MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 62102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32002	NC_014152	T	6	6	1626057	1626062	0 %	100 %	0 %	0 %	296133066
32003	NC_014152	GTT	2	6	1626109	1626114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133066
32004	NC_014152	TCA	2	6	1626171	1626176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133066
32005	NC_014152	TCC	2	6	1626196	1626201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32006	NC_014152	CTTT	2	8	1626209	1626216	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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32009	NC_014152	TCA	2	6	1626420	1626425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133067
32010	NC_014152	A	6	6	1626522	1626527	100 %	0 %	0 %	0 %	296133067
32011	NC_014152	TAAA	2	8	1626542	1626549	75 %	25 %	0 %	0 %	296133067
32012	NC_014152	T	7	7	1626587	1626593	0 %	100 %	0 %	0 %	296133067
32013	NC_014152	TTC	2	6	1626596	1626601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133067
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32017	NC_014152	CTTC	2	8	1626985	1626992	0 %	50 %	0 %	50 %	296133067
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32043	NC_014152	CATCGG	2	12	1628388	1628399	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296133070
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32115	NC_014152	A	6	6	1632305	1632310	100 %	0 %	0 %	0 %	296133075
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32117	NC_014152	CCG	2	6	1632413	1632418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133075
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32340	NC_014152	TA	4	8	1642982	1642989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32341	NC_014152	TAT	2	6	1643007	1643012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32342	NC_014152	TCCC	2	8	1643024	1643031	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
32343	NC_014152	ACC	2	6	1643041	1643046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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32346	NC_014152	TA	5	10	1643109	1643118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32347	NC_014152	T	6	6	1643156	1643161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32348	NC_014152	A	7	7	1643171	1643177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32349	NC_014152	TCT	2	6	1643268	1643273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133086
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32354	NC_014152	TGG	2	6	1643410	1643415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296133086
32355	NC_014152	ACC	2	6	1643430	1643435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133086
32356	NC_014152	CAT	2	6	1643789	1643794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133086
32357	NC_014152	ACC	2	6	1643894	1643899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133086
32358	NC_014152	TTC	2	6	1643942	1643947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133086
32359	NC_014152	AGC	2	6	1643957	1643962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133086
32360	NC_014152	ACT	2	6	1644009	1644014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133086
32361	NC_014152	CAATA	2	10	1644044	1644053	60 %	20 %	0 %	20 %	296133086
32362	NC_014152	TCC	2	6	1644072	1644077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133086
32363	NC_014152	TTC	2	6	1644155	1644160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133086
32364	NC_014152	ATT	2	6	1644173	1644178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133086
32365	NC_014152	CAC	2	6	1644367	1644372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133087
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32367	NC_014152	CAAC	2	8	1644510	1644517	50 %	0 %	0 %	50 %	296133087
32368	NC_014152	AC	3	6	1644552	1644557	50 %	0 %	0 %	50 %	296133087
32369	NC_014152	CCA	2	6	1644570	1644575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133087
32370	NC_014152	CCG	2	6	1644581	1644586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133087
32371	NC_014152	GAC	2	6	1644715	1644720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133087
32372	NC_014152	ATA	2	6	1644788	1644793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133087
32373	NC_014152	CAG	2	6	1644844	1644849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133087
32374	NC_014152	CAA	2	6	1644859	1644864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133087
32375	NC_014152	TCC	2	6	1644888	1644893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133088
32376	NC_014152	AATG	2	8	1645013	1645020	50 %	25 %	25 %	0 %	296133088
32377	NC_014152	CCTG	2	8	1645035	1645042	0 %	25 %	25 %	50 %	296133088
32378	NC_014152	GGC	2	6	1645083	1645088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133088
