MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 62102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20004	NC_014152	CTA	2	6	1011115	1011120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20005	NC_014152	AGGGGG	2	12	1011174	1011185	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
20006	NC_014152	ATT	2	6	1011230	1011235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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20119	NC_014152	CAT	2	6	1017544	1017549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132511
20120	NC_014152	T	7	7	1017631	1017637	0 %	100 %	0 %	0 %	296132511
20121	NC_014152	TAAT	2	8	1017667	1017674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20122	NC_014152	TAAA	2	8	1017726	1017733	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20123	NC_014152	ACC	2	6	1017747	1017752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20124	NC_014152	AGG	2	6	1017846	1017851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20125	NC_014152	TAA	2	6	1017877	1017882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20126	NC_014152	TGA	2	6	1017892	1017897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20127	NC_014152	TTG	2	6	1017932	1017937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132512
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20129	NC_014152	T	6	6	1018136	1018141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20130	NC_014152	ACT	2	6	1018151	1018156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132513
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20355	NC_014152	CTG	2	6	1029539	1029544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20356	NC_014152	ATC	2	6	1029575	1029580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132524
20357	NC_014152	CGGG	2	8	1029584	1029591	0 %	0 %	75 %	25 %	296132524
20358	NC_014152	GGCT	2	8	1029627	1029634	0 %	25 %	50 %	25 %	296132524
20359	NC_014152	ATT	2	6	1029662	1029667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132524
20360	NC_014152	CCG	2	6	1029763	1029768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132524
20361	NC_014152	CTGGC	2	10	1029770	1029779	0 %	20 %	40 %	40 %	296132524
20362	NC_014152	GCC	2	6	1029803	1029808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132524
20363	NC_014152	ACC	3	9	1029861	1029869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296132524
20364	NC_014152	GGGT	2	8	1029960	1029967	0 %	25 %	75 %	0 %	296132524
20365	NC_014152	GGC	2	6	1029985	1029990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132524
20366	NC_014152	A	6	6	1029993	1029998	100 %	0 %	0 %	0 %	296132524
20367	NC_014152	CGA	2	6	1030000	1030005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132524
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20370	NC_014152	ACT	2	6	1030101	1030106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132524
20371	NC_014152	GTGG	2	8	1030162	1030169	0 %	25 %	75 %	0 %	296132524
20372	NC_014152	A	6	6	1030212	1030217	100 %	0 %	0 %	0 %	296132524
20373	NC_014152	CGGG	2	8	1030273	1030280	0 %	0 %	75 %	25 %	296132524
20374	NC_014152	T	6	6	1030299	1030304	0 %	100 %	0 %	0 %	296132524
20375	NC_014152	ACCG	2	8	1030334	1030341	25 %	0 %	25 %	50 %	296132524
20376	NC_014152	A	6	6	1030347	1030352	100 %	0 %	0 %	0 %	296132524
20377	NC_014152	TTG	2	6	1030379	1030384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132524
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20379	NC_014152	T	6	6	1030661	1030666	0 %	100 %	0 %	0 %	296132524
20380	NC_014152	TGC	2	6	1030686	1030691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132524
20381	NC_014152	ATC	2	6	1030692	1030697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132524
20382	NC_014152	TGG	2	6	1030701	1030706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132524
20383	NC_014152	TGC	2	6	1030785	1030790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132524
20384	NC_014152	GGA	2	6	1030801	1030806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296132524
20385	NC_014152	GAA	2	6	1030928	1030933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132524
20386	NC_014152	GGC	2	6	1030945	1030950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132524
20387	NC_014152	CAG	2	6	1030978	1030983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132524
20388	NC_014152	AGGC	2	8	1031009	1031016	25 %	0 %	50 %	25 %	296132524
20389	NC_014152	GCC	2	6	1031039	1031044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132524
20390	NC_014152	TA	3	6	1031046	1031051	50 %	50 %	0 %	0 %	296132524
20391	NC_014152	CGGC	3	12	1031112	1031123	0 %	0 %	50 %	50 %	296132524
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20393	NC_014152	GGT	2	6	1031293	1031298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132524
20394	NC_014152	CTGC	2	8	1031372	1031379	0 %	25 %	25 %	50 %	296132524
20395	NC_014152	GC	3	6	1031378	1031383	0 %	0 %	50 %	50 %	296132524
20396	NC_014152	GAC	2	6	1031390	1031395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132524
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20398	NC_014152	CAG	2	6	1031658	1031663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132524
20399	NC_014152	GCGGG	2	10	1031735	1031744	0 %	0 %	80 %	20 %	296132524
