MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 62102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42502	NC_014152	GTA	2	6	2161206	2161211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133592
42503	NC_014152	GCT	2	6	2161215	2161220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133592
42504	NC_014152	CAA	2	6	2161254	2161259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133592
42505	NC_014152	TGA	2	6	2161382	2161387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133592
42506	NC_014152	TAA	2	6	2161394	2161399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133592
42507	NC_014152	GCC	2	6	2161416	2161421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133592
42508	NC_014152	A	6	6	2161483	2161488	100 %	0 %	0 %	0 %	296133592
42509	NC_014152	CTG	2	6	2161554	2161559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133593
42510	NC_014152	ACC	2	6	2161611	2161616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133593
42511	NC_014152	CAC	2	6	2161622	2161627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133593
42512	NC_014152	GGA	2	6	2161635	2161640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296133593
42513	NC_014152	AGC	2	6	2161689	2161694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133593
42514	NC_014152	CCT	2	6	2161781	2161786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42515	NC_014152	TTTG	2	8	2161788	2161795	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42516	NC_014152	TGT	2	6	2161853	2161858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42517	NC_014152	TTAT	2	8	2161874	2161881	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42518	NC_014152	AG	3	6	2161961	2161966	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42519	NC_014152	T	6	6	2161967	2161972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42520	NC_014152	T	7	7	2161998	2162004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42521	NC_014152	AAT	2	6	2162022	2162027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42522	NC_014152	TTC	2	6	2162029	2162034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42523	NC_014152	CCT	2	6	2162042	2162047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42524	NC_014152	TAA	2	6	2162066	2162071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42525	NC_014152	ATT	2	6	2162089	2162094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42526	NC_014152	AAT	2	6	2162133	2162138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42527	NC_014152	AAT	2	6	2162155	2162160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42528	NC_014152	TAA	2	6	2162173	2162178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42529	NC_014152	CTAT	2	8	2162210	2162217	25 %	50 %	0 %	25 %	296133594
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42533	NC_014152	GTC	2	6	2162639	2162644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133594
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42539	NC_014152	CGG	2	6	2163064	2163069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133594
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42542	NC_014152	AATT	2	8	2163135	2163142	50 %	50 %	0 %	0 %	296133594
42543	NC_014152	CA	3	6	2163144	2163149	50 %	0 %	0 %	50 %	296133594
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42547	NC_014152	A	6	6	2163269	2163274	100 %	0 %	0 %	0 %	296133594
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42552	NC_014152	AAG	2	6	2163537	2163542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296133594
42553	NC_014152	A	6	6	2163555	2163560	100 %	0 %	0 %	0 %	296133594
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42579	NC_014152	AGT	2	6	2164885	2164890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133595
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42603	NC_014152	TCA	2	6	2166269	2166274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133597
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42611	NC_014152	CTT	2	6	2166645	2166650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42612	NC_014152	ATTC	2	8	2166679	2166686	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42613	NC_014152	T	6	6	2166717	2166722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42614	NC_014152	A	6	6	2166765	2166770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42615	NC_014152	T	6	6	2166809	2166814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42616	NC_014152	CCA	2	6	2166973	2166978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133598
42617	NC_014152	T	6	6	2166983	2166988	0 %	100 %	0 %	0 %	296133598
42618	NC_014152	CAGG	2	8	2167003	2167010	25 %	0 %	50 %	25 %	296133598
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42620	NC_014152	A	6	6	2167131	2167136	100 %	0 %	0 %	0 %	296133598
42621	NC_014152	TCT	2	6	2167161	2167166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133598
