MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 62102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44002	NC_014152	TTA	2	6	2238498	2238503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133664
44003	NC_014152	CCG	2	6	2238540	2238545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133664
44004	NC_014152	ATTA	2	8	2238748	2238755	50 %	50 %	0 %	0 %	296133664
44005	NC_014152	T	6	6	2238785	2238790	0 %	100 %	0 %	0 %	296133664
44006	NC_014152	AAT	2	6	2238803	2238808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133664
44007	NC_014152	GCC	2	6	2238818	2238823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133664
44008	NC_014152	CAA	2	6	2238982	2238987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133664
44009	NC_014152	GTA	2	6	2239013	2239018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133664
44010	NC_014152	ATTTT	2	10	2239046	2239055	20 %	80 %	0 %	0 %	296133664
44011	NC_014152	ATGAG	2	10	2239109	2239118	40 %	20 %	40 %	0 %	296133664
44012	NC_014152	GTG	2	6	2239121	2239126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296133664
44013	NC_014152	ATA	2	6	2239154	2239159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133664
44014	NC_014152	AGC	2	6	2239189	2239194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133664
44015	NC_014152	TCC	2	6	2239223	2239228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133664
44016	NC_014152	AGA	2	6	2239246	2239251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296133664
44017	NC_014152	CGGTA	2	10	2239252	2239261	20 %	20 %	40 %	20 %	296133664
44018	NC_014152	CAAA	2	8	2239314	2239321	75 %	0 %	0 %	25 %	296133664
44019	NC_014152	AGCC	2	8	2239390	2239397	25 %	0 %	25 %	50 %	296133664
44020	NC_014152	TTC	2	6	2239445	2239450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133664
44021	NC_014152	TCG	2	6	2239465	2239470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133664
44022	NC_014152	C	6	6	2239480	2239485	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
44023	NC_014152	TAT	2	6	2239520	2239525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44024	NC_014152	T	6	6	2239666	2239671	0 %	100 %	0 %	0 %	296133665
44025	NC_014152	GGA	2	6	2239696	2239701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296133665
44026	NC_014152	GTC	2	6	2239716	2239721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133665
44027	NC_014152	CTGG	2	8	2239754	2239761	0 %	25 %	50 %	25 %	296133665
44028	NC_014152	TC	3	6	2239824	2239829	0 %	50 %	0 %	50 %	296133665
44029	NC_014152	T	6	6	2239918	2239923	0 %	100 %	0 %	0 %	296133665
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44032	NC_014152	TTGC	2	8	2239986	2239993	0 %	50 %	25 %	25 %	296133665
44033	NC_014152	TTAA	2	8	2240040	2240047	50 %	50 %	0 %	0 %	296133665
44034	NC_014152	CTT	2	6	2240062	2240067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133665
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44037	NC_014152	GCA	2	6	2240163	2240168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133665
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44039	NC_014152	C	6	6	2240190	2240195	0 %	0 %	0 %	100 %	296133665
44040	NC_014152	TCA	2	6	2240202	2240207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133665
44041	NC_014152	GGA	2	6	2240279	2240284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296133665
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44045	NC_014152	GGTTCA	2	12	2240439	2240450	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	296133665
44046	NC_014152	CGT	2	6	2240518	2240523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133665
44047	NC_014152	GATA	2	8	2240582	2240589	50 %	25 %	25 %	0 %	296133665
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44049	NC_014152	CCAAAA	2	12	2240676	2240687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133665
44050	NC_014152	TCCC	2	8	2240712	2240719	0 %	25 %	0 %	75 %	296133665
44051	NC_014152	TGAA	2	8	2240736	2240743	50 %	25 %	25 %	0 %	296133665
44052	NC_014152	TAC	2	6	2240834	2240839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133665
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44055	NC_014152	TAA	2	6	2240908	2240913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133665
44056	NC_014152	CCGG	2	8	2241007	2241014	0 %	0 %	50 %	50 %	296133665
44057	NC_014152	GCC	2	6	2241032	2241037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133665
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44061	NC_014152	AT	3	6	2241435	2241440	50 %	50 %	0 %	0 %	296133665
44062	NC_014152	CTT	2	6	2241450	2241455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133665
44063	NC_014152	TA	4	8	2241469	2241476	50 %	50 %	0 %	0 %	296133665
44064	NC_014152	T	7	7	2241530	2241536	0 %	100 %	0 %	0 %	296133665
44065	NC_014152	CGG	2	6	2241542	2241547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133665
44066	NC_014152	TTCCG	2	10	2241592	2241601	0 %	40 %	20 %	40 %	296133665
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44072	NC_014152	AT	3	6	2242023	2242028	50 %	50 %	0 %	0 %	296133666
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44074	NC_014152	T	6	6	2242144	2242149	0 %	100 %	0 %	0 %	296133666
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44089	NC_014152	ATTT	2	8	2242658	2242665	25 %	75 %	0 %	0 %	296133667
44090	NC_014152	CTT	2	6	2242724	2242729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133667
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44101	NC_014152	GCT	2	6	2243137	2243142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133667
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44114	NC_014152	TGG	2	6	2243680	2243685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296133668
44115	NC_014152	AAT	2	6	2243726	2243731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133668
44116	NC_014152	TG	3	6	2243753	2243758	0 %	50 %	50 %	0 %	296133668
