MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 62102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_014152	CGG	2	6	578770	578775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132108
11502	NC_014152	ATGCT	2	10	578795	578804	20 %	40 %	20 %	20 %	296132108
11503	NC_014152	AGC	2	6	578865	578870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132108
11504	NC_014152	TTTG	2	8	578919	578926	0 %	75 %	25 %	0 %	296132108
11505	NC_014152	GGA	2	6	578990	578995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_014152	GA	3	6	579152	579157	50 %	0 %	50 %	0 %	296132109
11507	NC_014152	ATT	2	6	579158	579163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132109
11508	NC_014152	TTC	2	6	579165	579170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132109
11509	NC_014152	GCA	2	6	579189	579194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132109
11510	NC_014152	TAT	2	6	579248	579253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132109
11511	NC_014152	AT	3	6	579259	579264	50 %	50 %	0 %	0 %	296132109
11512	NC_014152	A	6	6	579268	579273	100 %	0 %	0 %	0 %	296132109
11513	NC_014152	GAT	2	6	579309	579314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132109
11514	NC_014152	AGG	2	6	579365	579370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11515	NC_014152	TG	3	6	579402	579407	0 %	50 %	50 %	0 %	296132110
11516	NC_014152	AAG	2	6	579445	579450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132110
11517	NC_014152	GTTAAA	2	12	579459	579470	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	296132110
11518	NC_014152	GCA	2	6	579521	579526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132110
11519	NC_014152	ATA	2	6	579564	579569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132110
11520	NC_014152	GGCG	2	8	579626	579633	0 %	0 %	75 %	25 %	296132110
11521	NC_014152	G	6	6	579762	579767	0 %	0 %	100 %	0 %	296132110
11522	NC_014152	AAT	2	6	579827	579832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132110
11523	NC_014152	ATC	2	6	579915	579920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132110
11524	NC_014152	GAT	2	6	579947	579952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132110
11525	NC_014152	ATG	2	6	579982	579987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132110
11526	NC_014152	ACG	2	6	579994	579999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132110
11527	NC_014152	GGAA	2	8	580051	580058	50 %	0 %	50 %	0 %	296132110
11528	NC_014152	AGG	2	6	580060	580065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296132110
11529	NC_014152	AAAT	2	8	580111	580118	75 %	25 %	0 %	0 %	296132111
11530	NC_014152	GGA	2	6	580151	580156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296132111
11531	NC_014152	A	6	6	580275	580280	100 %	0 %	0 %	0 %	296132111
11532	NC_014152	CGGTT	2	10	580346	580355	0 %	40 %	40 %	20 %	296132111
11533	NC_014152	GCC	2	6	580387	580392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132111
11534	NC_014152	CGC	2	6	580457	580462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132111
11535	NC_014152	ATA	2	6	580560	580565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132111
11536	NC_014152	A	6	6	580639	580644	100 %	0 %	0 %	0 %	296132111
11537	NC_014152	CCA	2	6	580765	580770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296132111
11538	NC_014152	TGT	2	6	580784	580789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132111
11539	NC_014152	GTG	2	6	580805	580810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132111
11540	NC_014152	GGCA	2	8	580822	580829	25 %	0 %	50 %	25 %	296132111
11541	NC_014152	GGT	2	6	580848	580853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132111
11542	NC_014152	CTT	2	6	580900	580905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132111
11543	NC_014152	ATG	2	6	580986	580991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132111
11544	NC_014152	AAC	2	6	581010	581015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132111
11545	NC_014152	GTTTG	2	10	581088	581097	0 %	60 %	40 %	0 %	296132112
11546	NC_014152	TAAT	2	8	581164	581171	50 %	50 %	0 %	0 %	296132112
11547	NC_014152	TGGCT	2	10	581175	581184	0 %	40 %	40 %	20 %	296132112
11548	NC_014152	T	6	6	581241	581246	0 %	100 %	0 %	0 %	296132112
11549	NC_014152	ACC	2	6	581325	581330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296132112
11550	NC_014152	AATT	2	8	581354	581361	50 %	50 %	0 %	0 %	296132112
11551	NC_014152	GCCAC	2	10	581406	581415	20 %	0 %	20 %	60 %	296132112
11552	NC_014152	TG	3	6	581421	581426	0 %	50 %	50 %	0 %	296132112
11553	NC_014152	CCTGG	2	10	581429	581438	0 %	20 %	40 %	40 %	296132112
11554	NC_014152	GCG	2	6	581448	581453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132112
11555	NC_014152	CGG	2	6	581469	581474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132112
11556	NC_014152	GAA	2	6	581487	581492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132112
11557	NC_014152	TTTG	2	8	581539	581546	0 %	75 %	25 %	0 %	296132113
11558	NC_014152	AGG	2	6	581554	581559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296132113
11559	NC_014152	GGCG	2	8	581603	581610	0 %	0 %	75 %	25 %	296132113
11560	NC_014152	CT	3	6	581678	581683	0 %	50 %	0 %	50 %	296132113
11561	NC_014152	CCA	2	6	581733	581738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296132113
11562	NC_014152	CTTTTG	2	12	581772	581783	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	296132113
