MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 62102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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55502	NC_014152	AT	3	6	2820017	2820022	50 %	50 %	0 %	0 %	296134201
55503	NC_014152	TGC	2	6	2820071	2820076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134201
55504	NC_014152	CAG	2	6	2820080	2820085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134201
55505	NC_014152	AAT	2	6	2820089	2820094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296134201
55506	NC_014152	CGC	2	6	2820155	2820160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134201
55507	NC_014152	CTT	2	6	2820272	2820277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134201
55508	NC_014152	GCA	2	6	2820299	2820304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134201
55509	NC_014152	ATG	2	6	2820334	2820339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134201
55510	NC_014152	TATTG	2	10	2820345	2820354	20 %	60 %	20 %	0 %	296134201
55511	NC_014152	GCC	2	6	2820381	2820386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134201
55512	NC_014152	AGT	2	6	2820456	2820461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134201
55513	NC_014152	T	6	6	2820538	2820543	0 %	100 %	0 %	0 %	296134201
55514	NC_014152	GAT	2	6	2820576	2820581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134201
55515	NC_014152	T	6	6	2820586	2820591	0 %	100 %	0 %	0 %	296134201
55516	NC_014152	TTC	2	6	2820615	2820620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134201
55517	NC_014152	T	6	6	2820643	2820648	0 %	100 %	0 %	0 %	296134201
55518	NC_014152	CAA	2	6	2820720	2820725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134201
55519	NC_014152	ATG	2	6	2820783	2820788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134201
55520	NC_014152	AAT	2	6	2820834	2820839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296134201
55521	NC_014152	TCT	2	6	2820881	2820886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134201
55522	NC_014152	GAT	2	6	2820897	2820902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134201
55523	NC_014152	T	6	6	2820945	2820950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55524	NC_014152	AAT	2	6	2821059	2821064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55525	NC_014152	CGG	2	6	2821164	2821169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134202
55526	NC_014152	ATC	2	6	2821248	2821253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134202
55527	NC_014152	T	7	7	2821265	2821271	0 %	100 %	0 %	0 %	296134202
55528	NC_014152	A	6	6	2821322	2821327	100 %	0 %	0 %	0 %	296134202
55529	NC_014152	TTCAA	2	10	2821332	2821341	40 %	40 %	0 %	20 %	296134202
55530	NC_014152	TTG	2	6	2821368	2821373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296134202
55531	NC_014152	GCC	2	6	2821447	2821452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134202
55532	NC_014152	CCA	2	6	2821486	2821491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134202
55533	NC_014152	GCT	2	6	2821587	2821592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134202
55534	NC_014152	T	6	6	2821605	2821610	0 %	100 %	0 %	0 %	296134202
55535	NC_014152	AACC	2	8	2821637	2821644	50 %	0 %	0 %	50 %	296134202
55536	NC_014152	CAG	2	6	2821651	2821656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134202
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55538	NC_014152	CAT	2	6	2821726	2821731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134202
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55542	NC_014152	GCC	2	6	2822031	2822036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134202
55543	NC_014152	TCA	2	6	2822067	2822072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134202
55544	NC_014152	TCAG	2	8	2822121	2822128	25 %	25 %	25 %	25 %	296134202
55545	NC_014152	TGTAG	2	10	2822154	2822163	20 %	40 %	40 %	0 %	296134202
55546	NC_014152	AT	3	6	2822176	2822181	50 %	50 %	0 %	0 %	296134202
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55550	NC_014152	GGT	2	6	2822216	2822221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134202
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55552	NC_014152	CTT	2	6	2822314	2822319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134202
55553	NC_014152	AT	3	6	2822358	2822363	50 %	50 %	0 %	0 %	296134202
55554	NC_014152	CAGC	2	8	2822365	2822372	25 %	0 %	25 %	50 %	296134202
55555	NC_014152	GGA	2	6	2822389	2822394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296134202
55556	NC_014152	TCA	2	6	2822422	2822427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134202
55557	NC_014152	T	6	6	2822527	2822532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55558	NC_014152	TTTA	2	8	2822538	2822545	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55559	NC_014152	TTG	2	6	2822575	2822580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55560	NC_014152	TTTTA	2	10	2822617	2822626	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55561	NC_014152	T	6	6	2822629	2822634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55562	NC_014152	T	8	8	2822645	2822652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55563	NC_014152	ATG	2	6	2822801	2822806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134203
