MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 62102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_014152	A	6	6	1576120	1576125	100 %	0 %	0 %	0 %	296133012
31003	NC_014152	TAT	2	6	1576137	1576142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133012
31004	NC_014152	CTAT	2	8	1576164	1576171	25 %	50 %	0 %	25 %	296133012
31005	NC_014152	TTG	2	6	1576200	1576205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133012
31006	NC_014152	TA	3	6	1576232	1576237	50 %	50 %	0 %	0 %	296133012
31007	NC_014152	A	7	7	1576246	1576252	100 %	0 %	0 %	0 %	296133012
31008	NC_014152	TCA	2	6	1576304	1576309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133013
31009	NC_014152	AGA	2	6	1576315	1576320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296133013
31010	NC_014152	AC	3	6	1576410	1576415	50 %	0 %	0 %	50 %	296133013
31011	NC_014152	GTT	2	6	1576582	1576587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133013
31012	NC_014152	GAA	2	6	1576643	1576648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296133013
31013	NC_014152	ATT	2	6	1576649	1576654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133013
31014	NC_014152	GTT	2	6	1576658	1576663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133013
31015	NC_014152	GAC	2	6	1576775	1576780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133013
31016	NC_014152	TTG	2	6	1576797	1576802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133013
31017	NC_014152	TTG	2	6	1576863	1576868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133013
31018	NC_014152	ATT	2	6	1576906	1576911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133013
31019	NC_014152	GATG	2	8	1576912	1576919	25 %	25 %	50 %	0 %	296133013
31020	NC_014152	TAA	2	6	1576935	1576940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133013
31021	NC_014152	ATGA	2	8	1577123	1577130	50 %	25 %	25 %	0 %	296133013
31022	NC_014152	TGA	2	6	1577179	1577184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133013
31023	NC_014152	TA	3	6	1577204	1577209	50 %	50 %	0 %	0 %	296133013
31024	NC_014152	AAC	2	6	1577246	1577251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133013
31025	NC_014152	TGCT	2	8	1577253	1577260	0 %	50 %	25 %	25 %	296133013
31026	NC_014152	CTG	2	6	1577418	1577423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133013
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31028	NC_014152	GAA	2	6	1577471	1577476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296133013
31029	NC_014152	CGGT	2	8	1577551	1577558	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31030	NC_014152	T	7	7	1577563	1577569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31031	NC_014152	A	6	6	1577626	1577631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31032	NC_014152	ATC	2	6	1577655	1577660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31033	NC_014152	AT	3	6	1577679	1577684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31034	NC_014152	GGTG	2	8	1577697	1577704	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
31035	NC_014152	A	7	7	1577734	1577740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31036	NC_014152	AATTGA	2	12	1577870	1577881	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	296133014
31037	NC_014152	ATT	2	6	1577886	1577891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133014
31038	NC_014152	A	7	7	1577934	1577940	100 %	0 %	0 %	0 %	296133014
31039	NC_014152	GA	3	6	1577999	1578004	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31040	NC_014152	T	6	6	1578021	1578026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31041	NC_014152	AT	3	6	1578027	1578032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31042	NC_014152	TAA	3	9	1578046	1578054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31043	NC_014152	TAAC	2	8	1578061	1578068	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31044	NC_014152	A	6	6	1578069	1578074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31045	NC_014152	GTT	2	6	1578084	1578089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133015
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31052	NC_014152	CTGG	2	8	1578354	1578361	0 %	25 %	50 %	25 %	296133015
31053	NC_014152	CAT	2	6	1578396	1578401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133015
31054	NC_014152	TTGG	2	8	1578413	1578420	0 %	50 %	50 %	0 %	296133015
31055	NC_014152	AT	3	6	1578431	1578436	50 %	50 %	0 %	0 %	296133015
31056	NC_014152	CTT	2	6	1578501	1578506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133015
31057	NC_014152	A	6	6	1578532	1578537	100 %	0 %	0 %	0 %	296133015
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31063	NC_014152	T	6	6	1578824	1578829	0 %	100 %	0 %	0 %	296133016
31064	NC_014152	CTTTT	2	10	1578857	1578866	0 %	80 %	0 %	20 %	296133016
31065	NC_014152	GTTTT	2	10	1578900	1578909	0 %	80 %	20 %	0 %	296133016
31066	NC_014152	GC	3	6	1578918	1578923	0 %	0 %	50 %	50 %	296133016
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31072	NC_014152	TTA	2	6	1579230	1579235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133017
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31075	NC_014152	TCTT	2	8	1579332	1579339	0 %	75 %	0 %	25 %	296133017
31076	NC_014152	CTG	2	6	1579382	1579387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133017
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31084	NC_014152	GAAT	2	8	1579676	1579683	50 %	25 %	25 %	0 %	296133018
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31093	NC_014152	TTATT	2	10	1580409	1580418	20 %	80 %	0 %	0 %	296133018
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31103	NC_014152	ACT	2	6	1580747	1580752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133018