32379	NC_014152	CCT	2	6	1645105	1645110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133088
32380	NC_014152	TGG	2	6	1645132	1645137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296133088
32381	NC_014152	TGC	2	6	1645152	1645157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133088
32382	NC_014152	TTC	2	6	1645265	1645270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133088
32383	NC_014152	GTC	2	6	1645292	1645297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133088
32384	NC_014152	T	6	6	1645298	1645303	0 %	100 %	0 %	0 %	296133088
32385	NC_014152	ATTT	2	8	1645315	1645322	25 %	75 %	0 %	0 %	296133088
32386	NC_014152	CTGTT	2	10	1645379	1645388	0 %	60 %	20 %	20 %	296133088
32387	NC_014152	CCT	2	6	1645393	1645398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133088
32388	NC_014152	ATC	2	6	1645410	1645415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133088
32389	NC_014152	TAC	2	6	1645418	1645423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133088
32390	NC_014152	GCA	2	6	1645453	1645458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133088
32391	NC_014152	TCA	2	6	1645479	1645484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133088
32392	NC_014152	T	6	6	1645493	1645498	0 %	100 %	0 %	0 %	296133088
32393	NC_014152	CCG	2	6	1645507	1645512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133088
32394	NC_014152	GCC	2	6	1645535	1645540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133088
32395	NC_014152	TGG	2	6	1645570	1645575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296133088
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32399	NC_014152	AAC	2	6	1645721	1645726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133088
32400	NC_014152	CTA	2	6	1645849	1645854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133088
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32402	NC_014152	GCA	2	6	1645879	1645884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133088
32403	NC_014152	CTT	2	6	1645894	1645899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133088
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32408	NC_014152	A	6	6	1646454	1646459	100 %	0 %	0 %	0 %	296133089
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32410	NC_014152	TAT	2	6	1646583	1646588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133089
32411	NC_014152	TTC	2	6	1646599	1646604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133089
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32418	NC_014152	GCA	2	6	1647044	1647049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133089
32419	NC_014152	GTTG	2	8	1647069	1647076	0 %	50 %	50 %	0 %	296133089
32420	NC_014152	ATC	2	6	1647189	1647194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133089
32421	NC_014152	TA	4	8	1647201	1647208	50 %	50 %	0 %	0 %	296133089
32422	NC_014152	CAA	2	6	1647239	1647244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133089
32423	NC_014152	AC	3	6	1647253	1647258	50 %	0 %	0 %	50 %	296133089
32424	NC_014152	ACCCAA	2	12	1647303	1647314	50 %	0 %	0 %	50 %	296133089
32425	NC_014152	TTC	2	6	1647351	1647356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133089
32426	NC_014152	T	8	8	1647362	1647369	0 %	100 %	0 %	0 %	296133089
32427	NC_014152	TCA	2	6	1647391	1647396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133089
32428	NC_014152	GCA	2	6	1647484	1647489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133089
32429	NC_014152	CCT	2	6	1647546	1647551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32430	NC_014152	TCA	2	6	1647565	1647570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32431	NC_014152	T	6	6	1647647	1647652	0 %	100 %	0 %	0 %	296133090
32432	NC_014152	T	6	6	1647660	1647665	0 %	100 %	0 %	0 %	296133090
32433	NC_014152	AGG	2	6	1647684	1647689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296133090
32434	NC_014152	GCC	2	6	1647709	1647714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133090
32435	NC_014152	ATT	2	6	1647731	1647736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133090
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32440	NC_014152	TA	3	6	1647875	1647880	50 %	50 %	0 %	0 %	296133090
32441	NC_014152	CTTT	2	8	1647895	1647902	0 %	75 %	0 %	25 %	296133090
32442	NC_014152	T	7	7	1647900	1647906	0 %	100 %	0 %	0 %	296133090
32443	NC_014152	A	7	7	1647917	1647923	100 %	0 %	0 %	0 %	296133090
32444	NC_014152	TTC	2	6	1647938	1647943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133090
32445	NC_014152	ATT	2	6	1647969	1647974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133090
32446	NC_014152	GCA	2	6	1647990	1647995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133090
