MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 62102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_014152	CAG	2	6	858069	858074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132371
17002	NC_014152	CAT	2	6	858096	858101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132371
17003	NC_014152	ATA	2	6	858169	858174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132371
17004	NC_014152	GTG	2	6	858178	858183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132371
17005	NC_014152	CAGGAG	2	12	858202	858213	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	296132371
17006	NC_014152	CCGG	2	8	858262	858269	0 %	0 %	50 %	50 %	296132371
17007	NC_014152	CCGG	2	8	858305	858312	0 %	0 %	50 %	50 %	296132371
17008	NC_014152	GATT	2	8	858323	858330	25 %	50 %	25 %	0 %	296132371
17009	NC_014152	CGG	2	6	858374	858379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132371
17010	NC_014152	ATT	2	6	858390	858395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132371
17011	NC_014152	GCC	2	6	858418	858423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132371
17012	NC_014152	CCT	2	6	858533	858538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296132371
17013	NC_014152	GGCA	2	8	858576	858583	25 %	0 %	50 %	25 %	296132371
17014	NC_014152	GGC	2	6	858591	858596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132371
17015	NC_014152	GAA	2	6	858637	858642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132371
17016	NC_014152	GGC	2	6	858871	858876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132371
17017	NC_014152	GACT	2	8	858903	858910	25 %	25 %	25 %	25 %	296132371
17018	NC_014152	GAT	2	6	858985	858990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132371
17019	NC_014152	T	6	6	859034	859039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17020	NC_014152	AAT	2	6	859043	859048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17021	NC_014152	ATAGT	2	10	859059	859068	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17022	NC_014152	CAG	2	6	859176	859181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132372
17023	NC_014152	AAAGG	2	10	859185	859194	60 %	0 %	40 %	0 %	296132372
17024	NC_014152	TGG	2	6	859195	859200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132372
17025	NC_014152	AAG	2	6	859222	859227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132372
17026	NC_014152	CCCT	2	8	859260	859267	0 %	25 %	0 %	75 %	296132372
17027	NC_014152	GCG	2	6	859306	859311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132372
17028	NC_014152	GTA	2	6	859356	859361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132372
17029	NC_014152	GCA	2	6	859417	859422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132372
17030	NC_014152	A	6	6	859422	859427	100 %	0 %	0 %	0 %	296132372
17031	NC_014152	TCC	2	6	859430	859435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296132372
17032	NC_014152	TAAAT	2	10	859519	859528	60 %	40 %	0 %	0 %	296132372
17033	NC_014152	T	7	7	859528	859534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17034	NC_014152	AGT	2	6	859553	859558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17035	NC_014152	A	6	6	859601	859606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17036	NC_014152	T	6	6	859666	859671	0 %	100 %	0 %	0 %	296132373
17037	NC_014152	CTTT	2	8	859674	859681	0 %	75 %	0 %	25 %	296132373
17038	NC_014152	ATT	2	6	859711	859716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132373
17039	NC_014152	TCG	2	6	859877	859882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132373
17040	NC_014152	GC	3	6	859895	859900	0 %	0 %	50 %	50 %	296132373
17041	NC_014152	TGC	2	6	859905	859910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132373
17042	NC_014152	TTC	2	6	859927	859932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132373
17043	NC_014152	CTG	2	6	859954	859959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132373
17044	NC_014152	T	6	6	859996	860001	0 %	100 %	0 %	0 %	296132373
17045	NC_014152	TCTT	2	8	860005	860012	0 %	75 %	0 %	25 %	296132373
17046	NC_014152	GCA	2	6	860067	860072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132373
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17048	NC_014152	AGG	2	6	860097	860102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296132373
17049	NC_014152	CTT	2	6	860121	860126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132373
17050	NC_014152	GCT	2	6	860194	860199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132373
17051	NC_014152	GTG	2	6	860302	860307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132373
17052	NC_014152	GGC	2	6	860370	860375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132373
17053	NC_014152	GAA	2	6	860446	860451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132373
17054	NC_014152	GTTG	2	8	860486	860493	0 %	50 %	50 %	0 %	296132373
17055	NC_014152	GCC	2	6	860553	860558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132373
17056	NC_014152	CTAC	2	8	860567	860574	25 %	25 %	0 %	50 %	296132373
17057	NC_014152	TCA	2	6	860645	860650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132373
17058	NC_014152	AT	3	6	860659	860664	50 %	50 %	0 %	0 %	296132373
17059	NC_014152	ACAG	2	8	860665	860672	50 %	0 %	25 %	25 %	296132373
17060	NC_014152	TTA	2	6	860691	860696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132373
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17062	NC_014152	CCG	2	6	860813	860818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132373
17063	NC_014152	TGT	2	6	860840	860845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132373
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17065	NC_014152	CGG	2	6	860893	860898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132373
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17069	NC_014152	CTG	2	6	860942	860947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132373
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17071	NC_014152	ATTA	2	8	861036	861043	50 %	50 %	0 %	0 %	296132374
17072	NC_014152	TC	3	6	861085	861090	0 %	50 %	0 %	50 %	296132374
17073	NC_014152	TTAC	2	8	861093	861100	25 %	50 %	0 %	25 %	296132374
17074	NC_014152	GCG	2	6	861185	861190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132374
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17078	NC_014152	GATT	2	8	861272	861279	25 %	50 %	25 %	0 %	296132374
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17081	NC_014152	CTG	2	6	861379	861384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132374
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17086	NC_014152	ATGGC	2	10	861758	861767	20 %	20 %	40 %	20 %	296132374
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17088	NC_014152	GTAT	2	8	861821	861828	25 %	50 %	25 %	0 %	296132374
17089	NC_014152	TGCC	2	8	861839	861846	0 %	25 %	25 %	50 %	296132374
17090	NC_014152	TA	3	6	861870	861875	50 %	50 %	0 %	0 %	296132374
17091	NC_014152	TCT	3	9	861883	861891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132374
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17093	NC_014152	T	6	6	861947	861952	0 %	100 %	0 %	0 %	296132374
17094	NC_014152	TTCG	2	8	862017	862024	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17095	NC_014152	CAA	2	6	862029	862034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17097	NC_014152	GAG	2	6	862094	862099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17098	NC_014152	GAAT	2	8	862100	862107	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17099	NC_014152	CTA	2	6	862118	862123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132375
17100	NC_014152	GAG	2	6	862159	862164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296132375
17101	NC_014152	TGGCCA	2	12	862214	862225	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296132375
17102	NC_014152	A	6	6	862358	862363	100 %	0 %	0 %	0 %	296132375
17103	NC_014152	CAA	2	6	862386	862391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132375
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17105	NC_014152	TGA	2	6	862434	862439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132375
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17108	NC_014152	T	8	8	862557	862564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17109	NC_014152	AAT	2	6	862596	862601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17110	NC_014152	AAT	2	6	862610	862615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17111	NC_014152	GCC	2	6	862668	862673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132376
17112	NC_014152	GCGCCG	2	12	862688	862699	0 %	0 %	50 %	50 %	296132376
17113	NC_014152	GAA	2	6	862733	862738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132376
17114	NC_014152	AACCC	2	10	862847	862856	40 %	0 %	0 %	60 %	296132376
17115	NC_014152	GTGAT	2	10	862907	862916	20 %	40 %	40 %	0 %	296132376
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17242	NC_014152	ATT	2	6	869196	869201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17500	NC_014152	TA	3	6	882717	882722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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