MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 62102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_014152	GAA	2	6	555644	555649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132085
11002	NC_014152	TGC	2	6	555661	555666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132085
11003	NC_014152	GAT	2	6	555673	555678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132085
11004	NC_014152	GCC	2	6	555695	555700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132085
11005	NC_014152	TTCCCG	2	12	555721	555732	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	296132085
11006	NC_014152	GC	3	6	555758	555763	0 %	0 %	50 %	50 %	296132085
11007	NC_014152	GAT	2	6	555823	555828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132085
11008	NC_014152	CCAC	2	8	555909	555916	25 %	0 %	0 %	75 %	296132085
11009	NC_014152	CAT	2	6	555984	555989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11010	NC_014152	A	6	6	556005	556010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_014152	TCCCT	2	10	556011	556020	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
11012	NC_014152	T	7	7	556035	556041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_014152	AAC	2	6	556062	556067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11014	NC_014152	A	6	6	556089	556094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_014152	AAT	2	6	556098	556103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_014152	AAT	2	6	556130	556135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_014152	GAA	2	6	556193	556198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_014152	AAC	2	6	556211	556216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132086
11019	NC_014152	A	7	7	556227	556233	100 %	0 %	0 %	0 %	296132086
11020	NC_014152	CCT	2	6	556277	556282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296132086
11021	NC_014152	TAT	2	6	556385	556390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132086
11022	NC_014152	GCCTG	2	10	556396	556405	0 %	20 %	40 %	40 %	296132086
11023	NC_014152	AATT	2	8	556448	556455	50 %	50 %	0 %	0 %	296132086
11024	NC_014152	AGC	2	6	556495	556500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132086
11025	NC_014152	AGC	2	6	556628	556633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132086
11026	NC_014152	ACT	2	6	556634	556639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132086
11027	NC_014152	GCG	2	6	556669	556674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132086
11028	NC_014152	GAG	2	6	556732	556737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296132086
11029	NC_014152	TA	3	6	556780	556785	50 %	50 %	0 %	0 %	296132086
11030	NC_014152	GAA	2	6	556786	556791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132086
11031	NC_014152	A	6	6	556790	556795	100 %	0 %	0 %	0 %	296132086
11032	NC_014152	AGC	2	6	556805	556810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132086
11033	NC_014152	TGA	2	6	556815	556820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132086
11034	NC_014152	GA	4	8	556885	556892	50 %	0 %	50 %	0 %	296132086
11035	NC_014152	AAAG	2	8	557028	557035	75 %	0 %	25 %	0 %	296132086
11036	NC_014152	TGA	2	6	557055	557060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132086
11037	NC_014152	G	6	6	557079	557084	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11038	NC_014152	ATG	2	6	557156	557161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_014152	AAC	2	6	557174	557179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11040	NC_014152	AGG	2	6	557187	557192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_014152	ATT	2	6	557212	557217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_014152	G	6	6	557250	557255	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11043	NC_014152	CGT	2	6	557283	557288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11044	NC_014152	AGG	2	6	557314	557319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_014152	AAATT	2	10	557555	557564	60 %	40 %	0 %	0 %	296132087
11046	NC_014152	AAT	2	6	557577	557582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132087
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11049	NC_014152	A	6	6	557729	557734	100 %	0 %	0 %	0 %	296132088
11050	NC_014152	TA	3	6	557759	557764	50 %	50 %	0 %	0 %	296132088
11051	NC_014152	GGCA	2	8	557932	557939	25 %	0 %	50 %	25 %	296132088
11052	NC_014152	TTA	2	6	557941	557946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132088
11053	NC_014152	GGA	2	6	558016	558021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296132088
11054	NC_014152	TTA	2	6	558042	558047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132088
11055	NC_014152	A	7	7	558060	558066	100 %	0 %	0 %	0 %	296132088
11056	NC_014152	TTA	2	6	558110	558115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132088
11057	NC_014152	A	7	7	558146	558152	100 %	0 %	0 %	0 %	296132088
11058	NC_014152	TAA	2	6	558189	558194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132088
11059	NC_014152	CA	3	6	558214	558219	50 %	0 %	0 %	50 %	296132088
11060	NC_014152	AGG	2	6	558246	558251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296132088
11061	NC_014152	ACT	2	6	558257	558262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132088
11062	NC_014152	AAT	2	6	558330	558335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_014152	AAT	2	6	558462	558467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_014152	T	7	7	558510	558516	0 %	100 %	0 %	0 %	296132089
11065	NC_014152	ATTT	2	8	558517	558524	25 %	75 %	0 %	0 %	296132089