11563	NC_014152	TTA	2	6	581858	581863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132113
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11565	NC_014152	ATT	2	6	581937	581942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132114
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11567	NC_014152	TGC	2	6	582164	582169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132114
11568	NC_014152	TTA	2	6	582200	582205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132114
11569	NC_014152	CTGC	2	8	582268	582275	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11570	NC_014152	TTAAA	2	10	582294	582303	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11571	NC_014152	TA	3	6	582309	582314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11572	NC_014152	A	6	6	582318	582323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11573	NC_014152	T	6	6	582387	582392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_014152	TCAT	2	8	582415	582422	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11575	NC_014152	GA	3	6	582428	582433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11576	NC_014152	AGAA	2	8	582434	582441	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11577	NC_014152	GGGAG	2	10	582447	582456	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_014152	AGGC	2	8	582486	582493	25 %	0 %	50 %	25 %	296132115
11579	NC_014152	A	6	6	582511	582516	100 %	0 %	0 %	0 %	296132115
11580	NC_014152	GGC	2	6	582524	582529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132115
11581	NC_014152	TTCT	2	8	582550	582557	0 %	75 %	0 %	25 %	296132115
11582	NC_014152	TCAA	2	8	582583	582590	50 %	25 %	0 %	25 %	296132115
11583	NC_014152	TGC	2	6	582670	582675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132115
11584	NC_014152	CTG	2	6	582679	582684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132115
11585	NC_014152	TGT	2	6	582743	582748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132115
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11588	NC_014152	A	6	6	582830	582835	100 %	0 %	0 %	0 %	296132115
11589	NC_014152	AC	3	6	582898	582903	50 %	0 %	0 %	50 %	296132115
11590	NC_014152	CGA	2	6	582935	582940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132115
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11593	NC_014152	AGGT	2	8	583144	583151	25 %	25 %	50 %	0 %	296132115
11594	NC_014152	GAA	2	6	583218	583223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132115
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11601	NC_014152	ACA	2	6	583328	583333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132115
11602	NC_014152	A	7	7	583366	583372	100 %	0 %	0 %	0 %	296132115
11603	NC_014152	TA	3	6	583467	583472	50 %	50 %	0 %	0 %	296132115
11604	NC_014152	TA	3	6	583552	583557	50 %	50 %	0 %	0 %	296132115
11605	NC_014152	AAG	2	6	583612	583617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132115
11606	NC_014152	A	6	6	583705	583710	100 %	0 %	0 %	0 %	296132115
11607	NC_014152	ATC	2	6	583743	583748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132115
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11610	NC_014152	A	6	6	583946	583951	100 %	0 %	0 %	0 %	296132115
11611	NC_014152	A	6	6	584050	584055	100 %	0 %	0 %	0 %	296132115
11612	NC_014152	A	7	7	584104	584110	100 %	0 %	0 %	0 %	296132115
11613	NC_014152	TAAA	2	8	584152	584159	75 %	25 %	0 %	0 %	296132115
11614	NC_014152	A	6	6	584204	584209	100 %	0 %	0 %	0 %	296132115
11615	NC_014152	TTA	2	6	584219	584224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132115
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11619	NC_014152	TAA	2	6	584403	584408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132116
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11621	NC_014152	ATC	2	6	584572	584577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132116
11622	NC_014152	CCAT	2	8	584799	584806	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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11624	NC_014152	AAG	2	6	584906	584911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11853	NC_014152	AAGC	2	8	596052	596059	50 %	0 %	25 %	25 %	296132124
11854	NC_014152	A	7	7	596087	596093	100 %	0 %	0 %	0 %	296132124
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11859	NC_014152	AGAT	2	8	596351	596358	50 %	25 %	25 %	0 %	296132124
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11862	NC_014152	ATA	2	6	596435	596440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132125
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11991	NC_014152	GGC	2	6	603954	603959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132134
11992	NC_014152	ATC	2	6	603972	603977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132134
11993	NC_014152	GCC	2	6	603984	603989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132134
11994	NC_014152	CGA	2	6	604049	604054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132134
11995	NC_014152	GCC	2	6	604149	604154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132134
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11998	NC_014152	A	6	6	604266	604271	100 %	0 %	0 %	0 %	296132134
11999	NC_014152	AGC	2	6	604296	604301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132134
12000	NC_014152	CAG	2	6	604373	604378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132134

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