MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 62102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_014152	GCT	2	6	2213799	2213804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133640
43502	NC_014152	ACT	2	6	2213844	2213849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133640
43503	NC_014152	CAA	2	6	2213918	2213923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133641
43504	NC_014152	ACCT	2	8	2214050	2214057	25 %	25 %	0 %	50 %	296133641
43505	NC_014152	TTG	2	6	2214069	2214074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133641
43506	NC_014152	TCT	2	6	2214093	2214098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133641
43507	NC_014152	T	6	6	2214133	2214138	0 %	100 %	0 %	0 %	296133641
43508	NC_014152	CCG	2	6	2214156	2214161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133641
43509	NC_014152	T	7	7	2214200	2214206	0 %	100 %	0 %	0 %	296133641
43510	NC_014152	ACA	2	6	2214207	2214212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133641
43511	NC_014152	CCT	2	6	2214278	2214283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133641
43512	NC_014152	CGT	2	6	2214298	2214303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133641
43513	NC_014152	CCA	2	6	2214370	2214375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43514	NC_014152	TAT	2	6	2214477	2214482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43515	NC_014152	TA	3	6	2214490	2214495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43516	NC_014152	TGG	2	6	2214517	2214522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43517	NC_014152	A	6	6	2214535	2214540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43518	NC_014152	A	6	6	2214583	2214588	100 %	0 %	0 %	0 %	296133642
43519	NC_014152	T	6	6	2214589	2214594	0 %	100 %	0 %	0 %	296133642
43520	NC_014152	ATAA	2	8	2214606	2214613	75 %	25 %	0 %	0 %	296133642
43521	NC_014152	T	6	6	2214675	2214680	0 %	100 %	0 %	0 %	296133642
43522	NC_014152	CTTC	2	8	2214681	2214688	0 %	50 %	0 %	50 %	296133642
43523	NC_014152	CT	3	6	2214713	2214718	0 %	50 %	0 %	50 %	296133642
43524	NC_014152	T	7	7	2214721	2214727	0 %	100 %	0 %	0 %	296133642
43525	NC_014152	ACA	2	6	2214781	2214786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133642
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43527	NC_014152	TTC	2	6	2214823	2214828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133642
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43532	NC_014152	CAT	2	6	2214960	2214965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133642
43533	NC_014152	GCA	2	6	2214984	2214989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133642
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43535	NC_014152	GTAT	2	8	2215024	2215031	25 %	50 %	25 %	0 %	296133642
43536	NC_014152	T	7	7	2215049	2215055	0 %	100 %	0 %	0 %	296133642
43537	NC_014152	CTT	2	6	2215075	2215080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133642
43538	NC_014152	T	6	6	2215079	2215084	0 %	100 %	0 %	0 %	296133642
43539	NC_014152	ACC	2	6	2215108	2215113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43540	NC_014152	AATA	2	8	2215138	2215145	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43541	NC_014152	TTA	2	6	2215153	2215158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43542	NC_014152	A	6	6	2215170	2215175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43543	NC_014152	TAAT	2	8	2215196	2215203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43544	NC_014152	CCG	2	6	2215275	2215280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43545	NC_014152	TTC	2	6	2215282	2215287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43546	NC_014152	TAATC	2	10	2215404	2215413	40 %	40 %	0 %	20 %	296133643
43547	NC_014152	TGC	2	6	2215457	2215462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133643
43548	NC_014152	ATC	2	6	2215472	2215477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133643
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43550	NC_014152	GAG	2	6	2215558	2215563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296133643
43551	NC_014152	G	6	6	2215639	2215644	0 %	0 %	100 %	0 %	296133643
43552	NC_014152	CTG	2	6	2215666	2215671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133643
43553	NC_014152	CGT	2	6	2215700	2215705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133643
43554	NC_014152	TCC	2	6	2215717	2215722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133643
43555	NC_014152	CGG	2	6	2215754	2215759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133643
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43558	NC_014152	AATT	2	8	2215889	2215896	50 %	50 %	0 %	0 %	296133643
43559	NC_014152	T	6	6	2216074	2216079	0 %	100 %	0 %	0 %	296133643
43560	NC_014152	CTTTAC	2	12	2216098	2216109	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	296133643
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43568	NC_014152	T	6	6	2216777	2216782	0 %	100 %	0 %	0 %	296133643
43569	NC_014152	TGGG	2	8	2216788	2216795	0 %	25 %	75 %	0 %	296133643
43570	NC_014152	GCA	2	6	2216805	2216810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133643
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43573	NC_014152	AGC	2	6	2217048	2217053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133643
43574	NC_014152	TCT	2	6	2217187	2217192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133643
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43576	NC_014152	TTG	2	6	2217382	2217387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43577	NC_014152	GCA	2	6	2217536	2217541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43578	NC_014152	AT	3	6	2217559	2217564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43579	NC_014152	TTC	2	6	2217579	2217584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133644
43580	NC_014152	T	8	8	2217638	2217645	0 %	100 %	0 %	0 %	296133644
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43585	NC_014152	TGA	2	6	2217797	2217802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133644
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43588	NC_014152	TAT	2	6	2217857	2217862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43589	NC_014152	CTAT	2	8	2217887	2217894	25 %	50 %	0 %	25 %	296133645
43590	NC_014152	TGTC	2	8	2217897	2217904	0 %	50 %	25 %	25 %	296133645
43591	NC_014152	TCT	2	6	2218110	2218115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133645
43592	NC_014152	TAA	2	6	2218130	2218135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133645
