MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 62102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12004	NC_014152	CTG	2	6	604632	604637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132134
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12006	NC_014152	AG	3	6	604854	604859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12007	NC_014152	TGA	2	6	604861	604866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12013	NC_014152	TCACC	2	10	605298	605307	20 %	20 %	0 %	60 %	296132135
12014	NC_014152	TAC	2	6	605333	605338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132136
12015	NC_014152	T	7	7	605352	605358	0 %	100 %	0 %	0 %	296132136
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12057	NC_014152	AGC	2	6	607756	607761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12121	NC_014152	GAAT	2	8	611139	611146	50 %	25 %	25 %	0 %	296132142
12122	NC_014152	GCA	2	6	611156	611161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132142
12123	NC_014152	A	8	8	611161	611168	100 %	0 %	0 %	0 %	296132142
12124	NC_014152	GCT	2	6	611255	611260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132142
12125	NC_014152	GAA	2	6	611297	611302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132142
12126	NC_014152	CGG	2	6	611339	611344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132142
12127	NC_014152	TGAACA	2	12	611353	611364	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296132142
12128	NC_014152	GCA	2	6	611368	611373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132142
12129	NC_014152	GAT	2	6	611395	611400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132142
12130	NC_014152	TAA	2	6	611443	611448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132142
12131	NC_014152	T	6	6	611575	611580	0 %	100 %	0 %	0 %	296132142
12132	NC_014152	GTA	2	6	611603	611608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132142
12133	NC_014152	CAG	3	9	611705	611713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132142
12134	NC_014152	TA	3	6	611781	611786	50 %	50 %	0 %	0 %	296132142
12135	NC_014152	AGTG	2	8	611861	611868	25 %	25 %	50 %	0 %	296132142
12136	NC_014152	ACA	3	9	611880	611888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132142
12137	NC_014152	AGAAA	2	10	611911	611920	80 %	0 %	20 %	0 %	296132142
12138	NC_014152	TCC	2	6	611934	611939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296132142
12139	NC_014152	ATCTG	2	10	612012	612021	20 %	40 %	20 %	20 %	296132142
12140	NC_014152	GAG	2	6	612092	612097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296132142
12141	NC_014152	GATG	2	8	612165	612172	25 %	25 %	50 %	0 %	296132142
12142	NC_014152	GGT	2	6	612307	612312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132142
12143	NC_014152	AGA	2	6	612421	612426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132142
12144	NC_014152	AGGT	2	8	612456	612463	25 %	25 %	50 %	0 %	296132142
12145	NC_014152	TAG	2	6	612572	612577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12146	NC_014152	ATT	2	6	612615	612620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12147	NC_014152	T	8	8	612619	612626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12148	NC_014152	AGA	2	6	612676	612681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12149	NC_014152	CAGAG	2	10	612690	612699	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12150	NC_014152	ATC	2	6	612715	612720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12151	NC_014152	AAT	2	6	612766	612771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132143
12152	NC_014152	TGG	2	6	612792	612797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132143
12153	NC_014152	TGG	2	6	612810	612815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132143
12154	NC_014152	AGC	2	6	612847	612852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132143
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12156	NC_014152	GCT	2	6	612938	612943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132143
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12158	NC_014152	TGG	2	6	613091	613096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132144
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12160	NC_014152	ACTG	2	8	613188	613195	25 %	25 %	25 %	25 %	296132144
12161	NC_014152	A	6	6	613265	613270	100 %	0 %	0 %	0 %	296132144
12162	NC_014152	A	6	6	613282	613287	100 %	0 %	0 %	0 %	296132144
12163	NC_014152	GCT	2	6	613342	613347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132144
12164	NC_014152	GGCCAG	2	12	613560	613571	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296132144
12165	NC_014152	CGG	2	6	613667	613672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132144
12166	NC_014152	GTG	2	6	613754	613759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132144
12167	NC_014152	GGC	2	6	613828	613833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132144
12168	NC_014152	TA	4	8	613858	613865	50 %	50 %	0 %	0 %	296132144
12169	NC_014152	AT	3	6	613870	613875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12170	NC_014152	AGG	2	6	613918	613923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12171	NC_014152	GGTT	2	8	614010	614017	0 %	50 %	50 %	0 %	296132145
12172	NC_014152	CGG	2	6	614099	614104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132145
12173	NC_014152	TGATA	2	10	614112	614121	40 %	40 %	20 %	0 %	296132145
