MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 62102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34003	NC_014152	T	6	6	1726661	1726666	0 %	100 %	0 %	0 %	296133173
34004	NC_014152	C	6	6	1726722	1726727	0 %	0 %	0 %	100 %	296133173
34005	NC_014152	GTCC	2	8	1726909	1726916	0 %	25 %	25 %	50 %	296133173
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34008	NC_014152	GCAT	2	8	1726984	1726991	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34009	NC_014152	CAG	2	6	1727018	1727023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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34011	NC_014152	A	6	6	1727066	1727071	100 %	0 %	0 %	0 %	296133174
34012	NC_014152	ATCT	2	8	1727076	1727083	25 %	50 %	0 %	25 %	296133174
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34064	NC_014152	CT	3	6	1729632	1729637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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34104	NC_014152	T	6	6	1731446	1731451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34105	NC_014152	TAA	2	6	1731513	1731518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34121	NC_014152	ACC	2	6	1732064	1732069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133179
34122	NC_014152	AGG	2	6	1732087	1732092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296133179
34123	NC_014152	GCC	2	6	1732166	1732171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133179
34124	NC_014152	TCC	2	6	1732191	1732196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133179
34125	NC_014152	GTA	2	6	1732243	1732248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133180
34126	NC_014152	GCA	2	6	1732251	1732256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133180
34127	NC_014152	TTC	2	6	1732261	1732266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133180
34128	NC_014152	GCA	2	6	1732430	1732435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133180
34129	NC_014152	ACAG	2	8	1732454	1732461	50 %	0 %	25 %	25 %	296133180
34130	NC_014152	GTG	3	9	1732517	1732525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296133180
34131	NC_014152	AGT	2	6	1732543	1732548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133180
34132	NC_014152	TTG	2	6	1732586	1732591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133180
34133	NC_014152	T	6	6	1732608	1732613	0 %	100 %	0 %	0 %	296133180
34134	NC_014152	CAAT	2	8	1732760	1732767	50 %	25 %	0 %	25 %	296133180
34135	NC_014152	TCA	2	6	1732841	1732846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133180
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34141	NC_014152	CCT	2	6	1733201	1733206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133181
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34144	NC_014152	CGG	2	6	1733279	1733284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133181
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34148	NC_014152	TTTC	2	8	1733398	1733405	0 %	75 %	0 %	25 %	296133181
34149	NC_014152	CAT	2	6	1733484	1733489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133181
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34152	NC_014152	TGG	2	6	1733636	1733641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296133181
34153	NC_014152	AAT	2	6	1733648	1733653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133181
34154	NC_014152	GCC	2	6	1733688	1733693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133181
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34156	NC_014152	GCT	2	6	1733812	1733817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133181
34157	NC_014152	GCT	2	6	1733965	1733970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133181
34158	NC_014152	TCA	2	6	1733993	1733998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133181
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34166	NC_014152	T	7	7	1734274	1734280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34167	NC_014152	A	7	7	1734286	1734292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34168	NC_014152	TAC	2	6	1734320	1734325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34169	NC_014152	A	6	6	1734335	1734340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34170	NC_014152	AGTA	2	8	1734433	1734440	50 %	25 %	25 %	0 %	296133183
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34175	NC_014152	A	6	6	1734665	1734670	100 %	0 %	0 %	0 %	296133183
34176	NC_014152	CGT	2	6	1734682	1734687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133183
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34179	NC_014152	GGC	2	6	1734761	1734766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133183
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34181	NC_014152	TGCC	2	8	1734853	1734860	0 %	25 %	25 %	50 %	296133183
34182	NC_014152	AT	3	6	1734940	1734945	50 %	50 %	0 %	0 %	296133183
34183	NC_014152	GCC	2	6	1735120	1735125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34184	NC_014152	TAC	2	6	1735131	1735136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133184
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34186	NC_014152	TCA	2	6	1735284	1735289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133184
34187	NC_014152	ACT	2	6	1735329	1735334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133184
34188	NC_014152	CAT	2	6	1735450	1735455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133184
34189	NC_014152	AGT	2	6	1735474	1735479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133184
34190	NC_014152	GCCAT	2	10	1735495	1735504	20 %	20 %	20 %	40 %	296133184
34191	NC_014152	ATC	2	6	1735523	1735528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133184
34192	NC_014152	TCC	2	6	1735592	1735597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133184
34193	NC_014152	CTT	2	6	1735621	1735626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133184
34194	NC_014152	TCA	2	6	1735653	1735658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133184
34195	NC_014152	TCT	2	6	1735878	1735883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133184
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34197	NC_014152	AAAC	2	8	1735987	1735994	75 %	0 %	0 %	25 %	296133184
34198	NC_014152	ACTGC	2	10	1735995	1736004	20 %	20 %	20 %	40 %	296133184
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34200	NC_014152	GCCC	2	8	1736077	1736084	0 %	0 %	25 %	75 %	296133184
34201	NC_014152	TGC	2	6	1736145	1736150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133184
34202	NC_014152	AAGTA	2	10	1736179	1736188	60 %	20 %	20 %	0 %	296133184
34203	NC_014152	ATA	2	6	1736196	1736201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133184
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34205	NC_014152	T	6	6	1736333	1736338	0 %	100 %	0 %	0 %	296133184
