MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 62102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40501	NC_014152	TCC	2	6	2059586	2059591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40502	NC_014152	GCA	2	6	2059596	2059601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40503	NC_014152	TAA	2	6	2059614	2059619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133493
40504	NC_014152	CAG	2	6	2059635	2059640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133493
40505	NC_014152	TCA	2	6	2059672	2059677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133493
40506	NC_014152	TCA	2	6	2059720	2059725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133493
40507	NC_014152	AGT	2	6	2059740	2059745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133493
40508	NC_014152	T	6	6	2059779	2059784	0 %	100 %	0 %	0 %	296133493
40509	NC_014152	GGCG	2	8	2059838	2059845	0 %	0 %	75 %	25 %	296133493
40510	NC_014152	TCT	2	6	2059870	2059875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133493
40511	NC_014152	CTC	2	6	2059914	2059919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133493
40512	NC_014152	TCA	2	6	2059928	2059933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133493
40513	NC_014152	CTC	2	6	2059953	2059958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133493
40514	NC_014152	ATT	2	6	2060019	2060024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133493
40515	NC_014152	TCA	2	6	2060044	2060049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133493
40516	NC_014152	T	6	6	2060079	2060084	0 %	100 %	0 %	0 %	296133493
40517	NC_014152	TCA	2	6	2060092	2060097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133493
40518	NC_014152	CTTCT	2	10	2060139	2060148	0 %	60 %	0 %	40 %	296133493
40519	NC_014152	CTT	2	6	2060288	2060293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133493
40520	NC_014152	ATTC	2	8	2060300	2060307	25 %	50 %	0 %	25 %	296133493
40521	NC_014152	A	6	6	2060426	2060431	100 %	0 %	0 %	0 %	296133493
40522	NC_014152	TGA	2	6	2060485	2060490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133493
40523	NC_014152	T	6	6	2060507	2060512	0 %	100 %	0 %	0 %	296133493
40524	NC_014152	CTT	2	6	2060513	2060518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133493
40525	NC_014152	GGAATA	2	12	2060539	2060550	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	296133493
40526	NC_014152	TTG	2	6	2060584	2060589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133493
40527	NC_014152	AAT	2	6	2060628	2060633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133493
40528	NC_014152	TCG	2	6	2060638	2060643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133493
40529	NC_014152	TCG	2	6	2060719	2060724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133493
40530	NC_014152	TTG	2	6	2060828	2060833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133493
40531	NC_014152	CTCTT	2	10	2060911	2060920	0 %	60 %	0 %	40 %	296133493
40532	NC_014152	CCA	2	6	2060978	2060983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133493
40533	NC_014152	TTC	2	6	2061078	2061083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133493
40534	NC_014152	TCG	2	6	2061170	2061175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133493
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40536	NC_014152	TCT	2	6	2061231	2061236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133493
40537	NC_014152	CTC	2	6	2061255	2061260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133493
40538	NC_014152	A	7	7	2061305	2061311	100 %	0 %	0 %	0 %	296133493
40539	NC_014152	TCC	2	6	2061337	2061342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133493
40540	NC_014152	AAT	2	6	2061546	2061551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40541	NC_014152	TAT	2	6	2061564	2061569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40542	NC_014152	AGA	2	6	2061573	2061578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40543	NC_014152	ATT	2	6	2061609	2061614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40544	NC_014152	TGCC	2	8	2061650	2061657	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40545	NC_014152	ATTTTT	2	12	2061663	2061674	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40546	NC_014152	T	7	7	2061670	2061676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40547	NC_014152	TTA	2	6	2061856	2061861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133494
40548	NC_014152	CAT	2	6	2062133	2062138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133494
40549	NC_014152	CTT	2	6	2062145	2062150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40550	NC_014152	TCGT	2	8	2062183	2062190	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40551	NC_014152	GGCAAA	2	12	2062303	2062314	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40552	NC_014152	GCAA	2	8	2062387	2062394	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40553	NC_014152	TTGTT	2	10	2062478	2062487	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40554	NC_014152	TGC	2	6	2062647	2062652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40555	NC_014152	ATT	2	6	2062672	2062677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40556	NC_014152	GTTTTT	2	12	2062708	2062719	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40557	NC_014152	GTTG	2	8	2062758	2062765	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40558	NC_014152	TA	4	8	2062766	2062773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40559	NC_014152	ATT	2	6	2062824	2062829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40560	NC_014152	TGA	2	6	2062841	2062846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40561	NC_014152	T	6	6	2062857	2062862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40562	NC_014152	CTT	2	6	2062901	2062906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40563	NC_014152	CTTT	2	8	2062928	2062935	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40564	NC_014152	GATG	2	8	2062997	2063004	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40565	NC_014152	ATTG	2	8	2063040	2063047	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40566	NC_014152	TCT	2	6	2063092	2063097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40567	NC_014152	TACA	2	8	2063120	2063127	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40568	NC_014152	AGC	2	6	2063217	2063222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40569	NC_014152	TAA	2	6	2063241	2063246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40570	NC_014152	TTGAT	2	10	2063307	2063316	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