11066	NC_014152	ATA	2	6	558545	558550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132089
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11070	NC_014152	CTA	2	6	558641	558646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132089
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11072	NC_014152	GCT	2	6	558710	558715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132089
11073	NC_014152	ATA	2	6	558822	558827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132089
11074	NC_014152	ATAA	2	8	558857	558864	75 %	25 %	0 %	0 %	296132089
11075	NC_014152	TGA	2	6	558865	558870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132089
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11077	NC_014152	TA	3	6	558925	558930	50 %	50 %	0 %	0 %	296132089
11078	NC_014152	TA	3	6	558991	558996	50 %	50 %	0 %	0 %	296132089
11079	NC_014152	ATAC	2	8	559015	559022	50 %	25 %	0 %	25 %	296132089
11080	NC_014152	A	6	6	559030	559035	100 %	0 %	0 %	0 %	296132089
11081	NC_014152	GAT	2	6	559061	559066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132089
11082	NC_014152	T	7	7	559066	559072	0 %	100 %	0 %	0 %	296132089
11083	NC_014152	TG	3	6	559122	559127	0 %	50 %	50 %	0 %	296132089
11084	NC_014152	A	6	6	559138	559143	100 %	0 %	0 %	0 %	296132089
11085	NC_014152	A	7	7	559146	559152	100 %	0 %	0 %	0 %	296132089
11086	NC_014152	TGT	2	6	559157	559162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132089
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11088	NC_014152	GGC	2	6	559180	559185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11089	NC_014152	GGT	2	6	559264	559269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11090	NC_014152	CAC	2	6	559506	559511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296132090
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11094	NC_014152	TCG	2	6	559738	559743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132090
11095	NC_014152	AAC	2	6	559746	559751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132090
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11097	NC_014152	GATA	2	8	560053	560060	50 %	25 %	25 %	0 %	296132090
11098	NC_014152	T	6	6	560223	560228	0 %	100 %	0 %	0 %	296132091
11099	NC_014152	CGG	2	6	560258	560263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132091
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11101	NC_014152	GAT	2	6	560299	560304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132091
11102	NC_014152	AAACC	2	10	560354	560363	60 %	0 %	0 %	40 %	296132091
11103	NC_014152	CAG	2	6	560460	560465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132091
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11105	NC_014152	GTT	2	6	560549	560554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132091
11106	NC_014152	GGA	2	6	560582	560587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296132091
11107	NC_014152	CCAG	2	8	560614	560621	25 %	0 %	25 %	50 %	296132091
11108	NC_014152	AGA	2	6	560626	560631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132091
11109	NC_014152	AGT	2	6	560651	560656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132091
11110	NC_014152	GGGCTT	2	12	560677	560688	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	296132091
11111	NC_014152	CGGA	2	8	560690	560697	25 %	0 %	50 %	25 %	296132091
11112	NC_014152	A	6	6	560718	560723	100 %	0 %	0 %	0 %	296132091
11113	NC_014152	TCC	2	6	560889	560894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296132091
11114	NC_014152	TCA	2	6	560910	560915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132091
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11116	NC_014152	T	6	6	560981	560986	0 %	100 %	0 %	0 %	296132091
11117	NC_014152	CCG	2	6	561071	561076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132091
11118	NC_014152	CTT	2	6	561112	561117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132091
11119	NC_014152	GTG	2	6	561135	561140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132091
11120	NC_014152	CTT	2	6	561204	561209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132091
11121	NC_014152	CTT	2	6	561221	561226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132091
11122	NC_014152	TTC	2	6	561506	561511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132091
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11124	NC_014152	CGG	2	6	561767	561772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132092
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11232	NC_014152	T	6	6	566579	566584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11235	NC_014152	A	6	6	566670	566675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11236	NC_014152	AAT	2	6	566679	566684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11237	NC_014152	AAT	2	6	566711	566716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11238	NC_014152	GAA	2	6	566774	566779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11245	NC_014152	AGC	2	6	567076	567081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132098
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11247	NC_014152	ACT	2	6	567215	567220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132098
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11499	NC_014152	GCG	2	6	578598	578603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132108
11500	NC_014152	GTGGCT	2	12	578676	578687	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	296132108

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