MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 62102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41002	NC_014152	TCA	2	6	2086039	2086044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133518
41003	NC_014152	AAC	2	6	2086093	2086098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133518
41004	NC_014152	CCG	2	6	2086103	2086108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133518
41005	NC_014152	TCA	2	6	2086202	2086207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133518
41006	NC_014152	TA	3	6	2086361	2086366	50 %	50 %	0 %	0 %	296133519
41007	NC_014152	TCC	2	6	2086371	2086376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133519
41008	NC_014152	TCC	2	6	2086410	2086415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133519
41009	NC_014152	GAAA	2	8	2086454	2086461	75 %	0 %	25 %	0 %	296133519
41010	NC_014152	GCC	2	6	2086579	2086584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133519
41011	NC_014152	TCCTG	2	10	2086639	2086648	0 %	40 %	20 %	40 %	296133519
41012	NC_014152	CGC	2	6	2086689	2086694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133519
41013	NC_014152	TCT	2	6	2086704	2086709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133519
41014	NC_014152	AT	3	6	2086742	2086747	50 %	50 %	0 %	0 %	296133519
41015	NC_014152	CTG	2	6	2086782	2086787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133519
41016	NC_014152	GCC	2	6	2086801	2086806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133519
41017	NC_014152	ACC	3	9	2086824	2086832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133519
41018	NC_014152	A	6	6	2086909	2086914	100 %	0 %	0 %	0 %	296133519
41019	NC_014152	ACCA	2	8	2086940	2086947	50 %	0 %	0 %	50 %	296133519
41020	NC_014152	CCT	2	6	2086960	2086965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133520
41021	NC_014152	CAA	2	6	2086982	2086987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133520
41022	NC_014152	TGC	2	6	2087027	2087032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133520
41023	NC_014152	CAA	2	6	2087072	2087077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133520
41024	NC_014152	CTGG	2	8	2087247	2087254	0 %	25 %	50 %	25 %	296133520
41025	NC_014152	T	6	6	2087277	2087282	0 %	100 %	0 %	0 %	296133520
41026	NC_014152	CT	3	6	2087306	2087311	0 %	50 %	0 %	50 %	296133520
41027	NC_014152	TTC	2	6	2087332	2087337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133521
41028	NC_014152	TCC	2	6	2087339	2087344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133521
41029	NC_014152	AT	3	6	2087356	2087361	50 %	50 %	0 %	0 %	296133521
41030	NC_014152	CAG	2	6	2087362	2087367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133521
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41032	NC_014152	CGG	2	6	2087390	2087395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133521
41033	NC_014152	TCC	2	6	2087402	2087407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133521
41034	NC_014152	GCTT	2	8	2087426	2087433	0 %	50 %	25 %	25 %	296133521
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41038	NC_014152	CTTTT	2	10	2087527	2087536	0 %	80 %	0 %	20 %	296133521
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41049	NC_014152	TCCG	2	8	2088077	2088084	0 %	25 %	25 %	50 %	296133521
41050	NC_014152	A	6	6	2088115	2088120	100 %	0 %	0 %	0 %	296133521
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41052	NC_014152	GGCA	2	8	2088217	2088224	25 %	0 %	50 %	25 %	296133521
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41055	NC_014152	AT	3	6	2088519	2088524	50 %	50 %	0 %	0 %	296133521
41056	NC_014152	TCA	2	6	2088575	2088580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133521
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41058	NC_014152	TGC	2	6	2088624	2088629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133521
41059	NC_014152	CCTCT	2	10	2088664	2088673	0 %	40 %	0 %	60 %	296133521
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41081	NC_014152	A	7	7	2090082	2090088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41082	NC_014152	AAG	2	6	2090211	2090216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41083	NC_014152	TTGC	2	8	2090230	2090237	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41084	NC_014152	TTG	2	6	2090294	2090299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41085	NC_014152	GT	3	6	2090362	2090367	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41086	NC_014152	A	10	10	2090509	2090518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41089	NC_014152	TAAA	2	8	2090792	2090799	75 %	25 %	0 %	0 %	296133522
41090	NC_014152	GTCT	2	8	2090829	2090836	0 %	50 %	25 %	25 %	296133522
41091	NC_014152	AAAT	2	8	2090874	2090881	75 %	25 %	0 %	0 %	296133522
41092	NC_014152	AGA	2	6	2090904	2090909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296133522
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41098	NC_014152	ATA	2	6	2091419	2091424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41099	NC_014152	TAT	2	6	2091435	2091440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133523
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41101	NC_014152	CGG	2	6	2091526	2091531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133523
41102	NC_014152	TTTA	2	8	2091620	2091627	25 %	75 %	0 %	0 %	296133523
41103	NC_014152	TCT	2	6	2091682	2091687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133523
41104	NC_014152	GCCAG	2	10	2091716	2091725	20 %	0 %	40 %	40 %	296133523
41105	NC_014152	TAAA	2	8	2091733	2091740	75 %	25 %	0 %	0 %	296133523
41106	NC_014152	TCC	2	6	2091773	2091778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133523
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41113	NC_014152	CTTT	2	8	2091970	2091977	0 %	75 %	0 %	25 %	296133523
41114	NC_014152	T	8	8	2092000	2092007	0 %	100 %	0 %	0 %	296133523
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41116	NC_014152	CAA	2	6	2092132	2092137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133523
41117	NC_014152	A	8	8	2092151	2092158	100 %	0 %	0 %	0 %	296133523
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41239	NC_014152	CTT	2	6	2098650	2098655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133528
41240	NC_014152	ATT	2	6	2098688	2098693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133528
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41277	NC_014152	ACCT	2	8	2100717	2100724	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41278	NC_014152	TAG	2	6	2100729	2100734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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41323	NC_014152	CA	3	6	2102912	2102917	50 %	0 %	0 %	50 %	296133533
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41329	NC_014152	TCTT	2	8	2103103	2103110	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41330	NC_014152	CTA	2	6	2103161	2103166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133534
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41343	NC_014152	TGGC	2	8	2103886	2103893	0 %	25 %	50 %	25 %	296133534
41344	NC_014152	AT	3	6	2103925	2103930	50 %	50 %	0 %	0 %	296133534
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41348	NC_014152	CAA	2	6	2104323	2104328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133535
41349	NC_014152	GCA	2	6	2104402	2104407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133535
41350	NC_014152	TCA	2	6	2104547	2104552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133535
41351	NC_014152	GATT	2	8	2104630	2104637	25 %	50 %	25 %	0 %	296133535
41352	NC_014152	ATA	2	6	2104778	2104783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133536
41353	NC_014152	TGGG	2	8	2104806	2104813	0 %	25 %	75 %	0 %	296133536
41354	NC_014152	TCC	2	6	2104852	2104857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133536
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41476	NC_014152	CTC	2	6	2111609	2111614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41477	NC_014152	TA	3	6	2111623	2111628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41478	NC_014152	ACT	2	6	2111640	2111645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41479	NC_014152	ACA	2	6	2111713	2111718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41480	NC_014152	T	6	6	2111733	2111738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41481	NC_014152	ATTT	2	8	2111747	2111754	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41482	NC_014152	TC	3	6	2111776	2111781	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41483	NC_014152	CTT	2	6	2111786	2111791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41484	NC_014152	CCA	2	6	2111820	2111825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133544
41485	NC_014152	AAT	2	6	2111850	2111855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133544
41486	NC_014152	CTGCG	2	10	2111861	2111870	0 %	20 %	40 %	40 %	296133544
41487	NC_014152	AT	3	6	2111901	2111906	50 %	50 %	0 %	0 %	296133544
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