MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 62102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51501	NC_014152	TAT	3	9	2615891	2615899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51502	NC_014152	TAA	2	6	2615909	2615914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51503	NC_014152	A	6	6	2615943	2615948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51504	NC_014152	GCG	2	6	2616012	2616017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134011
51505	NC_014152	T	6	6	2616042	2616047	0 %	100 %	0 %	0 %	296134011
51506	NC_014152	TGA	2	6	2616095	2616100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134011
51507	NC_014152	GTAC	2	8	2616126	2616133	25 %	25 %	25 %	25 %	296134011
51508	NC_014152	CTGC	2	8	2616141	2616148	0 %	25 %	25 %	50 %	296134011
51509	NC_014152	TCT	2	6	2616204	2616209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134012
51510	NC_014152	ACA	2	6	2616245	2616250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134012
51511	NC_014152	CT	3	6	2616267	2616272	0 %	50 %	0 %	50 %	296134012
51512	NC_014152	TCT	2	6	2616284	2616289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134012
51513	NC_014152	TTC	2	6	2616601	2616606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134012
51514	NC_014152	GCA	2	6	2616632	2616637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134012
51515	NC_014152	TA	3	6	2616669	2616674	50 %	50 %	0 %	0 %	296134012
51516	NC_014152	CTTC	2	8	2616719	2616726	0 %	50 %	0 %	50 %	296134012
51517	NC_014152	AT	3	6	2616735	2616740	50 %	50 %	0 %	0 %	296134012
51518	NC_014152	A	6	6	2616782	2616787	100 %	0 %	0 %	0 %	296134012
51519	NC_014152	CAA	2	6	2616867	2616872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134012
51520	NC_014152	GTA	2	6	2616899	2616904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134012
51521	NC_014152	GCC	2	6	2616932	2616937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134012
51522	NC_014152	TTC	2	6	2617030	2617035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134012
51523	NC_014152	ACC	2	6	2617190	2617195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134012
51524	NC_014152	CATG	2	8	2617239	2617246	25 %	25 %	25 %	25 %	296134012
51525	NC_014152	T	6	6	2617247	2617252	0 %	100 %	0 %	0 %	296134012
51526	NC_014152	CCG	2	6	2617253	2617258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134012
51527	NC_014152	CCA	2	6	2617305	2617310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134012
51528	NC_014152	TCA	2	6	2617325	2617330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134012
51529	NC_014152	GCC	2	6	2617348	2617353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134012
51530	NC_014152	CGC	2	6	2617365	2617370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134012
51531	NC_014152	CCT	2	6	2617379	2617384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296134012
51532	NC_014152	CCG	2	6	2617402	2617407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134012
51533	NC_014152	CAA	2	6	2617413	2617418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134012
51534	NC_014152	CAT	2	6	2617471	2617476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134012
51535	NC_014152	CTA	2	6	2617541	2617546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51536	NC_014152	CAA	2	6	2617645	2617650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134013
51537	NC_014152	GCC	2	6	2617707	2617712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134013
51538	NC_014152	CAGC	2	8	2617732	2617739	25 %	0 %	25 %	50 %	296134013
51539	NC_014152	TAT	2	6	2617784	2617789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296134013
51540	NC_014152	AAAATT	2	12	2617797	2617808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296134013
51541	NC_014152	TCC	2	6	2617829	2617834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51542	NC_014152	ATT	2	6	2617855	2617860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296134014
51543	NC_014152	GAT	2	6	2617880	2617885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134014
51544	NC_014152	AAT	2	6	2617972	2617977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296134014
51545	NC_014152	CGG	2	6	2617986	2617991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134014
51546	NC_014152	T	6	6	2618030	2618035	0 %	100 %	0 %	0 %	296134014
51547	NC_014152	GGT	2	6	2618087	2618092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134014
51548	NC_014152	GCA	2	6	2618274	2618279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134014
51549	NC_014152	T	6	6	2618353	2618358	0 %	100 %	0 %	0 %	296134014
51550	NC_014152	AGG	2	6	2618490	2618495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296134014
51551	NC_014152	TAAA	2	8	2618503	2618510	75 %	25 %	0 %	0 %	296134014
51552	NC_014152	TCC	2	6	2618628	2618633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296134014
51553	NC_014152	CAT	2	6	2618797	2618802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134014
51554	NC_014152	CCAG	2	8	2618827	2618834	25 %	0 %	25 %	50 %	296134014
51555	NC_014152	GCT	2	6	2618857	2618862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134014
51556	NC_014152	CGC	2	6	2618866	2618871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134014
51557	NC_014152	ACC	2	6	2618889	2618894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134014
51558	NC_014152	CTT	2	6	2618926	2618931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134014
51559	NC_014152	TCC	2	6	2618970	2618975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296134014
51560	NC_014152	CCG	2	6	2618981	2618986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134014
51561	NC_014152	CAAA	2	8	2619032	2619039	75 %	0 %	0 %	25 %	296134014
51562	NC_014152	C	6	6	2619061	2619066	0 %	0 %	0 %	100 %	296134015
51563	NC_014152	CAG	3	9	2619087	2619095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134015
