MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacter italicus Ab9 chromosome

Total Repeats: 59504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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54002	NC_013921	CCA	2	6	2221412	2221417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289579327
54003	NC_013921	TGA	2	6	2221422	2221427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579327
54004	NC_013921	GGTG	2	8	2221514	2221521	0 %	25 %	75 %	0 %	289579327
54005	NC_013921	TTGC	2	8	2221551	2221558	0 %	50 %	25 %	25 %	289579327
54006	NC_013921	TAA	2	6	2221605	2221610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289579327
54007	NC_013921	GAA	3	9	2221631	2221639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579327
54008	NC_013921	A	6	6	2221638	2221643	100 %	0 %	0 %	0 %	289579327
54009	NC_013921	CAA	2	6	2221687	2221692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289579327
54010	NC_013921	TGCC	2	8	2221747	2221754	0 %	25 %	25 %	50 %	289579328
54011	NC_013921	GAA	2	6	2221809	2221814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579328
54012	NC_013921	A	6	6	2221851	2221856	100 %	0 %	0 %	0 %	289579328
54013	NC_013921	AAG	2	6	2221999	2222004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579328
54014	NC_013921	GCC	2	6	2222059	2222064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579328
54015	NC_013921	GCA	2	6	2222076	2222081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579328
54016	NC_013921	GTCC	2	8	2222103	2222110	0 %	25 %	25 %	50 %	289579328
54017	NC_013921	CAT	2	6	2222147	2222152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579328
54018	NC_013921	CCG	2	6	2222164	2222169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579328
54019	NC_013921	AAG	2	6	2222299	2222304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579328
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54021	NC_013921	GAC	2	6	2222373	2222378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579328
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54023	NC_013921	GGA	2	6	2222657	2222662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579328
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54026	NC_013921	GTC	2	6	2222821	2222826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579328
54027	NC_013921	GTA	2	6	2222877	2222882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579328
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54032	NC_013921	ACAAA	2	10	2223092	2223101	80 %	0 %	0 %	20 %	289579328
54033	NC_013921	A	6	6	2223099	2223104	100 %	0 %	0 %	0 %	289579328
54034	NC_013921	CAT	2	6	2223165	2223170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54035	NC_013921	TTTA	2	8	2223186	2223193	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54036	NC_013921	ATTT	2	8	2223217	2223224	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54037	NC_013921	TTGC	2	8	2223254	2223261	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54038	NC_013921	TAA	2	6	2223268	2223273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54039	NC_013921	CCT	2	6	2223280	2223285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54040	NC_013921	A	6	6	2223301	2223306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54041	NC_013921	GCC	2	6	2223313	2223318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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54043	NC_013921	TCTG	2	8	2223392	2223399	0 %	50 %	25 %	25 %	289579329
54044	NC_013921	AAT	2	6	2223400	2223405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289579329
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54053	NC_013921	TATT	2	8	2223721	2223728	25 %	75 %	0 %	0 %	289579329
54054	NC_013921	TCT	2	6	2223760	2223765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289579329
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54084	NC_013921	CT	3	6	2225180	2225185	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54085	NC_013921	CT	3	6	2225189	2225194	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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54120	NC_013921	TCA	2	6	2226611	2226616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579330
54121	NC_013921	T	6	6	2226619	2226624	0 %	100 %	0 %	0 %	289579330
54122	NC_013921	AT	3	6	2226625	2226630	50 %	50 %	0 %	0 %	289579330
54123	NC_013921	ATGT	2	8	2226760	2226767	25 %	50 %	25 %	0 %	289579330
54124	NC_013921	TATTT	2	10	2226787	2226796	20 %	80 %	0 %	0 %	289579330
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54126	NC_013921	TGA	2	6	2227056	2227061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579330
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54131	NC_013921	CTTTT	2	10	2227251	2227260	0 %	80 %	0 %	20 %	289579330
