MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 62102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_014152	GGT	2	6	677370	677375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132208
13502	NC_014152	AAC	2	6	677386	677391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13503	NC_014152	CCGCC	2	10	677513	677522	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
13504	NC_014152	GGC	2	6	677546	677551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13505	NC_014152	GCC	2	6	677565	677570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13506	NC_014152	AGA	2	6	677752	677757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13507	NC_014152	GAA	2	6	677795	677800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13508	NC_014152	AAC	2	6	677924	677929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13509	NC_014152	ACT	2	6	677982	677987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13510	NC_014152	GGAA	2	8	678094	678101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13511	NC_014152	AAT	2	6	678143	678148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13512	NC_014152	GTT	2	6	678302	678307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13513	NC_014152	CTT	2	6	678347	678352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132209
13514	NC_014152	TAA	2	6	678354	678359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132209
13515	NC_014152	T	6	6	678380	678385	0 %	100 %	0 %	0 %	296132209
13516	NC_014152	ATAATT	2	12	678393	678404	50 %	50 %	0 %	0 %	296132209
13517	NC_014152	TAA	2	6	678444	678449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132209
13518	NC_014152	TA	3	6	678487	678492	50 %	50 %	0 %	0 %	296132209
13519	NC_014152	CAG	2	6	678565	678570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132209
13520	NC_014152	TTA	2	6	678581	678586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132209
13521	NC_014152	TCTCC	2	10	678626	678635	0 %	40 %	0 %	60 %	296132209
13522	NC_014152	AGA	2	6	678637	678642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132209
13523	NC_014152	GA	5	10	678650	678659	50 %	0 %	50 %	0 %	296132209
13524	NC_014152	ATT	2	6	678666	678671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132209
13525	NC_014152	AGA	2	6	678676	678681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132209
13526	NC_014152	AAC	2	6	678687	678692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132209
13527	NC_014152	TAAA	2	8	678696	678703	75 %	25 %	0 %	0 %	296132209
13528	NC_014152	AGA	2	6	678730	678735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132209
13529	NC_014152	ATG	2	6	678741	678746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132209
13530	NC_014152	AT	3	6	678788	678793	50 %	50 %	0 %	0 %	296132209
13531	NC_014152	AAG	2	6	678814	678819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132209
13532	NC_014152	ATT	2	6	678882	678887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132209
13533	NC_014152	TTTA	2	8	678966	678973	25 %	75 %	0 %	0 %	296132209
13534	NC_014152	ATC	2	6	679011	679016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132209
13535	NC_014152	A	7	7	679062	679068	100 %	0 %	0 %	0 %	296132209
13536	NC_014152	GAA	2	6	679178	679183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132209
13537	NC_014152	ATTT	2	8	679323	679330	25 %	75 %	0 %	0 %	296132209
13538	NC_014152	AT	3	6	679360	679365	50 %	50 %	0 %	0 %	296132209
13539	NC_014152	CAG	2	6	679376	679381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132209
13540	NC_014152	ATC	2	6	679400	679405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13541	NC_014152	TAG	2	6	679412	679417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13542	NC_014152	AAG	2	6	679423	679428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13543	NC_014152	CAA	2	6	679678	679683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13544	NC_014152	AG	3	6	679706	679711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13545	NC_014152	AAAG	2	8	679720	679727	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13546	NC_014152	CCG	2	6	679728	679733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13547	NC_014152	GCGG	2	8	679778	679785	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13548	NC_014152	GTA	2	6	679850	679855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132210
13549	NC_014152	TG	3	6	679866	679871	0 %	50 %	50 %	0 %	296132210
13550	NC_014152	TCC	2	6	679903	679908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296132210
13551	NC_014152	CCTC	2	8	679925	679932	0 %	25 %	0 %	75 %	296132210
13552	NC_014152	CAT	3	9	679983	679991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132210
13553	NC_014152	GTA	2	6	679994	679999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132210
13554	NC_014152	TG	3	6	680013	680018	0 %	50 %	50 %	0 %	296132210
13555	NC_014152	ATT	2	6	680137	680142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132210
13556	NC_014152	TCG	2	6	680160	680165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132210
13557	NC_014152	ATT	2	6	680229	680234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13558	NC_014152	TCT	2	6	680257	680262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13559	NC_014152	A	6	6	680263	680268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13560	NC_014152	A	6	6	680272	680277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13561	NC_014152	TTAT	2	8	680279	680286	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13562	NC_014152	CGA	2	6	680435	680440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13563	NC_014152	ATG	2	6	680464	680469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13564	NC_014152	T	6	6	680490	680495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13565	NC_014152	TTATG	2	10	680523	680532	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13566	NC_014152	TAAA	2	8	680540	680547	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13567	NC_014152	TGT	2	6	680575	680580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13568	NC_014152	ATA	2	6	680765	680770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13569	NC_014152	AGG	2	6	680818	680823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13570	NC_014152	CCA	2	6	680876	680881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296132211