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55565	NC_014152	T	6	6	2822927	2822932	0 %	100 %	0 %	0 %	296134203
55566	NC_014152	CCTCTA	2	12	2822949	2822960	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	296134203
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55568	NC_014152	AGTA	2	8	2823118	2823125	50 %	25 %	25 %	0 %	296134203
55569	NC_014152	CAG	2	6	2823262	2823267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134203
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55571	NC_014152	GCT	2	6	2823392	2823397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134203
55572	NC_014152	CAAAA	2	10	2823451	2823460	80 %	0 %	0 %	20 %	296134203
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55575	NC_014152	CGA	2	6	2823711	2823716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134204
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55589	NC_014152	TGGTAG	2	12	2824591	2824602	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	296134204
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55591	NC_014152	TTTC	2	8	2824656	2824663	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55592	NC_014152	ATGT	2	8	2824695	2824702	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55593	NC_014152	AGCC	2	8	2824768	2824775	25 %	0 %	25 %	50 %	296134205
55594	NC_014152	T	6	6	2825023	2825028	0 %	100 %	0 %	0 %	296134205
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55599	NC_014152	CCG	2	6	2825317	2825322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55600	NC_014152	T	7	7	2825328	2825334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55601	NC_014152	TTC	2	6	2825388	2825393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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55610	NC_014152	AAG	2	6	2825752	2825757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296134206
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55615	NC_014152	TCTG	2	8	2826334	2826341	0 %	50 %	25 %	25 %	296134206
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55619	NC_014152	T	6	6	2826463	2826468	0 %	100 %	0 %	0 %	296134206
55620	NC_014152	GCA	2	6	2826477	2826482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134206
55621	NC_014152	AG	3	6	2826487	2826492	50 %	0 %	50 %	0 %	296134206
55622	NC_014152	CTG	2	6	2826648	2826653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134206
55623	NC_014152	GTCAGT	2	12	2826758	2826769	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	296134206
55624	NC_014152	GAA	2	6	2826873	2826878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296134207
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55626	NC_014152	TTG	2	6	2826945	2826950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296134207
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55628	NC_014152	CCTT	2	8	2827014	2827021	0 %	50 %	0 %	50 %	296134207
55629	NC_014152	CTT	2	6	2827062	2827067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134207
55630	NC_014152	ATC	2	6	2827118	2827123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134207
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55636	NC_014152	GGCCC	2	10	2827337	2827346	0 %	0 %	40 %	60 %	296134207
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55638	NC_014152	TTTC	2	8	2827365	2827372	0 %	75 %	0 %	25 %	296134207
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55641	NC_014152	TATTT	2	10	2827571	2827580	20 %	80 %	0 %	0 %	296134207
55642	NC_014152	G	6	6	2827631	2827636	0 %	0 %	100 %	0 %	296134207
55643	NC_014152	TCC	2	6	2827665	2827670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296134207
55644	NC_014152	CTTT	2	8	2827754	2827761	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55645	NC_014152	TTA	2	6	2827803	2827808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296134208
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55650	NC_014152	TGTT	2	8	2827957	2827964	0 %	75 %	25 %	0 %	296134208
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55654	NC_014152	CAAA	2	8	2828206	2828213	75 %	0 %	0 %	25 %	296134208
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55659	NC_014152	A	6	6	2828526	2828531	100 %	0 %	0 %	0 %	296134208
55660	NC_014152	TAT	2	6	2828553	2828558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55703	NC_014152	ATA	2	6	2830566	2830571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296134211
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55726	NC_014152	ATTA	2	8	2831568	2831575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55727	NC_014152	CT	4	8	2831603	2831610	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55728	NC_014152	AG	3	6	2831640	2831645	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55729	NC_014152	TTA	2	6	2831682	2831687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55731	NC_014152	TTAA	2	8	2831796	2831803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55732	NC_014152	TCT	2	6	2831847	2831852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134212
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55738	NC_014152	TGG	2	6	2832087	2832092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134212