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54146	NC_013921	A	6	6	2227968	2227973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54152	NC_013921	T	6	6	2228212	2228217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54153	NC_013921	A	6	6	2228226	2228231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54154	NC_013921	T	6	6	2228253	2228258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54155	NC_013921	TCC	2	6	2228305	2228310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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54161	NC_013921	T	6	6	2228484	2228489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54217	NC_013921	TA	3	6	2231012	2231017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54218	NC_013921	AGCTA	2	10	2231048	2231057	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
54219	NC_013921	ATA	2	6	2231103	2231108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54220	NC_013921	TCA	3	9	2231109	2231117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54221	NC_013921	ATT	2	6	2231128	2231133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289579335
54222	NC_013921	T	6	6	2231138	2231143	0 %	100 %	0 %	0 %	289579335
54223	NC_013921	AAT	2	6	2231160	2231165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289579335
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54225	NC_013921	TTG	2	6	2231233	2231238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289579335
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54227	NC_013921	TAA	2	6	2231264	2231269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289579335
54228	NC_013921	AGT	2	6	2231282	2231287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579335
54229	NC_013921	ATGG	2	8	2231312	2231319	25 %	25 %	50 %	0 %	289579335
54230	NC_013921	TTGA	2	8	2231332	2231339	25 %	50 %	25 %	0 %	289579335
54231	NC_013921	CAA	3	9	2231357	2231365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289579335
54232	NC_013921	TCCC	2	8	2231418	2231425	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
54233	NC_013921	TCC	2	6	2231469	2231474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54234	NC_013921	TTG	2	6	2231507	2231512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54235	NC_013921	A	7	7	2231546	2231552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54236	NC_013921	GTGGAT	2	12	2231620	2231631	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
54237	NC_013921	AT	3	6	2231693	2231698	50 %	50 %	0 %	0 %	289579336
54238	NC_013921	ACA	2	6	2231730	2231735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289579336
54239	NC_013921	TAT	2	6	2231765	2231770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289579336
54240	NC_013921	TAC	2	6	2231782	2231787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579336
54241	NC_013921	TTA	2	6	2231793	2231798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289579336
54242	NC_013921	CT	3	6	2231826	2231831	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54243	NC_013921	AATA	2	8	2231857	2231864	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54244	NC_013921	ACA	2	6	2231934	2231939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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54346	NC_013921	TC	3	6	2235453	2235458	0 %	50 %	0 %	50 %	289579342
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54354	NC_013921	TTTG	2	8	2235754	2235761	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54355	NC_013921	AT	3	6	2235801	2235806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54356	NC_013921	ATAGTA	2	12	2235826	2235837	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54357	NC_013921	TTTTA	2	10	2235898	2235907	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54358	NC_013921	AC	4	8	2235914	2235921	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54359	NC_013921	TAC	2	6	2235988	2235993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54360	NC_013921	A	6	6	2236017	2236022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54361	NC_013921	CCT	2	6	2236049	2236054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54362	NC_013921	AGT	2	6	2236059	2236064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579343
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54364	NC_013921	CAT	2	6	2236083	2236088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579343
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54488	NC_013921	CTA	2	6	2241208	2241213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579346
54489	NC_013921	CAT	2	6	2241239	2241244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579346
54490	NC_013921	CTA	2	6	2241256	2241261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579346
54491	NC_013921	GTC	2	6	2241264	2241269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579346
54492	NC_013921	AGGC	2	8	2241383	2241390	25 %	0 %	50 %	25 %	289579346
54493	NC_013921	T	6	6	2241397	2241402	0 %	100 %	0 %	0 %	289579346
54494	NC_013921	TTTCT	2	10	2241409	2241418	0 %	80 %	0 %	20 %	289579346
54495	NC_013921	ATCC	2	8	2241456	2241463	25 %	25 %	0 %	50 %	289579346
54496	NC_013921	TTATC	2	10	2241562	2241571	20 %	60 %	0 %	20 %	289579346
54497	NC_013921	GAAG	2	8	2241632	2241639	50 %	0 %	50 %	0 %	289579346
54498	NC_013921	GCT	2	6	2241648	2241653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579346
54499	NC_013921	TTA	2	6	2241667	2241672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289579346
54500	NC_013921	CCATG	2	10	2241754	2241763	20 %	20 %	20 %	40 %	289579346

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