MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 62102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014152	TAA	2	6	221297	221302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_014152	TTTA	2	8	221325	221332	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_014152	T	6	6	221349	221354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_014152	A	6	6	221441	221446	100 %	0 %	0 %	0 %	296131751
4505	NC_014152	AGG	2	6	221495	221500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131751
4506	NC_014152	TGG	2	6	221537	221542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131751
4507	NC_014152	TGC	2	6	221649	221654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131751
4508	NC_014152	AT	3	6	221738	221743	50 %	50 %	0 %	0 %	296131751
4509	NC_014152	TAT	2	6	221778	221783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131751
4510	NC_014152	AGG	2	6	221975	221980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_014152	TAT	2	6	221982	221987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131752
4512	NC_014152	AGT	2	6	222177	222182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131752
4513	NC_014152	AAT	2	6	222202	222207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131752
4514	NC_014152	CCA	2	6	222539	222544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296131752
4515	NC_014152	GAAG	2	8	222615	222622	50 %	0 %	50 %	0 %	296131752
4516	NC_014152	ACG	2	6	222701	222706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131752
4517	NC_014152	GGC	2	6	222744	222749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131752
4518	NC_014152	ATG	2	6	222808	222813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131752
4519	NC_014152	GAC	2	6	222814	222819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131752
4520	NC_014152	AGCT	2	8	222848	222855	25 %	25 %	25 %	25 %	296131752
4521	NC_014152	ATT	3	9	222883	222891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131752
4522	NC_014152	CGG	2	6	223055	223060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131752
4523	NC_014152	AAG	2	6	223158	223163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131752
4524	NC_014152	GTAG	2	8	223164	223171	25 %	25 %	50 %	0 %	296131752
4525	NC_014152	TGT	2	6	223264	223269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131753
4526	NC_014152	A	7	7	223294	223300	100 %	0 %	0 %	0 %	296131753
4527	NC_014152	CGA	2	6	223312	223317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131753
4528	NC_014152	AT	3	6	223344	223349	50 %	50 %	0 %	0 %	296131753
4529	NC_014152	A	6	6	223447	223452	100 %	0 %	0 %	0 %	296131753
4530	NC_014152	AT	3	6	223553	223558	50 %	50 %	0 %	0 %	296131754
4531	NC_014152	TGGA	2	8	223627	223634	25 %	25 %	50 %	0 %	296131754
4532	NC_014152	GAA	2	6	223686	223691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131754
4533	NC_014152	TGCT	2	8	223750	223757	0 %	50 %	25 %	25 %	296131754
4534	NC_014152	AGA	2	6	223765	223770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131754
4535	NC_014152	A	6	6	223852	223857	100 %	0 %	0 %	0 %	296131754
4536	NC_014152	GAG	2	6	223896	223901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131754
4537	NC_014152	TTC	2	6	223948	223953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131754
4538	NC_014152	GACA	2	8	223991	223998	50 %	0 %	25 %	25 %	296131754
4539	NC_014152	A	6	6	223998	224003	100 %	0 %	0 %	0 %	296131754
4540	NC_014152	GGGT	2	8	224047	224054	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_014152	CCG	2	6	224078	224083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4542	NC_014152	ATT	3	9	224089	224097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_014152	TA	3	6	224163	224168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_014152	A	6	6	224298	224303	100 %	0 %	0 %	0 %	296131755
4545	NC_014152	AGA	2	6	224510	224515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131755
4546	NC_014152	TGCC	2	8	224587	224594	0 %	25 %	25 %	50 %	296131755
4547	NC_014152	CGGCC	2	10	224603	224612	0 %	0 %	40 %	60 %	296131755
4548	NC_014152	AAG	2	6	224614	224619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131755
4549	NC_014152	G	6	6	224762	224767	0 %	0 %	100 %	0 %	296131755
4550	NC_014152	CTG	2	6	224778	224783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131755
4551	NC_014152	GGC	2	6	224816	224821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131755
4552	NC_014152	AAG	2	6	224896	224901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131755
4553	NC_014152	A	6	6	224939	224944	100 %	0 %	0 %	0 %	296131755
4554	NC_014152	TAT	2	6	225058	225063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131755
4555	NC_014152	TA	3	6	225079	225084	50 %	50 %	0 %	0 %	296131755
4556	NC_014152	GAT	2	6	225137	225142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131755
4557	NC_014152	AGG	2	6	225155	225160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131755
4558	NC_014152	AATT	2	8	225161	225168	50 %	50 %	0 %	0 %	296131755
4559	NC_014152	A	6	6	225179	225184	100 %	0 %	0 %	0 %	296131756
4560	NC_014152	AAC	2	6	225187	225192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131756
4561	NC_014152	A	6	6	225209	225214	100 %	0 %	0 %	0 %	296131756
4562	NC_014152	ATT	2	6	225252	225257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131756
4563	NC_014152	TGA	2	6	225274	225279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131756
4564	NC_014152	GGTA	2	8	225280	225287	25 %	25 %	50 %	0 %	296131756
4565	NC_014152	CTT	2	6	225296	225301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131756
4566	NC_014152	TGG	2	6	225321	225326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131756
4567	NC_014152	GGA	2	6	225361	225366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131756
4568	NC_014152	TAC	2	6	225400	225405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131756
4569	NC_014152	CGGT	2	8	225478	225485	0 %	25 %	50 %	25 %	296131756
4570	NC_014152	ATT	2	6	225557	225562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131756
4571	NC_014152	GCA	2	6	225563	225568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131756
4572	NC_014152	CGC	2	6	225600	225605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296131756
4573	NC_014152	GT	3	6	225724	225729	0 %	50 %	50 %	0 %	296131756
4574	NC_014152	CTT	2	6	225882	225887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131756
4575	NC_014152	TAT	2	6	225895	225900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131756
4576	NC_014152	GAA	2	6	225956	225961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131756
4577	NC_014152	GAA	2	6	225983	225988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131756
4578	NC_014152	TAAA	2	8	225990	225997	75 %	25 %	0 %	0 %	296131756