55739	NC_014152	GGC	2	6	2832095	2832100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134212
55740	NC_014152	GCC	2	6	2832187	2832192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134212
55741	NC_014152	CAC	2	6	2832206	2832211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134212
55742	NC_014152	TTGG	2	8	2832266	2832273	0 %	50 %	50 %	0 %	296134212
55743	NC_014152	CTC	2	6	2832329	2832334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296134212
55744	NC_014152	TAA	2	6	2832419	2832424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296134212
55745	NC_014152	TCCA	2	8	2832516	2832523	25 %	25 %	0 %	50 %	296134212
55746	NC_014152	TTCC	2	8	2832535	2832542	0 %	50 %	0 %	50 %	296134212
55747	NC_014152	CGT	2	6	2832562	2832567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134212
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55749	NC_014152	A	6	6	2832692	2832697	100 %	0 %	0 %	0 %	296134212
55750	NC_014152	AAT	2	6	2832902	2832907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296134212
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55752	NC_014152	GGC	2	6	2832968	2832973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134212
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55763	NC_014152	GCA	2	6	2833588	2833593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134212
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55768	NC_014152	TCC	2	6	2833799	2833804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296134213
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55773	NC_014152	GCCA	2	8	2834003	2834010	25 %	0 %	25 %	50 %	296134213
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55780	NC_014152	T	8	8	2834323	2834330	0 %	100 %	0 %	0 %	296134213
55781	NC_014152	C	6	6	2834446	2834451	0 %	0 %	0 %	100 %	296134213
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55785	NC_014152	CCAG	2	8	2834674	2834681	25 %	0 %	25 %	50 %	296134213
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55802	NC_014152	CAT	2	6	2835306	2835311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134213
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55810	NC_014152	ACC	2	6	2835744	2835749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55811	NC_014152	AGG	2	6	2835848	2835853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296134214
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55827	NC_014152	GTCA	2	8	2836728	2836735	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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55842	NC_014152	AATT	2	8	2837551	2837558	50 %	50 %	0 %	0 %	296134215
55843	NC_014152	GA	3	6	2837612	2837617	50 %	0 %	50 %	0 %	296134216
55844	NC_014152	AAC	2	6	2837636	2837641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134216
55845	NC_014152	AG	3	6	2837642	2837647	50 %	0 %	50 %	0 %	296134216
55846	NC_014152	GCG	2	6	2837657	2837662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134216
55847	NC_014152	ACG	2	6	2837693	2837698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134216
55848	NC_014152	TAAGG	2	10	2837746	2837755	40 %	20 %	40 %	0 %	296134216
55849	NC_014152	TGA	2	6	2837793	2837798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134216
55850	NC_014152	GCC	2	6	2837825	2837830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134216
55851	NC_014152	TAA	2	6	2837883	2837888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296134216
55852	NC_014152	TA	3	6	2837956	2837961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55853	NC_014152	T	7	7	2838024	2838030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55854	NC_014152	ATT	2	6	2838113	2838118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296134217
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55856	NC_014152	ACCT	2	8	2838136	2838143	25 %	25 %	0 %	50 %	296134217
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55974	NC_014152	TA	3	6	2843710	2843715	50 %	50 %	0 %	0 %	296134220
55975	NC_014152	CATA	2	8	2843724	2843731	50 %	25 %	0 %	25 %	296134220
55976	NC_014152	CGTT	2	8	2843804	2843811	0 %	50 %	25 %	25 %	296134220
55977	NC_014152	TC	3	6	2843983	2843988	0 %	50 %	0 %	50 %	296134220
55978	NC_014152	TTTC	2	8	2843994	2844001	0 %	75 %	0 %	25 %	296134220
55979	NC_014152	A	6	6	2844052	2844057	100 %	0 %	0 %	0 %	296134220
55980	NC_014152	CGT	2	6	2844090	2844095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134220
55981	NC_014152	TTC	2	6	2844184	2844189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134220
55982	NC_014152	TTC	2	6	2844193	2844198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134220
55983	NC_014152	AGT	2	6	2844214	2844219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134220
55984	NC_014152	GTT	2	6	2844241	2844246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296134220
55985	NC_014152	GCC	2	6	2844410	2844415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134220
55986	NC_014152	GATTTG	2	12	2844479	2844490	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	296134220
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55999	NC_014152	TCT	2	6	2845107	2845112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134220
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