31104	NC_014152	CTT	2	6	1580796	1580801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133018
31105	NC_014152	CCTG	2	8	1580822	1580829	0 %	25 %	25 %	50 %	296133018
31106	NC_014152	TCC	2	6	1580869	1580874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133018
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31110	NC_014152	GCG	3	9	1580961	1580969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133018
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31117	NC_014152	T	7	7	1581387	1581393	0 %	100 %	0 %	0 %	296133019
31118	NC_014152	ATCA	2	8	1581449	1581456	50 %	25 %	0 %	25 %	296133019
31119	NC_014152	CAAACA	2	12	1581484	1581495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133019
31120	NC_014152	TGT	2	6	1581552	1581557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133019
31121	NC_014152	TCC	2	6	1581636	1581641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133019
31122	NC_014152	ATCC	2	8	1581694	1581701	25 %	25 %	0 %	50 %	296133019
31123	NC_014152	TTTC	2	8	1581750	1581757	0 %	75 %	0 %	25 %	296133019
31124	NC_014152	CTG	2	6	1581818	1581823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133019
31125	NC_014152	GGC	2	6	1581831	1581836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133019
31126	NC_014152	GCA	2	6	1581906	1581911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133019
31127	NC_014152	T	6	6	1581923	1581928	0 %	100 %	0 %	0 %	296133019
31128	NC_014152	T	6	6	1581979	1581984	0 %	100 %	0 %	0 %	296133019
31129	NC_014152	CCT	2	6	1581987	1581992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31130	NC_014152	AATT	2	8	1582026	1582033	50 %	50 %	0 %	0 %	296133020
31131	NC_014152	ATT	2	6	1582053	1582058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133020
31132	NC_014152	TTG	2	6	1582246	1582251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133020
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31139	NC_014152	TCC	2	6	1582441	1582446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31140	NC_014152	T	6	6	1582462	1582467	0 %	100 %	0 %	0 %	296133021
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31154	NC_014152	CTATAG	2	12	1583119	1583130	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	296133022
31155	NC_014152	AAATA	2	10	1583315	1583324	80 %	20 %	0 %	0 %	296133022
31156	NC_014152	GTA	2	6	1583349	1583354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133022
31157	NC_014152	CAT	2	6	1583456	1583461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133022
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31162	NC_014152	TAG	2	6	1583793	1583798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133023
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31170	NC_014152	TCT	3	9	1584218	1584226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133024
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31220	NC_014152	CTG	2	6	1586580	1586585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133025
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31222	NC_014152	T	7	7	1586785	1586791	0 %	100 %	0 %	0 %	296133025
31223	NC_014152	TCT	2	6	1586842	1586847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133025
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31225	NC_014152	T	7	7	1586870	1586876	0 %	100 %	0 %	0 %	296133025
31226	NC_014152	TAG	2	6	1586968	1586973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133025
31227	NC_014152	ATA	2	6	1587006	1587011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133025
31228	NC_014152	TCA	2	6	1587061	1587066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133025
31229	NC_014152	A	7	7	1587206	1587212	100 %	0 %	0 %	0 %	296133025
31230	NC_014152	ATC	2	6	1587215	1587220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133025
31231	NC_014152	AAG	2	6	1587265	1587270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296133026
31232	NC_014152	AT	3	6	1587303	1587308	50 %	50 %	0 %	0 %	296133026
31233	NC_014152	ATT	2	6	1587314	1587319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133026
31234	NC_014152	CTC	2	6	1587334	1587339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133026
31235	NC_014152	CTG	2	6	1587373	1587378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133026
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31472	NC_014152	AAT	2	6	1598749	1598754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133038
31473	NC_014152	GCCG	2	8	1598767	1598774	0 %	0 %	50 %	50 %	296133038
31474	NC_014152	GTTCCT	2	12	1598793	1598804	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	296133038
31475	NC_014152	TCT	2	6	1598813	1598818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133038
31476	NC_014152	C	6	6	1598833	1598838	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31477	NC_014152	TCTT	2	8	1598855	1598862	0 %	75 %	0 %	25 %	296133039
31478	NC_014152	T	7	7	1598912	1598918	0 %	100 %	0 %	0 %	296133039
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31480	NC_014152	CAGTA	2	10	1599035	1599044	40 %	20 %	20 %	20 %	296133039
31481	NC_014152	TTGG	2	8	1599152	1599159	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31482	NC_014152	TCG	2	6	1599232	1599237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133040
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31484	NC_014152	TAA	2	6	1599281	1599286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133040
31485	NC_014152	GCC	2	6	1599357	1599362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133040
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31500	NC_014152	TCCC	2	8	1600274	1600281	0 %	25 %	0 %	75 %	296133040

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