32447	NC_014152	AAT	2	6	1648024	1648029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133090
32448	NC_014152	AT	3	6	1648028	1648033	50 %	50 %	0 %	0 %	296133090
32449	NC_014152	C	6	6	1648044	1648049	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
32450	NC_014152	TAA	2	6	1648114	1648119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133091
32451	NC_014152	T	7	7	1648120	1648126	0 %	100 %	0 %	0 %	296133091
32452	NC_014152	GCT	2	6	1648134	1648139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133091
32453	NC_014152	GTC	2	6	1648307	1648312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133091
32454	NC_014152	CCTG	2	8	1648450	1648457	0 %	25 %	25 %	50 %	296133091
32455	NC_014152	GGGT	2	8	1648489	1648496	0 %	25 %	75 %	0 %	296133091
32456	NC_014152	ATGA	2	8	1648546	1648553	50 %	25 %	25 %	0 %	296133091
32457	NC_014152	ATT	2	6	1648575	1648580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133091
32458	NC_014152	TTA	2	6	1648605	1648610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133092
32459	NC_014152	AAT	2	6	1648620	1648625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133092
32460	NC_014152	TCC	2	6	1648699	1648704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133092
32461	NC_014152	A	8	8	1648716	1648723	100 %	0 %	0 %	0 %	296133092
32462	NC_014152	C	6	6	1648735	1648740	0 %	0 %	0 %	100 %	296133092
32463	NC_014152	CCT	2	6	1648799	1648804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133093
32464	NC_014152	CTG	2	6	1648809	1648814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133093
32465	NC_014152	CGG	2	6	1648847	1648852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133093
32466	NC_014152	CAAA	2	8	1648884	1648891	75 %	0 %	0 %	25 %	296133093
32467	NC_014152	GCT	2	6	1649015	1649020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133093
32468	NC_014152	TTAA	2	8	1649087	1649094	50 %	50 %	0 %	0 %	296133093
32469	NC_014152	T	6	6	1649118	1649123	0 %	100 %	0 %	0 %	296133093
32470	NC_014152	CAA	2	6	1649173	1649178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133093
32471	NC_014152	ACT	2	6	1649207	1649212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133093
32472	NC_014152	GCA	2	6	1649285	1649290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133093
32473	NC_014152	GT	3	6	1649302	1649307	0 %	50 %	50 %	0 %	296133093
32474	NC_014152	A	6	6	1649308	1649313	100 %	0 %	0 %	0 %	296133093
32475	NC_014152	GT	3	6	1649314	1649319	0 %	50 %	50 %	0 %	296133093
32476	NC_014152	TA	3	6	1649389	1649394	50 %	50 %	0 %	0 %	296133093
32477	NC_014152	CTT	2	6	1649421	1649426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133093
32478	NC_014152	AGC	2	6	1649431	1649436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133093
32479	NC_014152	CTG	2	6	1649473	1649478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133093
32480	NC_014152	GGC	2	6	1649479	1649484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133093
32481	NC_014152	GCA	2	6	1649504	1649509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133093
32482	NC_014152	CTGT	2	8	1649611	1649618	0 %	50 %	25 %	25 %	296133093
32483	NC_014152	ATTTCA	2	12	1649710	1649721	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32484	NC_014152	TAA	2	6	1649902	1649907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133094
32485	NC_014152	GCT	2	6	1650075	1650080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133094
32486	NC_014152	A	6	6	1650092	1650097	100 %	0 %	0 %	0 %	296133094
32487	NC_014152	TTAA	2	8	1650186	1650193	50 %	50 %	0 %	0 %	296133094
32488	NC_014152	T	6	6	1650227	1650232	0 %	100 %	0 %	0 %	296133094
32489	NC_014152	TTG	2	6	1650247	1650252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133094
32490	NC_014152	CAC	2	6	1650275	1650280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133094
32491	NC_014152	T	7	7	1650379	1650385	0 %	100 %	0 %	0 %	296133094
32492	NC_014152	T	6	6	1650476	1650481	0 %	100 %	0 %	0 %	296133094
32493	NC_014152	CGC	2	6	1650520	1650525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133094
32494	NC_014152	CCCG	2	8	1650526	1650533	0 %	0 %	25 %	75 %	296133094
32495	NC_014152	TAA	2	6	1650585	1650590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133094
32496	NC_014152	TAA	2	6	1650766	1650771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133094
32497	NC_014152	CAA	2	6	1650913	1650918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133094
32498	NC_014152	ATCA	2	8	1650932	1650939	50 %	25 %	0 %	25 %	296133094
32499	NC_014152	TCC	2	6	1651036	1651041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133095
32500	NC_014152	TTC	2	6	1651071	1651076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133095

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