51564	NC_014152	A	6	6	2619151	2619156	100 %	0 %	0 %	0 %	296134015
51565	NC_014152	AAC	2	6	2619181	2619186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134015
51566	NC_014152	A	6	6	2619194	2619199	100 %	0 %	0 %	0 %	296134015
51567	NC_014152	ATA	2	6	2619208	2619213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296134015
51568	NC_014152	A	6	6	2619252	2619257	100 %	0 %	0 %	0 %	296134015
51569	NC_014152	CCA	2	6	2619278	2619283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134015
51570	NC_014152	A	6	6	2619287	2619292	100 %	0 %	0 %	0 %	296134015
51571	NC_014152	A	6	6	2619355	2619360	100 %	0 %	0 %	0 %	296134015
51572	NC_014152	AAG	2	6	2619477	2619482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296134015
51573	NC_014152	AAT	2	6	2619489	2619494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296134015
51574	NC_014152	GCA	2	6	2619533	2619538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134015
51575	NC_014152	ACC	2	6	2619547	2619552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134015
51576	NC_014152	ATT	2	6	2619667	2619672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296134015
51577	NC_014152	ACT	3	9	2619721	2619729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134015
51578	NC_014152	GCC	2	6	2619754	2619759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134015
51579	NC_014152	TAC	2	6	2619765	2619770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134015
51580	NC_014152	CAG	2	6	2619786	2619791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134015
51581	NC_014152	A	8	8	2619864	2619871	100 %	0 %	0 %	0 %	296134015
51582	NC_014152	TAAAG	2	10	2619872	2619881	60 %	20 %	20 %	0 %	296134015
51583	NC_014152	CCA	2	6	2619911	2619916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134015
51584	NC_014152	GCG	2	6	2619920	2619925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134015
51585	NC_014152	AAT	2	6	2619933	2619938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296134015
51586	NC_014152	AACA	2	8	2620065	2620072	75 %	0 %	0 %	25 %	296134015
51587	NC_014152	T	6	6	2620130	2620135	0 %	100 %	0 %	0 %	296134015
51588	NC_014152	TCC	2	6	2620159	2620164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296134016
51589	NC_014152	ATT	2	6	2620193	2620198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296134016
51590	NC_014152	TTTCTT	2	12	2620203	2620214	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	296134016
51591	NC_014152	GC	3	6	2620250	2620255	0 %	0 %	50 %	50 %	296134016
51592	NC_014152	AACA	2	8	2620286	2620293	75 %	0 %	0 %	25 %	296134016
51593	NC_014152	ACC	2	6	2620297	2620302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134016
51594	NC_014152	ATG	2	6	2620425	2620430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134016
51595	NC_014152	A	6	6	2620443	2620448	100 %	0 %	0 %	0 %	296134016
51596	NC_014152	AGG	2	6	2620519	2620524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296134016
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51598	NC_014152	GGC	3	9	2620730	2620738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134016
51599	NC_014152	GGGT	2	8	2620756	2620763	0 %	25 %	75 %	0 %	296134016
51600	NC_014152	TGG	2	6	2620773	2620778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134016
51601	NC_014152	AGC	2	6	2620809	2620814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134016
51602	NC_014152	GCA	2	6	2620897	2620902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134016
51603	NC_014152	AGC	2	6	2620923	2620928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134016
51604	NC_014152	AGT	2	6	2620940	2620945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134016
51605	NC_014152	C	6	6	2620979	2620984	0 %	0 %	0 %	100 %	296134016
51606	NC_014152	TTC	2	6	2621054	2621059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134016
51607	NC_014152	CTTT	2	8	2621106	2621113	0 %	75 %	0 %	25 %	296134016
51608	NC_014152	TA	3	6	2621150	2621155	50 %	50 %	0 %	0 %	296134016
51609	NC_014152	CCG	2	6	2621228	2621233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134016
51610	NC_014152	TCCT	2	8	2621273	2621280	0 %	50 %	0 %	50 %	296134016
51611	NC_014152	CAC	2	6	2621291	2621296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134016
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51613	NC_014152	TGT	2	6	2621425	2621430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296134016
51614	NC_014152	CAG	2	6	2621456	2621461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134016
51615	NC_014152	TTC	2	6	2621462	2621467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134016
51616	NC_014152	CATA	2	8	2621524	2621531	50 %	25 %	0 %	25 %	296134016
51617	NC_014152	GTC	2	6	2621546	2621551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134016
51618	NC_014152	TTG	2	6	2621565	2621570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296134016
51619	NC_014152	GCT	2	6	2621595	2621600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134016
51620	NC_014152	TCT	2	6	2621688	2621693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134016
51621	NC_014152	T	6	6	2621740	2621745	0 %	100 %	0 %	0 %	296134016
51622	NC_014152	ATT	2	6	2621799	2621804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296134016
51623	NC_014152	TTAT	2	8	2621816	2621823	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51624	NC_014152	ATTC	2	8	2621842	2621849	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51625	NC_014152	ATAA	2	8	2621878	2621885	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51626	NC_014152	GTT	2	6	2621966	2621971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296134017
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51633	NC_014152	TGA	2	6	2622101	2622106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134017
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51640	NC_014152	GAAA	2	8	2622425	2622432	75 %	0 %	25 %	0 %	296134017
