MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 62102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014152	ATG	2	6	270613	270618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131790
5502	NC_014152	GAAA	2	8	270662	270669	75 %	0 %	25 %	0 %	296131790
5503	NC_014152	TCA	2	6	270709	270714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131790
5504	NC_014152	GGA	2	6	270725	270730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131790
5505	NC_014152	TTA	2	6	270759	270764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131790
5506	NC_014152	A	6	6	270795	270800	100 %	0 %	0 %	0 %	296131790
5507	NC_014152	AT	3	6	270808	270813	50 %	50 %	0 %	0 %	296131790
5508	NC_014152	GAA	2	6	271029	271034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131790
5509	NC_014152	AAG	2	6	271081	271086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131790
5510	NC_014152	TAA	2	6	271222	271227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_014152	AG	3	6	271256	271261	50 %	0 %	50 %	0 %	296131791
5512	NC_014152	TAA	2	6	271276	271281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131791
5513	NC_014152	GCC	2	6	271320	271325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296131791
5514	NC_014152	CCGG	2	8	271437	271444	0 %	0 %	50 %	50 %	296131791
5515	NC_014152	T	7	7	271452	271458	0 %	100 %	0 %	0 %	296131791
5516	NC_014152	CCT	2	6	271528	271533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296131791
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5518	NC_014152	TCG	2	6	271602	271607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131791
5519	NC_014152	TCC	2	6	271633	271638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5520	NC_014152	AT	3	6	271761	271766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_014152	TAT	3	9	271783	271791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_014152	AGG	2	6	271820	271825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_014152	TAT	2	6	271880	271885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131792
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5530	NC_014152	TAT	2	6	272329	272334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_014152	AGA	2	6	272377	272382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_014152	TGG	2	6	272387	272392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_014152	TGG	2	6	272409	272414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_014152	ACT	2	6	272418	272423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_014152	T	8	8	272423	272430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_014152	G	6	6	272435	272440	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_014152	A	7	7	272455	272461	100 %	0 %	0 %	0 %	296131793
5538	NC_014152	ATTTTT	2	12	272481	272492	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	296131793
5539	NC_014152	TA	3	6	272516	272521	50 %	50 %	0 %	0 %	296131793
5540	NC_014152	GATT	2	8	272585	272592	25 %	50 %	25 %	0 %	296131793
5541	NC_014152	TAT	2	6	272618	272623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131793
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5543	NC_014152	G	6	6	272709	272714	0 %	0 %	100 %	0 %	296131793
5544	NC_014152	GGTT	2	8	272735	272742	0 %	50 %	50 %	0 %	296131793
5545	NC_014152	TGGGTA	2	12	272782	272793	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	296131793
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5551	NC_014152	ATT	2	6	273232	273237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131793
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5555	NC_014152	TTG	2	6	273419	273424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131793
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5557	NC_014152	AACCA	2	10	273448	273457	60 %	0 %	0 %	40 %	296131793
5558	NC_014152	TG	3	6	273596	273601	0 %	50 %	50 %	0 %	296131794
5559	NC_014152	GCC	2	6	273614	273619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296131794
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5591	NC_014152	ATA	3	9	275427	275435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_014152	TAG	2	6	275440	275445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5595	NC_014152	TA	3	6	275537	275542	50 %	50 %	0 %	0 %	296131797
5596	NC_014152	A	6	6	275542	275547	100 %	0 %	0 %	0 %	296131797
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5603	NC_014152	AGGA	2	8	275837	275844	50 %	0 %	50 %	0 %	296131797
5604	NC_014152	TAA	2	6	275925	275930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_014152	T	7	7	275983	275989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_014152	GTTT	2	8	275990	275997	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_014152	A	6	6	276046	276051	100 %	0 %	0 %	0 %	296131798
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5623	NC_014152	CA	3	6	276896	276901	50 %	0 %	0 %	50 %	296131798
5624	NC_014152	ATG	2	6	276954	276959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131798
5625	NC_014152	GGC	2	6	277005	277010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131798
5626	NC_014152	AGA	2	6	277109	277114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131798
5627	NC_014152	AAG	2	6	277117	277122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131798
