MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 62102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_014152	TCCT	2	8	2186797	2186804	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43002	NC_014152	ATA	2	6	2186837	2186842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43003	NC_014152	T	7	7	2186854	2186860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43004	NC_014152	ATT	2	6	2186871	2186876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43005	NC_014152	A	6	6	2186886	2186891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43006	NC_014152	TAA	2	6	2186956	2186961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43007	NC_014152	CAA	2	6	2187012	2187017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133615
43008	NC_014152	AAG	2	6	2187073	2187078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296133615
43009	NC_014152	TTG	2	6	2187168	2187173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133615
43010	NC_014152	ATT	2	6	2187180	2187185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133615
43011	NC_014152	GCA	2	6	2187343	2187348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133615
43012	NC_014152	CAA	2	6	2187404	2187409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133615
43013	NC_014152	AGA	2	6	2187506	2187511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296133615
43014	NC_014152	GGT	2	6	2187537	2187542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296133615
43015	NC_014152	CA	4	8	2187555	2187562	50 %	0 %	0 %	50 %	296133615
43016	NC_014152	TCGC	2	8	2187580	2187587	0 %	25 %	25 %	50 %	296133615
43017	NC_014152	GCT	2	6	2187648	2187653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133615
43018	NC_014152	AAAC	2	8	2187668	2187675	75 %	0 %	0 %	25 %	296133615
43019	NC_014152	T	6	6	2187729	2187734	0 %	100 %	0 %	0 %	296133615
43020	NC_014152	ATT	2	6	2187786	2187791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133615
43021	NC_014152	TGC	2	6	2187806	2187811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133615
43022	NC_014152	A	6	6	2187909	2187914	100 %	0 %	0 %	0 %	296133615
43023	NC_014152	A	6	6	2187972	2187977	100 %	0 %	0 %	0 %	296133615
43024	NC_014152	ATGAT	2	10	2187997	2188006	40 %	40 %	20 %	0 %	296133615
43025	NC_014152	AG	3	6	2188083	2188088	50 %	0 %	50 %	0 %	296133615
43026	NC_014152	AT	3	6	2188278	2188283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43027	NC_014152	GT	3	6	2188375	2188380	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43028	NC_014152	ATT	2	6	2188405	2188410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43029	NC_014152	TTA	2	6	2188415	2188420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43030	NC_014152	TTA	2	6	2188429	2188434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43031	NC_014152	TTA	2	6	2188443	2188448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43032	NC_014152	TTA	2	6	2188457	2188462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43033	NC_014152	TTA	2	6	2188471	2188476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43034	NC_014152	TTA	2	6	2188485	2188490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43035	NC_014152	TTA	2	6	2188499	2188504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43036	NC_014152	TTA	2	6	2188513	2188518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43037	NC_014152	TTA	2	6	2188527	2188532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43038	NC_014152	TTA	2	6	2188541	2188546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43039	NC_014152	TC	3	6	2188703	2188708	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43040	NC_014152	CCT	2	6	2188750	2188755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43041	NC_014152	CTC	2	6	2189024	2189029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43042	NC_014152	CCTGCG	2	12	2189038	2189049	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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43044	NC_014152	ACC	2	6	2189268	2189273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43045	NC_014152	GGT	2	6	2189491	2189496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43046	NC_014152	CGA	2	6	2189504	2189509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43047	NC_014152	CTGTC	2	10	2189612	2189621	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
43048	NC_014152	TTG	2	6	2189668	2189673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43049	NC_014152	GCC	2	6	2189761	2189766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43050	NC_014152	CTC	2	6	2189813	2189818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43051	NC_014152	CGT	2	6	2189856	2189861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43052	NC_014152	CCTCT	2	10	2189909	2189918	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
