MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 62102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_014152	TGC	2	6	703201	703206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132234
14002	NC_014152	GACT	2	8	703263	703270	25 %	25 %	25 %	25 %	296132234
14003	NC_014152	A	6	6	703397	703402	100 %	0 %	0 %	0 %	296132234
14004	NC_014152	GAA	3	9	703430	703438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132234
14005	NC_014152	TGT	2	6	703441	703446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132234
14006	NC_014152	ACG	2	6	703476	703481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132234
14007	NC_014152	GGTT	2	8	703528	703535	0 %	50 %	50 %	0 %	296132234
14008	NC_014152	TGG	2	6	703628	703633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132234
14009	NC_014152	TGT	2	6	703669	703674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132234
14010	NC_014152	CAGA	2	8	703748	703755	50 %	0 %	25 %	25 %	296132234
14011	NC_014152	GGC	2	6	703834	703839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132234
14012	NC_014152	TGG	2	6	704004	704009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132234
14013	NC_014152	GAA	2	6	704045	704050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132234
14014	NC_014152	A	6	6	704194	704199	100 %	0 %	0 %	0 %	296132235
14015	NC_014152	GAA	2	6	704260	704265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132235
14016	NC_014152	ATG	2	6	704272	704277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132235
14017	NC_014152	TGA	2	6	704280	704285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132235
14018	NC_014152	GT	3	6	704310	704315	0 %	50 %	50 %	0 %	296132235
14019	NC_014152	GGC	2	6	704348	704353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132235
14020	NC_014152	GGC	2	6	704428	704433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132235
14021	NC_014152	ATA	2	6	704483	704488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132235
14022	NC_014152	TTA	2	6	704491	704496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132235
14023	NC_014152	AACC	2	8	704511	704518	50 %	0 %	0 %	50 %	296132235
14024	NC_014152	T	6	6	704559	704564	0 %	100 %	0 %	0 %	296132235
14025	NC_014152	AACTGG	2	12	704627	704638	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296132235
14026	NC_014152	CAT	2	6	704696	704701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132235
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14028	NC_014152	ACTT	2	8	704728	704735	25 %	50 %	0 %	25 %	296132235
14029	NC_014152	GAT	2	6	704943	704948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132235
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14031	NC_014152	GAAG	2	8	705033	705040	50 %	0 %	50 %	0 %	296132235
14032	NC_014152	GCT	2	6	705076	705081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132235
14033	NC_014152	GCC	2	6	705094	705099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132235
14034	NC_014152	CGG	2	6	705156	705161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132235
14035	NC_014152	CGG	2	6	705285	705290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132235
14036	NC_014152	TA	3	6	705346	705351	50 %	50 %	0 %	0 %	296132235
14037	NC_014152	TTG	2	6	705493	705498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132235
14038	NC_014152	G	6	6	705649	705654	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_014152	AT	3	6	705670	705675	50 %	50 %	0 %	0 %	296132236
14040	NC_014152	GT	3	6	705688	705693	0 %	50 %	50 %	0 %	296132236
14041	NC_014152	TG	3	6	705707	705712	0 %	50 %	50 %	0 %	296132236
14042	NC_014152	A	6	6	705769	705774	100 %	0 %	0 %	0 %	296132236
14043	NC_014152	CTG	2	6	705785	705790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132236
14044	NC_014152	TCG	2	6	705800	705805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132236
14045	NC_014152	TGA	2	6	705849	705854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132236
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14050	NC_014152	GT	3	6	706059	706064	0 %	50 %	50 %	0 %	296132236
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14060	NC_014152	GCA	2	6	706441	706446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132237
14061	NC_014152	TGA	2	6	706508	706513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132237
14062	NC_014152	A	7	7	706518	706524	100 %	0 %	0 %	0 %	296132237
14063	NC_014152	A	6	6	706547	706552	100 %	0 %	0 %	0 %	296132237
14064	NC_014152	AAC	2	6	706731	706736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132237
14065	NC_014152	TGT	2	6	706739	706744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132237
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14069	NC_014152	CTG	2	6	706779	706784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132237
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14085	NC_014152	TCG	2	6	707876	707881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132238
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14091	NC_014152	TAA	2	6	708245	708250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14092	NC_014152	A	6	6	708260	708265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14093	NC_014152	AGC	2	6	708298	708303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14094	NC_014152	TA	3	6	708345	708350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14095	NC_014152	AT	3	6	708356	708361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14096	NC_014152	GAG	2	6	708372	708377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14097	NC_014152	A	6	6	708520	708525	100 %	0 %	0 %	0 %	296132239
14098	NC_014152	GAA	2	6	708549	708554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132239
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14102	NC_014152	CAAT	2	8	708769	708776	50 %	25 %	0 %	25 %	296132240
14103	NC_014152	ACC	2	6	708785	708790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296132240
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14105	NC_014152	A	6	6	708856	708861	100 %	0 %	0 %	0 %	296132240
14106	NC_014152	GAA	2	6	708953	708958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132240
14107	NC_014152	TTA	2	6	709026	709031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14108	NC_014152	T	6	6	709059	709064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14109	NC_014152	TA	3	6	709079	709084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14110	NC_014152	AT	3	6	709141	709146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14111	NC_014152	ATA	2	6	709154	709159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14112	NC_014152	CAG	2	6	709163	709168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14113	NC_014152	GAA	2	6	709213	709218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132241