5628	NC_014152	GAA	2	6	277133	277138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131798
5629	NC_014152	A	6	6	277215	277220	100 %	0 %	0 %	0 %	296131799
5630	NC_014152	GTGGAA	2	12	277262	277273	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	296131799
5631	NC_014152	GCG	2	6	277389	277394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131799
5632	NC_014152	TCC	2	6	277421	277426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296131799
5633	NC_014152	GAT	2	6	277436	277441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131799
5634	NC_014152	AGGA	2	8	277468	277475	50 %	0 %	50 %	0 %	296131799
5635	NC_014152	ATT	2	6	277728	277733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131799
5636	NC_014152	GGT	2	6	277784	277789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131799
5637	NC_014152	CCAGT	2	10	277801	277810	20 %	20 %	20 %	40 %	296131799
5638	NC_014152	ATT	2	6	277811	277816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131799
5639	NC_014152	AGG	2	6	277819	277824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131799
5640	NC_014152	GTTG	2	8	277849	277856	0 %	50 %	50 %	0 %	296131799
5641	NC_014152	GTTCC	2	10	277861	277870	0 %	40 %	20 %	40 %	296131799
5642	NC_014152	TAC	2	6	277907	277912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131799
5643	NC_014152	GGT	2	6	278000	278005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131799
5644	NC_014152	TCA	2	6	278205	278210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131799
5645	NC_014152	ATG	2	6	278261	278266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131799
5646	NC_014152	TGC	2	6	278338	278343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131799
5647	NC_014152	TGCT	2	8	278364	278371	0 %	50 %	25 %	25 %	296131799
5648	NC_014152	AAG	2	6	278534	278539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131799
5649	NC_014152	TGG	2	6	278556	278561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131799
5650	NC_014152	ATA	2	6	278592	278597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131799
5651	NC_014152	GAG	2	6	278618	278623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131799
5652	NC_014152	GAA	2	6	278653	278658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131799
5653	NC_014152	CA	3	6	278808	278813	50 %	0 %	0 %	50 %	296131800
5654	NC_014152	CGG	2	6	278890	278895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131800
5655	NC_014152	AT	3	6	278896	278901	50 %	50 %	0 %	0 %	296131800
5656	NC_014152	AT	3	6	278966	278971	50 %	50 %	0 %	0 %	296131800
5657	NC_014152	TAT	2	6	279010	279015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131800
5658	NC_014152	TAC	2	6	279056	279061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131800
5659	NC_014152	A	6	6	279108	279113	100 %	0 %	0 %	0 %	296131800
5660	NC_014152	GTT	2	6	279128	279133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131800
5661	NC_014152	CAT	2	6	279139	279144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131800
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5664	NC_014152	G	6	6	279211	279216	0 %	0 %	100 %	0 %	296131800
5665	NC_014152	ATG	2	6	279248	279253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131800
5666	NC_014152	TGC	2	6	279310	279315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131800
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5669	NC_014152	GTT	2	6	279378	279383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131801
5670	NC_014152	GGGT	2	8	279418	279425	0 %	25 %	75 %	0 %	296131801
5671	NC_014152	ATTG	2	8	279515	279522	25 %	50 %	25 %	0 %	296131801
5672	NC_014152	TGC	2	6	279664	279669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131801
5673	NC_014152	ATT	2	6	279708	279713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131801
5674	NC_014152	A	6	6	279811	279816	100 %	0 %	0 %	0 %	296131801
5675	NC_014152	CAA	2	6	279818	279823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131801
5676	NC_014152	T	7	7	279937	279943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5677	NC_014152	GTGG	2	8	279952	279959	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5678	NC_014152	ATTTT	2	10	279974	279983	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5679	NC_014152	T	6	6	279999	280004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5680	NC_014152	AGC	2	6	280139	280144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131802
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5682	NC_014152	AAC	2	6	280328	280333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131802
5683	NC_014152	A	6	6	280391	280396	100 %	0 %	0 %	0 %	296131802
5684	NC_014152	GAA	2	6	280492	280497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131802
5685	NC_014152	AAAT	2	8	280503	280510	75 %	25 %	0 %	0 %	296131802
5686	NC_014152	TGG	2	6	280523	280528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131802
5687	NC_014152	TAC	2	6	280581	280586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131802
5688	NC_014152	A	6	6	280667	280672	100 %	0 %	0 %	0 %	296131802
5689	NC_014152	AT	3	6	280693	280698	50 %	50 %	0 %	0 %	296131802
5690	NC_014152	AGG	2	6	280717	280722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131802
