MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 62102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42117	NC_014152	TCC	2	6	2141062	2141067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133575
42118	NC_014152	TAA	2	6	2141135	2141140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133575
42119	NC_014152	TTC	2	6	2141199	2141204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133575
42120	NC_014152	GCA	2	6	2141293	2141298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133575
42121	NC_014152	CCATGG	2	12	2141336	2141347	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296133575
42122	NC_014152	GCC	2	6	2141367	2141372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133575
42123	NC_014152	CAA	2	6	2141390	2141395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133575
42124	NC_014152	GTAT	2	8	2141486	2141493	25 %	50 %	25 %	0 %	296133575
42125	NC_014152	GGT	2	6	2141514	2141519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296133575
42126	NC_014152	CTT	2	6	2141558	2141563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133575
42127	NC_014152	ACATCA	2	12	2141576	2141587	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	296133575
42128	NC_014152	CAG	2	6	2141651	2141656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133575
42129	NC_014152	ATA	2	6	2141674	2141679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133575
42130	NC_014152	CCGC	2	8	2141686	2141693	0 %	0 %	25 %	75 %	296133575
42131	NC_014152	GCA	2	6	2141704	2141709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133575
42132	NC_014152	TCC	2	6	2141804	2141809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42133	NC_014152	TA	3	6	2141829	2141834	50 %	50 %	0 %	0 %	296133576
42134	NC_014152	TGA	2	6	2141842	2141847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133576
42135	NC_014152	CAG	3	9	2141848	2141856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133576
42136	NC_014152	TAAT	2	8	2141908	2141915	50 %	50 %	0 %	0 %	296133576
42137	NC_014152	AGC	2	6	2141954	2141959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133576
42138	NC_014152	AGCC	2	8	2142011	2142018	25 %	0 %	25 %	50 %	296133576
42139	NC_014152	CGC	2	6	2142023	2142028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133576
42140	NC_014152	ATA	2	6	2142036	2142041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133576
42141	NC_014152	A	7	7	2142065	2142071	100 %	0 %	0 %	0 %	296133576
42142	NC_014152	AGC	2	6	2142116	2142121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133576
42143	NC_014152	ATT	2	6	2142129	2142134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133576
42144	NC_014152	CAT	2	6	2142191	2142196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133576
42145	NC_014152	AAC	2	6	2142198	2142203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133576
42146	NC_014152	CCA	2	6	2142204	2142209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133576
42147	NC_014152	AAAG	2	8	2142234	2142241	75 %	0 %	25 %	0 %	296133576
42148	NC_014152	CAG	2	6	2142274	2142279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133576
42149	NC_014152	ACA	2	6	2142298	2142303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133576
42150	NC_014152	TA	3	6	2142389	2142394	50 %	50 %	0 %	0 %	296133576
42151	NC_014152	AACCA	2	10	2142407	2142416	60 %	0 %	0 %	40 %	296133576
42152	NC_014152	GCT	2	6	2142591	2142596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133576
42153	NC_014152	CTA	2	6	2142646	2142651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133576
42154	NC_014152	TAGT	2	8	2142708	2142715	25 %	50 %	25 %	0 %	296133576
42155	NC_014152	ACCG	2	8	2142755	2142762	25 %	0 %	25 %	50 %	296133576
42156	NC_014152	TCA	2	6	2142787	2142792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133577
42157	NC_014152	ACT	2	6	2142835	2142840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133577
42158	NC_014152	T	8	8	2142840	2142847	0 %	100 %	0 %	0 %	296133577
42159	NC_014152	TGA	2	6	2142911	2142916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133577
42160	NC_014152	GCG	2	6	2142941	2142946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133577
42161	NC_014152	T	8	8	2143033	2143040	0 %	100 %	0 %	0 %	296133577
42162	NC_014152	ATC	2	6	2143054	2143059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133577
42163	NC_014152	CAC	2	6	2143098	2143103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133577
42164	NC_014152	CAA	2	6	2143109	2143114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133577
42165	NC_014152	TTC	2	6	2143297	2143302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133577
42166	NC_014152	ATA	2	6	2143318	2143323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133577
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42168	NC_014152	GGCC	2	8	2143419	2143426	0 %	0 %	50 %	50 %	296133577
42169	NC_014152	CTT	2	6	2143517	2143522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133577
42170	NC_014152	CA	3	6	2143537	2143542	50 %	0 %	0 %	50 %	296133577
42171	NC_014152	GGA	2	6	2143548	2143553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296133577
42172	NC_014152	TCTTT	2	10	2143557	2143566	0 %	80 %	0 %	20 %	296133577
42173	NC_014152	CGGC	2	8	2143577	2143584	0 %	0 %	50 %	50 %	296133577
42174	NC_014152	ACA	2	6	2143618	2143623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133577
42175	NC_014152	ACCA	2	8	2143683	2143690	50 %	0 %	0 %	50 %	296133577
