264046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133685
44542	NC_014152	GGC	2	6	2264083	2264088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133685
44543	NC_014152	CTG	2	6	2264111	2264116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44544	NC_014152	CCT	2	6	2264117	2264122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44545	NC_014152	AT	4	8	2264150	2264157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44546	NC_014152	TAT	2	6	2264210	2264215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44547	NC_014152	T	6	6	2264227	2264232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44548	NC_014152	A	6	6	2264241	2264246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44549	NC_014152	TGG	2	6	2264306	2264311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44550	NC_014152	AAC	2	6	2264337	2264342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44551	NC_014152	ACG	2	6	2264476	2264481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133686
44552	NC_014152	G	6	6	2264534	2264539	0 %	0 %	100 %	0 %	296133686
44553	NC_014152	AAT	2	6	2264577	2264582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133686
44554	NC_014152	GCCT	2	8	2264638	2264645	0 %	25 %	25 %	50 %	296133686
44555	NC_014152	CAT	2	6	2264700	2264705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133686
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44573	NC_014152	CGG	2	6	2265282	2265287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133686
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44587	NC_014152	CGG	2	6	2266106	2266111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133687
44588	NC_014152	ACCGGA	2	12	2266148	2266159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133687
44589	NC_014152	TA	3	6	2266243	2266248	50 %	50 %	0 %	0 %	296133687
44590	NC_014152	CAA	2	6	2266375	2266380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44591	NC_014152	GCC	2	6	2266425	2266430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133688
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44600	NC_014152	TCCT	2	8	2266794	2266801	0 %	50 %	0 %	50 %	296133688
44601	NC_014152	GCA	2	6	2266899	2266904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133688
44602	NC_014152	T	6	6	2266929	2266934	0 %	100 %	0 %	0 %	296133688
44603	NC_014152	TCC	2	6	2266980	2266985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133688
44604	NC_014152	TTC	2	6	2267058	2267063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133688
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44606	NC_014152	CCA	2	6	2267135	2267140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133688
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44608	NC_014152	TCT	2	6	2267191	2267196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133688
44609	NC_014152	T	6	6	2267253	2267258	0 %	100 %	0 %	0 %	296133688
44610	NC_014152	TCA	2	6	2267290	2267295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133688
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44615	NC_014152	CTAT	2	8	2267635	2267642	25 %	50 %	0 %	25 %	296133689
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44619	NC_014152	CCCACT	2	12	2267805	2267816	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	296133689
44620	NC_014152	GCC	2	6	2267835	2267840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133689
44621	NC_014152	TGC	2	6	2267843	2267848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133689
44622	NC_014152	CCTG	2	8	2267854	2267861	0 %	25 %	25 %	50 %	296133689
44623	NC_014152	CCAA	2	8	2267998	2268005	50 %	0 %	0 %	50 %	296133689
44624	NC_014152	AGC	2	6	2268043	2268048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133689
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44626	NC_014152	TTTCGG	2	12	2268119	2268130	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	296133689
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44628	NC_014152	ATT	2	6	2268188	2268193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44629	NC_014152	CAT	2	6	2268240	2268245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44630	NC_014152	GCC	2	6	2268354	2268359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133690
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44645	NC_014152	CTA	2	6	2268864	2268869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44647	NC_014152	ATA	2	6	2268893	2268898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44648	NC_014152	TTA	2	6	2268903	2268908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44649	NC_014152	TGT	2	6	2268934	2268939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44650	NC_014152	ATT	2	6	2268941	2268946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44654	NC_014152	GCCG	2	8	2269087	2269094	0 %	0 %	50 %	50 %	296133691
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44682	NC_014152	TA	3	6	2270405	2270410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44683	NC_014152	CAT	2	6	2270421	2270426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44724	NC_014152	CCTT	2	8	2272826	2272833	0 %	50 %	0 %	50 %	296133694
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44732	NC_014152	A	6	6	2273279	2273284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44733	NC_014152	AGG	2	6	2273387	2273392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296133695
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44735	NC_014152	GT	3	6	2273517	2273522	0 %	50 %	50 %	0 %	296133695
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44952	NC_014152	A	7	7	2284216	2284222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44953	NC_014152	A	7	7	2284235	2284241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44958	NC_014152	TGT	2	6	2284545	2284550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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44964	NC_014152	ATT	2	6	2284899	2284904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44965	NC_014152	GAA	2	6	2284967	2284972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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