MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 62102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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53002	NC_014152	CATC	2	8	2693451	2693458	25 %	25 %	0 %	50 %	296134083
53003	NC_014152	A	6	6	2693461	2693466	100 %	0 %	0 %	0 %	296134083
53004	NC_014152	CCA	2	6	2693550	2693555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134083
53005	NC_014152	AAC	2	6	2693725	2693730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134083
53006	NC_014152	TAA	2	6	2693779	2693784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296134083
53007	NC_014152	TTG	2	6	2693871	2693876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53008	NC_014152	AAG	2	6	2693918	2693923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296134084
53009	NC_014152	AAG	2	6	2693948	2693953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296134084
53010	NC_014152	TTG	2	6	2694006	2694011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296134084
53011	NC_014152	GAA	2	6	2694090	2694095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296134084
53012	NC_014152	T	6	6	2694144	2694149	0 %	100 %	0 %	0 %	296134084
53013	NC_014152	CTC	2	6	2694152	2694157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296134084
53014	NC_014152	GGC	2	6	2694278	2694283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134084
53015	NC_014152	CCT	2	6	2694313	2694318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296134084
53016	NC_014152	GAC	2	6	2694367	2694372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134084
53017	NC_014152	CCG	2	6	2694384	2694389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134084
53018	NC_014152	TTC	2	6	2694464	2694469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134084
53019	NC_014152	TTAT	2	8	2694513	2694520	25 %	75 %	0 %	0 %	296134084
53020	NC_014152	CCGG	2	8	2694552	2694559	0 %	0 %	50 %	50 %	296134084
53021	NC_014152	AATT	2	8	2694587	2694594	50 %	50 %	0 %	0 %	296134084
53022	NC_014152	TGT	2	6	2694603	2694608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296134084
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53024	NC_014152	TTCC	2	8	2694678	2694685	0 %	50 %	0 %	50 %	296134084
53025	NC_014152	TAA	2	6	2694697	2694702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296134084
53026	NC_014152	C	6	6	2694779	2694784	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
53027	NC_014152	TTC	2	6	2694816	2694821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53028	NC_014152	ATT	2	6	2694832	2694837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53029	NC_014152	CCGG	2	8	2694864	2694871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53030	NC_014152	ATTTTA	2	12	2694902	2694913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53031	NC_014152	A	6	6	2694950	2694955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53032	NC_014152	TAA	2	6	2694974	2694979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296134085
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53037	NC_014152	CT	3	6	2695230	2695235	0 %	50 %	0 %	50 %	296134085
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53039	NC_014152	TTA	2	6	2695252	2695257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53040	NC_014152	TAT	2	6	2695270	2695275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53041	NC_014152	A	6	6	2695278	2695283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53042	NC_014152	CCG	2	6	2695306	2695311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53043	NC_014152	TTCA	2	8	2695343	2695350	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53044	NC_014152	TAC	2	6	2695422	2695427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134086
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53053	NC_014152	CAT	2	6	2695941	2695946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134086
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53055	NC_014152	TCA	2	6	2696064	2696069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134086
53056	NC_014152	CCTT	2	8	2696132	2696139	0 %	50 %	0 %	50 %	296134086
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53058	NC_014152	GTAC	2	8	2696190	2696197	25 %	25 %	25 %	25 %	296134086
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53071	NC_014152	AGGA	2	8	2697198	2697205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53072	NC_014152	GA	3	6	2697219	2697224	50 %	0 %	50 %	0 %	296134087
53073	NC_014152	ATGAAA	2	12	2697244	2697255	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	296134087
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53079	NC_014152	ATT	2	6	2697589	2697594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53080	NC_014152	ACC	2	6	2697617	2697622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53081	NC_014152	AGC	2	6	2697631	2697636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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53092	NC_014152	AT	3	6	2698159	2698164	50 %	50 %	0 %	0 %	296134088
53093	NC_014152	CTG	2	6	2698250	2698255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134088
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53121	NC_014152	AAG	2	6	2699709	2699714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296134089
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53151	NC_014152	GGA	2	6	2701579	2701584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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53219	NC_014152	A	6	6	2704638	2704643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53236	NC_014152	TCA	2	6	2705499	2705504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134094
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53353	NC_014152	GCC	2	6	2711076	2711081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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53359	NC_014152	CA	3	6	2711282	2711287	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53360	NC_014152	AT	3	6	2711288	2711293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53361	NC_014152	ATT	2	6	2711301	2711306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53390	NC_014152	T	6	6	2713008	2713013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53478	NC_014152	AATA	2	8	2717848	2717855	75 %	25 %	0 %	0 %	296134105
53479	NC_014152	TTC	2	6	2717858	2717863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134105
53480	NC_014152	TGT	2	6	2717910	2717915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296134105
53481	NC_014152	TTC	2	6	2718007	2718012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134105
53482	NC_014152	CGGC	2	8	2718037	2718044	0 %	0 %	50 %	50 %	296134105
53483	NC_014152	AGTCC	2	10	2718111	2718120	20 %	20 %	20 %	40 %	296134105
53484	NC_014152	TCAT	2	8	2718125	2718132	25 %	50 %	0 %	25 %	296134105
53485	NC_014152	ACTTCC	2	12	2718161	2718172	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	296134105
53486	NC_014152	GTT	2	6	2718224	2718229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53487	NC_014152	T	6	6	2718270	2718275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53488	NC_014152	AAT	2	6	2718288	2718293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53489	NC_014152	AG	4	8	2718298	2718305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53490	NC_014152	CT	4	8	2718311	2718318	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53491	NC_014152	TAT	2	6	2718322	2718327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53492	NC_014152	T	6	6	2718334	2718339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53493	NC_014152	GCA	3	9	2718365	2718373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134106
53494	NC_014152	T	6	6	2718414	2718419	0 %	100 %	0 %	0 %	296134106
53495	NC_014152	GCA	2	6	2718458	2718463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134106
53496	NC_014152	ATG	2	6	2718494	2718499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134106
53497	NC_014152	CAG	2	6	2718513	2718518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134106
53498	NC_014152	GGC	2	6	2718547	2718552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134106
53499	NC_014152	ATA	2	6	2718620	2718625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296134106
53500	NC_014152	AT	3	6	2718669	2718674	50 %	50 %	0 %	0 %	296134106

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