MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 62102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54001	NC_014152	TGT	2	6	2742579	2742584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296134127
54002	NC_014152	TGA	2	6	2742609	2742614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134127
54003	NC_014152	TTG	2	6	2742692	2742697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296134127
54004	NC_014152	CCA	2	6	2742738	2742743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134127
54005	NC_014152	ATTA	2	8	2742853	2742860	50 %	50 %	0 %	0 %	296134127
54006	NC_014152	CTT	2	6	2742897	2742902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134127
54007	NC_014152	GTC	2	6	2742997	2743002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134127
54008	NC_014152	TTTC	2	8	2743025	2743032	0 %	75 %	0 %	25 %	296134127
54009	NC_014152	CTG	2	6	2743061	2743066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134127
54010	NC_014152	TAA	2	6	2743077	2743082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296134127
54011	NC_014152	TAT	2	6	2743089	2743094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296134127
54012	NC_014152	T	6	6	2743271	2743276	0 %	100 %	0 %	0 %	296134127
54013	NC_014152	GGC	2	6	2743318	2743323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134127
54014	NC_014152	CGC	2	6	2743347	2743352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134127
54015	NC_014152	CCT	2	6	2743402	2743407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54016	NC_014152	TTTACA	2	12	2743428	2743439	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54017	NC_014152	CCT	2	6	2743447	2743452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54018	NC_014152	TCA	2	6	2743453	2743458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54019	NC_014152	TAAT	2	8	2743468	2743475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54020	NC_014152	ACC	2	6	2743517	2743522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54021	NC_014152	T	6	6	2743532	2743537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54022	NC_014152	GCT	2	6	2743606	2743611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134128
54023	NC_014152	TGG	2	6	2743614	2743619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134128
54024	NC_014152	ATC	2	6	2743742	2743747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134128
54025	NC_014152	A	6	6	2743766	2743771	100 %	0 %	0 %	0 %	296134128
54026	NC_014152	A	6	6	2743977	2743982	100 %	0 %	0 %	0 %	296134128
54027	NC_014152	CT	3	6	2743993	2743998	0 %	50 %	0 %	50 %	296134128
54028	NC_014152	AAC	2	6	2744165	2744170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134128
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54030	NC_014152	A	8	8	2744197	2744204	100 %	0 %	0 %	0 %	296134128
54031	NC_014152	A	6	6	2744214	2744219	100 %	0 %	0 %	0 %	296134128
54032	NC_014152	AGG	2	6	2744265	2744270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296134128
54033	NC_014152	TGT	3	9	2744315	2744323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296134129
54034	NC_014152	ATA	2	6	2744331	2744336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296134129
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54036	NC_014152	TGA	2	6	2744368	2744373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134129
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54042	NC_014152	A	7	7	2744836	2744842	100 %	0 %	0 %	0 %	296134129
54043	NC_014152	CAAA	2	8	2744892	2744899	75 %	0 %	0 %	25 %	296134129
54044	NC_014152	CCA	2	6	2745032	2745037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134129
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54050	NC_014152	GACA	2	8	2745293	2745300	50 %	0 %	25 %	25 %	296134129
54051	NC_014152	GCG	2	6	2745382	2745387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134129
54052	NC_014152	ACC	2	6	2745474	2745479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134129
54053	NC_014152	GTC	2	6	2745512	2745517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134130
54054	NC_014152	ACA	2	6	2745607	2745612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134130
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54056	NC_014152	ATC	2	6	2745783	2745788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134130
54057	NC_014152	ATT	2	6	2745804	2745809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296134130
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54060	NC_014152	AAC	2	6	2745879	2745884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134130
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54062	NC_014152	TCCT	2	8	2746177	2746184	0 %	50 %	0 %	50 %	296134130
54063	NC_014152	TCT	2	6	2746216	2746221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134130
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54067	NC_014152	GGCT	2	8	2746475	2746482	0 %	25 %	50 %	25 %	296134130
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54105	NC_014152	CT	3	6	2748578	2748583	0 %	50 %	0 %	50 %	296134132
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54113	NC_014152	TTTC	2	8	2748872	2748879	0 %	75 %	0 %	25 %	296134132