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14115	NC_014152	AGAC	2	8	709337	709344	50 %	0 %	25 %	25 %	296132241
14116	NC_014152	T	6	6	709384	709389	0 %	100 %	0 %	0 %	296132241
14117	NC_014152	GAA	2	6	709393	709398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132241
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14123	NC_014152	GCACCG	2	12	709708	709719	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	296132241
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14240	NC_014152	ATG	2	6	714932	714937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132244
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14244	NC_014152	ATA	2	6	715138	715143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14245	NC_014152	CAA	2	6	715213	715218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14246	NC_014152	ACCTG	2	10	715317	715326	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14247	NC_014152	TCTG	2	8	715378	715385	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14248	NC_014152	T	6	6	715393	715398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14371	NC_014152	ATTGT	2	10	722094	722103	20 %	60 %	20 %	0 %	296132252
14372	NC_014152	TTC	2	6	722114	722119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132252
14373	NC_014152	GCG	2	6	722307	722312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132252
14374	NC_014152	TGG	2	6	722389	722394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132252
14375	NC_014152	GTA	2	6	722427	722432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132252
14376	NC_014152	GAA	2	6	722491	722496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132252
14377	NC_014152	TGC	2	6	722507	722512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132252
14378	NC_014152	GGGTT	2	10	722547	722556	0 %	40 %	60 %	0 %	296132252
14379	NC_014152	GATA	2	8	722573	722580	50 %	25 %	25 %	0 %	296132252
14380	NC_014152	GCG	2	6	722589	722594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132252
14381	NC_014152	CG	3	6	722620	722625	0 %	0 %	50 %	50 %	296132252
14382	NC_014152	TTCAGC	2	12	722646	722657	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	296132252
14383	NC_014152	TCG	2	6	722667	722672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132252
14384	NC_014152	ACT	2	6	722680	722685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132252
14385	NC_014152	GGC	2	6	722786	722791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132252
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14390	NC_014152	GCC	2	6	722903	722908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132252
14391	NC_014152	ACA	2	6	722972	722977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132252
14392	NC_014152	T	6	6	723073	723078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14393	NC_014152	TAA	2	6	723133	723138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14394	NC_014152	A	6	6	723167	723172	100 %	0 %	0 %	0 %	296132253
14395	NC_014152	T	6	6	723183	723188	0 %	100 %	0 %	0 %	296132253
14396	NC_014152	A	6	6	723231	723236	100 %	0 %	0 %	0 %	296132253
14397	NC_014152	A	6	6	723283	723288	100 %	0 %	0 %	0 %	296132253
14398	NC_014152	AACAT	2	10	723396	723405	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14399	NC_014152	TATT	2	8	723408	723415	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14400	NC_014152	CAAA	2	8	723432	723439	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14401	NC_014152	ATT	2	6	723452	723457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132254
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14404	NC_014152	CTA	2	6	723707	723712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132254
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14407	NC_014152	TGT	2	6	723855	723860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132254
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14410	NC_014152	TCT	2	6	724019	724024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132254
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14413	NC_014152	TCTG	2	8	724246	724253	0 %	50 %	25 %	25 %	296132255
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14433	NC_014152	GCG	2	6	725341	725346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132255
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14437	NC_014152	ATTTT	2	10	725604	725613	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14438	NC_014152	ATT	2	6	725618	725623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14439	NC_014152	TGT	2	6	725646	725651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14440	NC_014152	GAT	2	6	725829	725834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132256
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14476	NC_014152	GA	3	6	727741	727746	50 %	0 %	50 %	0 %	296132258
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14483	NC_014152	T	7	7	728119	728125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14484	NC_014152	GTCCCG	2	12	728143	728154	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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14486	NC_014152	T	6	6	728262	728267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14487	NC_014152	ACT	2	6	728336	728341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14489	NC_014152	T	7	7	728412	728418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14490	NC_014152	TGG	2	6	728489	728494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132259
14491	NC_014152	CGG	2	6	728505	728510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132259
14492	NC_014152	T	6	6	728517	728522	0 %	100 %	0 %	0 %	296132259
14493	NC_014152	CCA	2	6	728525	728530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296132259
14494	NC_014152	GCT	2	6	728549	728554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132259
14495	NC_014152	GTT	2	6	728570	728575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132259
14496	NC_014152	CTG	2	6	728669	728674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132259
14497	NC_014152	T	7	7	728793	728799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14498	NC_014152	TA	3	6	728832	728837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14499	NC_014152	TTAA	2	8	728845	728852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14500	NC_014152	TTTA	2	8	728867	728874	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

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