MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 62102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_014152	ATC	2	6	805668	805673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16002	NC_014152	CTT	2	6	805685	805690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16003	NC_014152	GGT	2	6	805699	805704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16004	NC_014152	T	6	6	805803	805808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_014152	ATT	2	6	805813	805818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132326
16006	NC_014152	GAA	2	6	805866	805871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132326
16007	NC_014152	TTA	2	6	805890	805895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132326
16008	NC_014152	AATT	2	8	805994	806001	50 %	50 %	0 %	0 %	296132326
16009	NC_014152	TTG	2	6	806015	806020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132326
16010	NC_014152	ATT	3	9	806027	806035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132326
16011	NC_014152	TCCAC	2	10	806170	806179	20 %	20 %	0 %	60 %	296132326
16012	NC_014152	TGA	2	6	806200	806205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132326
16013	NC_014152	TCTGG	2	10	806261	806270	0 %	40 %	40 %	20 %	296132326
16014	NC_014152	T	6	6	806321	806326	0 %	100 %	0 %	0 %	296132326
16015	NC_014152	AAC	2	6	806336	806341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132326
16016	NC_014152	GTT	2	6	806414	806419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132326
16017	NC_014152	TGT	3	9	806458	806466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132326
16018	NC_014152	TGC	2	6	806504	806509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132326
16019	NC_014152	AGA	2	6	806526	806531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132326
16020	NC_014152	T	6	6	806555	806560	0 %	100 %	0 %	0 %	296132326
16021	NC_014152	ACAT	2	8	806612	806619	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16022	NC_014152	ATT	2	6	806642	806647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16023	NC_014152	TAC	2	6	806685	806690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16024	NC_014152	GGT	2	6	806696	806701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16025	NC_014152	GGT	2	6	806703	806708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16026	NC_014152	T	6	6	806777	806782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16027	NC_014152	AAT	2	6	806847	806852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16028	NC_014152	TGG	2	6	806897	806902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_014152	GGGT	2	8	806905	806912	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
16030	NC_014152	CAGG	3	12	806963	806974	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16031	NC_014152	GCC	2	6	807004	807009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16032	NC_014152	CGGAG	2	10	807150	807159	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16033	NC_014152	GGC	2	6	807224	807229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16034	NC_014152	CTGC	2	8	807274	807281	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16035	NC_014152	GCA	2	6	807295	807300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16036	NC_014152	CCCA	2	8	807325	807332	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
16037	NC_014152	GAAG	2	8	807347	807354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16038	NC_014152	GCA	2	6	807388	807393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16039	NC_014152	GTT	2	6	807408	807413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16040	NC_014152	GTT	2	6	807445	807450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16041	NC_014152	CGG	2	6	807562	807567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132327
16042	NC_014152	TGA	2	6	807568	807573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132327
16043	NC_014152	T	6	6	807624	807629	0 %	100 %	0 %	0 %	296132327
16044	NC_014152	A	6	6	807636	807641	100 %	0 %	0 %	0 %	296132327
16045	NC_014152	GAT	2	6	807995	808000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132327
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16047	NC_014152	AT	3	6	808096	808101	50 %	50 %	0 %	0 %	296132327
16048	NC_014152	GAAA	2	8	808136	808143	75 %	0 %	25 %	0 %	296132327
16049	NC_014152	GTT	2	6	808173	808178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132327
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16055	NC_014152	GTT	2	6	808563	808568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132328
16056	NC_014152	CTTTTC	2	12	808597	808608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132328
16057	NC_014152	TGG	2	6	808618	808623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132328
16058	NC_014152	TGA	2	6	808684	808689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132328
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16060	NC_014152	TAT	2	6	808810	808815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132328
16061	NC_014152	TGA	2	6	808876	808881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132328
16062	NC_014152	T	6	6	808919	808924	0 %	100 %	0 %	0 %	296132328
16063	NC_014152	AGA	2	6	808967	808972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132328
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16065	NC_014152	CAA	2	6	809038	809043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132328
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16067	NC_014152	TA	3	6	809069	809074	50 %	50 %	0 %	0 %	296132328
16068	NC_014152	GGT	2	6	809093	809098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132328
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16071	NC_014152	TCT	2	6	809158	809163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16072	NC_014152	CCT	2	6	809164	809169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296132329
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16075	NC_014152	CTG	2	6	809413	809418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132329
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16077	NC_014152	TCT	3	9	809466	809474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132329
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16082	NC_014152	TGGT	2	8	809921	809928	0 %	50 %	50 %	0 %	296132330
16083	NC_014152	CATA	2	8	809968	809975	50 %	25 %	0 %	25 %	296132330
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16085	NC_014152	CCA	2	6	810184	810189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296132331
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16087	NC_014152	GCC	2	6	810331	810336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132332
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16092	NC_014152	T	6	6	810640	810645	0 %	100 %	0 %	0 %	296132332
16093	NC_014152	T	6	6	810747	810752	0 %	100 %	0 %	0 %	296132332
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16099	NC_014152	AG	3	6	811114	811119	50 %	0 %	50 %	0 %	296132332
16100	NC_014152	CAA	2	6	811134	811139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132332
16101	NC_014152	A	6	6	811138	811143	100 %	0 %	0 %	0 %	296132332
16102	NC_014152	AT	3	6	811159	811164	50 %	50 %	0 %	0 %	296132332
16103	NC_014152	CTT	2	6	811191	811196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16107	NC_014152	A	7	7	811312	811318	100 %	0 %	0 %	0 %	296132333
16108	NC_014152	TGT	2	6	811325	811330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132333
16109	NC_014152	AAAGG	2	10	811341	811350	60 %	0 %	40 %	0 %	296132333
16110	NC_014152	TAC	2	6	811377	811382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132333
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16115	NC_014152	TGG	2	6	811693	811698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132333
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16120	NC_014152	TACC	2	8	812179	812186	25 %	25 %	0 %	50 %	296132334
16121	NC_014152	T	6	6	812261	812266	0 %	100 %	0 %	0 %	296132334
16122	NC_014152	TAA	2	6	812302	812307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132334
16123	NC_014152	GATTT	2	10	812316	812325	20 %	60 %	20 %	0 %	296132334
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16125	NC_014152	GAA	2	6	812333	812338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132334
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16128	NC_014152	GGC	2	6	812420	812425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132334
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16247	NC_014152	AAG	2	6	818390	818395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132339
16248	NC_014152	CTT	2	6	818540	818545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132339
16249	NC_014152	AGG	2	6	818600	818605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296132339
16250	NC_014152	CCT	2	6	818669	818674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296132339
16251	NC_014152	CAGT	2	8	818682	818689	25 %	25 %	25 %	25 %	296132339
16252	NC_014152	TTC	2	6	818693	818698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132339
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16371	NC_014152	GGC	2	6	824369	824374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132343
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