40571	NC_014152	ATT	2	6	2063353	2063358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40572	NC_014152	T	6	6	2063374	2063379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40573	NC_014152	TTC	2	6	2063392	2063397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40574	NC_014152	TC	3	6	2063441	2063446	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40575	NC_014152	TTGTC	2	10	2063499	2063508	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
40576	NC_014152	TCC	2	6	2063578	2063583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40577	NC_014152	CAA	2	6	2063655	2063660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133495
40578	NC_014152	CTT	2	6	2063691	2063696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133495
40579	NC_014152	TA	3	6	2063740	2063745	50 %	50 %	0 %	0 %	296133495
40580	NC_014152	GCTT	2	8	2063803	2063810	0 %	50 %	25 %	25 %	296133495
40581	NC_014152	TCAA	2	8	2063840	2063847	50 %	25 %	0 %	25 %	296133495
40582	NC_014152	ACAA	2	8	2063911	2063918	75 %	0 %	0 %	25 %	296133495
40583	NC_014152	CAT	2	6	2063931	2063936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133495
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40590	NC_014152	ATT	2	6	2064270	2064275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133496
40591	NC_014152	T	6	6	2064278	2064283	0 %	100 %	0 %	0 %	296133496
40592	NC_014152	ACAT	2	8	2064313	2064320	50 %	25 %	0 %	25 %	296133496
40593	NC_014152	TCC	3	9	2064322	2064330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40594	NC_014152	CAA	2	6	2064347	2064352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40595	NC_014152	TTTC	2	8	2064368	2064375	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40596	NC_014152	CTT	2	6	2064385	2064390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40597	NC_014152	TTG	2	6	2064463	2064468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40598	NC_014152	T	8	8	2064475	2064482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40599	NC_014152	TAA	2	6	2064527	2064532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40600	NC_014152	TAT	2	6	2064564	2064569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40601	NC_014152	GTTC	2	8	2064576	2064583	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40602	NC_014152	A	6	6	2064608	2064613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40603	NC_014152	AT	3	6	2064691	2064696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40604	NC_014152	ACC	2	6	2064706	2064711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40605	NC_014152	TA	3	6	2064729	2064734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40606	NC_014152	TGT	2	6	2064737	2064742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40607	NC_014152	TAAT	2	8	2064746	2064753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40608	NC_014152	CTA	2	6	2064773	2064778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40609	NC_014152	CAA	2	6	2064834	2064839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40610	NC_014152	GAA	2	6	2064843	2064848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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40612	NC_014152	TTC	2	6	2064948	2064953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40613	NC_014152	ATT	2	6	2064963	2064968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40614	NC_014152	T	6	6	2064967	2064972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40615	NC_014152	A	6	6	2065008	2065013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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40618	NC_014152	TG	3	6	2065086	2065091	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40619	NC_014152	TTCG	2	8	2065099	2065106	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40620	NC_014152	CAA	2	6	2065169	2065174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40621	NC_014152	TCC	2	6	2065238	2065243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40622	NC_014152	CAAA	2	8	2065307	2065314	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40623	NC_014152	T	6	6	2065331	2065336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40624	NC_014152	TTAA	2	8	2065394	2065401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40625	NC_014152	ATT	2	6	2065435	2065440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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40986	NC_014152	CAGC	3	12	2085063	2085074	25 %	0 %	25 %	50 %	296133517
40987	NC_014152	GCCG	2	8	2085084	2085091	0 %	0 %	50 %	50 %	296133517
40988	NC_014152	TACA	2	8	2085097	2085104	50 %	25 %	0 %	25 %	296133517
40989	NC_014152	T	7	7	2085107	2085113	0 %	100 %	0 %	0 %	296133517
40990	NC_014152	C	6	6	2085279	2085284	0 %	0 %	0 %	100 %	296133518
40991	NC_014152	TAA	2	6	2085427	2085432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133518
40992	NC_014152	CTC	2	6	2085459	2085464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133518
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40994	NC_014152	T	6	6	2085521	2085526	0 %	100 %	0 %	0 %	296133518
40995	NC_014152	ATG	2	6	2085532	2085537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133518
40996	NC_014152	GCT	2	6	2085597	2085602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133518
40997	NC_014152	CT	3	6	2085750	2085755	0 %	50 %	0 %	50 %	296133518
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41000	NC_014152	T	6	6	2085886	2085891	0 %	100 %	0 %	0 %	296133518

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