MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 62102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_014152	CAA	2	6	503607	503612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132037
10003	NC_014152	ATA	2	6	503615	503620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132037
10004	NC_014152	GTA	2	6	503625	503630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132037
10005	NC_014152	ATT	2	6	503662	503667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132038
10006	NC_014152	ATC	2	6	503669	503674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132038
10007	NC_014152	GAT	2	6	503725	503730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132038
10008	NC_014152	GCA	2	6	503745	503750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132038
10009	NC_014152	AATT	2	8	503787	503794	50 %	50 %	0 %	0 %	296132038
10010	NC_014152	ATC	2	6	503822	503827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132038
10011	NC_014152	TAT	2	6	504004	504009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132038
10012	NC_014152	GAT	2	6	504031	504036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132038
10013	NC_014152	C	6	6	504068	504073	0 %	0 %	0 %	100 %	296132038
10014	NC_014152	AAG	2	6	504081	504086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132038
10015	NC_014152	GCG	2	6	504243	504248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132038
10016	NC_014152	AT	3	6	504263	504268	50 %	50 %	0 %	0 %	296132038
10017	NC_014152	CAG	2	6	504269	504274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132038
10018	NC_014152	TGC	2	6	504304	504309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132038
10019	NC_014152	TAA	2	6	504324	504329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132038
10020	NC_014152	TTG	2	6	504339	504344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132038
10021	NC_014152	GAAAA	2	10	504368	504377	80 %	0 %	20 %	0 %	296132038
10022	NC_014152	ATC	2	6	504426	504431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132039
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10024	NC_014152	GCA	2	6	504469	504474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132039
10025	NC_014152	AAGT	2	8	504495	504502	50 %	25 %	25 %	0 %	296132039
10026	NC_014152	TGA	2	6	504511	504516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132039
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10028	NC_014152	CCGGA	2	10	504647	504656	20 %	0 %	40 %	40 %	296132039
10029	NC_014152	TAAA	2	8	504732	504739	75 %	25 %	0 %	0 %	296132039
10030	NC_014152	GGC	2	6	504769	504774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132039
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10033	NC_014152	CAGA	2	8	504947	504954	50 %	0 %	25 %	25 %	296132039
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10039	NC_014152	A	7	7	505073	505079	100 %	0 %	0 %	0 %	296132039
10040	NC_014152	TTA	2	6	505080	505085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132039
10041	NC_014152	CCAA	2	8	505086	505093	50 %	0 %	0 %	50 %	296132039
10042	NC_014152	CTG	2	6	505157	505162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132039
10043	NC_014152	CAT	2	6	505174	505179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132039
10044	NC_014152	CCAT	2	8	505257	505264	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10045	NC_014152	TAA	2	6	505314	505319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_014152	TTTG	2	8	505338	505345	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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10052	NC_014152	AAT	2	6	505639	505644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132040
10053	NC_014152	TGC	2	6	505677	505682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132040
10054	NC_014152	CAT	2	6	505742	505747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132040
10055	NC_014152	TTA	2	6	505766	505771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132040
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10057	NC_014152	TGA	3	9	505855	505863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132040
10058	NC_014152	GAA	2	6	505922	505927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132040
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10060	NC_014152	GTG	2	6	506027	506032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132040
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10064	NC_014152	TGA	2	6	506200	506205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132040
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10088	NC_014152	GCC	2	6	507150	507155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132043
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10094	NC_014152	CCGG	2	8	507407	507414	0 %	0 %	50 %	50 %	296132043
10095	NC_014152	TGACC	2	10	507418	507427	20 %	20 %	20 %	40 %	296132043
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10100	NC_014152	TACAA	2	10	507567	507576	60 %	20 %	0 %	20 %	296132043
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10102	NC_014152	T	6	6	507775	507780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_014152	CAA	2	6	507806	507811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10104	NC_014152	TAA	2	6	507881	507886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_014152	ATT	2	6	507889	507894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_014152	AAT	2	6	507941	507946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_014152	AGAA	2	8	507973	507980	75 %	0 %	25 %	0 %	296132044