54114	NC_014152	CATCC	2	10	2748888	2748897	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
54115	NC_014152	TTTGTT	2	12	2748907	2748918	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54116	NC_014152	T	10	10	2748917	2748926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54117	NC_014152	CACT	2	8	2749000	2749007	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54118	NC_014152	A	7	7	2749013	2749019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54119	NC_014152	CTC	2	6	2749079	2749084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54120	NC_014152	T	6	6	2749121	2749126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54121	NC_014152	AT	3	6	2749182	2749187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54122	NC_014152	TATGAT	2	12	2749345	2749356	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	296134133
54123	NC_014152	TTG	2	6	2749623	2749628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296134133
54124	NC_014152	CCTGG	2	10	2749700	2749709	0 %	20 %	40 %	40 %	296134133
54125	NC_014152	GACA	2	8	2749716	2749723	50 %	0 %	25 %	25 %	296134133
54126	NC_014152	TGT	2	6	2749779	2749784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296134133
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54129	NC_014152	GA	3	6	2750064	2750069	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54130	NC_014152	GAA	2	6	2750081	2750086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296134134
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54132	NC_014152	AAG	2	6	2750383	2750388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296134134
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54163	NC_014152	ACC	2	6	2752323	2752328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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54173	NC_014152	T	7	7	2752720	2752726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54174	NC_014152	A	7	7	2752738	2752744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54175	NC_014152	TTATA	2	10	2752768	2752777	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54179	NC_014152	GAAA	2	8	2752827	2752834	75 %	0 %	25 %	0 %	296134137
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54183	NC_014152	ATG	2	6	2753066	2753071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134137
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54187	NC_014152	A	6	6	2753239	2753244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54188	NC_014152	TAAA	2	8	2753257	2753264	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54189	NC_014152	GAA	2	6	2753269	2753274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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54221	NC_014152	CAG	2	6	2755349	2755354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134140
54222	NC_014152	GC	3	6	2755381	2755386	0 %	0 %	50 %	50 %	296134140
54223	NC_014152	CAT	2	6	2755431	2755436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134140
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54225	NC_014152	AT	3	6	2755488	2755493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54226	NC_014152	TTA	2	6	2755495	2755500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54227	NC_014152	ACC	2	6	2755538	2755543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54228	NC_014152	ATA	2	6	2755553	2755558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54229	NC_014152	TCC	2	6	2755616	2755621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54230	NC_014152	A	6	6	2755636	2755641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54231	NC_014152	AAAAAC	2	12	2755653	2755664	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54232	NC_014152	ACT	2	6	2755680	2755685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54233	NC_014152	TTAA	2	8	2755759	2755766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54234	NC_014152	CATG	2	8	2755781	2755788	25 %	25 %	25 %	25 %	296134141
54235	NC_014152	ATTA	2	8	2755803	2755810	50 %	50 %	0 %	0 %	296134141
54236	NC_014152	CT	3	6	2755870	2755875	0 %	50 %	0 %	50 %	296134141
54237	NC_014152	A	8	8	2755877	2755884	100 %	0 %	0 %	0 %	296134141
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54239	NC_014152	ATT	2	6	2755920	2755925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296134141
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54361	NC_014152	TCA	2	6	2762202	2762207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134148
54362	NC_014152	GAT	2	6	2762219	2762224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134148
54363	NC_014152	TGTT	2	8	2762253	2762260	0 %	75 %	25 %	0 %	296134148
54364	NC_014152	TAA	2	6	2762293	2762298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296134148
54365	NC_014152	T	6	6	2762364	2762369	0 %	100 %	0 %	0 %	296134148
54366	NC_014152	AAAGA	2	10	2762392	2762401	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54367	NC_014152	TTA	2	6	2762405	2762410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54413	NC_014152	ATTA	2	8	2764637	2764644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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