43053	NC_014152	ACT	2	6	2189954	2189959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43054	NC_014152	TC	3	6	2190017	2190022	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43055	NC_014152	GC	3	6	2190023	2190028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43056	NC_014152	TC	3	6	2190037	2190042	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43057	NC_014152	CCTA	2	8	2190043	2190050	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43058	NC_014152	ACT	2	6	2190127	2190132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43059	NC_014152	TG	3	6	2190166	2190171	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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43061	NC_014152	CGG	2	6	2190379	2190384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43062	NC_014152	TC	3	6	2190426	2190431	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43063	NC_014152	CTC	2	6	2190449	2190454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43064	NC_014152	TAC	2	6	2190508	2190513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43065	NC_014152	TCT	2	6	2190557	2190562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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43067	NC_014152	CT	3	6	2190611	2190616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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43071	NC_014152	GTCG	2	8	2191058	2191065	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43072	NC_014152	CCA	2	6	2191076	2191081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43073	NC_014152	AACT	2	8	2191140	2191147	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43074	NC_014152	GCTA	2	8	2191205	2191212	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43075	NC_014152	CTCCC	2	10	2191307	2191316	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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43083	NC_014152	TCGC	2	8	2191676	2191683	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43084	NC_014152	TGT	2	6	2191702	2191707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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43093	NC_014152	TTC	2	6	2192154	2192159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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43095	NC_014152	T	6	6	2192408	2192413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43096	NC_014152	GA	3	6	2192476	2192481	50 %	0 %	50 %	0 %	296133616
43097	NC_014152	TCGA	2	8	2192485	2192492	25 %	25 %	25 %	25 %	296133616
43098	NC_014152	CAGC	2	8	2192534	2192541	25 %	0 %	25 %	50 %	296133616
43099	NC_014152	GTCT	2	8	2192587	2192594	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43100	NC_014152	AAC	2	6	2192616	2192621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43101	NC_014152	CTT	2	6	2192622	2192627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43102	NC_014152	AGG	2	6	2192660	2192665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43103	NC_014152	GTG	2	6	2192788	2192793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43104	NC_014152	GT	3	6	2192803	2192808	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43105	NC_014152	GT	3	6	2192973	2192978	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43106	NC_014152	ATG	2	6	2192998	2193003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43107	NC_014152	TCC	2	6	2193024	2193029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43108	NC_014152	TC	3	6	2193046	2193051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43109	NC_014152	CACGA	2	10	2193125	2193134	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
43110	NC_014152	GAC	2	6	2193138	2193143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43111	NC_014152	CAC	2	6	2193151	2193156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43112	NC_014152	CAAG	2	8	2193171	2193178	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43113	NC_014152	GAC	2	6	2193184	2193189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43114	NC_014152	TTC	2	6	2193234	2193239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43115	NC_014152	CCT	2	6	2193374	2193379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43116	NC_014152	AG	3	6	2193473	2193478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43117	NC_014152	TCC	2	6	2193498	2193503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43118	NC_014152	CTCTC	2	10	2193542	2193551	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
43119	NC_014152	AGGC	2	8	2193577	2193584	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43120	NC_014152	GCT	2	6	2193688	2193693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43121	NC_014152	TCC	2	6	2193715	2193720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43122	NC_014152	CT	3	6	2193734	2193739	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43123	NC_014152	TGA	2	6	2193747	2193752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43124	NC_014152	CTT	2	6	2193775	2193780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43125	NC_014152	CTG	2	6	2193834	2193839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43126	NC_014152	TCG	2	6	2193909	2193914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43127	NC_014152	AAGC	2	8	2194108	2194115	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43128	NC_014152	CGC	2	6	2194153	2194158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43129	NC_014152	GCCG	2	8	2194245	2194252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43130	NC_014152	TTC	2	6	2194265	2194270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43131	NC_014152	T	6	6	2194339	2194344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43132	NC_014152	TTA	2	6	2194356	2194361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43140	NC_014152	CCGG	2	8	2194632	2194639	0 %	0 %	50 %	50 %	296133617