42622	NC_014152	CCGT	2	8	2167182	2167189	0 %	25 %	25 %	50 %	296133598
42623	NC_014152	AGCC	2	8	2167307	2167314	25 %	0 %	25 %	50 %	296133598
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42625	NC_014152	ACCT	2	8	2167367	2167374	25 %	25 %	0 %	50 %	296133598
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42628	NC_014152	CTG	2	6	2167601	2167606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133598
42629	NC_014152	CT	3	6	2167801	2167806	0 %	50 %	0 %	50 %	296133598
42630	NC_014152	TGT	2	6	2167824	2167829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133598
42631	NC_014152	TAC	2	6	2167862	2167867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133598
42632	NC_014152	TTCCTT	2	12	2167940	2167951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133598
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42647	NC_014152	TTCC	2	8	2168669	2168676	0 %	50 %	0 %	50 %	296133598
42648	NC_014152	T	7	7	2168690	2168696	0 %	100 %	0 %	0 %	296133598
42649	NC_014152	GGTT	2	8	2168703	2168710	0 %	50 %	50 %	0 %	296133598
42650	NC_014152	CGCGG	2	10	2168773	2168782	0 %	0 %	60 %	40 %	296133598
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42655	NC_014152	GATT	2	8	2168979	2168986	25 %	50 %	25 %	0 %	296133598
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42664	NC_014152	ACC	2	6	2169728	2169733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133599
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42668	NC_014152	AAT	2	6	2169797	2169802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133599
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42682	NC_014152	CCA	2	6	2170646	2170651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133600
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42684	NC_014152	TCCG	2	8	2170700	2170707	0 %	25 %	25 %	50 %	296133600
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42686	NC_014152	AT	3	6	2170760	2170765	50 %	50 %	0 %	0 %	296133600
42687	NC_014152	ATCT	2	8	2170779	2170786	25 %	50 %	0 %	25 %	296133600
42688	NC_014152	TTC	2	6	2170806	2170811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133600
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42700	NC_014152	GCAA	2	8	2171392	2171399	50 %	0 %	25 %	25 %	296133600
42701	NC_014152	TATC	2	8	2171432	2171439	25 %	50 %	0 %	25 %	296133600
42702	NC_014152	ATC	2	6	2171463	2171468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133600
42703	NC_014152	AG	3	6	2171517	2171522	50 %	0 %	50 %	0 %	296133600
42704	NC_014152	ATTAA	2	10	2171617	2171626	60 %	40 %	0 %	0 %	296133600
42705	NC_014152	T	6	6	2171628	2171633	0 %	100 %	0 %	0 %	296133600
42706	NC_014152	ATC	2	6	2171719	2171724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133600
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42708	NC_014152	TCC	2	6	2171928	2171933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42709	NC_014152	GCC	2	6	2171937	2171942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133601
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42711	NC_014152	ACATTT	2	12	2171965	2171976	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	296133601
42712	NC_014152	TACT	2	8	2172001	2172008	25 %	50 %	0 %	25 %	296133601
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42720	NC_014152	ATT	2	6	2172645	2172650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42721	NC_014152	ATTT	2	8	2172662	2172669	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42722	NC_014152	T	8	8	2172697	2172704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42723	NC_014152	AAAGGA	2	12	2172726	2172737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42724	NC_014152	AT	3	6	2172762	2172767	50 %	50 %	0 %	0 %	296133603
42725	NC_014152	ATTAA	2	10	2172791	2172800	60 %	40 %	0 %	0 %	296133603
42726	NC_014152	A	7	7	2172878	2172884	100 %	0 %	0 %	0 %	296133603
42727	NC_014152	T	7	7	2172961	2172967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42728	NC_014152	GCC	2	6	2172993	2172998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133604
42729	NC_014152	CGC	2	6	2173042	2173047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133604
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42731	NC_014152	GTT	2	6	2173183	2173188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133604
42732	NC_014152	TTC	2	6	2173211	2173216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133604
42733	NC_014152	TATAT	2	10	2173275	2173284	40 %	60 %	0 %	0 %	296133604
42734	NC_014152	TCT	2	6	2173293	2173298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133604
42735	NC_014152	TCA	2	6	2173437	2173442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133604
42736	NC_014152	A	6	6	2173515	2173520	100 %	0 %	0 %	0 %	296133604
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