42176	NC_014152	AAC	2	6	2143692	2143697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133577
42177	NC_014152	TCG	2	6	2143795	2143800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133578
42178	NC_014152	CCT	2	6	2143801	2143806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133578
42179	NC_014152	TTCGA	2	10	2143863	2143872	20 %	40 %	20 %	20 %	296133578
42180	NC_014152	TA	3	6	2143880	2143885	50 %	50 %	0 %	0 %	296133578
42181	NC_014152	GTT	2	6	2144303	2144308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133578
42182	NC_014152	ACC	2	6	2144372	2144377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42183	NC_014152	AT	3	6	2144418	2144423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42184	NC_014152	A	7	7	2144476	2144482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42185	NC_014152	TTAC	2	8	2144522	2144529	25 %	50 %	0 %	25 %	296133579
42186	NC_014152	CAG	2	6	2144533	2144538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133579
42187	NC_014152	CAA	2	6	2144539	2144544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133579
42188	NC_014152	CTT	2	6	2144655	2144660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133579
42189	NC_014152	TGT	2	6	2144691	2144696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133579
42190	NC_014152	ATTT	2	8	2144703	2144710	25 %	75 %	0 %	0 %	296133579
42191	NC_014152	CTC	2	6	2144843	2144848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133580
42192	NC_014152	AATT	2	8	2145080	2145087	50 %	50 %	0 %	0 %	296133580
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42194	NC_014152	TC	3	6	2145195	2145200	0 %	50 %	0 %	50 %	296133580
42195	NC_014152	CAAA	2	8	2145260	2145267	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42196	NC_014152	T	7	7	2145289	2145295	0 %	100 %	0 %	0 %	296133581
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42199	NC_014152	ATCA	2	8	2145604	2145611	50 %	25 %	0 %	25 %	296133581
42200	NC_014152	GTT	2	6	2145777	2145782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133581
42201	NC_014152	AAT	2	6	2145856	2145861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133581
42202	NC_014152	ATA	2	6	2145863	2145868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133581
42203	NC_014152	GCAGG	2	10	2145915	2145924	20 %	0 %	60 %	20 %	296133581
42204	NC_014152	CTG	2	6	2145936	2145941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133581
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42207	NC_014152	T	6	6	2146016	2146021	0 %	100 %	0 %	0 %	296133581
42208	NC_014152	CCGC	2	8	2146028	2146035	0 %	0 %	25 %	75 %	296133581
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42214	NC_014152	TA	3	6	2146353	2146358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42215	NC_014152	AGT	2	6	2146407	2146412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42216	NC_014152	CTT	2	6	2146446	2146451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42217	NC_014152	TGC	2	6	2146498	2146503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42218	NC_014152	CAGG	2	8	2146514	2146521	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42219	NC_014152	GCC	2	6	2146569	2146574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42220	NC_014152	CGG	2	6	2146616	2146621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42221	NC_014152	CTGC	2	8	2146653	2146660	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42222	NC_014152	CACC	2	8	2146713	2146720	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
42223	NC_014152	CCT	2	6	2146721	2146726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42224	NC_014152	TGT	2	6	2146727	2146732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42225	NC_014152	AAC	2	6	2146753	2146758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42226	NC_014152	AGA	2	6	2146777	2146782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42227	NC_014152	TGG	2	6	2146817	2146822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42228	NC_014152	GTT	2	6	2146985	2146990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42229	NC_014152	GCA	2	6	2147032	2147037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42230	NC_014152	CCTGC	2	10	2147066	2147075	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
42231	NC_014152	CACC	2	8	2147117	2147124	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
42232	NC_014152	AGGG	2	8	2147195	2147202	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
42233	NC_014152	GTA	2	6	2147218	2147223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133582
42234	NC_014152	GCT	2	6	2147355	2147360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133582
42235	NC_014152	T	6	6	2147429	2147434	0 %	100 %	0 %	0 %	296133582
42236	NC_014152	TTGC	2	8	2147456	2147463	0 %	50 %	25 %	25 %	296133582
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42325	NC_014152	TTTC	2	8	2152142	2152149	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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42351	NC_014152	ACT	2	6	2153529	2153534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42353	NC_014152	T	6	6	2153622	2153627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42354	NC_014152	ATTT	2	8	2153636	2153643	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42355	NC_014152	TC	3	6	2153665	2153670	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42356	NC_014152	CTT	2	6	2153675	2153680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42357	NC_014152	AAAT	2	8	2153753	2153760	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42358	NC_014152	TCCC	2	8	2153788	2153795	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