13571	NC_014152	TGG	3	9	680930	680938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132211
13572	NC_014152	TGC	3	9	680969	680977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132211
13573	NC_014152	AGA	2	6	680990	680995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132211
13574	NC_014152	GGA	2	6	681039	681044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296132211
13575	NC_014152	ATG	2	6	681194	681199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132211
13576	NC_014152	GCG	2	6	681218	681223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132211
13577	NC_014152	AAGGC	2	10	681245	681254	40 %	0 %	40 %	20 %	296132211
13578	NC_014152	TTG	2	6	681269	681274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132211
13579	NC_014152	ATG	2	6	681286	681291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132211
13580	NC_014152	CAA	2	6	681306	681311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132211
13581	NC_014152	A	6	6	681328	681333	100 %	0 %	0 %	0 %	296132211
13582	NC_014152	GCG	2	6	681344	681349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132211
13583	NC_014152	ATT	2	6	681367	681372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132211
13584	NC_014152	GCA	2	6	681411	681416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132211
13585	NC_014152	GAA	2	6	681616	681621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132211
13586	NC_014152	GAA	2	6	681655	681660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13587	NC_014152	A	6	6	681717	681722	100 %	0 %	0 %	0 %	296132212
13588	NC_014152	TGGT	2	8	681783	681790	0 %	50 %	50 %	0 %	296132212
13589	NC_014152	TGT	2	6	681823	681828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132212
13590	NC_014152	CTG	2	6	681851	681856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132212
13591	NC_014152	GAT	2	6	681884	681889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132212
13592	NC_014152	ATT	2	6	681899	681904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132212
13593	NC_014152	TTC	2	6	681960	681965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132212
13594	NC_014152	TA	3	6	681978	681983	50 %	50 %	0 %	0 %	296132212
13595	NC_014152	CAG	2	6	681988	681993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132212
13596	NC_014152	AAGA	2	8	681998	682005	75 %	0 %	25 %	0 %	296132212
13597	NC_014152	AGG	2	6	682011	682016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296132212
13598	NC_014152	GGCC	2	8	682018	682025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13599	NC_014152	GAAA	2	8	682028	682035	75 %	0 %	25 %	0 %	296132213
13600	NC_014152	GGTC	2	8	682061	682068	0 %	25 %	50 %	25 %	296132213
13601	NC_014152	CCA	2	6	682114	682119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296132213
13602	NC_014152	CTTG	2	8	682157	682164	0 %	50 %	25 %	25 %	296132213
13603	NC_014152	GCT	2	6	682238	682243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132213
13604	NC_014152	CAT	2	6	682289	682294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132213
13605	NC_014152	AAGG	2	8	682305	682312	50 %	0 %	50 %	0 %	296132213
13606	NC_014152	TCC	2	6	682339	682344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296132213
13607	NC_014152	GAA	2	6	682386	682391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132213
13608	NC_014152	AGAA	2	8	682445	682452	75 %	0 %	25 %	0 %	296132214
13609	NC_014152	CCAG	2	8	682516	682523	25 %	0 %	25 %	50 %	296132214
13610	NC_014152	GTG	2	6	682608	682613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132214
13611	NC_014152	CTA	2	6	682667	682672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132214
13612	NC_014152	TAC	2	6	682742	682747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132214
13613	NC_014152	GGC	2	6	682776	682781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132214
13614	NC_014152	A	6	6	682785	682790	100 %	0 %	0 %	0 %	296132214
13615	NC_014152	GTG	2	6	682812	682817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132214
13616	NC_014152	AGC	2	6	682901	682906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132214
13617	NC_014152	CGGC	2	8	682972	682979	0 %	0 %	50 %	50 %	296132214
13618	NC_014152	CAA	2	6	682991	682996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132214
13619	NC_014152	GA	3	6	683026	683031	50 %	0 %	50 %	0 %	296132214
13620	NC_014152	CGG	2	6	683084	683089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132214
13621	NC_014152	TTAA	2	8	683352	683359	50 %	50 %	0 %	0 %	296132214
13622	NC_014152	TCG	2	6	683455	683460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132214
13623	NC_014152	T	6	6	683640	683645	0 %	100 %	0 %	0 %	296132214
13624	NC_014152	GAA	2	6	683673	683678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132214
13625	NC_014152	GAA	2	6	683681	683686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132214
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13992	NC_014152	TCCA	2	8	702914	702921	25 %	25 %	0 %	50 %	296132233
13993	NC_014152	GAG	2	6	702931	702936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296132233
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13996	NC_014152	A	7	7	703011	703017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13997	NC_014152	AAGAA	2	10	703021	703030	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13998	NC_014152	A	6	6	703115	703120	100 %	0 %	0 %	0 %	296132234
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