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51652	NC_014152	GCCC	2	8	2622950	2622957	0 %	0 %	25 %	75 %	296134017
51653	NC_014152	TA	3	6	2622960	2622965	50 %	50 %	0 %	0 %	296134017
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51655	NC_014152	CTG	2	6	2622990	2622995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134017
51656	NC_014152	CGG	2	6	2623148	2623153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134017
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51688	NC_014152	A	6	6	2624749	2624754	100 %	0 %	0 %	0 %	296134019
51689	NC_014152	A	9	9	2624772	2624780	100 %	0 %	0 %	0 %	296134019
51690	NC_014152	AGG	2	6	2624840	2624845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296134019
51691	NC_014152	CGG	2	6	2624846	2624851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134019
51692	NC_014152	CTGT	2	8	2624880	2624887	0 %	50 %	25 %	25 %	296134019
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51697	NC_014152	AG	3	6	2625113	2625118	50 %	0 %	50 %	0 %	296134019
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51700	NC_014152	A	6	6	2625296	2625301	100 %	0 %	0 %	0 %	296134019
51701	NC_014152	TGG	2	6	2625307	2625312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134019
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51708	NC_014152	TAC	2	6	2625914	2625919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134020
51709	NC_014152	AG	3	6	2625937	2625942	50 %	0 %	50 %	0 %	296134020
51710	NC_014152	CCT	2	6	2626147	2626152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296134021
51711	NC_014152	TCC	2	6	2626193	2626198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296134021
51712	NC_014152	AACC	2	8	2626288	2626295	50 %	0 %	0 %	50 %	296134021
51713	NC_014152	CGT	2	6	2626305	2626310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134021
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51716	NC_014152	A	6	6	2626479	2626484	100 %	0 %	0 %	0 %	296134021
51717	NC_014152	AAACC	2	10	2626501	2626510	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
51718	NC_014152	TTC	2	6	2626581	2626586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134022
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51721	NC_014152	GCCT	2	8	2626883	2626890	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51722	NC_014152	GCC	2	6	2626911	2626916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51723	NC_014152	TACAA	2	10	2626926	2626935	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
51724	NC_014152	GAA	2	6	2626946	2626951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51725	NC_014152	AAC	2	6	2627005	2627010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51726	NC_014152	GAA	2	6	2627075	2627080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296134023
51727	NC_014152	A	6	6	2627129	2627134	100 %	0 %	0 %	0 %	296134023
51728	NC_014152	CCGGG	2	10	2627165	2627174	0 %	0 %	60 %	40 %	296134023
51729	NC_014152	CTG	2	6	2627195	2627200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134023
51730	NC_014152	GCC	2	6	2627219	2627224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134023
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51732	NC_014152	CCA	2	6	2627307	2627312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134023
51733	NC_014152	ATG	2	6	2627313	2627318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134023
51734	NC_014152	GTA	2	6	2627372	2627377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134023
51735	NC_014152	TGG	2	6	2627415	2627420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134023
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51854	NC_014152	A	6	6	2634733	2634738	100 %	0 %	0 %	0 %	296134029
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51856	NC_014152	CCT	2	6	2634785	2634790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296134029
51857	NC_014152	CTC	2	6	2634844	2634849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296134029
51858	NC_014152	TATTT	2	10	2634910	2634919	20 %	80 %	0 %	0 %	296134029
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51860	NC_014152	TAT	2	6	2635068	2635073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296134029
51861	NC_014152	CTC	2	6	2635153	2635158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296134029
51862	NC_014152	A	6	6	2635161	2635166	100 %	0 %	0 %	0 %	296134029
51863	NC_014152	CT	3	6	2635259	2635264	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51864	NC_014152	ATTA	2	8	2635270	2635277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51865	NC_014152	CCTG	2	8	2635288	2635295	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51866	NC_014152	A	7	7	2635334	2635340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51869	NC_014152	GCC	2	6	2635480	2635485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134030
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51871	NC_014152	A	6	6	2635713	2635718	100 %	0 %	0 %	0 %	296134030
51872	NC_014152	GTCT	2	8	2635723	2635730	0 %	50 %	25 %	25 %	296134030
51873	NC_014152	GCT	2	6	2635731	2635736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134030
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51922	NC_014152	TCC	2	6	2637778	2637783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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51933	NC_014152	TGC	3	9	2638517	2638525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134034
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51979	NC_014152	CTT	2	6	2640902	2640907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134035
51980	NC_014152	ATTAAA	2	12	2640943	2640954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296134035
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51982	NC_014152	A	6	6	2640986	2640991	100 %	0 %	0 %	0 %	296134035
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