MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 62102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_014152	TGG	2	6	1600283	1600288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296133040
31502	NC_014152	GAA	2	6	1600297	1600302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296133040
31503	NC_014152	T	6	6	1600350	1600355	0 %	100 %	0 %	0 %	296133040
31504	NC_014152	CAT	2	6	1600452	1600457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133040
31505	NC_014152	GCCG	2	8	1600510	1600517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31506	NC_014152	CGT	2	6	1600522	1600527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31507	NC_014152	GTTCG	2	10	1600641	1600650	0 %	40 %	40 %	20 %	296133041
31508	NC_014152	TCA	2	6	1600678	1600683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133041
31509	NC_014152	CAT	2	6	1600729	1600734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133041
31510	NC_014152	TGC	2	6	1600833	1600838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133041
31511	NC_014152	CG	3	6	1600873	1600878	0 %	0 %	50 %	50 %	296133041
31512	NC_014152	GCT	2	6	1600885	1600890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133041
31513	NC_014152	T	6	6	1600892	1600897	0 %	100 %	0 %	0 %	296133041
31514	NC_014152	TTGA	2	8	1600925	1600932	25 %	50 %	25 %	0 %	296133041
31515	NC_014152	CCT	2	6	1600959	1600964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31516	NC_014152	AT	3	6	1601002	1601007	50 %	50 %	0 %	0 %	296133042
31517	NC_014152	T	6	6	1601122	1601127	0 %	100 %	0 %	0 %	296133042
31518	NC_014152	AACT	2	8	1601187	1601194	50 %	25 %	0 %	25 %	296133042
31519	NC_014152	TTG	2	6	1601266	1601271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133042
31520	NC_014152	CAG	2	6	1601313	1601318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133042
31521	NC_014152	T	6	6	1601347	1601352	0 %	100 %	0 %	0 %	296133042
31522	NC_014152	ATT	2	6	1601403	1601408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133042
31523	NC_014152	CCT	2	6	1601431	1601436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31524	NC_014152	TCA	2	6	1601462	1601467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133043
31525	NC_014152	GCCG	3	12	1601497	1601508	0 %	0 %	50 %	50 %	296133043
31526	NC_014152	GGTC	2	8	1601637	1601644	0 %	25 %	50 %	25 %	296133043
31527	NC_014152	CAG	2	6	1601677	1601682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133043
31528	NC_014152	CGG	2	6	1601703	1601708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133043
31529	NC_014152	CAA	2	6	1601835	1601840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133043
31530	NC_014152	GCA	2	6	1601903	1601908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133043
31531	NC_014152	ATT	2	6	1601920	1601925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133043
31532	NC_014152	GCC	2	6	1601930	1601935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133043
31533	NC_014152	CCG	2	6	1601963	1601968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133043
31534	NC_014152	ACG	2	6	1602031	1602036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133043
31535	NC_014152	CTG	2	6	1602232	1602237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133043
31536	NC_014152	CCA	2	6	1602347	1602352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133043
31537	NC_014152	TGC	2	6	1602422	1602427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133043
31538	NC_014152	CAAC	2	8	1602459	1602466	50 %	0 %	0 %	50 %	296133043
31539	NC_014152	ATTG	2	8	1602534	1602541	25 %	50 %	25 %	0 %	296133043
31540	NC_014152	ATA	2	6	1602584	1602589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133043
31541	NC_014152	TGTT	2	8	1602607	1602614	0 %	75 %	25 %	0 %	296133043
31542	NC_014152	CAG	2	6	1602685	1602690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133043
31543	NC_014152	CCT	2	6	1602938	1602943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31544	NC_014152	TGC	2	6	1603003	1603008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133044
31545	NC_014152	CTT	2	6	1603009	1603014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133044
31546	NC_014152	TCA	2	6	1603085	1603090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133044
31547	NC_014152	ATA	2	6	1603138	1603143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133044
31548	NC_014152	CTG	2	6	1603180	1603185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133044
31549	NC_014152	T	6	6	1603246	1603251	0 %	100 %	0 %	0 %	296133044
31550	NC_014152	T	6	6	1603314	1603319	0 %	100 %	0 %	0 %	296133044
31551	NC_014152	TTA	2	6	1603403	1603408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133044
31552	NC_014152	TCA	2	6	1603412	1603417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133044
31553	NC_014152	AGG	2	6	1603529	1603534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296133044
31554	NC_014152	T	8	8	1603551	1603558	0 %	100 %	0 %	0 %	296133044
31555	NC_014152	TA	3	6	1603598	1603603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31556	NC_014152	CCT	2	6	1603608	1603613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133045
31557	NC_014152	TTC	2	6	1603672	1603677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133045
31558	NC_014152	AGA	2	6	1603679	1603684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296133045
31559	NC_014152	TAG	2	6	1603706	1603711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133045
31560	NC_014152	TCT	2	6	1603722	1603727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133045
31561	NC_014152	TC	3	6	1603742	1603747	0 %	50 %	0 %	50 %	296133045
31562	NC_014152	TCT	2	6	1603789	1603794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133045
31563	NC_014152	TTC	2	6	1603795	1603800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133045
31564	NC_014152	T	6	6	1603824	1603829	0 %	100 %	0 %	0 %	296133045