43593	NC_014152	GTC	2	6	2218202	2218207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133645
43594	NC_014152	ATTTC	2	10	2218209	2218218	20 %	60 %	0 %	20 %	296133645
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43598	NC_014152	GCC	2	6	2218323	2218328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133645
43599	NC_014152	AT	3	6	2218368	2218373	50 %	50 %	0 %	0 %	296133645
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43606	NC_014152	A	6	6	2218709	2218714	100 %	0 %	0 %	0 %	296133645
43607	NC_014152	ATTA	2	8	2218746	2218753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43608	NC_014152	TTAA	2	8	2218774	2218781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43609	NC_014152	TAG	2	6	2218813	2218818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133646
43610	NC_014152	ATA	2	6	2219024	2219029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133646
43611	NC_014152	CAC	2	6	2219032	2219037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133646
43612	NC_014152	CCGG	2	8	2219089	2219096	0 %	0 %	50 %	50 %	296133646
43613	NC_014152	CCT	2	6	2219183	2219188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133646
43614	NC_014152	TCG	2	6	2219209	2219214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133646
43615	NC_014152	GCA	2	6	2219425	2219430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133646
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43619	NC_014152	CAA	2	6	2219526	2219531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133646
43620	NC_014152	CCT	2	6	2219591	2219596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43621	NC_014152	ATT	2	6	2219627	2219632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43622	NC_014152	T	7	7	2219648	2219654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43623	NC_014152	AAC	2	6	2219675	2219680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43624	NC_014152	AT	3	6	2219702	2219707	50 %	50 %	0 %	0 %	296133647
43625	NC_014152	TTC	2	6	2219770	2219775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133647
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43643	NC_014152	A	7	7	2220706	2220712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43644	NC_014152	TA	3	6	2220753	2220758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43645	NC_014152	AAT	2	6	2220820	2220825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43649	NC_014152	GAAG	2	8	2221001	2221008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43650	NC_014152	GGTG	2	8	2221009	2221016	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
43651	NC_014152	GGTT	2	8	2221117	2221124	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43652	NC_014152	CCT	2	6	2221136	2221141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43653	NC_014152	A	7	7	2221142	2221148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43654	NC_014152	TAT	2	6	2221190	2221195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43656	NC_014152	CCG	2	6	2221313	2221318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43657	NC_014152	GGC	2	6	2221360	2221365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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43659	NC_014152	GCA	2	6	2221431	2221436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43660	NC_014152	CACC	2	8	2221464	2221471	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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43662	NC_014152	GCT	2	6	2221506	2221511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43696	NC_014152	A	6	6	2223432	2223437	100 %	0 %	0 %	0 %	296133650
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43701	NC_014152	A	7	7	2223543	2223549	100 %	0 %	0 %	0 %	296133650
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43707	NC_014152	AAT	2	6	2223835	2223840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43724	NC_014152	GCG	2	6	2224821	2224826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133651
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43728	NC_014152	CCT	2	6	2225001	2225006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43729	NC_014152	ATG	2	6	2225026	2225031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43730	NC_014152	CCAAG	2	10	2225163	2225172	40 %	0 %	20 %	40 %	296133652
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43732	NC_014152	AC	3	6	2225224	2225229	50 %	0 %	0 %	50 %	296133652
43733	NC_014152	ACC	2	6	2225284	2225289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133652
43734	NC_014152	TTAA	2	8	2225348	2225355	50 %	50 %	0 %	0 %	296133652
43735	NC_014152	ATT	2	6	2225384	2225389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133652
43736	NC_014152	ATC	2	6	2225464	2225469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133652
43737	NC_014152	AATTT	2	10	2225492	2225501	40 %	60 %	0 %	0 %	296133652
43738	NC_014152	TCC	2	6	2225560	2225565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133652
43739	NC_014152	TCG	2	6	2225600	2225605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133652
43740	NC_014152	CAA	2	6	2225691	2225696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133652
43741	NC_014152	GCA	2	6	2225757	2225762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133652
43742	NC_014152	GGC	2	6	2225768	2225773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133652
43743	NC_014152	CAACC	2	10	2225815	2225824	40 %	0 %	0 %	60 %	296133652
43744	NC_014152	CAA	2	6	2225847	2225852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133652
43745	NC_014152	A	7	7	2225851	2225857	100 %	0 %	0 %	0 %	296133652
43746	NC_014152	CAA	2	6	2225971	2225976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133652
43747	NC_014152	CCGGA	2	10	2226006	2226015	20 %	0 %	40 %	40 %	296133652
43748	NC_014152	TCTATA	2	12	2226101	2226112	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	296133652
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43795	NC_014152	TTATA	2	10	2228223	2228232	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43797	NC_014152	A	7	7	2228280	2228286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43976	NC_014152	GCC	2	6	2237100	2237105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133663
43977	NC_014152	TA	3	6	2237113	2237118	50 %	50 %	0 %	0 %	296133663
43978	NC_014152	TGT	2	6	2237119	2237124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133663
43979	NC_014152	TGT	2	6	2237212	2237217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133663
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