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20401	NC_014152	A	6	6	1031850	1031855	100 %	0 %	0 %	0 %	296132524
20402	NC_014152	CT	3	6	1031880	1031885	0 %	50 %	0 %	50 %	296132524
20403	NC_014152	CTG	2	6	1031984	1031989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132524
20404	NC_014152	GGCT	2	8	1031994	1032001	0 %	25 %	50 %	25 %	296132524
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20406	NC_014152	TGC	2	6	1032028	1032033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132524
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20409	NC_014152	CGC	2	6	1032248	1032253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132524
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20412	NC_014152	GGC	2	6	1032335	1032340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132524
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20423	NC_014152	GCG	2	6	1033100	1033105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132525
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20433	NC_014152	CTG	2	6	1033673	1033678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132525
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20456	NC_014152	CGAT	2	8	1034682	1034689	25 %	25 %	25 %	25 %	296132525
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20458	NC_014152	GAT	2	6	1034714	1034719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132525
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20460	NC_014152	AT	3	6	1034910	1034915	50 %	50 %	0 %	0 %	296132525
20461	NC_014152	TGC	2	6	1034977	1034982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132525
20462	NC_014152	TGAAAT	2	12	1034986	1034997	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	296132525
20463	NC_014152	ATA	2	6	1035017	1035022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132525
20464	NC_014152	GCTG	2	8	1035046	1035053	0 %	25 %	50 %	25 %	296132525
20465	NC_014152	GAA	2	6	1035089	1035094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132525
20466	NC_014152	ATG	2	6	1035141	1035146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132525
20467	NC_014152	GCA	2	6	1035161	1035166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132525
20468	NC_014152	CCTC	2	8	1035216	1035223	0 %	25 %	0 %	75 %	296132525
20469	NC_014152	TTA	2	6	1035295	1035300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132525
20470	NC_014152	TGG	2	6	1035310	1035315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132525
20471	NC_014152	GGC	2	6	1035323	1035328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132525
20472	NC_014152	GTTTC	2	10	1035403	1035412	0 %	60 %	20 %	20 %	296132525
20473	NC_014152	GGCC	2	8	1035547	1035554	0 %	0 %	50 %	50 %	296132525
20474	NC_014152	GAA	2	6	1035713	1035718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132525
20475	NC_014152	CCAGGG	2	12	1035744	1035755	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296132525
20476	NC_014152	CTGATT	2	12	1035761	1035772	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	296132525
20477	NC_014152	GCG	2	6	1035779	1035784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132525
20478	NC_014152	CTGGA	2	10	1035878	1035887	20 %	20 %	40 %	20 %	296132525
20479	NC_014152	CTGCC	2	10	1035889	1035898	0 %	20 %	20 %	60 %	296132525
20480	NC_014152	TGA	2	6	1035946	1035951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132525
20481	NC_014152	CGG	2	6	1035969	1035974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132525
20482	NC_014152	GGC	2	6	1036005	1036010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132525
20483	NC_014152	CCG	2	6	1036044	1036049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132525
20484	NC_014152	GAA	2	6	1036055	1036060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132525
20485	NC_014152	CCG	2	6	1036101	1036106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132525
20486	NC_014152	CGG	2	6	1036161	1036166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132525
20487	NC_014152	GGC	2	6	1036180	1036185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132525
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20489	NC_014152	GATGGA	2	12	1036216	1036227	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	296132525
20490	NC_014152	TCA	2	6	1036284	1036289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132525
20491	NC_014152	GCA	2	6	1036360	1036365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132525
20492	NC_014152	G	6	6	1036377	1036382	0 %	0 %	100 %	0 %	296132525
20493	NC_014152	CCTG	2	8	1036588	1036595	0 %	25 %	25 %	50 %	296132525
20494	NC_014152	CTGC	2	8	1036636	1036643	0 %	25 %	25 %	50 %	296132525
20495	NC_014152	GTTTT	2	10	1036659	1036668	0 %	80 %	20 %	0 %	296132525
20496	NC_014152	AT	3	6	1036823	1036828	50 %	50 %	0 %	0 %	296132525
20497	NC_014152	A	6	6	1036864	1036869	100 %	0 %	0 %	0 %	296132525
20498	NC_014152	TGA	2	6	1036873	1036878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20499	NC_014152	GGT	2	6	1036983	1036988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132526
20500	NC_014152	AAGG	2	8	1037004	1037011	50 %	0 %	50 %	0 %	296132526

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