10108	NC_014152	AGG	2	6	508017	508022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296132044
10109	NC_014152	TTAC	2	8	508029	508036	25 %	50 %	0 %	25 %	296132044
10110	NC_014152	GCA	2	6	508084	508089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132044
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10117	NC_014152	A	6	6	508605	508610	100 %	0 %	0 %	0 %	296132044
10118	NC_014152	ATT	2	6	508658	508663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132044
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10120	NC_014152	TTGT	2	8	508787	508794	0 %	75 %	25 %	0 %	296132044
10121	NC_014152	G	6	6	508893	508898	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_014152	GTT	2	6	508951	508956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132045
10123	NC_014152	AGT	2	6	509184	509189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132045
10124	NC_014152	GCA	2	6	509275	509280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132045
10125	NC_014152	AG	3	6	509349	509354	50 %	0 %	50 %	0 %	296132045
10126	NC_014152	A	7	7	509398	509404	100 %	0 %	0 %	0 %	296132045
10127	NC_014152	GTAG	2	8	509419	509426	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_014152	A	6	6	509428	509433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_014152	ATT	2	6	509443	509448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10130	NC_014152	TCC	2	6	509470	509475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10131	NC_014152	GGA	2	6	509508	509513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10132	NC_014152	AAT	2	6	509535	509540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10133	NC_014152	AACC	2	8	509571	509578	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10134	NC_014152	T	6	6	509607	509612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10135	NC_014152	AATT	2	8	509654	509661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10136	NC_014152	CT	3	6	509676	509681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10137	NC_014152	T	8	8	509698	509705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10138	NC_014152	CT	3	6	509748	509753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10139	NC_014152	TGA	2	6	509790	509795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10141	NC_014152	T	6	6	509875	509880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10142	NC_014152	AGCC	2	8	509962	509969	25 %	0 %	25 %	50 %	296132046
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10153	NC_014152	GAA	2	6	510717	510722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132046
10154	NC_014152	AG	3	6	510803	510808	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10155	NC_014152	GGT	2	6	510873	510878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132047
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10158	NC_014152	A	7	7	510973	510979	100 %	0 %	0 %	0 %	296132047
10159	NC_014152	T	6	6	511043	511048	0 %	100 %	0 %	0 %	296132047
10160	NC_014152	GTTG	2	8	511098	511105	0 %	50 %	50 %	0 %	296132047
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10173	NC_014152	GATA	2	8	511569	511576	50 %	25 %	25 %	0 %	296132047
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10187	NC_014152	TAA	2	6	512116	512121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132047
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10196	NC_014152	G	6	6	512580	512585	0 %	0 %	100 %	0 %	296132049
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10208	NC_014152	T	6	6	513214	513219	0 %	100 %	0 %	0 %	296132049
10209	NC_014152	CTGC	2	8	513231	513238	0 %	25 %	25 %	50 %	296132049
10210	NC_014152	CAG	2	6	513271	513276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132049
10211	NC_014152	CTG	2	6	513312	513317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132049
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10223	NC_014152	TCA	2	6	514109	514114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132049
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10229	NC_014152	GAT	2	6	514346	514351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132049
10230	NC_014152	CAGG	2	8	514353	514360	25 %	0 %	50 %	25 %	296132049
10231	NC_014152	CTG	2	6	514376	514381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132049
10232	NC_014152	GGCC	2	8	514504	514511	0 %	0 %	50 %	50 %	296132049
10233	NC_014152	CTTTG	2	10	514549	514558	0 %	60 %	20 %	20 %	296132049
10234	NC_014152	CTT	2	6	514566	514571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132049
10235	NC_014152	GAT	2	6	514585	514590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132049
10236	NC_014152	CCT	2	6	514636	514641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10237	NC_014152	GTT	2	6	514707	514712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132050
10238	NC_014152	T	6	6	514784	514789	0 %	100 %	0 %	0 %	296132050
10239	NC_014152	GCC	2	6	514907	514912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132050
10240	NC_014152	CG	3	6	515105	515110	0 %	0 %	50 %	50 %	296132050
10241	NC_014152	AAC	2	6	515272	515277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132050
10242	NC_014152	GAT	2	6	515279	515284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132050
10243	NC_014152	CCTGG	2	10	515297	515306	0 %	20 %	40 %	40 %	296132050
10244	NC_014152	AAT	2	6	515366	515371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132050
10245	NC_014152	TCC	2	6	515391	515396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296132050
10246	NC_014152	TGG	3	9	515439	515447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132050