34206	NC_014152	CTT	2	6	1736365	1736370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133184
34207	NC_014152	CGGCTA	2	12	1736374	1736385	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296133184
34208	NC_014152	GCA	2	6	1736403	1736408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133184
34209	NC_014152	AGTT	2	8	1736443	1736450	25 %	50 %	25 %	0 %	296133184
34210	NC_014152	AGCA	2	8	1736487	1736494	50 %	0 %	25 %	25 %	296133184
34211	NC_014152	T	6	6	1736543	1736548	0 %	100 %	0 %	0 %	296133184
34212	NC_014152	A	6	6	1736564	1736569	100 %	0 %	0 %	0 %	296133184
34213	NC_014152	CTT	2	6	1736620	1736625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133184
34214	NC_014152	ATC	2	6	1736633	1736638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133184
34215	NC_014152	CAA	2	6	1736740	1736745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133184
34216	NC_014152	TGTTC	2	10	1736814	1736823	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
34217	NC_014152	AAT	2	6	1736836	1736841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133185
34218	NC_014152	TTG	2	6	1736861	1736866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133185
34219	NC_014152	A	6	6	1736902	1736907	100 %	0 %	0 %	0 %	296133185
34220	NC_014152	AAT	2	6	1736947	1736952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133185
34221	NC_014152	T	6	6	1737064	1737069	0 %	100 %	0 %	0 %	296133185
34222	NC_014152	TCC	2	6	1737111	1737116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133185
34223	NC_014152	GCCTTT	2	12	1737130	1737141	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	296133185
34224	NC_014152	TTG	2	6	1737212	1737217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133185
34225	NC_014152	CGC	2	6	1737255	1737260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133185
34226	NC_014152	CT	3	6	1737343	1737348	0 %	50 %	0 %	50 %	296133185
34227	NC_014152	GCA	2	6	1737356	1737361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133185
34228	NC_014152	AT	3	6	1737414	1737419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34229	NC_014152	TAC	2	6	1737423	1737428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34230	NC_014152	A	6	6	1737511	1737516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34231	NC_014152	A	6	6	1737547	1737552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34232	NC_014152	TTC	2	6	1737779	1737784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133186
34233	NC_014152	CTA	2	6	1737880	1737885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133186
34234	NC_014152	GGC	2	6	1737941	1737946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133186
34235	NC_014152	GCA	2	6	1737958	1737963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133186
34236	NC_014152	GGCC	2	8	1737979	1737986	0 %	0 %	50 %	50 %	296133186
34237	NC_014152	GCC	2	6	1738014	1738019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133186
34238	NC_014152	AAT	2	6	1738058	1738063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133186
34239	NC_014152	ATG	2	6	1738248	1738253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133186
34240	NC_014152	TCA	2	6	1738270	1738275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133186
34241	NC_014152	TAA	2	6	1738474	1738479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133186
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34247	NC_014152	ATT	2	6	1738810	1738815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34248	NC_014152	T	6	6	1738814	1738819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34249	NC_014152	ATT	2	6	1738832	1738837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34250	NC_014152	CAA	2	6	1738844	1738849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34251	NC_014152	GGC	2	6	1738936	1738941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133187
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34283	NC_014152	CATA	2	8	1740640	1740647	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34284	NC_014152	T	6	6	1740677	1740682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34285	NC_014152	AG	3	6	1740692	1740697	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34286	NC_014152	CAA	2	6	1740721	1740726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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34302	NC_014152	CGG	2	6	1741715	1741720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133189
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34344	NC_014152	TA	3	6	1743833	1743838	50 %	50 %	0 %	0 %	296133191
34345	NC_014152	AGA	2	6	1743852	1743857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296133191
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34350	NC_014152	CTT	2	6	1744153	1744158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133191
34351	NC_014152	GGC	2	6	1744241	1744246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133191
34352	NC_014152	ACC	2	6	1744251	1744256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133191
34353	NC_014152	CTTTTG	2	12	1744264	1744275	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	296133191
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34475	NC_014152	TCA	2	6	1749649	1749654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133195
34476	NC_014152	GCC	2	6	1749802	1749807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133196
34477	NC_014152	ACA	2	6	1749824	1749829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133196
34478	NC_014152	C	7	7	1749841	1749847	0 %	0 %	0 %	100 %	296133196
34479	NC_014152	TGG	2	6	1749885	1749890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296133196
34480	NC_014152	GGT	2	6	1749912	1749917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296133196
34481	NC_014152	CAGG	2	8	1749924	1749931	25 %	0 %	50 %	25 %	296133196
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34483	NC_014152	TTG	2	6	1750184	1750189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133196
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34485	NC_014152	A	6	6	1750280	1750285	100 %	0 %	0 %	0 %	296133197
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34490	NC_014152	AAT	2	6	1750571	1750576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133197
34491	NC_014152	A	6	6	1750601	1750606	100 %	0 %	0 %	0 %	296133197
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34494	NC_014152	CAT	2	6	1750669	1750674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133197
34495	NC_014152	A	6	6	1750682	1750687	100 %	0 %	0 %	0 %	296133197
34496	NC_014152	CAT	2	6	1750730	1750735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133197
34497	NC_014152	TC	3	6	1750736	1750741	0 %	50 %	0 %	50 %	296133197
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