42359	NC_014152	AGC	2	6	2153801	2153806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42360	NC_014152	TCC	2	6	2153810	2153815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42361	NC_014152	TCTCC	2	10	2153820	2153829	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
42362	NC_014152	CACC	2	8	2153830	2153837	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
42363	NC_014152	TTAA	2	8	2153864	2153871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42364	NC_014152	TCA	2	6	2153877	2153882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42365	NC_014152	T	6	6	2153893	2153898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42366	NC_014152	AAC	2	6	2153997	2154002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42367	NC_014152	CAA	2	6	2154023	2154028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133588
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42370	NC_014152	A	7	7	2154226	2154232	100 %	0 %	0 %	0 %	296133588
42371	NC_014152	CCTT	2	8	2154260	2154267	0 %	50 %	0 %	50 %	296133588
42372	NC_014152	GTG	2	6	2154305	2154310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296133588
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42374	NC_014152	TAA	2	6	2154470	2154475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133588
42375	NC_014152	TGAT	2	8	2154484	2154491	25 %	50 %	25 %	0 %	296133588
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42379	NC_014152	CTGCC	2	10	2154811	2154820	0 %	20 %	20 %	60 %	296133588
42380	NC_014152	CTG	2	6	2154831	2154836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133588
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42387	NC_014152	AGG	2	6	2155198	2155203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42388	NC_014152	CCTC	2	8	2155267	2155274	0 %	25 %	0 %	75 %	296133589
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42399	NC_014152	A	6	6	2156146	2156151	100 %	0 %	0 %	0 %	296133589
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42413	NC_014152	TCTTT	2	10	2156735	2156744	0 %	80 %	0 %	20 %	296133590
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42446	NC_014152	TGT	2	6	2158388	2158393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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42449	NC_014152	T	6	6	2158457	2158462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42450	NC_014152	T	6	6	2158475	2158480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42451	NC_014152	AAT	2	6	2158543	2158548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42454	NC_014152	TTA	2	6	2158650	2158655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42458	NC_014152	GA	3	6	2158808	2158813	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42459	NC_014152	TTCT	2	8	2158859	2158866	0 %	75 %	0 %	25 %	296133591
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42464	NC_014152	TA	3	6	2159050	2159055	50 %	50 %	0 %	0 %	296133591
42465	NC_014152	TATG	2	8	2159106	2159113	25 %	50 %	25 %	0 %	296133591
42466	NC_014152	AAAC	2	8	2159145	2159152	75 %	0 %	0 %	25 %	296133591
42467	NC_014152	ATA	2	6	2159158	2159163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133591
42468	NC_014152	GCCA	2	8	2159389	2159396	25 %	0 %	25 %	50 %	296133591
42469	NC_014152	AATA	2	8	2159454	2159461	75 %	25 %	0 %	0 %	296133591
42470	NC_014152	GCC	2	6	2159485	2159490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133591
42471	NC_014152	AT	3	6	2159504	2159509	50 %	50 %	0 %	0 %	296133591
42472	NC_014152	GTC	2	6	2159550	2159555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133591
42473	NC_014152	AAC	2	6	2159578	2159583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133591
42474	NC_014152	CCAG	2	8	2159664	2159671	25 %	0 %	25 %	50 %	296133591
42475	NC_014152	ACC	2	6	2159719	2159724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133591
42476	NC_014152	GCC	2	6	2159737	2159742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133591
42477	NC_014152	AGC	2	6	2159754	2159759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133591
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42479	NC_014152	CAT	2	6	2159921	2159926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133591
42480	NC_014152	AGC	2	6	2159961	2159966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133591
42481	NC_014152	ACC	2	6	2159991	2159996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133591
42482	NC_014152	A	6	6	2160012	2160017	100 %	0 %	0 %	0 %	296133591
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42484	NC_014152	AAT	2	6	2160048	2160053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133591
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42486	NC_014152	A	6	6	2160229	2160234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42487	NC_014152	AGT	2	6	2160236	2160241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42488	NC_014152	ACT	2	6	2160251	2160256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42490	NC_014152	T	6	6	2160390	2160395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42491	NC_014152	T	6	6	2160470	2160475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42492	NC_014152	AGG	2	6	2160487	2160492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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