MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 62102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33005	NC_014152	ACT	2	6	1676063	1676068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133120
33006	NC_014152	T	6	6	1676082	1676087	0 %	100 %	0 %	0 %	296133120
33007	NC_014152	TGC	2	6	1676091	1676096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133120
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33124	NC_014152	TC	3	6	1680901	1680906	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33125	NC_014152	AATCT	2	10	1680907	1680916	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33126	NC_014152	AGG	2	6	1680956	1680961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33127	NC_014152	AAAGA	2	10	1680992	1681001	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33128	NC_014152	CCG	2	6	1681034	1681039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33129	NC_014152	CAA	2	6	1681069	1681074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33130	NC_014152	ACGT	2	8	1681079	1681086	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33131	NC_014152	CTT	2	6	1681129	1681134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33132	NC_014152	TGC	2	6	1681155	1681160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33133	NC_014152	GGC	2	6	1681161	1681166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33134	NC_014152	GA	3	6	1681214	1681219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33135	NC_014152	TGG	2	6	1681283	1681288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33136	NC_014152	CCGG	2	8	1681323	1681330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33137	NC_014152	AAAC	2	8	1681345	1681352	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33138	NC_014152	TGC	2	6	1681446	1681451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33139	NC_014152	AAG	2	6	1681484	1681489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33140	NC_014152	T	6	6	1681606	1681611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33141	NC_014152	ACC	2	6	1681618	1681623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33142	NC_014152	T	6	6	1681647	1681652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33143	NC_014152	ATT	2	6	1681663	1681668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33144	NC_014152	T	6	6	1681667	1681672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33145	NC_014152	TTA	2	6	1681688	1681693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33146	NC_014152	AT	3	6	1681747	1681752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33147	NC_014152	AT	3	6	1681756	1681761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33148	NC_014152	TGT	2	6	1681794	1681799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133124
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33158	NC_014152	ACC	2	6	1682466	1682471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33159	NC_014152	GCCGC	2	10	1682477	1682486	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
33160	NC_014152	ATAA	2	8	1682502	1682509	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33161	NC_014152	ATT	2	6	1682539	1682544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33162	NC_014152	AAT	2	6	1682567	1682572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33163	NC_014152	GCA	2	6	1682582	1682587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33164	NC_014152	AATCC	2	10	1682615	1682624	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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33166	NC_014152	ATAA	2	8	1682668	1682675	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33167	NC_014152	TAC	3	9	1682696	1682704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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33172	NC_014152	AAC	2	6	1682928	1682933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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33183	NC_014152	CTT	2	6	1683512	1683517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33184	NC_014152	GTACC	2	10	1683519	1683528	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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33198	NC_014152	A	6	6	1684004	1684009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33199	NC_014152	T	6	6	1684027	1684032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33200	NC_014152	T	7	7	1684038	1684044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33201	NC_014152	TATG	2	8	1684056	1684063	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33202	NC_014152	TAC	2	6	1684084	1684089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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33205	NC_014152	ATA	2	6	1684276	1684281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33218	NC_014152	CTG	2	6	1684907	1684912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133126
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33226	NC_014152	TCCC	2	8	1685159	1685166	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
33227	NC_014152	CTT	2	6	1685198	1685203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133127
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33229	NC_014152	CAA	2	6	1685328	1685333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133127
33230	NC_014152	TA	3	6	1685424	1685429	50 %	50 %	0 %	0 %	296133127
33231	NC_014152	AG	3	6	1685487	1685492	50 %	0 %	50 %	0 %	296133127
33232	NC_014152	TCT	2	6	1685513	1685518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133127
33233	NC_014152	GCC	2	6	1685519	1685524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133127
33234	NC_014152	ACC	2	6	1685539	1685544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133127
33235	NC_014152	ATTTC	2	10	1685618	1685627	20 %	60 %	0 %	20 %	296133127
33236	NC_014152	TCA	2	6	1685766	1685771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33237	NC_014152	AT	3	6	1685829	1685834	50 %	50 %	0 %	0 %	296133128
33238	NC_014152	CCT	2	6	1685862	1685867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133128
33239	NC_014152	CGG	2	6	1685974	1685979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133128
33240	NC_014152	GCT	2	6	1685986	1685991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133128
33241	NC_014152	AT	3	6	1686015	1686020	50 %	50 %	0 %	0 %	296133128
33242	NC_014152	CTC	2	6	1686043	1686048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33243	NC_014152	GCCA	2	8	1686123	1686130	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33244	NC_014152	A	6	6	1686137	1686142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33245	NC_014152	ACT	2	6	1686168	1686173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33246	NC_014152	A	7	7	1686175	1686181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33247	NC_014152	AGG	2	6	1686184	1686189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33248	NC_014152	GCG	2	6	1686198	1686203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133129
33249	NC_014152	GCAG	2	8	1686234	1686241	25 %	0 %	50 %	25 %	296133129
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33484	NC_014152	GTC	2	6	1699626	1699631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133143
33485	NC_014152	CCG	2	6	1699720	1699725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133143
33486	NC_014152	TCAGC	2	10	1699726	1699735	20 %	20 %	20 %	40 %	296133143
33487	NC_014152	CCG	2	6	1699779	1699784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133143
33488	NC_014152	CTG	2	6	1699830	1699835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133143
33489	NC_014152	CCA	2	6	1699840	1699845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133143
33490	NC_014152	ACA	2	6	1699869	1699874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133143
33491	NC_014152	TA	3	6	1699937	1699942	50 %	50 %	0 %	0 %	296133143
33492	NC_014152	TCT	3	9	1699947	1699955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133143
33493	NC_014152	T	7	7	1700028	1700034	0 %	100 %	0 %	0 %	296133143
33494	NC_014152	GGCC	2	8	1700049	1700056	0 %	0 %	50 %	50 %	296133143
33495	NC_014152	ACAG	2	8	1700073	1700080	50 %	0 %	25 %	25 %	296133143
33496	NC_014152	GTA	2	6	1700130	1700135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133143
33497	NC_014152	GCT	2	6	1700218	1700223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133143
33498	NC_014152	ACA	2	6	1700271	1700276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133143
33499	NC_014152	TCT	2	6	1700295	1700300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133143
33500	NC_014152	GTG	2	6	1700309	1700314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296133143

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