MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 62102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_014152	TGCAAT	2	12	957751	957762	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	296132461
19003	NC_014152	AAT	2	6	957813	957818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132461
19004	NC_014152	TGA	2	6	957858	957863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132461
19005	NC_014152	GCTAT	2	10	957907	957916	20 %	40 %	20 %	20 %	296132461
19006	NC_014152	TCG	2	6	958115	958120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132461
19007	NC_014152	GGT	2	6	958123	958128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132461
19008	NC_014152	TGA	2	6	958179	958184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132461
19009	NC_014152	ACGG	2	8	958187	958194	25 %	0 %	50 %	25 %	296132461
19010	NC_014152	TGT	2	6	958229	958234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132461
19011	NC_014152	CGGG	2	8	958323	958330	0 %	0 %	75 %	25 %	296132461
19012	NC_014152	CCG	2	6	958405	958410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132461
19013	NC_014152	ATC	2	6	958468	958473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132461
19014	NC_014152	GCG	2	6	958499	958504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132461
19015	NC_014152	TAA	2	6	958581	958586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132461
19016	NC_014152	GCC	2	6	958590	958595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132461
19017	NC_014152	TTGAT	2	10	958628	958637	20 %	60 %	20 %	0 %	296132462
19018	NC_014152	A	6	6	958656	958661	100 %	0 %	0 %	0 %	296132462
19019	NC_014152	TG	3	6	958774	958779	0 %	50 %	50 %	0 %	296132462
19020	NC_014152	CTG	2	6	958815	958820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132462
19021	NC_014152	TGG	2	6	958841	958846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132462
19022	NC_014152	ATC	2	6	958910	958915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132462
19023	NC_014152	GT	3	6	959085	959090	0 %	50 %	50 %	0 %	296132462
19024	NC_014152	T	6	6	959167	959172	0 %	100 %	0 %	0 %	296132462
19025	NC_014152	TGA	2	6	959255	959260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132462
19026	NC_014152	A	6	6	959287	959292	100 %	0 %	0 %	0 %	296132462
19027	NC_014152	ACC	2	6	959299	959304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296132462
19028	NC_014152	CTGCGG	2	12	959313	959324	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	296132462
19029	NC_014152	GGC	2	6	959399	959404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132462
19030	NC_014152	ATTA	2	8	959469	959476	50 %	50 %	0 %	0 %	296132462
19031	NC_014152	AAGT	2	8	959498	959505	50 %	25 %	25 %	0 %	296132462
19032	NC_014152	TGT	2	6	959526	959531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132462
19033	NC_014152	CAA	2	6	959625	959630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132462
19034	NC_014152	CTTGCT	2	12	959707	959718	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	296132462
19035	NC_014152	AC	3	6	959803	959808	50 %	0 %	0 %	50 %	296132462
19036	NC_014152	A	6	6	959842	959847	100 %	0 %	0 %	0 %	296132462
19037	NC_014152	TTAA	2	8	959941	959948	50 %	50 %	0 %	0 %	296132462
19038	NC_014152	TAA	2	6	959954	959959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132462
19039	NC_014152	GAA	2	6	959971	959976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132462
19040	NC_014152	A	6	6	960000	960005	100 %	0 %	0 %	0 %	296132462
19041	NC_014152	CCGAA	2	10	960006	960015	40 %	0 %	20 %	40 %	296132462
19042	NC_014152	CTA	2	6	960137	960142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132462
19043	NC_014152	TAT	2	6	960143	960148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132462
19044	NC_014152	AAT	2	6	960184	960189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132462
19045	NC_014152	AGAA	2	8	960636	960643	75 %	0 %	25 %	0 %	296132462
19046	NC_014152	ATT	2	6	960703	960708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132462
19047	NC_014152	A	6	6	960722	960727	100 %	0 %	0 %	0 %	296132462
19048	NC_014152	GAA	2	6	960826	960831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132462
19049	NC_014152	A	6	6	960859	960864	100 %	0 %	0 %	0 %	296132462
19050	NC_014152	CACC	2	8	960937	960944	25 %	0 %	0 %	75 %	296132462
19051	NC_014152	ATG	2	6	961085	961090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132462
19052	NC_014152	GTT	2	6	961128	961133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132462
19053	NC_014152	CTATAA	2	12	961148	961159	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	296132462
19054	NC_014152	CAT	2	6	961202	961207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132462
19055	NC_014152	A	6	6	961304	961309	100 %	0 %	0 %	0 %	296132462
19056	NC_014152	CGG	2	6	961324	961329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19057	NC_014152	TTC	2	6	961351	961356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132463
19058	NC_014152	CAGC	2	8	961418	961425	25 %	0 %	25 %	50 %	296132463
19059	NC_014152	AGTC	2	8	961499	961506	25 %	25 %	25 %	25 %	296132463
19060	NC_014152	CAA	2	6	961542	961547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132463