44117	NC_014152	AC	3	6	2243799	2243804	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44118	NC_014152	CAC	2	6	2243839	2243844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44119	NC_014152	A	6	6	2243903	2243908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44120	NC_014152	T	7	7	2243926	2243932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44121	NC_014152	T	6	6	2243939	2243944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44122	NC_014152	AT	3	6	2243967	2243972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44123	NC_014152	TGT	2	6	2244002	2244007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44124	NC_014152	TGG	2	6	2244023	2244028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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44129	NC_014152	TTA	3	9	2244253	2244261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44131	NC_014152	AAGA	2	8	2244300	2244307	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44132	NC_014152	AGA	2	6	2244403	2244408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44133	NC_014152	CGC	2	6	2244414	2244419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44134	NC_014152	A	6	6	2244429	2244434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44135	NC_014152	TTA	2	6	2244512	2244517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44138	NC_014152	TAC	2	6	2244680	2244685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44142	NC_014152	A	6	6	2244821	2244826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44143	NC_014152	GCA	2	6	2244838	2244843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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44145	NC_014152	TCC	3	9	2244899	2244907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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44148	NC_014152	AG	3	6	2244982	2244987	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44149	NC_014152	GCC	2	6	2245014	2245019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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44152	NC_014152	GCA	2	6	2245132	2245137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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44157	NC_014152	CTGC	2	8	2245323	2245330	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44158	NC_014152	GCA	2	6	2245344	2245349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44159	NC_014152	CCT	2	6	2245375	2245380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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44163	NC_014152	GGA	2	6	2245468	2245473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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44232	NC_014152	ATT	2	6	2248673	2248678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133672
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44237	NC_014152	CTT	2	6	2249146	2249151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133672
44238	NC_014152	TC	3	6	2249171	2249176	0 %	50 %	0 %	50 %	296133672
44239	NC_014152	AAT	2	6	2249220	2249225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133672
44240	NC_014152	ATTAAT	2	12	2249289	2249300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44241	NC_014152	T	6	6	2249363	2249368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44242	NC_014152	A	6	6	2249466	2249471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44243	NC_014152	TTTC	2	8	2249513	2249520	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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44275	NC_014152	CTT	2	6	2251046	2251051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44279	NC_014152	GGTT	2	8	2251192	2251199	0 %	50 %	50 %	0 %	296133674
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44349	NC_014152	A	6	6	2254225	2254230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44352	NC_014152	A	7	7	2254301	2254307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44353	NC_014152	CAA	2	6	2254309	2254314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44354	NC_014152	AGT	2	6	2254327	2254332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44355	NC_014152	TA	3	6	2254345	2254350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44356	NC_014152	TG	4	8	2254420	2254427	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44357	NC_014152	AAAT	2	8	2254520	2254527	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44358	NC_014152	TAAC	2	8	2254533	2254540	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44359	NC_014152	CGG	2	6	2254541	2254546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44360	NC_014152	TCA	2	6	2254579	2254584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133679
44361	NC_014152	TTTA	2	8	2254586	2254593	25 %	75 %	0 %	0 %	296133679
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44363	NC_014152	GTG	2	6	2254686	2254691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296133679
44364	NC_014152	A	6	6	2254773	2254778	100 %	0 %	0 %	0 %	296133679
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44473	NC_014152	TTC	2	6	2260831	2260836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133682
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44478	NC_014152	CTTA	2	8	2261110	2261117	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44479	NC_014152	A	6	6	2261164	2261169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44480	NC_014152	ATA	2	6	2261190	2261195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44481	NC_014152	CAA	2	6	2261219	2261224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44482	NC_014152	A	7	7	2261272	2261278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44483	NC_014152	A	6	6	2261290	2261295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44484	NC_014152	GAA	2	6	2261298	2261303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44485	NC_014152	A	8	8	2261342	2261349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44486	NC_014152	A	6	6	2261393	2261398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44487	NC_014152	AT	3	6	2261436	2261441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44488	NC_014152	CAA	2	6	2261556	2261561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44489	NC_014152	CAG	2	6	2261571	2261576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44490	NC_014152	TTA	2	6	2261591	2261596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44491	NC_014152	TTA	2	6	2261694	2261699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44492	NC_014152	CA	3	6	2261763	2261768	50 %	0 %	0 %	50 %	296133683
44493	NC_014152	CAA	2	6	2261812	2261817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133683
44494	NC_014152	TTGC	2	8	2261840	2261847	0 %	50 %	25 %	25 %	296133683
44495	NC_014152	ATC	2	6	2261848	2261853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133683
44496	NC_014152	TCA	2	6	2261858	2261863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133683
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44499	NC_014152	GCA	2	6	2261922	2261927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133683
44500	NC_014152	CTG	2	6	2261929	2261934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133683

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