12174	NC_014152	TGG	2	6	614207	614212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132145
12175	NC_014152	AGT	2	6	614280	614285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132145
12176	NC_014152	CAGC	2	8	614286	614293	25 %	0 %	25 %	50 %	296132145
12177	NC_014152	ATG	3	9	614308	614316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132145
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12179	NC_014152	TGA	2	6	614433	614438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132145
12180	NC_014152	ACT	2	6	614446	614451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132145
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12182	NC_014152	G	7	7	614516	614522	0 %	0 %	100 %	0 %	296132145
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12193	NC_014152	CGA	2	6	615231	615236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132145
12194	NC_014152	GCT	2	6	615247	615252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132145
12195	NC_014152	ATG	2	6	615383	615388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132145
12196	NC_014152	CTG	2	6	615400	615405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132145
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12199	NC_014152	TTAAA	2	10	615600	615609	60 %	40 %	0 %	0 %	296132145
12200	NC_014152	ATT	2	6	615639	615644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132146
12201	NC_014152	ACA	2	6	615694	615699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132146
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12203	NC_014152	CCGGC	2	10	615776	615785	0 %	0 %	40 %	60 %	296132146
12204	NC_014152	TAG	2	6	615855	615860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132146
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12208	NC_014152	AG	3	6	616044	616049	50 %	0 %	50 %	0 %	296132146
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12212	NC_014152	CTG	2	6	616223	616228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132146
12213	NC_014152	CAGC	2	8	616261	616268	25 %	0 %	25 %	50 %	296132146
12214	NC_014152	TA	3	6	616288	616293	50 %	50 %	0 %	0 %	296132146
12215	NC_014152	AGT	2	6	616558	616563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132147
12216	NC_014152	GAC	2	6	616583	616588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132147
12217	NC_014152	CTG	2	6	616610	616615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132147
12218	NC_014152	GC	3	6	616622	616627	0 %	0 %	50 %	50 %	296132147
12219	NC_014152	AT	3	6	616718	616723	50 %	50 %	0 %	0 %	296132147
12220	NC_014152	ACCGT	2	10	616735	616744	20 %	20 %	20 %	40 %	296132147
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12222	NC_014152	A	6	6	616845	616850	100 %	0 %	0 %	0 %	296132147
12223	NC_014152	AAT	2	6	616890	616895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132148
12224	NC_014152	CAACT	2	10	616914	616923	40 %	20 %	0 %	40 %	296132148
12225	NC_014152	GCG	2	6	616970	616975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132148
12226	NC_014152	GGTA	2	8	617019	617026	25 %	25 %	50 %	0 %	296132148
12227	NC_014152	TTA	2	6	617027	617032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132148
12228	NC_014152	AAC	2	6	617046	617051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132148
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12230	NC_014152	TTA	2	6	617153	617158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132148
12231	NC_014152	GCCC	2	8	617252	617259	0 %	0 %	25 %	75 %	296132148
12232	NC_014152	TGG	2	6	617276	617281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132148
12233	NC_014152	ATG	2	6	617372	617377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132148
12234	NC_014152	GTTG	2	8	617385	617392	0 %	50 %	50 %	0 %	296132148
12235	NC_014152	GGC	2	6	617466	617471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132148
12236	NC_014152	GAA	2	6	617554	617559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132148
12237	NC_014152	CAG	2	6	617606	617611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132148
12238	NC_014152	CTAT	2	8	617668	617675	25 %	50 %	0 %	25 %	296132148
12239	NC_014152	CGG	2	6	617793	617798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132148
12240	NC_014152	AACC	3	12	617835	617846	50 %	0 %	0 %	50 %	296132148
12241	NC_014152	CAA	2	6	617973	617978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132148
12242	NC_014152	G	6	6	618120	618125	0 %	0 %	100 %	0 %	296132148
12243	NC_014152	TGC	2	6	618138	618143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132148
12244	NC_014152	ATC	2	6	618145	618150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132148
12245	NC_014152	CTG	2	6	618208	618213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132148
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12249	NC_014152	GTA	2	6	618367	618372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132148
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12251	NC_014152	TGGT	2	8	618542	618549	0 %	50 %	50 %	0 %	296132148
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12274	NC_014152	AGG	2	6	619666	619671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12357	NC_014152	AT	3	6	623100	623105	50 %	50 %	0 %	0 %	296132156
12358	NC_014152	TTAT	2	8	623125	623132	25 %	75 %	0 %	0 %	296132156
12359	NC_014152	GTT	2	6	623143	623148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132156
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