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43146	NC_014152	CGAC	2	8	2194848	2194855	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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43149	NC_014152	T	7	7	2194917	2194923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43150	NC_014152	AT	3	6	2194973	2194978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43160	NC_014152	AT	3	6	2195771	2195776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43164	NC_014152	AATTTA	2	12	2195914	2195925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43165	NC_014152	A	8	8	2195937	2195944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43213	NC_014152	TCC	2	6	2198311	2198316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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43235	NC_014152	TAAA	2	8	2199910	2199917	75 %	25 %	0 %	0 %	296133624
43236	NC_014152	TGC	2	6	2199925	2199930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133624
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43239	NC_014152	CTTC	2	8	2200012	2200019	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43240	NC_014152	TAT	2	6	2200042	2200047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43242	NC_014152	A	6	6	2200144	2200149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43243	NC_014152	ATT	2	6	2200164	2200169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133625
43244	NC_014152	TA	3	6	2200252	2200257	50 %	50 %	0 %	0 %	296133625
43245	NC_014152	AGGT	2	8	2200274	2200281	25 %	25 %	50 %	0 %	296133625
43246	NC_014152	CAT	2	6	2200309	2200314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133625
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43248	NC_014152	TCA	2	6	2200364	2200369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133625
43249	NC_014152	CCTT	2	8	2200424	2200431	0 %	50 %	0 %	50 %	296133625
43250	NC_014152	CCG	2	6	2200504	2200509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133625
43251	NC_014152	GCT	2	6	2200608	2200613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133625
43252	NC_014152	TCCAGT	2	12	2200649	2200660	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	296133625
43253	NC_014152	AATG	2	8	2200721	2200728	50 %	25 %	25 %	0 %	296133625
43254	NC_014152	CTG	2	6	2200780	2200785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133625
43255	NC_014152	TTC	2	6	2200789	2200794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133625
43256	NC_014152	GA	3	6	2200795	2200800	50 %	0 %	50 %	0 %	296133625
43257	NC_014152	ATT	2	6	2200852	2200857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43258	NC_014152	A	6	6	2200898	2200903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43259	NC_014152	CTG	2	6	2201054	2201059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133626
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43263	NC_014152	GCC	2	6	2201225	2201230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133626
43264	NC_014152	T	6	6	2201249	2201254	0 %	100 %	0 %	0 %	296133626
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43275	NC_014152	TAT	3	9	2201749	2201757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43276	NC_014152	A	6	6	2201792	2201797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43277	NC_014152	T	6	6	2201818	2201823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43278	NC_014152	CGG	2	6	2202045	2202050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133627
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43323	NC_014152	TCT	2	6	2204982	2204987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133629
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43327	NC_014152	CTTG	2	8	2205337	2205344	0 %	50 %	25 %	25 %	296133630
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43334	NC_014152	AT	3	6	2205739	2205744	50 %	50 %	0 %	0 %	296133630
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43354	NC_014152	GGCCGG	2	12	2206453	2206464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133630
43355	NC_014152	CCA	2	6	2206473	2206478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133630
43356	NC_014152	GGCCGG	2	12	2206501	2206512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133630
43357	NC_014152	CCA	2	6	2206521	2206526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133630
43358	NC_014152	GCTG	2	8	2206532	2206539	0 %	25 %	50 %	25 %	296133630
43359	NC_014152	CAG	2	6	2206572	2206577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133630
43360	NC_014152	CTGA	2	8	2206605	2206612	25 %	25 %	25 %	25 %	296133630
43361	NC_014152	GAT	2	6	2206662	2206667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133630
43362	NC_014152	T	6	6	2206808	2206813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43363	NC_014152	AT	3	6	2206844	2206849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43364	NC_014152	TAA	2	6	2207008	2207013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133631
43365	NC_014152	AATC	2	8	2207017	2207024	50 %	25 %	0 %	25 %	296133631
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43367	NC_014152	AT	3	6	2207112	2207117	50 %	50 %	0 %	0 %	296133631
43368	NC_014152	ATT	2	6	2207159	2207164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133631
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43490	NC_014152	TAT	2	6	2213261	2213266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133640
43491	NC_014152	CGG	2	6	2213300	2213305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133640
43492	NC_014152	TTA	2	6	2213325	2213330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133640
43493	NC_014152	GCA	2	6	2213341	2213346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133640
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