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5696	NC_014152	GAACG	2	10	280874	280883	40 %	0 %	40 %	20 %	296131803
5697	NC_014152	TAC	2	6	280922	280927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131803
5698	NC_014152	ACC	2	6	280993	280998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296131803
5699	NC_014152	TCAG	2	8	281014	281021	25 %	25 %	25 %	25 %	296131803
5700	NC_014152	GGT	2	6	281336	281341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131803
5701	NC_014152	CAGG	2	8	281441	281448	25 %	0 %	50 %	25 %	296131803
5702	NC_014152	CAG	2	6	281460	281465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131803
5703	NC_014152	CCGA	2	8	281483	281490	25 %	0 %	25 %	50 %	296131803
5704	NC_014152	CTG	2	6	281502	281507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131803
5705	NC_014152	TGA	2	6	281527	281532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131803
5706	NC_014152	CCA	2	6	281590	281595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296131803
5707	NC_014152	GGC	2	6	281711	281716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131803
5708	NC_014152	A	6	6	281839	281844	100 %	0 %	0 %	0 %	296131803
5709	NC_014152	CAG	2	6	281845	281850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131803
5710	NC_014152	GCACA	2	10	281885	281894	40 %	0 %	20 %	40 %	296131803
5711	NC_014152	TGA	2	6	281899	281904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131803
5712	NC_014152	GAA	2	6	282057	282062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131803
5713	NC_014152	GCT	2	6	282065	282070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131803
5714	NC_014152	G	6	6	282159	282164	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5715	NC_014152	ATA	2	6	282213	282218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131804
5716	NC_014152	TGA	2	6	282404	282409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131804
5717	NC_014152	GCT	2	6	282413	282418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131804
5718	NC_014152	A	6	6	282423	282428	100 %	0 %	0 %	0 %	296131804
5719	NC_014152	AAGG	2	8	282747	282754	50 %	0 %	50 %	0 %	296131804
5720	NC_014152	TTG	2	6	282834	282839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131804
5721	NC_014152	TGC	2	6	282866	282871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131804
5722	NC_014152	GGCCAA	2	12	282872	282883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131804
5723	NC_014152	AAG	2	6	282910	282915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131804
5724	NC_014152	GCA	2	6	282954	282959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131804
5725	NC_014152	CCA	2	6	283021	283026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296131804
5726	NC_014152	TGA	2	6	283034	283039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131804
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5728	NC_014152	TGC	2	6	283175	283180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131804
5729	NC_014152	TTG	2	6	283328	283333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131805
5730	NC_014152	GAA	2	6	283346	283351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131805
5731	NC_014152	GGC	2	6	283397	283402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131805
5732	NC_014152	GAA	2	6	283568	283573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131805
5733	NC_014152	AGC	2	6	283650	283655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131805
5734	NC_014152	ATC	2	6	283697	283702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131805
5735	NC_014152	A	6	6	283806	283811	100 %	0 %	0 %	0 %	296131805
5736	NC_014152	CTT	2	6	283877	283882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131805
5737	NC_014152	TTA	2	6	283919	283924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131805
5738	NC_014152	A	7	7	283950	283956	100 %	0 %	0 %	0 %	296131805
5739	NC_014152	CA	3	6	283971	283976	50 %	0 %	0 %	50 %	296131805
5740	NC_014152	AT	3	6	283999	284004	50 %	50 %	0 %	0 %	296131805
5741	NC_014152	CGTA	2	8	284022	284029	25 %	25 %	25 %	25 %	296131805
5742	NC_014152	ATTA	2	8	284033	284040	50 %	50 %	0 %	0 %	296131805
5743	NC_014152	TGGGTT	2	12	284077	284088	0 %	50 %	50 %	0 %	296131805
5744	NC_014152	GT	3	6	284103	284108	0 %	50 %	50 %	0 %	296131805
5745	NC_014152	TGG	2	6	284148	284153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131805
5746	NC_014152	GTA	2	6	284405	284410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131805
5747	NC_014152	A	6	6	284452	284457	100 %	0 %	0 %	0 %	296131805
5748	NC_014152	CGGC	2	8	284596	284603	0 %	0 %	50 %	50 %	296131806
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5863	NC_014152	TA	3	6	290106	290111	50 %	50 %	0 %	0 %	296131809
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5865	NC_014152	A	6	6	290294	290299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5867	NC_014152	AGT	2	6	290336	290341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5869	NC_014152	TCAGG	2	10	290396	290405	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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5872	NC_014152	A	6	6	290620	290625	100 %	0 %	0 %	0 %	296131810
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