10247	NC_014152	TTC	2	6	515534	515539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132050
10248	NC_014152	GGC	2	6	515548	515553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132050
10249	NC_014152	GCA	2	6	515602	515607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132050
10250	NC_014152	GCA	2	6	515610	515615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132050
10251	NC_014152	TGG	2	6	515749	515754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132050
10252	NC_014152	CTG	2	6	515768	515773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132050
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10260	NC_014152	CAG	2	6	516088	516093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132050
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10263	NC_014152	AATAA	2	10	516311	516320	80 %	20 %	0 %	0 %	296132050
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10268	NC_014152	TCC	2	6	516853	516858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10269	NC_014152	GAA	2	6	516893	516898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132051
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10280	NC_014152	TGAT	2	8	517319	517326	25 %	50 %	25 %	0 %	296132051
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10298	NC_014152	CTA	2	6	518657	518662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10299	NC_014152	GAACA	2	10	518692	518701	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10300	NC_014152	AAG	2	6	518702	518707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10301	NC_014152	GGTGG	2	10	518915	518924	0 %	20 %	80 %	0 %	296132052
10302	NC_014152	GCT	2	6	518927	518932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132052
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10304	NC_014152	TGTT	2	8	519057	519064	0 %	75 %	25 %	0 %	296132052
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10340	NC_014152	ATT	2	6	520585	520590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10341	NC_014152	TAT	2	6	520695	520700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132054
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10349	NC_014152	A	6	6	521049	521054	100 %	0 %	0 %	0 %	296132054
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10352	NC_014152	GAA	2	6	521095	521100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132054
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10361	NC_014152	AGGT	2	8	521802	521809	25 %	25 %	50 %	0 %	296132055
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10365	NC_014152	T	6	6	521931	521936	0 %	100 %	0 %	0 %	296132055
10366	NC_014152	GTT	2	6	521984	521989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132055
10367	NC_014152	GCA	2	6	522010	522015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132055
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10369	NC_014152	ACC	2	6	522071	522076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296132055
10370	NC_014152	GTT	2	6	522172	522177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132055
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10374	NC_014152	CCG	2	6	522301	522306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132055
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10378	NC_014152	GCTG	2	8	522511	522518	0 %	25 %	50 %	25 %	296132055
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10384	NC_014152	TTGG	2	8	522775	522782	0 %	50 %	50 %	0 %	296132056
10385	NC_014152	GTT	2	6	522817	522822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132056
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10388	NC_014152	TGA	2	6	523050	523055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132056
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10405	NC_014152	AGCTT	2	10	523796	523805	20 %	40 %	20 %	20 %	296132056
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10441	NC_014152	TTC	2	6	525578	525583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10451	NC_014152	CAT	2	6	525949	525954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132060
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10454	NC_014152	AGA	2	6	525994	525999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132060
10455	NC_014152	TGC	2	6	526131	526136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132060
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10472	NC_014152	CTGG	2	8	527224	527231	0 %	25 %	50 %	25 %	296132060
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10480	NC_014152	A	6	6	527748	527753	100 %	0 %	0 %	0 %	296132060
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10484	NC_014152	TGA	2	6	527945	527950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132061
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10489	NC_014152	TGC	2	6	528260	528265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132061
10490	NC_014152	CGC	2	6	528346	528351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132061
10491	NC_014152	CTG	2	6	528352	528357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132061
10492	NC_014152	TGG	2	6	528380	528385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132061
10493	NC_014152	GGA	2	6	528429	528434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296132061
10494	NC_014152	GGA	2	6	528495	528500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296132061
10495	NC_014152	GGA	2	6	528558	528563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296132061
10496	NC_014152	GGC	2	6	528639	528644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132061
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