4579	NC_014152	CCG	2	6	226073	226078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296131757
4580	NC_014152	TGA	2	6	226136	226141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131757
4581	NC_014152	ACC	2	6	226402	226407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296131757
4582	NC_014152	ATT	2	6	226419	226424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131757
4583	NC_014152	ATT	2	6	226429	226434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131757
4584	NC_014152	CAG	2	6	226471	226476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131757
4585	NC_014152	GCT	2	6	226609	226614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131757
4586	NC_014152	GA	4	8	226664	226671	50 %	0 %	50 %	0 %	296131757
4587	NC_014152	GCG	2	6	226690	226695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131757
4588	NC_014152	GAT	3	9	226875	226883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131758
4589	NC_014152	GGT	2	6	227001	227006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131758
4590	NC_014152	ATA	3	9	227009	227017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131758
4591	NC_014152	GCG	2	6	227086	227091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131758
4592	NC_014152	ATT	2	6	227125	227130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131758
4593	NC_014152	GGA	2	6	227145	227150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131758
4594	NC_014152	AAG	2	6	227153	227158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131758
4595	NC_014152	ATT	2	6	227179	227184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131758
4596	NC_014152	T	7	7	227183	227189	0 %	100 %	0 %	0 %	296131758
4597	NC_014152	GAT	2	6	227191	227196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131758
4598	NC_014152	AAC	2	6	227197	227202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131758
4599	NC_014152	GAA	2	6	227227	227232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131758
4600	NC_014152	GCAG	2	8	227233	227240	25 %	0 %	50 %	25 %	296131758
4601	NC_014152	ATAG	2	8	227276	227283	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_014152	GAAA	2	8	227382	227389	75 %	0 %	25 %	0 %	296131759
4603	NC_014152	A	7	7	227387	227393	100 %	0 %	0 %	0 %	296131759
4604	NC_014152	CAG	2	6	227479	227484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131759
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4607	NC_014152	CCCGA	2	10	227581	227590	20 %	0 %	20 %	60 %	296131759
4608	NC_014152	AAG	2	6	227638	227643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131759
4609	NC_014152	TGT	2	6	227664	227669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131759
4610	NC_014152	TTGT	2	8	227779	227786	0 %	75 %	25 %	0 %	296131759
4611	NC_014152	CAAG	2	8	227901	227908	50 %	0 %	25 %	25 %	296131759
4612	NC_014152	GCA	2	6	227917	227922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131759
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4614	NC_014152	GAT	2	6	227994	227999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131759
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4616	NC_014152	TGA	2	6	228195	228200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131759
4617	NC_014152	CG	3	6	228223	228228	0 %	0 %	50 %	50 %	296131759
4618	NC_014152	AAATA	2	10	228245	228254	80 %	20 %	0 %	0 %	296131759
4619	NC_014152	GGA	2	6	228271	228276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_014152	AAT	2	6	228277	228282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_014152	TAA	2	6	228397	228402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131760
4622	NC_014152	A	8	8	228425	228432	100 %	0 %	0 %	0 %	296131760
4623	NC_014152	ATG	2	6	228486	228491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131760
4624	NC_014152	GAA	2	6	228551	228556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131760
4625	NC_014152	AATT	2	8	228600	228607	50 %	50 %	0 %	0 %	296131760
4626	NC_014152	AGC	2	6	228661	228666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131760
4627	NC_014152	GAA	2	6	228710	228715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131760
4628	NC_014152	AGA	2	6	228769	228774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131760
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4630	NC_014152	AT	3	6	228860	228865	50 %	50 %	0 %	0 %	296131760
4631	NC_014152	GGCC	2	8	228895	228902	0 %	0 %	50 %	50 %	296131760
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4634	NC_014152	GCA	2	6	229191	229196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131760
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4640	NC_014152	GGTTT	2	10	229460	229469	0 %	60 %	40 %	0 %	296131760
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4642	NC_014152	CAA	2	6	229592	229597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131760
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4645	NC_014152	A	6	6	229674	229679	100 %	0 %	0 %	0 %	296131760
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4648	NC_014152	CCCTG	2	10	229817	229826	0 %	20 %	20 %	60 %	296131760
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4650	NC_014152	AAG	2	6	229880	229885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4651	NC_014152	TTG	2	6	229915	229920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131761
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4654	NC_014152	T	6	6	230068	230073	0 %	100 %	0 %	0 %	296131761
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4670	NC_014152	T	6	6	230848	230853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4688	NC_014152	A	7	7	231732	231738	100 %	0 %	0 %	0 %	296131762
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4693	NC_014152	TA	3	6	231928	231933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4702	NC_014152	T	6	6	232305	232310	0 %	100 %	0 %	0 %	296131763
4703	NC_014152	TGT	2	6	232317	232322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131763
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4707	NC_014152	AT	3	6	232362	232367	50 %	50 %	0 %	0 %	296131763
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4732	NC_014152	CTT	2	6	233598	233603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131764
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4740	NC_014152	AAGT	2	8	234047	234054	50 %	25 %	25 %	0 %	296131764
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4747	NC_014152	ATAA	2	8	234294	234301	75 %	25 %	0 %	0 %	296131764
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4749	NC_014152	TCT	2	6	234410	234415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4999	NC_014152	AGTTA	2	10	246185	246194	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5000	NC_014152	A	6	6	246221	246226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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