19061	NC_014152	T	7	7	961814	961820	0 %	100 %	0 %	0 %	296132463
19062	NC_014152	GATT	2	8	961828	961835	25 %	50 %	25 %	0 %	296132463
19063	NC_014152	AAAAG	2	10	961865	961874	80 %	0 %	20 %	0 %	296132463
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19065	NC_014152	GCA	2	6	961962	961967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132463
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19067	NC_014152	GTTT	2	8	962060	962067	0 %	75 %	25 %	0 %	296132463
19068	NC_014152	AAG	2	6	962110	962115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132463
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19070	NC_014152	TTTA	2	8	962158	962165	25 %	75 %	0 %	0 %	296132463
19071	NC_014152	TAA	2	6	962309	962314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19072	NC_014152	TGATT	2	10	962349	962358	20 %	60 %	20 %	0 %	296132464
19073	NC_014152	TGA	2	6	962376	962381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132464
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19076	NC_014152	CTG	2	6	962470	962475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132464
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19079	NC_014152	TCGT	2	8	962657	962664	0 %	50 %	25 %	25 %	296132464
19080	NC_014152	CCGA	2	8	962748	962755	25 %	0 %	25 %	50 %	296132464
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19083	NC_014152	AG	3	6	962817	962822	50 %	0 %	50 %	0 %	296132464
19084	NC_014152	AAGA	2	8	962823	962830	75 %	0 %	25 %	0 %	296132464
19085	NC_014152	AGA	2	6	962842	962847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132464
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19087	NC_014152	T	6	6	962962	962967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19088	NC_014152	GTGG	2	8	962976	962983	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
19089	NC_014152	GCC	2	6	963072	963077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19090	NC_014152	GGC	2	6	963120	963125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19091	NC_014152	CTGC	2	8	963170	963177	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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19094	NC_014152	GGA	2	6	963258	963263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19095	NC_014152	ATT	2	6	963264	963269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19099	NC_014152	CCT	2	6	963562	963567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19100	NC_014152	CAA	2	6	963571	963576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19101	NC_014152	AGCA	2	8	963701	963708	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19102	NC_014152	A	6	6	963717	963722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19103	NC_014152	ATT	2	6	963742	963747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19104	NC_014152	TA	3	6	963793	963798	50 %	50 %	0 %	0 %	296132466
19105	NC_014152	CTT	2	6	963837	963842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132466
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19107	NC_014152	GAC	2	6	964215	964220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132466
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19109	NC_014152	CCAG	2	8	964244	964251	25 %	0 %	25 %	50 %	296132466
19110	NC_014152	T	6	6	964257	964262	0 %	100 %	0 %	0 %	296132466
19111	NC_014152	TGG	2	6	964370	964375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132466
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19115	NC_014152	CTT	2	6	964542	964547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132467
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19123	NC_014152	T	6	6	964830	964835	0 %	100 %	0 %	0 %	296132467
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19133	NC_014152	TA	3	6	965196	965201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19238	NC_014152	GAAT	2	8	970393	970400	50 %	25 %	25 %	0 %	296132472
19239	NC_014152	ATT	2	6	970444	970449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132472
19240	NC_014152	G	6	6	970527	970532	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19241	NC_014152	C	6	6	970543	970548	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19242	NC_014152	T	6	6	970555	970560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19243	NC_014152	CAG	2	6	970651	970656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132473
19244	NC_014152	T	6	6	970793	970798	0 %	100 %	0 %	0 %	296132473
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19489	NC_014152	ATG	2	6	984024	984029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132482
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19491	NC_014152	AGAAT	2	10	984087	984096	60 %	20 %	20 %	0 %	296132482
19492	NC_014152	TAA	2	6	984139	984144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132482
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19497	NC_014152	T	6	6	984357	984362	0 %	100 %	0 %	0 %	296132482
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19499	NC_014152	ATC	2	6	984458	984463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132482
19500	NC_014152	ACC	2	6	984475	984480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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