31565	NC_014152	CTT	2	6	1603866	1603871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133045
31566	NC_014152	ATC	2	6	1604070	1604075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31567	NC_014152	CAA	2	6	1604114	1604119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133046
31568	NC_014152	A	6	6	1604166	1604171	100 %	0 %	0 %	0 %	296133046
31569	NC_014152	ATC	2	6	1604180	1604185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133046
31570	NC_014152	AGC	2	6	1604297	1604302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133046
31571	NC_014152	GGT	2	6	1604580	1604585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296133046
31572	NC_014152	CACC	2	8	1604587	1604594	25 %	0 %	0 %	75 %	296133046
31573	NC_014152	GACC	2	8	1604599	1604606	25 %	0 %	25 %	50 %	296133046
31574	NC_014152	CAT	2	6	1604642	1604647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133046
31575	NC_014152	TGG	2	6	1604692	1604697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296133046
31576	NC_014152	GC	3	6	1604704	1604709	0 %	0 %	50 %	50 %	296133046
31577	NC_014152	CTT	2	6	1604773	1604778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133046
31578	NC_014152	CGG	2	6	1604851	1604856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133046
31579	NC_014152	ATC	2	6	1604871	1604876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133046
31580	NC_014152	A	6	6	1604911	1604916	100 %	0 %	0 %	0 %	296133046
31581	NC_014152	GGC	2	6	1605015	1605020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133046
31582	NC_014152	TGC	2	6	1605112	1605117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133046
31583	NC_014152	AATG	2	8	1605132	1605139	50 %	25 %	25 %	0 %	296133046
31584	NC_014152	TAT	2	6	1605323	1605328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133046
31585	NC_014152	AT	3	6	1605381	1605386	50 %	50 %	0 %	0 %	296133046
31586	NC_014152	CG	3	6	1605457	1605462	0 %	0 %	50 %	50 %	296133047
31587	NC_014152	GCC	2	6	1605495	1605500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133047
31588	NC_014152	GAA	2	6	1605503	1605508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296133047
31589	NC_014152	T	7	7	1605533	1605539	0 %	100 %	0 %	0 %	296133047
31590	NC_014152	GAT	2	6	1605558	1605563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133047
31591	NC_014152	GTT	2	6	1605573	1605578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133047
31592	NC_014152	CT	3	6	1605624	1605629	0 %	50 %	0 %	50 %	296133047
31593	NC_014152	AAT	2	6	1605759	1605764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133047
31594	NC_014152	T	6	6	1605764	1605769	0 %	100 %	0 %	0 %	296133047
31595	NC_014152	TCC	2	6	1605787	1605792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133047
31596	NC_014152	TCT	3	9	1605829	1605837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133047
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31598	NC_014152	CCT	2	6	1605920	1605925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133047
31599	NC_014152	CTT	3	9	1605941	1605949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133047
31600	NC_014152	T	7	7	1605954	1605960	0 %	100 %	0 %	0 %	296133047
31601	NC_014152	T	6	6	1605965	1605970	0 %	100 %	0 %	0 %	296133047
31602	NC_014152	CCT	2	6	1605974	1605979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133047
31603	NC_014152	TCC	2	6	1606012	1606017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133047
31604	NC_014152	TCT	2	6	1606033	1606038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133047
31605	NC_014152	GCC	2	6	1606120	1606125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133047
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31607	NC_014152	ATCTC	2	10	1606244	1606253	20 %	40 %	0 %	40 %	296133048
31608	NC_014152	CTT	2	6	1606284	1606289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133048
31609	NC_014152	GCT	2	6	1606317	1606322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133048
31610	NC_014152	CTT	2	6	1606326	1606331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133048
31611	NC_014152	GGC	2	6	1606420	1606425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133048
31612	NC_014152	CTT	2	6	1606428	1606433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133048
31613	NC_014152	TTG	2	6	1606489	1606494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133048
31614	NC_014152	TCA	2	6	1606505	1606510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133048
31615	NC_014152	TTC	2	6	1606552	1606557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133048
31616	NC_014152	T	6	6	1606599	1606604	0 %	100 %	0 %	0 %	296133048
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31618	NC_014152	ATT	2	6	1606724	1606729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133048
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31733	NC_014152	TTCTAT	2	12	1612101	1612112	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	296133054
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31975	NC_014152	CTA	2	6	1624552	1624557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31976	NC_014152	CAA	2	6	1624635	1624640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31977	NC_014152	CT	3	6	1624645	1624650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31978	NC_014152	AGA	2	6	1624741	1624746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296133065
31979	NC_014152	AGC	2	6	1624790	1624795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133065
31980	NC_014152	TGC	2	6	1624802	1624807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133065
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31997	NC_014152	TAT	3	9	1625462	1625470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31998	NC_014152	T	7	7	1625501	1625507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31999	NC_014152	TA	3	6	1625608	1625613	50 %	50 %	0 %	0 %	296133066
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